Rivularia sp. PCC 7116: Riv7116_5215
Help
Entry
Riv7116_5215 CDS
T02364
Name
(GenBank) tetratricopeptide repeat protein
Organism
riv
Rivularia sp. PCC 7116
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPR_1
TPR_2
TPR_11
TPR_8
TPR_17
TPR_16
TPR_19
TPR_14
TPR_12
TPR_6
TPR_9
PPTA
ANAPC3
TPR_10
TPR_7
BTAD
SF-assemblin
PknG_TPR
Ribosomal_S6
Baculo_PEP_C
TPR-S
Peptidase_M56
Alkyl_sulf_dimr
Wzy_C_2
Apolipoprotein
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY57610
UniProt:
K9RI26
LinkDB
All DBs
Position
complement(6557613..6560492)
Genome browser
AA seq
959 aa
AA seq
DB search
MKGFNSKVFAWVSFGNIMLSTLLLSVGVEAAKPTNNYIVAQASTEQQIERLEQQQQNTNQ
YIEQTTFLFSLFLATLVVLMIGVIISIFLLRRAVFREVTNLVTARFKELGDLEAKIASAN
KKVQKLIEEAEGTVDELNQEAKVLSEDIGSKQEGLSVLVSDLSASKQQALSEIESQIAVF
REALNKLDTEFTGKLSEVQANAQQQGNAIIQNLERLSGEFVPQMQGLQSDVLQQKDDVVE
NLKQSQVDFIGELKELQSVAEQQRDLILVSLQSLSAEFKPKLNVLEADLQQHKDLTVQNI
KQSQADFTTELQQLQSATQAQQQQILQNLQQQEANFAPQLSAILTHVQSQKDAIIENLKL
SENQFASTVSQLHTDLQTQKDGTLQRFAGTESEFSNQLSQLQQDAQKQRDAILQSLQKLE
TDFAPRLDDIETDAREKAGQYRDETLQNLEKLRSEISVELKQAQNLIEQQVNSTQNNIVN
LETSVAAKLQESQSGIQEQRQETLQSLSQLETDLTAKFALLQSEVQVRKDSAYELLQNLE
KEANNKISTSTNGIESQQNQTLESLQKLEKTAQEQLAALQSEITARKDSSLDKLDKLEST
LSEQLKLVQSDAETEKQQILQKLSEITPSEIASSAVSEILQKLEKVVEPVEKLQSNHPQL
FVNVDEFVTQGDELFASGDYQAAIDAYNKALEVQPENEKVWYQLGLSLWELQQYEDAIQC
FDKVLEINPQDADSWYHRGLALMELKRYEGAISAFGKVVKKQPDNEKLWFVLGMSLGRIK
RYEDAIAGFDRALKIKPDYYQAWVDKGVILGKLQRHEDAFQAFDKAVEVEPTNATAWMNR
GMALEMLERYDDAVVSFDKAITLHPTPKAYDKRGYVLIELERDEESLTSFDKALEIDENY
ASAYYNKAIAYSYQGKVDEAVETLQKAIALNEKYKEDAVNDPDFEAIAEDDKFKELVNG
NT seq
2880 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaaggctttaattcaaaggtatttgcttgggtttcgttcggcaatataatgttatca
acccttttgttgtctgttggggtagaggctgcgaaacctactaataattatattgttgct
caagcgtcaacggagcagcaaattgaacggttggagcaacagcagcaaaatactaatcaa
tatattgaacaaactacttttctcttcagtttatttctcgctaccttagtcgtattaatg
attggggtgattatttctatatttttgttaagacgtgcggtgtttcgggaagttacaaat
ttagtaactgcacgttttaaggagttgggtgatttagaagctaaaattgctagtgctaat
aaaaaggtacaaaaactcattgaagaagcggaaggtactgttgatgagttgaaccaagaa
gctaaggttttaagtgaagatattggtagcaagcaagaaggtttatcagttttagtttcc
gatttatctgcgtcgaagcaacaagctttgtcggaaattgaatcgcagattgctgtattt
agggaagctttgaataagttggatacggaatttactggtaagctatcggaagttcaagct
aatgctcagcaacaaggtaatgcgataattcaaaatttggaaaggttgagtggtgagttt
