Rivularia sp. PCC 7116: Riv7116_5696
Help
Entry
Riv7116_5696 CDS
T02364
Name
(GenBank) CHRD domain-containing protein
Organism
riv
Rivularia sp. PCC 7116
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CHRD
DUF4114
Spond_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFY58063
UniProt:
K9RKQ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(7171534..7173996)
Genome browser
AA seq
820 aa
AA seq
DB search
MARKEITVTIENLAPQQGTFLTPFWVGFHNGNFDTYDRGRPASPGLESLAEDGSTTLISQ
EFLQSGDGTVDGRILGPEGDAAGPIDPGEVATATFTLDSDDLNSQFFSYASMILPSNDAF
VANGNPEAIQIFDEEGNFIGADFIIAGKQVLDAGTEVNDEAENSTAFFGQSSPDTGIDQN
GVVQLHPGFVTGGRILSEDGSSPLALTAFTNGDFTSPDYQVARITISTEDKPLPIADPVR
ITSNLDGSQEVTAGDSDAQGTSVLTLNDTGDSLEYSLTVSGLDFGANGLVAGGAQTPDDT
SDDVTRLHIHNASRGENGGVVFSLFDTVAPELGNQLNIQGNQDEDLNVTLNENGSVTLAG
IWEETDSANDDLSELVAEIRDTQESEDLDLYFNVHTEEFPGGAIRGQLVVGDENNNTPPA
PDLVEVTVTVENLAPDNGTLLTPLWVGFHDGTFDTYDSGRPASAGLESLAEDGNTSLISR
EFISSGAGLVDGTITAPGGATPGPIDIGETTSLTFTVDRSLASSRFLNYAAMLLPSNDAF
IANGNPEAFEIFDQNGNFLGADFVVRGNQVLDAGTEVNDEAEDSTAFFGQSTPNTGTDEN
GVVELHQGFQADGRILSEPRFANADFTADGYEVARITVTTNDLPQTPLGAAFQDNGQGEA
LLDFRSIGNQQVTANLLEVTSEAAFNNLVGFYIIEDTQGTVLDEFGNALSPGDEGYAEAA
VARRAFELNRNTTEAQQFAGGELLAPFIIANGTAEEFLSQNPSNQGGDDPLAYFSFLGAN
PDGVEHIRLVDNNTFGFEDLFGGGDNDFDDLFFRAEFEVA
NT seq
2463 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcacgtaaagagataacagtcactattgaaaatctcgcaccacagcaaggaactttc
cttactcctttttgggttggtttccacaacggcaatttcgatacatatgaccggggcaga
cctgcatctccaggtttggaaagtcttgccgaagatggtagtacgactttaatttctcaa
gagtttcttcaaagtggggatggtacggttgatggtaggattctaggtcctgaaggagat
gcagcaggtccaattgaccctggtgaagttgcgactgctacttttactctggacagcgat
gacttaaatagccagtttttttcctatgcttcaatgattcttccttccaatgatgcattt
gtcgctaacggaaatcctgaagcgattcagatttttgatgaagagggaaattttattgga
gcagactttattattgcgggtaagcaggtattagatgctggtacggaagttaacgatgaa
gcagaaaatagtactgctttttttggtcaaagtagccctgatactgggattgaccaaaat
ggagtcgtacagctacaccctggctttgtgactggtggaagaattttgagcgaagacggg
agttctcccttagctcttacagcttttactaatggcgattttacctctccagattatcag
gttgctcgtattactatctctaccgaagacaagccccttccaattgcagatccagttaga
attacttccaatttagatggttctcaagaagttaccgctggggattcagatgctcaagga
acttctgttctcactcttaatgacactggagatagtctagagtatagtttgaccgtctct
gggttagattttggagccaatggtttagtcgcaggtggagcgcaaactcctgacgatacc
agcgatgatgttactagacttcacattcacaacgcatcacggggagaaaatggaggagtt
gtctttagtttatttgataccgttgctccagaacttggtaatcagctaaacatccaagga
aatcaagacgaagatttaaatgtaactctcaacgaaaatggttcggtcactttagcgggg
atttgggaagagacggattctgctaatgatgatttaagtgaattagtcgctgaaattcgc
gatactcaagaaagcgaagatttagatttatactttaacgttcatactgaagaatttcct
ggtggtgcaattcgcggtcagctagttgttggtgatgaaaataacaatacacctccagca
cccgatttagtggaagtgactgtaactgttgaaaacctagctcccgataatggaacattg
ttaacaccgttatgggttggttttcatgatgggacttttgatacttatgacagtggtaga
cccgcatctgctggtttggaaagcttagcagaagatggaaataccagtcttatttctcgc
gagtttattagtagcggtgctggtttagtagatggcacaattaccgctcctggaggagca
acaccaggtccaattgatatcggtgaaactaccagtcttacttttactgtagaccgttct
ttagcaagcagccgttttcttaattatgctgcgatgcttcttccgtctaacgatgctttt
attgccaatgggaatcctgaagcattcgagatttttgatcaaaatggtaatttcttgggc
gctgattttgttgtcagaggaaatcaagttttagatgcaggaaccgaagtcaatgacgaa
gcagaagacagtactgcgttttttggtcaaagtaccccaaatactggaactgacgaaaat
ggtgtagttgaacttcatcaaggttttcaagcagacggacgaattttaagcgaacccaga
tttgcgaatgctgattttactgctgatggttatgaagttgcccggattacggttacaact
aacgatctaccacagactcctctaggtgctgcttttcaagataacgggcagggagaagcg
ctgcttgactttagatcgataggtaatcaacaagtaacggctaatttattagaagttacc
agcgaagcagcttttaataatctagttggtttctacattattgaagatactcagggaacc
gtgttggatgagtttggtaacgctttaagccccggtgatgaaggttatgctgaagctgct
gtcgcaagaagagcttttgaattaaatcgtaacaccaccgaagctcaacagtttgccgga
ggagaattattagctccgtttattatcgccaatggaacagcagaagaatttctgtctcaa
aaccccagcaatcaaggaggagacgatccacttgcttacttttcattcctgggagcaaac
cccgatggagtagagcatattcgcttagtagataacaatactttcggttttgaagattta
tttggtggcggcgataatgacttcgatgatttatttttccgagctgaatttgaagttgct
taa
DBGET
integrated database retrieval system