Pseudoalteromonas tunicata: PTUN_a1032
Help
Entry
PTUN_a1032 CDS
T05187
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
ptu
Pseudoalteromonas tunicata
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
GGDEF
Reg_prop
Y_Y_Y
DUF5074
DUF6377
DUF515
SLC52_ribofla_tr
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATC93727
LinkDB
All DBs
Position
I:939179..942304
Genome browser
AA seq
1041 aa
AA seq
DB search
MIKTLVYFCLFLSVSCFASINDYVVKKWSTSDGLASQSLTSIVQDRQGYIWVGTQFGLSR
FDGMNFTNFSTANAEFLQSNAISKLQLDQDGMLWIGSKSGLVRLDPRSFDYATFNVNGGV
HDILADKEGRIWIAANGLYLFFNEKFIPINQLLANSEAPVWPNDDGSRTQKKLVGRIIGS
VSKMALSPQGIWLVNERNLLRLTYQLSSKSSVKLEITAKVALPDSLAQTIVTDLAWLEGN
LFLASEAGAYKLDVDEELRAIAIPYAIKKATYKIMSDSDGGIWASTEGRLSYRDPSGDWE
GVDSLELAQTWFNDIMRDRNNNIWLASSSDGLWQAHKGLVNRHATLAEIKEPIDAVTLSP
RNVLWVASRSGIGFYNDDKVFVTTINSVDYQNAKVQSLYFDNDRLFINTDSGLFIYDPEG
VHRPTERVLRTNSINSINRSADGSLWFGTERGLYRLGYNGLKSFIHNAKLGSNKITYQLI
SDNYNWLGTTKGAYVFSDKGIDPIATSTALANASISSMLELPDHVILIGTMTNGLFYRSL
DNEWHQLDASNGLPYGSILSLHYDEKYQHIWVSNLKGVYRMPAAQFSQKISNIQIEQVLS
SFDRQLDGKLSQCCAGKGQNAVADTGDSLWYPSLQGLIEIPKDIELFGQAILEPIVESIS
TTNQDHRVKDGSATIDLDARDLTINYSAIDFYAPNSLEFRYQLVNFDKSWRFANRRREAI
YTNLPPGVFTFELEVKRQSMTWEQAVKTHLTIKIAKRFDETIYFRLLIVSLFITLLYVVF
LIYRNQERRKQLELEKQVESRTTELTETNNKLNLANSQLKQVSHSDELTGLRSRRFLFDQ
LPKDIEHYQRNRESLEEQGKALALVIVNLDEFSRINDAYGPIFGDSCLQQVATLLIGKTQ
GSDYVVRWSGDEFLLLLRDMKRNAIDDYTKNLCRTISDHKFKLPNGKTVHLSSSLGWAFY
PLPLLGGQIIGWETSINLADLALHKVKERGRNGVATFTFDDQIDAFEFEDNEIIEKQLAD
LLDTQLAKLHIWMQERWSMKI
NT seq
3126 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgattaaaacgttagtctatttttgcctctttttgagtgtcagctgctttgcttctatc
aatgattatgtcgttaagaagtggagcaccagtgatggactagcgtcacaatcattgaca
agtattgtgcaagatcggcaaggctatatttgggtggggacccagtttggcctgagtcga
tttgacggcatgaattttactaattttagcactgctaatgctgagtttttacagagtaat
gcgataagcaaacttcagctcgatcaagatggcatgctttggattggtagtaaaagtggt
ttagtcaggctcgatcctcgttcgtttgattacgctacatttaacgtcaatggtggagtc
catgatattttggctgataaagaaggccgaatttggattgcagcaaatggtctatatctc
tttttcaacgaaaaatttatacctattaaccaactgctcgccaatagcgaagcacctgtc
tggcctaatgacgatggcagccgcactcaaaaaaaattagttggccgtatcattggttct
gtcagtaagatggcgctatcgcctcaaggcatttggctggttaatgagcgaaatttatta
cgactaacctatcaactcagttcaaaatcatcagtaaagcttgagatcaccgccaaggtg
gcacttcctgacagtttagcgcaaaccatagtcacggatttagcttggcttgaaggcaat
ttgtttttagcatcagaagcaggcgcttacaagctcgatgtggatgaagaactgcgcgcg
attgcaattccttatgcgattaaaaaagccacttataaaattatgagtgactcagatggt