gttccccaaatgcaggggttgcagtcggatgttttgcagcagaaggatgatgtggttgaa
aatctcaagcagtcgcaggttgattttatcggcgagttaaaggaacttcaatcggttgcg
gagcagcagcgagatttaattttagtttccttgcaaagcctttctgcggagtttaaacct
aaattaaatgttctggaagcggatttacagcaacataaggatttaacagtacaaaatatc
aaacaatcgcaagccgattttacaaccgagttgcagcagctacaatcggcgactcaagcc
cagcaacagcaaattttacagaatttacagcagcaagaagcgaattttgctcctcaactg
tcggcgattttgactcacgtacaaagtcagaaggatgcgattatcgagaatttaaaactt
tccgaaaatcagtttgcttctacggtttctcaactacataccgatttacaaacccaaaaa
gacggtactttacaaagatttgccggtaccgaatccgaattcagcaatcaattatctcag
cttcagcaagatgctcaaaaacagcgagatgctattttacagagtttacaaaaattagaa
accgattttgctccgcgacttgatgatattgaaaccgatgccagagaaaaagctggacaa
tatagggatgaaacgctacaaaatctcgaaaaattgcgttcggaaattagtgttgaattg
aaacaagcgcaaaacttgattgagcagcaagttaattcaactcaaaataatatagttaat
ttagaaacttccgttgctgcaaaacttcaagaatcacaatcgggaattcaagagcaaagg
caagaaaccctacaaagtttatcgcagttggaaactgatttaaccgcaaaatttgctctt
ttacaatctgaagtacaagtgcgtaaggattccgcttacgaattattgcagaatttagaa
aaagaagccaacaacaaaatttcaacttctaccaacggcatcgaatctcagcaaaatcaa
actttagaaagcttgcaaaaattagaaaaaaccgctcaggaacaacttgctgctttacaa
tcggaaattaccgctcgtaaagattctagtttagataaattggataaattggaatccacc
ttaagcgaacaattaaagttagtgcaatcggatgcagaaactgagaagcagcagatacta
caaaaactatccgaaattacacccagcgaaatagcctcctctgccgtgagcgaaatcttg
caaaagcttgaaaaggtagtagaaccggtagaaaaattacaatcaaatcatccccaatta
tttgtcaatgtcgatgaatttgttactcaaggtgacgagttatttgcaagcggagattat
caagcagccatcgacgcttataataaagccttggaagtacagccagaaaacgaaaaagtt
tggtatcagttaggtttaagtttatgggaattgcagcaatacgaagatgcgattcagtgt
tttgacaaagtattggaaattaatccccaagatgccgatagctggtaccatcgcggttta
gccttgatggaattgaagcgttatgaaggtgcaatttccgcttttggtaaagtcgtgaaa
aagcagccagataacgaaaagctgtggtttgtcttgggaatgagcttgggaagaatcaag
cgttacgaagacgcgatcgcaggttttgatcgagcgttgaaaattaagcccgattattat
caagcttgggttgataaaggtgtaatcttaggtaaattgcagcgtcatgaagatgcattt
caagcctttgataaagccgtagaagttgagccaactaatgcaaccgcttggatgaatcgc
ggcatggcgttagaaatgttggagcgttacgatgatgcagtagtttcctttgataaagcc
attaccttgcatcccactcctaaagcttatgataagcggggttatgttttaattgaatta
gaaagagatgaagaatcattaactagcttcgataaagccttggaaattgacgagaattat
gctagcgcttattacaacaaagccattgcttatagttatcaaggaaaagttgatgaagcg
gtagaaactctgcaaaaagcaattgcattaaacgagaagtacaaagaagatgctgtaaat
gacccagattttgaagcgattgcagaagatgataaatttaaggaattggtgaatgggtaa
DBGET
integrated database retrieval system
