Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid): 113555089
Help
Entry
113555089 CDS
T06065
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1 isoform X1
Organism
rmd
Rhopalosiphum maidis (corn leaf aphid)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
Ank_2
Ank
Ank_4
Ank_3
LRR_8
Ank_5
LRR_4
COR
Roc
LRR_1
Ras
Arf
GTP_EFTU
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
113555089
NCBI-ProteinID:
XP_026815223
LinkDB
All DBs
Position
4:complement(26148487..26163789)
Genome browser
AA seq
2483 aa
AA seq
DB search
MAEDEDFPGRLLHQVALWDNVDFLTDLLKDDEHKKFINSRDSWGRTALHAACSNEGSGCL
EILLNAGALVDTPCGPRGECRTALHISAHIGCPKNIQTLLNHNANLILQDSNGFTALDIA
LNAENTSCSKLLKDASDSWEESQSTIHMALRDAICRGDVSTTKTILSELGSKEEFIVNMA
PNGTTTLLYCACEVGKKDLVKMLLDHKADGRIHPITRYSPLYVVAFKGKKDVFEILLKKF
PDLIRQTTVEKWLPIHAACINGNIQVLELLLKYPYPPNVLVKLRKDNWEFDVPFDINTKD
VNGQTVLYLACLLGNTKIVDILLKYQVKAVKICGSDGISVKDDNNDMSKRSRISEGIQSI
VSRLRGSMTKEIDLNEKNLKPVEVNVYCNEEAPETALHAAVRNGFKDVVIALLENGADPN
LLTLQPSADYKQKDDDIREAGTSPLTLACSKGDTAIVELLLKYGARDDDCKALAAAMLTK
NQHLITTLLGTKAFADPEHKINKKAMTDNIASQFGGLSSLTYSNIFPSTPVMINWHSQRC
KLESIKSQWLIDGALHINPKLKMNPRSREIVLFAITRLDISNNSLTQVPTIIFQLQSLRY
LNLAQNKIEKLPDPKDSHQVTSPTSKKMSKLYKSIYTANVLEELYLQDNRLDKIPEELFR
LPSLTTLDLSNNKLHSVPFQMWRAPKLKDLNMAFNLIKELPYAQSEDEAKSLREKSVGRI
PILDKAYEVKEIDVNDIDESISLVHHNVWNRTIEIMEQIVRVDETSEVKSNSSQLSSLNL
SHNRFSSIPPVLSCLAVNLTRLNISYNCLRTMSYITSYPSSLKQLDLSHNKICVWPSLPQ
INLEEAAPDQENLLCYRLETGQVPKSTVPSKIRTSRRMSLRANILNRVCLHRRHLRLENL
RTLMLADNCMNRIQLTTDDDGFSAASNDSADELDDWDTGGTVLGHSKSKLIFPNLSMLDL
SNNQLKEIPTNINELINLSVLNISGNKDVTELPPQMGLLSRLWNLNTRGCSLQEPLKSMI
DSNKYKTMDVIGYLKSVLEDAKPYARMKLMIVGVQGIGKTSLLDQLRQEGTGNYKKKPVD
HWAKRMGNKNINQKTNKGTNISTVGVDIGDWVYEKKIRGNSQYGPVMFRTWDFGGQNEYY
ATHQYFLSKRSLYIVVWKITDGHRGIAEILQWLVNIQARAPNSPVIIIGTHYDVMSTMSP
EYSSEQLQQLIRDRFINIVDAEKYGLPRVLDTIEISCKTKHNIKLLCNIIYDTVFSLRPP
GSKELLLEQRVPATYLALEDIVSHIGSERRQAGLDPVLNLDQFRTAVNAEMLSRYHKSFR
DMAELNQAILFLHENGVLLHYDDATLKDLYFLDPQWLCDMLAHVVTIREINPFARSGIMK
LDDLQIVLKSSTCTREYIVNLLNKFEVALTWDSRSLLIPSLLPSEEDMYSQRAQPVSIKV
PVKSKIHKLRTKVSSQVMFDSIDIGEHITSRSDPEVSVRRLLLMSYFPSGFWSRLITRIL
GDDTIIHVIRQFFMPTEVNGDDFMCSDFQTQFDWILWQTGIELKFANKITLFRMKEVLHR
NSPINYRHLRFQLFQENSWYDVPIKTSSILETYLPLDTVIVKRPIKNNDKEDIGFRAIVL
DPSPVQAAKLLALVVDHIDVLLEDWYPTLGTRFVHTSEGKCLVTRLVPCPRCLAGSVETD
SISIDMKDDDGTSKIDHISKEFLKRDSDNKNIVRKSQESYNGSDGGDSGFGHDISPQSSR
KVSVEGHPLASDNQIEGGIHYGWIVEDCILAASSVDKLCVVCPKHGDLSLAQVAPDTVFL
DLGEELVINDQDIIRGKLLGRGAFGFVFKGVCKGKKPGNSIQIAIKMLQPVPPGPNASQS
AIIAYKGAQAKWDRDPLQYTCKSYCSARQELNIMLNLKHPNIVPLIGVCTKPLALILDLA
PMGALDQILRNYRRSGSKFDPHILQQIVFQIAKALEYLHQQRIIYRDLKSENVLVWSIPV
PLQDPYAVNTHVKMADYGISRLSLPSGTKGFGGTEGFMAPEIIKYNGEEEYTEKVDCFSF
GMFIYELITMHQPFENHESVKESILEGHRPALTYRETAYPSYLLDLMAVCWSQSPKERPS
