Rosa chinensis (China rose): 112174799
Help
Entry
112174799 CDS
T06020
Name
(RefSeq) MDIS1-interacting receptor like kinase 2
Organism
rcn
Rosa chinensis (China rose)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_4
LRR_8
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_6
LRRNT_2
Pkinase_fungal
Mid2
Haspin_kinase
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
112174799
NCBI-ProteinID:
XP_024168379
LinkDB
All DBs
Position
6:50340344..50344616
Genome browser
AA seq
1191 aa
AA seq
DB search
MEATSSQRIQAEALLKWKNSFTSSPPSLNSWSLTNLNHLCNWTAIVCDRNTNTVSEIHLA
NFNITAALTQFNFDKFPDLTHINLNGNNFSGPIPSAIGNLTKLTTLDLGNNTLEREVPAE
MGKLTELQFLSLYNNYLNGTIPYQLNNLKKVQYLLLGGNHLDTPDWSKFSGFPLLRYLDF
SENNLDSEFPEFICECRNLTFLDLSENLLTGQIPKLVVTNLVKLESLNLTDNRFQGPFPY
NFPNLKHLYLESNNFSGPFPEDIGLISGLQLISLFNNSLEGKIPSSVGQLKELQHLDLRE
NSLNSSIPSELGLCTNLTYLDLAVNKLSGELPMSLSNLNSLRELKLSDNLFTGPILPSLV
SNWTKMISLQLKNNSFNGNIPPEIGLLTKLDILWLSENNFSGSIPSEIGNLKVLKYLGLW
ENQLSGPIPMKFWNLTNLQLLDIGANNLSGPIPPEIGNMSSLVNFDVSTNQLEGELPKTI
SHLRKLEWFAVYINRFSGSIPSDFGKYSPNLTFVGFAWNSFSGELPPGLCSGFSLKLFLV
QFNDFTGPLPDCLRNCSALSRVRLDENQFTGNISNAFGVHPSLAVIYLSNNKFVGQLSPQ
WGECKNITDMRMEGNRISGQIPLELGQLTQLRYLTLSSNEFSGELPVSIGNLSLLFTLNL
SRNHLTGTIPHVLGKLTKLEHLDLSDNNFTGVLPVDPRMFESLTSLNISHNKLSGGIPEE
TGNLYLRYVLDLSSNSFSGSLPLNLAKLIMLEILNFSHNQLSGNIPSTYSRMVSLLGIDF
SYNNLTGPIPTGGIFQKKLPNNAFIGNSGLCGETEGLTSCTSGPKKSNKKILVGVLVPIC
GLLLMMTISAVILKFCKKSKLGEIDHPKVSKSFDSIIWGTHGKLTFSEIITATENFDEKY
LIGRGGFGSVYKAVLDRGRVVAVKKLNMSVDSSDDITELNRKSFENEIRTLTEVMHRNVI
KLYGFCSWKGCLYLVYEYAERGSLKMVLYAVEGEVDVLGWGTRVEIVQGIAHAISHLHND
CSHQIIHRDITLSNILLNRDFVPWLSDFGTARLLSSDSSNWTAVAGSYGYMAPELAFTMQ
VTDKCDVFSFGVVALEIMMGRHPGELLTSLSENGDMLLKDLLDQRLRSPSSQLAVRVVSL
LTMALACTSTNPDSRPTMHFVAKELSSARPRSCLSEPFSTVTINKLANFHN
NT seq
3576 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaggccacatcatcacaaagaatacaagctgaagctctcctaaaatggaagaacagc
tttacttcttcaccaccttctctgaattcatggtcgctcacaaacctaaaccacctatgc
aactggactgccattgtctgcgaccgcaataccaacacagtttctgaaatccaccttgca
aacttcaacatcactgcagcactaacacagttcaacttcgacaagtttcccgatctcacg
catatcaacctgaatggcaacaatttctcagggcctataccatctgccattggcaacctc
accaagctcacaaccttggatttgggaaacaataccttggaacgagaagtgcctgcagaa
atgggcaagttaacggagcttcagtttctaagtctctacaacaactatctcaatggtacc
attccctatcagctgaacaatctcaaaaaggtacaatatttgcttcttggaggtaaccac
ttagacactcctgactggtctaaattttcaggctttcctttgttgaggtaccttgatttt
tctgagaacaatttagattcagaattcccagaatttatatgtgaatgtaggaacttgacc
ttcctggatttgtctgaaaatcttttgactggccaaataccaaaattggtagttaccaac
ctggtcaagcttgaatctctcaatctgaccgacaaccgattccaaggaccattcccatat
aactttcccaaccttaagcacctttatttggaatcaaacaactttagtggtccatttcca
gaagatattggtttgatatctggtcttcaacttattagcctttttaacaattcccttgaa
ggcaaaatcccatcctctgtaggccaactgaaagagcttcagcacctcgatcttcgagag
aattccttgaactcttcaatcccttctgagcttggtctttgtaccaacctcacttacttg
