Rhincodon typus (whale shark): 109918958
Help
Entry
109918958 CDS
T06055
Name
(RefSeq) von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein-like
Organism
rtp
Rhincodon typus (whale shark)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FXa_inhibition
EGF
EGF_CA
cEGF
EGF_3
hEGF
EGF_2
Plasmod_Pvs28
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
109918958
NCBI-ProteinID:
XP_048473416
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(1071609..1126777)
Genome browser
AA seq
566 aa
AA seq
DB search
MSLIDQVLGKFGKGKDLVHVCGLPISGLEFAVITDSPTTDTQEVSFADAFKANDRGQDVN
ECEQVAQVCGGQAVCENIPGSYHCSCQPGFRGNGSYCEDDNECASGQHGCDTNARCGNII
GSYFCQCYQGFNGDGFSCFDIDECSVSNGQCQQVCVNEAGSFKCQCNKGYTLTVDSMTCT
DFDECLDENAGCSQICTNTNGSYICSCSHGYQLHVDMKQCVDIDECKIDNGRCSHSCTNR
NGGHVCGCPIGLALGKDKRTCVNITSCKMQNGGCEHVCTERVDGQVECSCHLGWKLLGDR
KSCTAVCNPVCQNYGVCVTPDTCDCPAGYPGPGCSAMCSPPCSHGGTCMRSNTCLCPQGW
AGAGCQTAVCDLPCANGGRCIAPNTCQCPSDYTGKQCLTAMCTPRCLNKGKCIDVNKCFC
PRGWQGARCQIEPVVCVPKCKNGGTCVGYNKCRCRSQFTGKNCETAVITPCVPLCQHGGT
CQQFNKCECPEGTAGSRCQKLTCPLVTMTVSTVRATRQAIRQSYMDRCGPLGVQLCIKYR
MNQLRVYVQAYMVAYKILCPKRGSGQ
NT seq
1701 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtccctgattgatcaagtcctgggaaaatttgggaagggaaaggatttggtccatgtg
tgcggccttcctatctccggtctggaattcgctgttataacggattcaccgacaacagat
acccaagaagtttcgttcgcagatgccttcaaagcaaatgacagaggacaagatgttaat
gaatgtgagcaagttgctcaggtttgtggaggacaagctgtgtgtgaaaatattccgggg
agttaccactgcagctgtcagcctggattccgtggcaatgggagctactgtgaagatgac
aatgagtgtgcctcaggacagcacggctgtgacactaatgcccgatgtgggaacatcatt
ggctcctatttctgccagtgctaccagggattcaatggagacggtttctcctgctttgac
atcgatgagtgctccgtcagtaatgggcagtgccagcaggtgtgtgtcaatgaagcgggc
agcttcaagtgccaatgtaacaagggttacacactgactgtcgacagcatgacttgcaca
gatttcgatgagtgtcttgatgagaatgcaggttgtagtcaaatctgtacaaataccaat
gggtcctatatctgctcctgttcccatggataccagctacatgttgatatgaagcagtgc
gttgatattgatgagtgtaagattgataatggccgctgttcccactcctgcaccaacaga
aatggaggtcatgtctgtgggtgccctattggactagcgctgggcaaggacaaaagaacc
tgtgtcaacatcacctcttgtaagatgcagaatggtggctgcgaacatgtctgcacagag
cgagtggatggacaggtggagtgttcctgccaccttggctggaaactgctgggtgaccgg
aagagttgtacagctgtttgtaacccagtctgtcagaactacggggtctgtgtaactcct
gatacctgtgactgccctgctggataccccgggccaggctgctctgcaatgtgttcccca
ccatgttctcatggtgggacgtgtatgaggtccaacacgtgtctgtgtccccagggctgg
gccggagctggctgtcagacagctgtgtgtgacttgccctgtgctaacggagggaggtgt
attgcgcccaatacttgccagtgtccttctgactacacggggaaacagtgtctcacagcc
atgtgcactccacgctgcctgaacaaagggaagtgcatcgatgtcaataagtgcttctgt
cccagagggtggcagggagctcgctgccagattgagccagttgtgtgtgtcccgaaatgt
aaaaatggaggcacgtgtgttggatacaataaatgccgatgtcgcagccagtttacggga
aagaactgtgagacagctgtgatcactccgtgtgttcccctgtgccaacatggaggcacc
tgtcaacagtttaataaatgtgaatgtcccgagggcactgcaggaagtcggtgtcagaaa
ctcacgtgtcccctggtgacgatgaccgtgagcacagtcagagccactcgccaggccatt
cgccagagctacatggacaggtgtgggccactgggggtccaactttgcatcaagtacagg
atgaatcagctccgtgtctatgtacaggcttacatggtggcttacaagatactgtgcccc
aaacgagggagcgggcagtga
DBGET
integrated database retrieval system
