KEGG   Rodentibacter pneumotropicus: NCTC8284_01484
Entry
NCTC8284_01484    CDS       T05800                                 
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat (20 copies)
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
rpne  Rodentibacter pneumotropicus
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:rpne00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:rpne02000]
    NCTC8284_01484
Transporters [BR:rpne02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   NCTC8284_01484
SSDB
Motif
Pfam: Collagen YadA_stalk
Other DBs
NCBI-ProteinID: VEH66322
UniProt: A0A3S5ES34
LinkDB
Position
1:924461..927616
AA seq 1051 aa
MAIKLAKDLKGLNSVNTKEIKLGDQTNNTTIKLDGNRIKYGDKNIANLGDEKHITKGEYA
VQNDGSVTMTYTDGNGKVVTNETAKITGIAKQDLSNINNSGETKIKNLAKATINMEDGKN
TKVSYRDVNDVKTFKVDVEGALANITSITNGNSSGKVEFRPDGSVNISGNNSISLNGKDG
HITGLTNTDWNVTNPTPVSGRAATEDQLKTVSNVVNKIGDNNIKLGSNSGTTEEQKLSKT
GGLQFNVVGGDSAKYISTTAAGTNVTIDLTKDTKDKIDNAAGKSLTNITNEGKKVITGLG
TVVEAGTNVVVTNTTDATTGQKTYTVSAVAQNLGDAELSYKANGANSQKVKVSQGLDFTD
GNYTTATVGANGKIQYDVNVGNITTGADGKAGIDGVNGKNTVATVKTVVEAINNSGWLAN
ATKSTGELDGTSVATKVAPSAVVNFDAGKNLTVKQDVTDPNNQTYTYSLSNDIAIGEKGE
PGTPGKDGVDGKIGINGKDGSAVVINGKDGSIGLNGTNGRNGLTIKGDKGAVGVDGTDGA
NGKDGMTRIIYKDDKGTNHTVATLEDGLRFTGNNESVENKQKLNTLVKVQGEGVNETTAK
TFESAAGNINVVADGSNKLEVKLNKDINLTDRGSIKVANTTVNNSGITITNPTDTTKTVS
LTNSGLNNGGNQIKNVANGTNPTDAVNLSQLDSVKAAERHIKPGEYKVDDTGTVTMNYVD
GDGKDVAGEAKITNIAKSDLKNITNDGKKVITGLGSIVQSGSKNVTVTPSEDQTTGQKTY
TVSVAEQNLGDAPLTYKANGTNDQTVTLSKGLNFTDGNYTAVSVDKDGIVKYEVKLGATP
TTPMDGKNGKDGENGIATVHQVIDIVNNSGWNANATGNVNGSSVAKTVKPGAVVNLDAGK
NLTVTQSGTDENQTYSFALNKDLTNLDKIVVNGKNGADGKDGVTITGPNGQNGEDGKVGI
SGKDGKDAISISGKDGVGHIGLTGPKGADGSDGVSADISVKEGKAGVDGKDGITRIVYKD
KDGKEHEVATHDDGMKYYGDAIASTNVIKNT
NT seq 3156 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttggcaattaaattagcaaaagatcttaaaggtttaaatagcgttaataccaaagaaatt
aaacttggtgatcaaacaaataacacgactattaagctcgatggtaatcgtattaaatat
ggtgacaagaatattgctaatttaggtgatgaaaaacatattacaaaaggtgaatatgct
gttcagaatgatggttctgtaacaatgacttataccgatggtaacggaaaagtagtcaca
aatgaaactgcaaaaatcacgggtattgccaaacaagatctttccaatattaataatagt
ggtgaaactaagatcaaaaacttagcgaaagctacaattaatatggaggatggtaaaaat
actaaagtatcgtaccgtgatgtgaatgatgttaaaacatttaaggtagatgttgagggt
gctttagcgaatattacttcaattactaacggtaatagctcaggtaaagttgagttcaga
ccggatggtagtgtaaatattagcggtaataattcaatcagcctaaatggtaaagacggt
cacattacaggcttaaccaataccgattggaatgtaaccaacccaactccggtatctggt
cgtgctgctacggaagatcagttaaaaacggtatctaatgtagtaaacaaaattggtgat
aacaatatcaaattaggcagtaattcaggtacaactgaggaacaaaagctatctaaaacg
