KEGG   Rhincodon typus (whale shark): 109926892
Entry
109926892         CDS       T06055                                 
Symbol
cubn
Name
(RefSeq) cubilin
Organism
rtp  Rhincodon typus (whale shark)
SSDB
Motif
Pfam: CUB EGF hEGF CUB_2 DUF3882
Other DBs
NCBI-GeneID: 109926892
NCBI-ProteinID: XP_048462936
LinkDB
Position
2:42993460..43259509
AA seq 2562 aa
MRLTPENSRPSKKSKRRFNIHILHHFQEIVWLLAERVLPLGVMLCRIQNIQLRRLERAYN
LFLPRITSNDGNLIFQTGNLKNIEFKTSSSGRIKLNNDDLEQQLIQIRKNKDDIVELKTS
GGHIPQNVSNQIVQLNARLLSLEASVQAVQSVNNILTCTCPPDYIGNGYGASGCVLLNDI
CQHDNPCANGQCVFTISGYVCICDPGWTSTNCTENINECASNPCQNGGSCTDGVNSYSCI
CTNEWTGPQCRIPQQGKLMIDPACGGTYEDSKGILTTPNWPNAYPSNRQCVYIIRQPTGE
RIHLQFTYMDLESNNSCSSVSVEVRDGETELDPLINKFCGSTLPAPITTNGNKLWIKFES
DISASKGGFIALYEVACGGTLNGNGVIESPYYPKSYPHDKSCEWVINQLEGQVVTLNFIS
FDIENATNCNNDYVEVRDGPVIDSPLIGKYCGTNIPPIVQSMQRSMFVKFKTDSKISSRG
FQVKYGSAVKGCTELLTKPVGTISSPGYPTDYPHGAKCIWYISVQPGNVIRLTFDFFDLE
YHMNCTKDYVEVYDNGPIISGRLIGRFCGRSVPPSVTSSGSLMSLLFVSDSSIAFQGFAA
SYDSLDASSVCREEFFELIGTLTSPNYPNGYSRNQECIYTINVENNKQILLNFTHFQLDG
YQTCTSGYVEIRNGGYETSPFVGQYCGSKAPPLITSHSNQLWIKFKSDNTLQYRVFKAHW
DGTTTGCGGTLTTSTGSFTSPNYPMPYSHNAECYWLIQTSAGSVIELQFEQFHLNSSAGC
NYDYLAIYNGNNSNSQLLAKLCGHQMSAPIRSSGNNMYIKLRTDSSVTAGGFFAKYAHIC
QRVIIANRSQGILESTNFPQPYPSKQDCTWTIQATAGNTINYTFTVFSLDFNNCHLAWLK
LYDGPSAQSPLIGTFCGNTIPPSGTSSGSRLHVAFHSDSSFSGNGFQMLWLQNGCGGELL
GPKGRFSSPGYPDRYPHNQECIWVIHGDSGSSIELTIHEFDVEYHQTCNFDVLEVYGGPD
ITSVRLAQLCRTRPPNNPLVVSSTGNYITVRFKTNSNSNAKGFNATWKQIAGGCGGNFTA
PNGEIHSPNYPSPYGSNVDCSWVITVDYHHRVLLDFADFDLEHHQSCDSDYVAVYDGLDE
AAPVLGKLCGSLIPKRITSTHNVIYVRFRSNNSNEHKGFRAQFDQACGSYIITDDVGGVI
TSPLYPKNYLDNQKCSWIIRAQKPFNHVTISFTDFAIENGGANCPADALQILDGDNYAAP
SIGRYCGNIMPHPITSFSDALFINFSSNNVNTFKGFRTVYAASTSACGGMYHMETGAFNS
PNFPDESPPNYECVWYIITSPGNRVQLSFISFDIELNINCTSAYLEIREGNSTGQLIGRY
CGSSLPANYTSNERHILWVKFVSDPTSPGGRFRAIFSHLYGNEIVGFQGQIASPLWPLHY
PHNANYHWTITVPASYIIHVRILELDIDAIQRCRYDNLMRRSRGDFIQVFKTMNNFYGVR
KGILFSQVGACGGVVVTADTPTFLFSPGWPNKYENHLDCSWVIRAPQGTVELNILALDIE
PNALCFYDKLVIRDGDNSHSPILATLCGRKLPGPVRSSGDAMFIRFISDEETNGGGFNAS
YYKTCGGRLNANHGVIFSPNYPNAYTSNLNCTWLVAVTSGSIISIHFNWTFQVQGSGTNC
TTGDYLELRNGPDGSSPPLTTHGRNGHYCGKNPPSTMHTSDNQLFVRFISDGSNEGLGFK
FTYEASNYACGGILYANNGSFHSPNWPQNFPENSECTWTIIAHESKHLEITFDKNFQIPD
STVNCGTSYVKVWGGTAETAETLLATLCGSAAPGLVISPANIVTVRFQSKGSVGSGFSAS
FTDRCGANFTASSGRIISPNYPDNYDSNLNCEYLINISDQRLIILQFEFFDVEGFLYCDD
DSLKIYSGTTASGQPIATLCGFLTPRPISSYGPVLLVFKTNHVNTETGFVVNYNLISCGG
SFQGSAGIISSPTYSCIENHSMNCTYHIIVGKNRIVKLKFNEFDIDTSSACTLTYVAVYD
GPNSLAPLLGQFCGAKMPPVLRSTNNSIFLVFKINSYCPIGGWRASYTETLGLNQGCGGY
LSNFRGNISSPDINFDGKYENNLDCVWCIFVPLNKVINMTFTAFQLEDPSEGICKSDYVN
IYDGEDINSPSVTTYCGSELPPSFVSSSNFLTVRFISGSSVELAGFKATYVANDLVCGGN
FNSTDTTQIITSPGYPHDYPPLTKCDWIIDAPAQEQIWVTVQEFNLPTSPNCTGDYLEIK
DWPLSDFGQIYRLCGSNSTFPDFYSYGRTIKIAFISKAYQSGNKFQLMHKVAGCSRQYNQ
SFGYLKSPGWPNVYPHYCNCTIILRAPESHKISLFFHAFSIEYFPGCNADYLEIKNGTES
