Rivularia sp. PCC 7116: Riv7116_4477
Help
Entry
Riv7116_4477 CDS
T02364
Name
(GenBank) cation/multidrug efflux pump
Organism
riv
Rivularia sp. PCC 7116
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
MMPL
Patched
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY56898
UniProt:
K9RHG4
LinkDB
All DBs
Position
5610510..5613866
Genome browser
AA seq
1118 aa
AA seq
DB search
MSLIKTAVRWRHGTFVLFCILALFGVLSLLSLPLELRPGGDRPEITISTSYSGASPREVE
ELITRPIEERLEEVQGIQEVTSSSASGISTINLEFNWDSDIDRRLVDVLNKLQQVEALPP
EAGESDVEIVSGSSSPMMWTILVAKEGFTPNDEHYRDLVDDVIVPRFRQVQGVGQFLVSG
GREREVEVVVDPKALADRNLTIGDVVNALRSNNRDIRGGPLVLGRREYRVRTVSRSTDVK
QLEDFVLRRDESGTVYLRDVAKAQMGRKIQDRALIRDNKPAVAVGIVRQPNANVPEISQG
IRQALVDLEKRFDREGEGITFDIPYDENDYINQSISFVQGNLMMGAVLAALILLLFLGSL
RTVAVIAITIPTTLITVFIVFAALGRSLNVISLASLAFAVGMVVDNAIVVLENVFTHMQM
GKSPVKAAIEGTEEVGGAMLASTLTTIAVFAPIVLVQGEAGQLFFDIGIGLSASVLFSLF
AALTLVPMLSGLFLNQAEAQRILQGMGNNGAGSREQGTGGERRNNQQIDSLLIASDQIIP
NPTNTSPRSKGHPSPYQGEGKGVRFFRNGFLAIQNLITKVSQIFLFFQRRFENFLLATVS
WSIGVGRKGRRLIVLAIPVTLLFISFQLLPPADYLPEGNRNLILWLAQPFPGTSIPEAIK
LSQGPRDFVSEQPEIMRSLYVHRNGLRAIAAFVEPEQATGNKLDEIVDRFRKQGGNFPGY
RFLVPRRVSIFRDPGKEFEVNIVGQDLEQLNQLQQQVMQQLRGLEGVQNARSNFVTGAPE
LQVIPNRVRLAEVGLSEAELGAVVEAALGGLRASEFTDGKRELDVTVELQNTSVETPEQL
RQLPLNIGNGRQVQLSDVAQVVEATGPDAINHVDLERSITLTVNVSREAPLGELIEQTEQ
QILEPLRETLPTGFRAELAGSADVLSETLMQLGSTFVLSLLITYLLLVALYRSFSFPVLI
MATVPMGISGALLSLILANTIPGVVVPLDMITGLGFVILTGVVVNNAILLVDRSLQLQQE
GKSYNDSLYLAVKDRLRPIFMSAGTSVLGMLPLAVIPGKGAELYQGLGIVLTGGLAFSTI
LTPTVVPALMGLLRDFSGNKEIGTKQLQGVDEVEVTNV
NT seq
3357 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtttaattaaaactgccgtccgttggcgacatggaacttttgttttattctgtatt
ttggcactattcggtgttttatctttattaagtctgcctttggaattgcgccctggtggc
gatcgcccggaaattacaattagtactagttattctggtgctagccctagggaagttgag
gagttaattactcgtccaatagaggaaaggttggaagaagtacaaggaatccaggaagtt
actagtagtagtgcttctggtattagtactatcaatttagaatttaattgggatagcgat
atagatagacggttagtggatgttttgaataaactccagcaagttgaagcattaccaccg
gaagctggggaatctgatgtagaaattgtcagcggtagcagtagtccgatgatgtggacg
atactggttgcgaaagaaggttttacgccgaatgacgaacattatcgggatttggttgat
gatgtcattgtaccaagattccgtcaagtgcaaggtgtggggcaatttctggtttctggt
ggtagggaaagggaagtagaagttgttgtcgatcctaaagctttagccgaccgcaatctt
actattggtgatgtagtcaatgcgctgcgtagtaataaccgagatattcgcggtggtccc
ttagtgttgggaagaagggaatatcgagttagaactgtgagtcgttcgacggatgtgaag
caattagaagattttgtgctgcgtcgggatgaatcgggaacggtttatttacgagatgtt
gctaaagctcaaatggggagaaaaattcaagatagggctttaattagagataataaaccg
gcggttgcggtgggaattgttcgtcagccaaatgccaacgtaccggaaatatctcaaggc
