KEGG   Candidatus Rhabdochlamydia oedothoracis: RHABOEDO_001257
Entry
RHABOEDO_001257   CDS       T07398                                 
Name
(GenBank) Autotransporter beta-domain
Organism
rhaw  Candidatus Rhabdochlamydia oedothoracis
SSDB
Motif
Pfam: Autotransporter PATR
Other DBs
NCBI-ProteinID: QYF49007
LinkDB
Position
complement(1280022..1283885)
AA seq 1287 aa
MKNLGLFIFSSTIVFSALSWAGSFTVTNNLDDEVEGSLRKAIVDLNNSLDSSNTITINPG
LSPIILQTDLPFIASSVDITASGSTPQVIDGNNNQFCLFSTVPFTPSLSVSIENCTLKNG
GAIGGSGGDSAGGGGGGGLGAGGALFIGFNDVVTFNSNVELLNNKAQGGSGGNVMTSDAN
PLPVAGGGGGISCLPNKNAPNSSEQNQGNGGGFMPGKGASGGVSLSELNDAMGYGGGDGG
GGSSGNSPGPGGGSGSGASATGNGSVAGGYCGGGGGVGFSPAASFGIGGGGGNGGGNATD
TGPSTGGAGGGFGSGGAGGIGKIANSGGGGGGGGFGGGGGGGLTGGGGGGFGSGGGGGSS
GQMGKGGFFGGDGGDNTGAGGGGGALGGAVFVGERATLILLNPTTIQDNTTEIGKAGVKT
GTDGNPVETGAATPGKGYAKDIFLFKDAQLILDGESNWNANFAIEADPDAPEDYFDNGIL
KKNTGMITLSGVNSYRGGTHINGGFLIASQDSNLGDPSGGISFDGGTLKAQMSFSSARNV
SLLGLGTINVESNSTLTLSGIVSGDSSLIKSNSGNLILTGVNTYSGGTTIDQGILALSED
GTLVSEGAVTINNTGSFDISGITASSQTIGDLSGSGTIVLGTKTLIEGTSNNTSYAGVIS
GTGSFTKQGTGTLTLTGDNSYTGGITVNAGVLVGNTTSLQQGIENNSTVVFDQAETGTYS
GIISGSGILTKQGPGVVNFTNDSSGFSSGTVNINAGTLLVNNKLGGAFTVATNAILGGGG
TAIGNVTNNGSVQPGNSIGTLTIDGDYTQTDSGELVIEINEAGATDLLKVTGIATLDGAL
QVHPTPGTYSAGTIYTFLTAGTDPTDPTVNGEFSSNSSTYPVDYTINYLSNEVQLLILTD
SLIIPPIVIPPIVIRASRPKGNAGAVEDYLFCSSFDFAETDIDTVAKALLVLPTDQYIKA
LNRLTPSQFGALALNELENNFSVVNTFFLSGENQRGGCYENDCEPTDIWFNPLGFVYSQD
SRPEIGHEAIGFTNQTYGFTIGIDHLFTDNWSLGAGIGYSQSQLDWKQQAGKACASSGYL
GPCLKYNSENFYFDFLVLGTGSFYDVHRKIKFPGISRNADSTPTIWNISESILAGFRLER
YCNFFLQPEILLDQLNIFQEAFKENKANSINLSVKRKYASFLRFLINMKLAKKWLYCNMC
LVPSVNVGWLRTTPLSGRHYTASFREGTFCKSDFSVTSFHQITDQILLGAQFSVSSQNGF
SISLGYDGKFGNGSKINQVNMALDWKF
NT seq 3864 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaaatttgggtctatttattttttctagtacgattgtcttttcagcattatcctgg
gcaggttcatttaccgttacaaataacctagatgatgaagtggagggaagccttcggaaa
gctatcgtagaccttaataactcacttgattcatcaaacacgataactattaacccgggc
ctttctcccattattcttcaaactgatttaccctttatcgcaagctcagtagatattacc
gcttctgggtctacccctcaagttatcgacggaaataacaatcaattctgcttattcagt
acggttccttttacaccttccttatcagtatccattgaaaattgtaccctaaaaaatgga
ggtgctattggaggttctggaggagactctgcaggaggaggtggaggaggaggattaggg
gctggaggagctctttttatcggttttaatgatgttgttacattcaattcaaatgtagag
cttttaaataacaaggcgcaaggcggttctggaggaaatgtgatgaccagcgatgcaaat
ccgttaccagttgcgggtggaggaggtggaatcagttgtcttccaaataaaaacgcgccc
aactcgtccgaacaaaatcaagggaacggaggaggctttatgcctggaaaaggagcatct
ggaggagtttcactttcggaattaaatgatgcaatgggatatggtggcggtgacggtggc
ggtggctcttcgggtaattctcctggtcctggtggcgggtcaggctctggggcatcagca
actggaaatggctcggttgcaggaggatactgtggtggcggcggtggtgttggttttagc
ccagcagcctcctttggcattggcggtggtggtggaaacggtggtggaaatgctacagat
actggtccatcaacaggaggagcaggaggaggttttggaagtggtggtgctggtggcatc
ggaaaaatcgcaaattctggaggaggaggaggaggaggaggttttggcggcggcggcggc
ggtggactaaccggaggaggaggaggaggttttggcagcggcggcggcggcggtagctca