ggtatctgggcttcaaccgaaggtcggttaagttatcgcgacccatcaggtgattgggaa
ggtgttgattcattagagcttgcgcagacttggtttaacgacattatgcgcgatcgcaat
aataatatttggctagccagctcaagtgatggtttgtggcaggcccataaaggattggtg
aaccgccatgcgacgcttgctgaaataaaagagccaattgatgcagttaccttatcgcct
agaaatgtgctctgggttgcgagtcgctcaggtattggtttttacaacgacgataaggta
tttgtgacaaccattaatagtgttgattatcaaaacgctaaagtacaaagtttgtatttt
gataatgatcgtttgttcattaatactgatagcggcctctttatttacgaccctgaagga
gtgcatcgtccaacggagcgggtgcttcgtactaattcaattaattctataaatcgttct
gctgacggctcattgtggtttggcactgagcgtggtttgtatcgacttggttataacggc
ttaaaatcgtttattcataatgcaaagttgggtagtaataaaattacctatcaattaatt
agcgataattataattggcttgggactacaaaaggtgcgtatgttttcagtgataaaggg
attgatcctattgcaacctcaaccgcacttgcaaatgcaagtatctcgagcatgctggaa
ttgcctgatcatgtaatattgattggtactatgactaatggcttattttatcgcagttta
gataatgaatggcaccaacttgatgcttcaaatggtttaccttatggctcaattttaagc
ttacattacgatgaaaaatatcagcatatttgggtcagtaacttaaaaggcgtttatcga
atgcctgcggcgcaatttagccaaaaaattagcaatattcaaattgaacaagtacttagc
tcatttgaccgtcaattagatggaaaattaagtcagtgttgtgctggtaaaggacaaaat
gcggtcgctgatactggggattctttgtggtacccaagtttgcagggcttgatagaaatt
cctaaagacattgagttatttggtcaggctattttagagccgatagttgaaagtattagt
actacaaatcaagatcatagagttaaagatggtagtgcaactattgatcttgatgcccga
gatttaacaattaattattcagcaatagatttttatgctcccaatagcttggagtttcgt
taccaattagttaattttgataagtcatggcgctttgctaatcgtcgccgagaagcaatt
tataccaatttaccgccaggagtatttacttttgaactagaagtaaagcgtcaaagtatg
acttgggaacaagcagtaaaaacgcaccttacaattaaaattgcaaaacgtttcgatgaa
accatttattttaggctgcttattgttagtttatttatcactttgttatatgttgttttt
ctgatttaccgtaatcaagaacggcgaaaacagcttgaacttgaaaaacaggttgaatca
cgtaccacagagctcactgaaaccaataacaagcttaacttggcaaactcacagttaaaa
caggtgagtcattctgatgagcttacaggccttcgcagcaggcgtttcttatttgatcag
ttaccaaaagatattgagcattatcaacgtaaccgcgaaagtttagaagagcaaggtaaa
gcattagccttagtgattgtaaaccttgatgagtttagtcgaattaatgatgcctatggc
cctatctttggtgatagttgtttgcaacaagttgcgactttattaataggtaaaacacaa
ggttctgattatgtagtgcgttggagtggtgacgagtttttattattactgcgtgatatg
aaacgtaatgcaattgatgattatactaaaaacctatgccgtactatttcagatcataaa
tttaaattacctaatggtaaaacagttcatttatcaagttcattaggctgggcattttat
ccactgccattgctaggtgggcaaattataggttgggaaacctcaattaatttggctgat
ttagcgttgcataaagttaaagagcggggacgcaacggggtggcaacgtttacttttgat
gatcagattgatgcctttgagtttgaagataatgaaattatcgaaaaacaacttgctgat
ttactcgatacccaattggcgaaattgcatatctggatgcaagaacgctggtcgatgaaa
atttaa
DBGET
integrated database retrieval system
