Pasteurella multocida subsp. multocida 3480: NT08PM_0227
Help
Entry
NT08PM_0227 CDS
T02057
Name
(GenBank) sialidase NanB
KO
K01186
sialidase-1 [EC:
3.2.1.18
]
Organism
pul
Pasteurella multocida subsp. multocida 3480
Pathway
pul00511
Other glycan degradation
pul00600
Sphingolipid metabolism
pul01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pul00001
]
09100 Metabolism
09103 Lipid metabolism
00600 Sphingolipid metabolism
NT08PM_0227
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00511 Other glycan degradation
NT08PM_0227
Enzymes [BR:
pul01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.18 exo-alpha-sialidase
NT08PM_0227
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BNR_2
BNR_3
Autotransporter
BNR
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI45386
LinkDB
All DBs
Position
222578..225775
Genome browser
AA seq
1065 aa
AA seq
DB search
MKKFNPSVLALSISSLLLTSTLTFGQIQQQDKALFGVKEHQESLLFHQSLVKQGSDNVPI
WRIPSLLRTKDGVLIAAADKRWQHRGDWGDIDTAIRISHDDGKTWGNITTILDLPSQNGE
KSPIRDDAPTFNPWAHRNNSSVPTYRNSAFLIDAQMVQDKRNGRIFLAVDMFPESTGLSG
TADNGVTEFGSGYVNIDGKQYLRLNKKEGYTSKQWTLRENGIVFNEKNEKTGYRVVINGD
PKKNFKDLGDVYDQDNNKLGNIYLKQTERNATVPFTAPNTSYFWLTHSDDNGKTWSSPID
LTSQVKKDWMRFFGTGPGVGIQTKKGNLLFPIYYINRHGKQSSALIISKDGGKTWDLGQS
PNDTRTELYGKNSETLNSNSSGHELTESQLVELQNGDLKLFMRNTSGRVMMSTSKDGGYS
WIETKQVPELNHGYSQLSVIKYSKKINGKEYIVFSGQSVSGNSGDNLRRDGKLFLGEVQE
SGEIKWDTTNLVREIVSQGKAAGQPNGYVYSSMAELGDGSIGLAYENTTDYTTIMYLPIE
MQEFFWKAGKIFSDVRQKEPLVFTYDGTETLEKIGDGVAIKRGEGESQSEINVSEGLLVL
DQQTKDGKNKAFTQLTLNNSGVAQVNSTQNIDRLVVNNGATGYLQFTVTDTHSPRLKINQ
DVTAHGQIVAVQVNLQKKLKPNDKGYYHAQGEELIAFKDNGQVKWRLVNDELKDGMYVYT
LASVAKPSVLRTTSQPHSLYLTNKLITADGKAVSTVAPLKAPLTVNARPQVNPVLASYLT
ANLALNKMSEQLQQSFMHETRLLQEKDRSIFVKYLNGKQKYGSNLSFIDYGYDFNASYSG
VMLGGKVWQSERGNHALYTALNKTSYKVTPKAVDGETKAKYHSWGGSINWHSNLPHNLIV
DLSVGYQKHKGDIEHAGHVRGYTFNIGADLGYRYQWMKNAFITPMVGLHYLYASLLDVND
QANKALLKYNNFNALKTNLGVDVNYRIGKFEVKGLLSYDMYQQKTRQLYVDDVAYKQGKL
ADTLHLNTQFVAHLTPRFAFSTEVGFQHARNKGQSSFAVGAHYQF
NT seq
3198 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttaatcctagtgtattggcgttgtccatatcaagtctgctactcacatcc
acattgacctttggtcaaatccagcaacaagataaagcactctttggtgtgaaagaacat
caagaaagcctactctttcatcagagcttagtaaaacaaggtagtgataatgtgccaatt
tggcgcattccgtctttattaagaacaaaagacggtgtattaattgccgccgcagataag
cgttggcaacaccgtggtgactggggcgatattgataccgcaatccgaattagtcatgat
gatgggaaaacatggggaaatattacaacgattttggatttgccatcacaaaatggagag
aaatcaccaattagagatgatgcgccaacgtttaatccttgggcacatcgtaataatagt
tctgtaccaacatatcgaaactcagcatttttgattgatgcacaaatggtacaagataag
cgcaatggtcgaatttttctggctgtagatatgtttccagaaagtactggcttatctgga
acagctgataatggcgttactgagtttggtagtggatatgtaaacattgatggaaaacaa