gacttggctgtgaataaactcagtggggaactgcctatgtccttgtccaatctcaatagc
ttgagggagttgaagttatctgataatctatttactgggccaatcttgccttctctggtc
tccaattggactaagatgatctctttgcaactcaaaaacaacagcttcaatgggaatatt
ccaccagaaattggcctgttgacaaaacttgatatcctctggctgagcgaaaacaatttc
tctggatcaattccctcagagataggaaacttgaaagttttgaaatatttaggtctttgg
gaaaaccagctctcagggccgattcctatgaaattttggaacctcacaaatcttcagctc
cttgatataggagccaataacctctccggcccaattcccccagagattggaaacatgagt
tccttggttaactttgatgtcagcacaaaccaacttgaaggggagttgccgaaaactatt
tctcacctcagaaaactagagtggtttgccgtttacattaataggttttcggggagcatt
cccagtgatttcgggaagtatagtcctaacttgacatttgttggtttcgcatggaacagc
ttctctggagaattgccgccagggttgtgtagtggattttctttgaagcttttcttagtg
caattcaacgacttcacagggccgttacctgattgcttgagaaactgttctgcattatct
agagtcagacttgacgagaatcaattcaccggaaacattagcaatgcatttggtgttcat
cccagtcttgcagtaatttaccttagtaacaacaagtttgttggtcaactctcgccacag
tggggagaatgcaagaatatcactgatatgcggatggagggaaatagaatttctggtcaa
attccacttgaacttgggcaattgacacagttgcggtatctaactctaagctctaatgaa
ttcagtggggagttgccagtttctattgggaatctaagcttgttgttcactcttaatctc
agcaggaaccacttgacgggaactatccctcatgttctaggcaaattgactaagcttgag
caccttgatttgtctgataataattttacaggggtattaccagtcgaccctcggatgttt
gagagcttaacaagcttgaacataagccataacaaattatcaggtggaatacctgaggag
actggtaatctgtacctgcggtacgtgttggacctaagcagcaattcattctcgggatca
ctaccattaaaccttgccaagcttataatgctggagattcttaatttctcgcataaccaa
ctctccggaaacatcccatcaacatattccagaatggttagtcttctcggcattgatttt
tcttacaacaacttgacaggtccaatcccaaccggtggcattttccaaaagaagcttccg
aataatgctttcattggaaatagtggtttatgtggtgaaacagaggggctaacttcatgc
acttcgggtcccaaaaagtccaacaagaaaattcttgttggcgtccttgttcccatttgt
ggtttattgctgatgatgaccatatctgctgtaatccttaagttctgcaagaaatcaaag
cttggagaaatcgatcatcctaaggtgtctaaaagttttgattcaattatttggggaaca
catggtaaactgacattttctgaaatcatcactgccaccgagaactttgatgaaaagtac
ctcattggaagaggaggttttggaagtgtctacaaggctgtgttggacagaggcagagtc
gttgcagttaagaaattgaatatgtcagtagattctagtgacgacattacagaattgaat
cgcaagagttttgagaatgagataagaacattgacagaagtgatgcacagaaatgtaata
aaactttatggattctgttcctggaaggggtgcttgtacttggtgtatgaatatgcagag
agaggcagtttgaaaatggtattgtatgcagtggagggcgaagtagatgtacttggctgg
ggaacaagggtggaaattgtgcaaggaatagctcatgctatttctcacttgcataatgac
tgctctcaccaaatcattcaccgcgacataacgttgagcaacatattattaaatcgggat
ttcgtgccatggctatcagactttggaacagcaagactattgagctcagattcctcaaac
tggactgctgtagcggggtcttatggctacatggctccagagctcgcattcacaatgcaa
gtgacagataagtgtgatgtattcagctttggagtggtggcattagaaattatgatggga
aggcatccaggggagctactgacttctctatcggaaaatggagatatgcttttgaaagat
ttgctagaccaaagacttcggtctccttcaagtcaattagcagtgcgagtggtttccttg
ttaacaatggccttggcctgcaccagcactaatccggattcacgaccaaccatgcatttt
gtggcaaaagaactgtcatcagccaggccccggagttgcctttctgagccgttcagtacg
gtaaccatcaataaattggcaaattttcataactag
DBGET
integrated database retrieval system