attcggcaagcattagtagatttagaaaagcggtttgatagggaaggggaaggtattact
tttgatattccctatgatgaaaatgactatatcaatcaatcgatttcttttgtgcaaggg
aatttgatgatgggtgctgtgttagcagcgttaattttattactatttcttggctcttta
cggacggttgctgttattgcaatcacgattcctacaactttaattacagtatttattgta
tttgcagctttaggacgttctttaaatgtaattagtttagctagtttggcattcgctgtg
gggatggtggttgataatgccatcgtggtgttggaaaatgtgtttactcatatgcaaatg
ggtaaatcaccagttaaagcagctatcgaaggtaccgaagaagttggtggtgcaatgttg
gcttccactttgacaactattgcagtatttgcgccaattgtattagttcagggagaagcg
ggacaattattttttgatattggtattggactttccgcatcggtattattttctttattt
gcagcattaactttagttccgatgctctccgggttatttctcaaccaagcagaagcacaa
cggatattgcaaggaatgggaaataatggagcagggagcagggagcagggaacaggggga
gaaagaaggaataatcaacaaattgattctttactaattgcttccgatcaaatcatccca
aatccaacaaatacctcaccacgctctaagggacacccctctccttaccaaggagaggga
aagggggtgaggtttttccggaatgggtttttagcgatccaaaatctaataaccaaagtc
tcccaaatattccttttcttccaacgtcgatttgaaaattttctccttgctacggtaagt
tggtcaataggagtcggacgtaaaggtagacgtttgatagtattagcaattcccgttacc
ttactatttatcagttttcaactcctacccccagcagattacctccccgaaggcaaccgc
aacttgatattatggctagcacaaccattccccggaactagcatacccgaagccattaaa
ctttcccaaggacctagagatttcgtcagcgagcaaccggaaatcatgcggagtctttac
gttcatcgtaatggcttaagagcgatcgccgcttttgtcgaaccagagcaagcaactggt
aacaagcttgatgaaattgttgatagatttaggaagcaggggggtaactttcccggatat
cgttttctagtaccccgacgagtatcaatttttcgcgatccaggtaaagaatttgaagtt
aatattgtcggacaagatttagaacagttaaatcaattgcagcagcaagtaatgcagcaa
ttacgaggattagaaggagtacaaaacgcccgctctaactttgtcaccggagcgccagaa
ttacaagttatccccaatcgagttaggttagcagaagtcggattatcggaagctgaattg
ggtgcagttgtcgaagcagccttgggaggtttgcgggcttccgaatttaccgatgggaaa
cgggaacttgatgtcaccgtggagttgcaaaatacatcagtagaaacaccagaacaacta
cggcaattaccgttaaatattggtaacggcagacaagtacagcttagcgacgttgcccaa
gttgtggaagccaccgggccagatgcaattaatcatgtagacttagaacgttcgataact
ctcaccgtcaacgtttctagagaagcacctttgggtgaattgatcgagcaaacagaacag
caaattttagaacccttacgcgaaactttaccaacgggtttccgtgccgaattagcaggc
tctgccgatgtgctatcggaaacattaatgcaattgggttcaacttttgttttgtcttta
ttaattacctatttactacttgttgccttatatcgctcctttagtttcccggttttgatt
atggcgacggtacccatgggaatatcgggagcattgttgagtttaattctggcaaatacc
attcccggcgtagtagttcccttggatatgattaccggattgggatttgtaattttgact
ggagttgtggtgaataatgccatcctacttgtagataggtcattacaattacagcaagaa
ggtaaaagctataatgactccttgtatttagcagtaaaagacagattgcgtccaattttc
atgtcagcaggaaccagtgtcttgggaatgttaccattagccgtgataccggggaaaggt
gcagaactttatcaaggattgggaattgtgttgacgggaggtttggcattttccacgatt
cttacacctacagtagtacctgcattgatgggattgttacgagacttttccggtaacaag
gaaattggaacaaaacagttgcagggagtcgatgaagtagaagttacaaacgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
