KEGG   Candidatus Ruthia magnifica (Calyptogena magnifica): Rmag_0255
Entry
Rmag_0255         CDS       T00438                                 
Name
(GenBank) ABC transporter related protein
  KO
K12541  ATP-binding cassette, subfamily C, bacterial LapB
Organism
rma  Candidatus Ruthia magnifica (Calyptogena magnifica)
Pathway
rma02010  ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rma00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09131 Membrane transport
   02010 ABC transporters
    Rmag_0255
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rma02000]
    Rmag_0255
   02044 Secretion system [BR:rma02044]
    Rmag_0255
Transporters [BR:rma02000]
 ABC transporters, eukaryotic type
  ABCC (CFTR/MRP) subfamily
   ABCC-BAC subgroup
    Rmag_0255
Secretion system [BR:rma02044]
 Type I secretion system
  Adhesin protein transporter
   Rmag_0255
SSDB
Motif
Pfam: ABC_tran ABC_membrane SMC_N AAA_18 Oxidored_q4
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABL02037
UniProt: A1AVT0
LinkDB
Position
278611..280689
AA seq 692 aa
MEQSLLFSLQRLSKLQRSRFNALELQQIIEDECNSSIEKLVMLHNVCHALLIPNPKALKS
INDPSLLPLLIFDEFQQWGILKSFNAKGEWVAEWFSKEKNSWLEVILYDLSKYNIFAIKM
KKKFDIGNGRIFKIVKTELITHKKWLIDASLAGVLINIVAVVSAFYSMQIYDRVVPTGAQ
QTLLVLTIGVLAITVLDFIAKLVRAGLYEKLIDNIDRRLSRDIYKRFLALRMDQLPKSVG
SLASQMRGYESVRSFLSTITTYLVVDVPFVLFYVLLIATIGGYLALLPMIFFVIATLTGL
YFHKKIETLADNINESVNLRVGLLVESVEGAETIKSGQGGWRMLSNWMNVTDEGRSYDLE
MKRMTDQSQYMVAFFQQSSFVLMVASGALLIGGGDLTMGGLIACSILSGRILAPVAQIPS
HLVQWANTKSAIRSLDMILDLKCDHDGIDSPIVFENLRGEFYIEAKTQINYGEKVALALP
EMRINPGEKIGVLGPIGSGKTSLLRLLSGMYKPNVGRILLDDIDLAHISKPILAEKIGFL
QQEGRLFKGTLRENLILGLVDPDDDKILKVSKLTGLLDSVISTTEKGLEQEIFEGGLGLS
GGQKQLLNLTRVVLRAPKIWLLDEPTASVDRNLEVLLINMFKKIIKVEDTLVLVTHKIEM
IELVDRLIVVNKNQIVMDGPKADVIAQLSGKT
NT seq 2079 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagcaaagtttattattcagtttgcagcgtttatcgaagttgcaaaggtctcgtttt
aatgcattagaattacaacagattattgaggatgaatgtaatagttcaattgaaaaattg
gtaatgttgcataatgtatgccatgcattattaattcctaatcctaaagcattaaaatct
attaatgacccctctttattgcctttattgatttttgatgaatttcaacaatggggtatt
cttaaaagttttaatgctaaaggagaatgggtagcagaatggttctctaaagagaaaaat
tcctggttagaggtaatactttatgatttgagtaagtataatatttttgccataaaaatg
aaaaaaaagttcgatataggtaatggtcgaatttttaaaatagttaaaaccgaattaatt
actcataaaaaatggttgattgatgcttctttagcaggagtgttgattaatattgtggct
gtggttagcgctttttattctatgcagatttatgaccgtgttgtgccaacaggtgctcaa
caaactttattggtgctgacaataggcgtattagcaataacggtgttagattttattgct
aagttagtgcgtgcagggttgtacgaaaagttaattgacaatatagatagacgtttatct
agagatatatacaaacggtttttggcattacgcatggatcaattgccaaaaagtgtgggt
agtttggcttcgcaaatgcgaggttatgagtcagtacgtagttttttatctactattacg
acttatctggtggttgacgttccatttgtgctgttctatgttttattaatcgctactatt
ggtggttatttagctttgctgcctatgatattttttgttatagcaactttaacaggatta
tattttcataagaaaatagaaacattagcagataatattaatgaatctgttaatcttaga
gtgggtttattagtggagtcagttgaaggtgctgaaacgattaaatctggtcaaggtggt
tggcgcatgctttctaattggatgaacgtcactgacgaaggtcgtagttatgatttagag
atgaagcgaatgactgaccagtctcagtatatggtggcattttttcaacaatcttcgttt
gtgttgatggtagcgtcaggtgcattattgattggtggtggtgatttgaccatgggtgga
ttaattgcttgttctattttatcaggtcgaattttggcgcctgttgcacaaattccatct
cacctagttcaatgggcaaacactaagtcagcaattagatcactagatatgattttggat
ttaaaatgtgaccatgatggtatagactcgcctattgtgtttgaaaatctacgtggtgaa
ttctatattgaagcgaaaacacaaataaattatggcgaaaaggtggctttagccttgcca
gaaatgagaatcaacccgggtgaaaaaattggtgttttaggacctattggctctggaaaa
acatcattattacgcctattaagtggtatgtacaagcctaatgttggtcgaattttgtta
gacgacattgatttggcccatatttcaaaacctattttagctgaaaaaattggtttttta
caacaagaagggcgactattcaaaggcacacttagagaaaatttaattttaggtctggtc
gatccagatgatgataaaattttgaaggtatctaaattaacaggcttattagatagtgtt
atctctactactgaaaaagggctagagcaagaaatatttgaaggtggattaggcttgtct
ggtggacaaaagcaattacttaatttaactagggtagttttgcgagcgccaaaaatatgg
ttattagatgagccaactgcatctgttgatcgtaacttagaagtattgttaatcaacatg
tttaaaaaaataataaaggtagaagatacgttggtattggtaacgcataaaattgaaatg
atagaattagttgaccgtttaattgttgttaataaaaatcaaatagtgatggatggacca
aaggctgatgtaattgctcaactttctggcaaaacataa

DBGET integrated database retrieval system