gggcaaatgggaaaaggaggtttttttggaggagatggaggagataataccggagcagga
ggaggaggaggagcattaggaggcgcggtttttgtaggcgaaagagctactctcatttta
cttaatccaaccaccatacaggacaatactactgaaataggtaaagccggagttaaaact
ggtacagatgggaatcctgttgaaactggggcagcaactcctggtaaaggatacgcaaag
gatatatttttatttaaagacgcccagctcattttagatggagaaagcaactggaatgca
aattttgctattgaagctgatccagatgcacctgaagattattttgataatgggattctt
aaaaagaatacaggaatgatcaccttatctggagtaaatagttacagaggaggaacgcat
attaatggaggtttcctaattgcttcacaggatagtaacttaggagatccatctggtggg
attagttttgacggaggaacccttaaagcacaaatgtccttttcttctgctcgaaacgtt
agccttttaggactaggaactatcaatgtagaatctaattctactttaaccctttcaggc
atcgtttctggtgattctagcctaattaaatccaatagtggaaatctgatcttgaccgga
gttaacacctatagtgggggaactacaattgatcaggggatcttagccctttccgaagat
ggaacgcttgtttctgaaggagctgttactattaataacacaggcagctttgatattagt
ggtatcacagcttcatcacaaaccatcggcgatctaagtggtagcggaactatagtttta
ggaacaaagactctgatcgaaggaacctctaataataccagttacgcaggagtgattagc
ggaacaggatcttttaccaaacaaggaactggaacgcttaccttaaccggagacaacagc
tacacaggaggaataacggtaaatgctggtgtattagtaggaaacacgacgagcttacaa
cagggtattgaaaacaatagtacagttgtgtttgatcaagcggaaacaggaacctattct
ggcattatttcaggatccgggattttaactaaacaaggacctggagtggtaaattttact
aatgattcgtcaggcttttcttcagggactgttaatattaatgcaggaactcttctggtg
aataataagttaggaggtgcgtttaccgtagctactaatgccatacttggggggggtgga
acagcgatcggcaatgtaactaataacggtagtgtgcaacctggtaattctattggtaca
ctaaccatagatggagattatacgcaaacggattctggagagcttgtcatagaaatcaat
gaagcaggagcaacagatctacttaaggttacaggaattgccacattggatggagcctta
caagtacatcctacccctgggacttattcagcggggacaatctatacttttcttaccgca
ggtacagatcctacagatcctaccgttaatggggaatttagcagtaattccagcacttac
cctgttgattataccatcaattatctttctaatgaggtgcaactccttattcttaccgat
tctttaattattcctcctatagttattcctcctatagttattcgtgctagtaggccaaag
ggtaacgcgggtgctgtagaggattatctattttgctcttcttttgattttgctgaaact
gatattgacacagttgcaaaagctctacttgttcttcccacagatcagtatataaaagct
ttaaatagattaaccccttctcaattcggagcgcttgccttaaacgaattagaaaacaat
tttagtgtagtaaataccttctttttatcaggagaaaaccaaagaggcggttgctatgaa
aatgattgtgaacctacagacatttggtttaacccgttaggatttgtttattcacaagat
agtcgtcctgagattggtcacgaagcaattggttttacaaatcaaacctatggatttact
attgggatagatcatttgtttactgataactggagtttaggcgctggtattggttattct
cagtctcagctagactggaaacaacaagcaggaaaagcctgtgcaagttcaggatatcta
ggtccttgtttaaaatataattctgagaatttttattttgactttcttgttttaggaaca
ggaagtttttatgatgtgcatcgaaaaattaaatttccagggatatctcgcaatgcagac
agcactcctacaatttggaacatttcagaaagcatattagcgggttttagattagagcgt
tactgtaatttctttcttcaaccagagattttattagatcaattgaatatttttcaagaa
gcgtttaaagaaaacaaagccaattctataaacttgtctgtaaaaagaaaatatgcttca
tttttacgttttctaattaatatgaaacttgccaaaaaatggctctattgcaatatgtgt
ttagtacccagcgttaacgtgggttggttaagaacaacacccctttcaggaagacattac
actgctagttttcgagaaggtacattttgtaaatcagatttttcagttactagttttcat
caaataaccgatcaaattctccttggagcacagttttctgtttcttctcaaaacggtttt
agcatttctttaggttatgatggaaaatttggaaatggttcaaagattaatcaagtaaac
atggcactggattggaagttttaa

DBGET integrated database retrieval system