ASQIVSIVSAPEFTHLYDVVSLSHSADVISCTRIPLPLSEDNENNGDEIWLPCSNGKLDR
LAFSITNWFHYRSANVSHKITAICTVDDHSIWLGDAEGQIHAYSSNDSKYMFSYKLITDQ
EVGVKRIVTLIDRHRVAVGLENGRIFLVRSDMSPLAPTMGEGSFVMSELGSSTILFDFIA
VNSNKTCELWCGENQGRISVYTIKQNVAINYEVLQHFDYTGLDTQVMSLSASRGHNLVWS
YVHPGCIVYQWDVVTRKIMNKLDCSKLIPCSESLKSISIEERLSPGKCQITSICAVGDEL
YLGTAWGCIVVVEQDTARPITVFRPYEQEVTCMTAACEGNAIISIGHGYRSLLKRYLSHC
NDMADVTGTTFAILWSTRNWNAY
NT seq
7452 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggccgaagacgaggattttcctggtcgacttttacaccaggttgcattatgggacaat
gtagacttcttgacggaccttctcaaagacgacgagcataaaaagtttatcaatagtcgc
gattcttggggtcgcactgctcttcatgcagcttgttctaatgaaggttctggttgtctg
gaaatattactcaatgctggagctcttgtagatacaccatgtggtcctcgtggcgaatgc
aggacagcattacacatcagtgcacacattggatgtccaaaaaacatccaaacacttttg
aatcacaatgcaaatttaatattgcaagactctaatggatttacagcacttgatatagct
ctcaatgcagaaaatacttcttgcagcaaattactgaaagatgcttcagattcttgggaa
gaatctcaaagtacaattcatatggctttgcgagacgctatctgcagaggtgatgttagt
actaccaaaacaattttgtcagaacttggatctaaagaagaattcattgttaacatggca
cctaatggtaccaccacattgttgtactgtgcttgtgaagtgggtaaaaaagacttggtg
aaaatgttacttgaccataaagctgatggtagaatacatccaatcactcggtattctcct
ctttatgttgtggctttcaaaggaaaaaaagatgtttttgaaatccttctcaagaaattc
cctgatctcattcgacaaactactgtagaaaaatggttgccaatccatgcggcatgtata
aatggaaatattcaagtattagagcttctactaaaatatccttatcctcctaatgtattg
gtaaaattaagaaaagataactgggaatttgacgtcccatttgacataaacactaaggat
gtcaatggtcaaacagtgttgtacctggcttgtcttttgggaaatacaaaaattgtagac
atactgttaaaatatcaagtgaaagctgtaaagatttgtggttctgatggaatttctgta
aaagatgataataacgacatgtcaaaacgtagtcgtatttctgaaggtatacagtcaata
gtttctcgtcttagaggaagtatgacaaaagaaattgatttgaatgagaaaaacttaaaa
cccgtggaagtaaatgtttattgcaatgaagaagctccagaaacagctcttcatgctgcc
gtacgaaatggatttaaagatgtggtaattgcgttacttgaaaatggtgctgatcccaat
ctactaactttacaaccatctgctgattacaaacaaaaagatgacgatatccgagaagct
ggtacttctccattgacattagcatgtagtaaaggagatacagctattgttgaattgctg
ttaaaatatggtgctagagacgatgactgtaaagctcttgcagctgcaatgttaactaaa
aatcaacatttaattacaacattacttggaactaaagcttttgctgatcccgaacataaa
attaataaaaaggcaatgacagataatattgcttcacaatttggcggtttatcaagttta
acatatagtaatatatttcctagtactccagttatgataaattggcatagtcaaagatgt
aaacttgaatctataaaatcacaatggctgattgacggtgctcttcatatcaatccaaag
ctgaaaatgaatccccgaagtagagaaattgttttgtttgcaattactagattagatata
tcaaataattcacttacccaagtgccgacaataatttttcaattacaaagtctcagatat
ttaaatttggctcaaaacaaaattgaaaaattacctgatccaaaagattctcatcaagta
acctctcctacaagcaaaaaaatgtccaaactatacaaatctatctatacggctaatgtt
ttagaagaactttacttgcaagataatcgtcttgataaaattcccgaagaactattcaga
ttaccttcattgactacacttgacttatccaacaacaaacttcattctgtaccttttcaa
atgtggcgtgctcctaagcttaaagatcttaatatggcatttaatttgataaaagaactt
ccatatgctcaatcagaagatgaagctaaaagtttacgagagaaatctgttggacgtatt
cctatattagacaaggcgtatgaagttaaagaaattgatgtcaatgatattgatgaaagt