ggtggtttgcaatttaatgtggtaggtggagatagtgctaaatacatatcaacaaccgct
gcaggtacgaatgttactattgatttaacgaaagatacaaaagacaaaattgataatgcc
gcgggtaaaagcctaaccaatattactaatgaaggtaagaaagtcattaccggattaggt
acagttgttgaagccggcactaacgtagtggtaaccaatacaactgatgctacaacaggc
caaaaaacttatactgttagtgcagtagctcaaaacttaggtgacgcagagctatcatac
aaagctaacggtgcgaattcacaaaaagttaaagtatcacaaggcttagatttcacagat
ggtaactacacaaccgcaacagtaggggcaaatggtaaaattcaatacgatgtaaacgta
ggtaatattacaaccggagcagatggtaaagcaggtattgatggcgtaaatggtaaaaac
actgttgcaacagtgaaaactgtagttgaggcaattaacaacagtggttggttagctaac
gcaacaaaatcaacaggtgagctggatggtacatcagtagcaactaaagtagccccaagt
gcggtcgtaaatttcgatgccggcaaaaacttaacagttaaacaagatgtgacggatcct
aataaccaaacttatacttattctttatcaaatgatattgcgattggtgaaaaaggtgaa
ccgggtacaccaggtaaagatggtgtcgatggtaagatcggcatcaatggtaaagacggt
tcggctgtggttattaatggtaaagacggttcaatcggcttgaatggtacaaacggtcgt
aatggtttaactatcaaaggcgataagggcgctgttggtgttgatgggactgatggggcg
aacggtaaagatggtatgactcgtattatttataaagatgataaaggtactaatcacact
gttgcaacattagaagatggactaagattcaccggtaataatgagtctgttgaaaataaa
cagaaactgaatactttagtaaaagtacaaggtgaaggtgttaatgaaaccacagctaaa
acctttgaatctgctgcaggcaatattaatgttgtcgcagatggtagcaataagttagaa
gttaagcttaacaaagatattaacttaactgatagaggttctataaaagtagccaatact
actgtaaacaatagcggtattactattactaacccgactgatacaactaaaacagtatct
ttaacaaactcagggctgaataatggtggaaaccaaattaaaaatgtagccaatggtacg
aatcctacagatgcagttaacttaagccagttggattcggtgaaagcagcagaacgccat
atcaaaccaggtgaatacaaagtagatgacacaggcacagtaaccatgaactatgttgat
ggtgatggtaaggatgttgcgggtgaagctaaaatcacaaatattgcaaaatcagattta
aaaaatattactaatgacggtaagaaagtgattaccggtttaggttcgattgttcaatcc
ggtagcaagaatgttacggtaacaccaagtgaagaccaaacaacaggtcagaaaacctat
acggtttctgttgcagagcaaaatcttggtgatgcgccattaacctataaagcaaatggc
acaaatgaccaaactgttactttatcaaaaggattgaattttacagatggtaactatacc
gctgtatctgtagataaagatggtattgttaaatatgaggttaagttaggtgcaactcca
accaccccaatggatggtaagaatggtaaagacggtgaaaatggcatagcaacagttcat
caagttattgatatcgtaaacaacagcggatggaatgcaaatgcaaccggcaatgtaaac
ggtagttccgtagcgaaaactgtaaaacctggcgcagtagttaatctggatgcaggtaaa
aatttaactgtcactcaaagtggtactgatgaaaatcaaacctatagctttgcgctgaat
aaagacctaactaatttagataagattgttgtaaacggcaaaaatggtgctgatggtaag
gatggtgtgacaatcacgggtcctaatggacaaaatggtgaagatggtaaagtcggaatc
agcggtaaagatggcaaagatgcaatttctatctctggtaaagatggagttggtcacatt
ggcttaactggccctaaaggtgctgatggcagtgatggcgtatcagctgatatttctgta
aaagaaggcaaagctggcgttgatggtaaagatggaattacccgtattgtttacaaagat
aaagatggcaaagaacatgaagtggcaacgcatgatgatggtatgaaatactatggcgat
gcaattgcgagtacaaatgtcatcaaaaacacttaa

DBGET integrated database retrieval system