NGQLLVRLCGKKLPNPIFSNFHALTLHFKSDVLGSHNGFEITWTSSPNGCGGTLFGSTGS
FYSPNYPATYSNNTDCEWIIEAPIGHVLTIHFTSLNIDDPGDCIKNYLKLYDGPDSNSPP
TGPYCGMESNIAPFTSTSYRVFVKFHAEYAVIPSGFRLQWTS
NT seq 7689 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgcgcctaacacctgaaaacagtagaccgtccaagaaatctaagagaagatttaacatc
cacattctccatcatttccaagagatcgtatggttgttggcagaaagagtattgcctcta
ggggtgatgttatgtagaattcaaaacattcaattgagaagacttgagagggcatataat
cttttcctaccaagaataacttcaaatgatggcaatttgatatttcaaactggcaaccta
aagaatattgaattcaagacttcatcatctgggaggattaaattaaataatgatgatctg
gaacaacaactcattcagattagaaaaaataaggatgacattgtggaattgaaaaccagt
ggaggtcatatccctcagaatgtttctaatcaaattgttcagctgaatgctaggctgcta
agtcttgaagccagtgttcaggctgtgcaatcagtaaataacattctgacttgcacttgt
cctcctgattacattgggaatggctatggagccagtggctgtgttcttctcaatgatatc
tgtcaacatgataatccctgtgcgaatgggcagtgtgttttcacaatttcaggttatgtg
tgcatttgtgatccaggatggaccagcactaactgtactgagaatattaatgaatgcgcc
agcaacccctgccagaatggtggaagctgtactgatggtgttaacagttattcctgtatt
tgcactaacgagtggacaggccctcagtgtcgaataccacagcaaggtaaactgatgatt
gatcctgcctgtggaggaacatatgaagacagtaagggcattctcaccacccccaactgg
cccaatgcatatcccagcaacaggcaatgtgtctacattatccggcagcccactggggag
cgcatccacctccagttcacatatatggatttggaatccaacaacagctgttcctcagtc
tccgtagaggttcgtgatggtgaaacagagctggatcctctaatcaacaagttctgtggt
tccaccctcccagctcccattactacaaatggtaacaaactgtggattaaatttgaatca
gacatttctgcctcaaaaggaggttttattgcactatatgaagttgcatgcggtggcaca
ctgaatggcaatggagtgatagagtctccttattatcctaagtcatacccgcatgacaaa
tcctgtgagtgggttatcaaccaactagaaggacaagtggtgacactcaacttcatttcc
tttgatattgagaatgctacaaactgcaacaatgactatgtggaggtcagagatggacct
gtgatagactctccactgattggtaaatattgcggtaccaacattccaccaatagtccag
tcaatgcagaggtcaatgtttgtcaagttcaagacagactccaaaataagtagccgtgga
tttcaagtcaagtatggatcagctgtgaaaggatgtactgaacttctgacaaaaccagta
ggtaccatttctagccctggatatccgacagattatccacacggtgccaaatgcatctgg
tatatctcagttcagcctggaaatgtcattcgtctcacattcgatttctttgatcttgaa
tatcacatgaactgcaccaaggattatgtcgaagtgtatgataatggtcccattatttct
ggcagactaataggaaggttctgcggaaggtctgttcctccttctgtgaccagcagtggc
agtttgatgagccttctgtttgtgtctgattcaagcatagcctttcagggattcgcagca
agttatgattctcttgatgcttcctcagtatgtcgagaagaattcttcgaattaattggt
acattaacctctccaaactatccaaatggctactctcgtaatcaagagtgcatctacaca
atcaatgtggaaaacaacaagcaaattctgctcaactttactcactttcagttagatgga
tatcaaacctgtacttctggctatgttgaaattagaaatggtggatatgaaacctccccc
tttgtcggacagtattgtggatcaaaagccccaccacttatcacatcccacagcaatcag
ctatggattaaatttaaatcagataacactcttcaatatcgtgtatttaaggctcattgg
gatggcactaccacaggttgtggtgggactcttacaacgtcaacagggagttttacctca
cccaactatccaatgccatattcacacaatgcagaatgctactggctgattcaaacgagt
gcaggtagtgtgattgaactgcaatttgaacaatttcatttgaactccagcgctggatgc
aattatgattacctagctatttataatggaaacaacagtaattcccagcttctggccaaa
ttatgtggtcatcagatgtcagcacctattcgctcttctggaaataatatgtacataaaa
ctccgaactgatagctcagtaacagcaggaggattttttgctaaatatgcacacatttgt
cagagagtaattattgcaaatcgtagtcaagggatcttggaaagtacaaactttccacag