atttcattagttcatcataatgtttggaatcgcactattgaaataatggaacaaattgta
agagttgatgaaacatcagaagttaaatctaacagctcacaattatcatcgttgaactta
tcacataatagatttagctcaatacctcctgtattatcatgtttagctgtaaacctaaca
cggctaaacatatcatataattgtttaaggacaatgagttatataacatcatatcccagt
tcactcaaacaattagacttaagtcacaataaaatatgtgtttggcctagtttaccacaa
attaatctagaagaggcagcacctgatcaagaaaatctattgtgttatcgattagaaacc
ggacaagtccccaaatcgactgtaccttcgaaaatacgaactagtagaagaatgtcatta
agagcaaacattttaaatcgtgtatgtttacatagacgccatttaaggcttgaaaatttg
agaactttaatgttagccgataactgtatgaacagaatacaattgacaactgatgatgat
ggattttctgctgcttcaaatgattcagccgatgagttagatgactgggatacaggaggt
acagttttgggacattcaaaatcaaaattaattttccctaacttgagtatgttggattta
agtaataatcaattaaaagaaattcctactaatataaacgaactcattaatttgtctgta
ttaaacataagtggaaataaagatgtaacagaactccctccacaaatgggtctgttgtca
cggttgtggaatttaaatactagaggctgtagtctacaggaaccactcaaatccatgatt
gactcaaataagtataaaacaatggatgttattggttatttgaagtcagttcttgaagat
gccaaaccatatgctcgtatgaaattaatgattgttggtgttcaaggaattggtaaaaca
tcattattagaccaactcagacaagaaggcactggaaattataaaaagaaacctgtggat
cattgggcaaaacgtatgggaaataaaaatataaatcaaaagacaaacaaagggacaaat
atttcaacagttggtgttgatattggtgattgggtgtatgaaaagaaaataagaggcaat
tctcaatatggcccagtgatgtttcgtacttgggactttggtggtcaaaatgaatactat
gccacacatcaatattttttatcaaaaagaagcttgtacattgtggtttggaaaatcaca
gatggtcatcgaggaattgcagaaatcttacaatggcttgtcaatatacaagctcgtgca
ccaaattcgccagttataattattggtacacactatgatgtcatgagcactatgtcccct
gaatattcttcagaacaattacaacaactaattagggatcgatttatcaatatagtggat
gctgaaaaatatggtttacctagagtattggatacaattgaaatcagttgtaaaacaaag
cataacatcaaacttttgtgtaatattatttacgatacagtgttcagtcttagacctcct
ggaagcaaagaactattattagaacaaagagtcccagcaacatatttagcattagaagac
attgtaagccatattggatctgaaagaagacaagctggtctagatcctgttttaaacttg
gatcaatttagaactgcagttaatgctgaaatgttatctcggtaccataaatcatttcga
gatatggctgaacttaaccaagcaattttgttcttgcacgaaaatggtgtattgttacat
tatgatgatgcaacactaaaagatctatattttttagatccacagtggttatgtgatatg
ttagcacatgtggtaacaattagagaaatcaatccttttgctcgatcaggtataatgaaa
ttagatgatttacaaattgttttgaagtcatcaacatgtacaagagaatatattgttaat
ttgctcaataaatttgaagtagcattaacttgggatagtagatctctattaataccatcc
cttttaccttcagaagaagatatgtatagtcaaagagcacaaccagtatctatcaaagtt
cctgtaaaatcaaaaatccataaattacgaactaaagtttcaagtcaagtaatgtttgat
tcaattgatattggagaacatataacaagtcgttcagatccagaagtatcagttcgccgt
ttgttactcatgtcgtattttccatcaggcttttggtctcgacttataactcgcatactt
ggagatgatactattatccatgtgatcagacagttttttatgccaacagaagtaaatggt
gatgattttatgtgttctgattttcaaactcaatttgattggatattatggcaaactgga
atcgaattaaaatttgctaataaaattactttgttccgtatgaaagaagttttacaccgt
aactctcctataaattataggcatctaagatttcaactttttcaagaaaactcttggtat
gatgtaccaataaaaacttcttcaattcttgaaacttacttacccctagatacagtgatt
gtaaagagaccaataaaaaataatgataaagaagacataggtttcagagctattgtatta