tacttaagacttaataaaaaagagggatatacttctaagcaatggactctgcgtgaaaac
ggaatagtttttaatgaaaaaaatgagaaaacgggatatcgagttgttataaatggcgac
cctaagaagaatttcaaagatctcggggacgtatatgatcaagataataataaacttgga
aatatttatttaaaacaaacagaaaggaatgcaacagttcctttcactgcacctaacacc
tcttatttttggctaactcattccgatgataatggaaaaacatggtctagtcctattgat
ttaacatcgcaagtgaaaaaagattggatgcgtttttttggcacaggacctggggtggga
attcaaacaaaaaaaggaaatttactctttcctatttattatattaatcgccatggtaaa
cagtcctctgcgctgattattagcaaagacggtggaaaaacatgggatttagggcaaagt
ccaaatgatacacgaaccgaattatatggtaagaattcagagacattgaatagtaactct
agtggtcacgaattaactgaatcacaattagtcgagttacaaaatggtgatttaaaactt
ttcatgcgtaatacaagtggtcgagttatgatgtctacttctaaagatggaggttatagt
tggattgaaactaagcaagtaccagagttaaatcacggctattcacaactttctgtcatt
aaatattccaaaaaaattaatggaaaagaatatattgttttttcagggcaatcagtgtcc
gggaatagtggtgataatctccgtagagatgggaaacttttcttaggagaagtgcaagaa
agtggtgaaataaaatgggatacaacgaatttagttagggaaatcgttagtcaaggtaaa
gcagcaggacagccaaacggctatgtttacagctcaatggcggaattaggtgatggcagt
attggtttagcttatgaaaatacgacagactacaccacaatcatgtatctccctattgaa
atgcaagaatttttttggaaagccggaaaaatctttagtgatgtgcgtcagaaagaacca
ttagtgtttacttatgatggaacggagacattggaaaaaattggcgatggggttgcgatt
aaacgtggtgaaggggaaagtcaaagtgaaattaatgtgagtgaaggcttgcttgtgttg
gatcagcaaacgaaagacggtaaaaacaaagcctttactcaacttacgcttaataactca
ggagtagctcaagttaattccacacaaaatattgatcggctcgttgtgaacaacggtgct
acggggtatttgcaatttacggtcacagatactcactctccacggcttaagattaatcaa
gacgtgactgcacatgggcagattgtggctgtacaagtcaacttacagaaaaaactcaaa
ccaaatgataaaggttattaccatgcccaaggagaagaactaatcgcatttaaggataat
ggacaagtcaaatggcgtttagttaacgatgaactaaaagatggcatgtatgtttatact
ttggcttcagtggctaaaccaagtgttttacgtacaacaagtcagccacattcactctat
ttaacaaataagttaattacagcagatggtaaagccgtatccacggtggctccattgaaa
gcaccattaaccgtaaatgctcgcccacaagtgaatccggtattagcttcttatttaacc
gccaatcttgcgcttaataaaatgagcgagcaacttcagcaaagttttatgcatgaaacg
cgtttattgcaagaaaaagatcgcagtatttttgttaagtatcttaatggtaaacaaaaa
tatggctcaaacttaagctttattgactatgggtatgattttaatgcgagttatagcggt
gtgatgttgggaggcaaagtatggcagtctgaacgtggtaaccatgccctgtatacagca
ttgaataaaacgtcctataaagtgacgccgaaagctgtagatggtgagacgaaagcgaaa
taccacagctggggaggaagtataaattggcatagtaacttgcctcacaatctgatagta
gatttatcagttggctatcaaaaacataagggcgacattgaacatgcaggtcatgtgaga
ggttatacttttaatattggtgcggatttaggttatcgctatcaatggatgaaaaatgcg
tttattacaccaatggtcggtttgcattatttatatgcctcgcttttagatgtcaatgac
caagcgaataaagcgttattgaaatataataatttcaatgcgttaaaaacgaatttaggt
gttgatgtgaactatcgaatcgggaagtttgaagtaaaaggtttactttcttacgatatg
tatcaacaaaaaacgcgtcaattgtatgttgatgatgtagcttataagcaaggtaaactg
gctgatacacttcatttaaatacacaattcgttgcccatttaacgccacgttttgcattt
tcaacggaagttggtttccagcatgcgcggaataaaggacagtcttcctttgctgttggg
gcacattatcagttctag
DBGET
integrated database retrieval system