gatccatctcctgtacaagcagcaaaattattggctctagtagtagaccatatagatgta
ttactagaagattggtatccgacattaggtactcgatttgtccatacatctgaaggaaaa
tgtttagtaactagactcgttccatgtccaagatgtttagctggaagtgttgaaaccgat
agtatttcaattgatatgaaagatgatgacggtacaagtaaaatagaccatatatctaaa
gagtttttaaaaagagattcggacaataaaaacattgtgcgaaaatcgcaagaaagctac
aatggttctgatgggggagacagtggttttggacatgatattagtccacaatcaagtaga
aaagtatctgttgaaggtcatcccttagcttcagataatcaaattgaaggtggtatacat
tatggatggatagtagaagattgtattttagctgcatcatctgtggataaactttgtgtt
gtatgtcctaagcatggagatttatctttagcacaagttgctcctgatactgtatttttg
gatttgggcgaagagctagtcattaatgatcaagatattatacgaggtaaattattaggt
cgtggggcatttggttttgtttttaaaggtgtatgtaaaggaaaaaaacctggtaatagt
atacaaattgccattaaaatgcttcaacctgtaccacctggacctaatgctagtcagtct
gctattatagcctataaaggagctcaagcaaaatgggaccgtgacccacttcaatataca
tgtaaatcttactgtagtgctagacaagaattaaatataatgctgaatctgaaacatcca
aatattgttccattaattggtgtttgtacaaaaccactagcacttattcttgaccttgcg
ccaatgggagcattggatcagattttaaggaactatcgaagatctggttcaaaatttgac
cctcatattttgcaacaaatagtttttcaaattgcaaaagcattagaatatttacatcag
caacgaattatatatagagatttaaaaagtgaaaatgttcttgtttggtctatcccagta
ccacttcaagacccttacgcagttaacactcatgttaaaatggcagattacggaattagt
cgtttatctctaccatctggtaccaaaggttttggtggtaccgaaggatttatggctcct
gaaataataaaatacaatggcgaagaagaatatactgaaaaagttgactgtttttcattt
ggtatgtttatttatgaactgattacaatgcatcaaccatttgaaaatcatgaatctgta
aaagaaagtatattagaaggacaccgaccagcattgacatatagagaaacagcttatcca
agttatttgcttgatttaatggcagtatgctggtctcaaagtccaaaagaacgtccttca
gctagccaaattgtttctatagtttcagctcctgaattcactcatttatatgatgtagtt
tcactgagtcattcagctgatgtaatttcttgtactcgaataccactaccactgagtgaa
gataacgaaaataatggtgatgaaatatggttaccttgttctaatggaaaacttgataga
ttggcatttagtatcacaaattggtttcactacagaagtgcaaatgtttcacataaaatt
acagccatttgtacagtagatgatcacagtatttggttaggagacgcagaaggacaaatt
catgcttactcgagtaatgatagcaagtacatgtttagctacaaacttattacagaccaa
gaagttggagtgaagcgcatagtgactctgatagataggcatagggttgcagtaggtttg
gaaaatggaagaatatttcttgtaagaagtgatatgtcccctttggctccaaccatggga
gaaggaagttttgtgatgagtgaacttggtagttctaccattctgtttgattttatagct
gttaatagtaataagacttgtgaattatggtgtggagaaaatcaaggccgaatatctgta
tacactataaaacaaaatgtggcaataaattatgaagttcttcaacattttgactataca
ggcttggacacacaagtcatgtctttaagcgcttctcgtggtcataatttagtatggtcg
tatgtgcatccaggttgcattgtttatcaatgggatgtagtaaccagaaaaataatgaac
aagttggattgttcaaaattaataccgtgttccgaaagtttaaaatctattagtatagaa
gaacgattaagtccaggaaaatgtcaaatcaccagtatttgtgcagtaggtgatgaactg
tatttaggcacagcatggggctgcattgtagttgttgaacaagacactgctaggcctatt
actgtatttaggccatatgaacaagaggtaacgtgtatgacagctgcctgtgaaggtaat
gcaattataagtattggccatgggtacagaagtttattgaaaaggtacttatctcactgt
aacgatatggctgatgtaacaggtacaacatttgcaatactttggtcaacacgcaactgg
aatgcttattaa
DBGET
integrated database retrieval system