ccttatccttccaagcaagactgtacctggaccatacaggcaacagctgggaacaccatc
aactacaccttcactgtcttcagtctggactttaacaactgccacttagcttggttaaag
ctatacgatggacccagtgcccagtctccacttatcggtactttctgtgggaatactata
cctccatcaggcacaagctctgggtctagactgcatgttgcattccattcggactccagc
ttttcagggaacggattccagatgctgtggttacagaatggatgtggtggagagttgctt
gggccaaaaggcagattcagcagtcctggctatccagacaggtatccacataatcaggaa
tgtatttgggtcattcacggagattctggcagcagtattgagctcaccatccatgagttt
gatgtggaatatcaccagacttgcaattttgatgtactggaggtgtatggtggtccagac
attacttctgtacggttagcccaactgtgtagaacccgcccaccaaacaacccattagtg
gtctccagcactggaaattatatcactgtccgatttaagacgaattcaaatagcaatgca
aaaggtttcaatgccacctggaaacagatagcaggaggttgtggtgggaattttacagct
cctaacggtgaaatccactcaccaaactatcccagtccttatggcagtaacgttgattgt
tcctgggtcatcactgtggattatcaccaccgtgtcctgcttgattttgctgacttcgac
ctcgaacatcatcagtcatgtgattctgactatgtagctgtttatgatggtttggatgaa
gcagcccccgtgttgggaaaactgtgtggtagtttaattccaaaaaggattacatcaact
cacaatgtaatctatgtacgtttccgctcaaataacagtaatgagcacaaaggattcaga
gcacaatttgaccaagcttgtgggtcctacattattactgatgatgttggtggagttatc
acatcacctctgtatcctaaaaactatttagacaatcagaaatgttcctggattattcga
gcgcagaaaccatttaaccatgttaccatctcttttactgactttgcaattgaaaacggt
ggtgcaaactgcccagcagatgctttgcaaatcttagatggagacaactatgcggcccct
tctattggtcgttactgtggaaatataatgcctcatcctatcacatcattcagtgatgcc
ttgtttatcaacttcagctccaacaatgtcaacacattcaaaggtttccgaacagtttat
gccgcatccacatcagcgtgtggcggaatgtatcacatggaaactggagcattcaatagt
cccaactttcctgatgaatctccacccaactatgagtgtgtctggtacatcatcacttca
cctggtaaccgtgtccaactatccttcatatctttcgatattgaactaaatataaactgt
acctcagcttaccttgaaattcgagaagggaattccactggacaattaattggacgttac
tgtggaagttctttacctgcaaattatacatcaaatgagaggcacatcttgtgggtgaag
tttgtgtctgatccaacgtctcctggtggtagattcagagccatcttttctcatttgtat
ggcaatgagattgtcggattccaaggacaaattgcatctccactgtggccactgcattac
ccacataatgccaactaccactggacaattactgttcctgcgtcctatatcatccatgtc
agaatattggaattggatattgatgcaatacaaagatgcagatatgataatttaatgaga
agatcaagaggtgactttattcaggtgttcaaaactatgaacaacttttacggcgtaagg
aagggtatcctgttttcacaagttggtgcatgcggtggagttgtcgtgactgcggatacc
ccaacatttctcttctcaccaggttggcccaacaagtacgaaaaccatttggactgctca
tgggtcatccgggcaccacaaggcacagtggaacttaacattctggccctagatattgaa
ccgaatgcgctgtgtttctacgataagttggtcatcagagatggggacaatagccattct
ccaatacttgccactttatgtggcagaaaattacctggacctgtccgatctagtggtgat
gcaatgttcattcgattcatatctgatgaggagaccaatggtggtggtttcaatgcttct
tactacaaaacttgtggtgggcggctcaatgctaaccatggtgtaattttttcacctaac
tatcccaacgcatatacatcaaatctcaattgcacatggcttgttgctgtcaccagtggt
tccataatttctatccactttaattggaccttccaagttcaaggttctggcacaaactgt
acaactggagactacttagagttaaggaatggacctgatgggtcttccccacctttgacc
acccatggaagaaatggacactattgtggcaaaaaccctccctctacaatgcatacatca
gacaatcagctctttgtacgattcatttctgatggaagtaatgaaggccttgggttcaag
ttcacgtatgaagcttcaaattatgcttgtggtggtatcctctatgcaaacaatggctct
ttccattcaccaaattggccgcagaattttcctgaaaatagcgaatgcacttggacaatt
atagcccatgaaagcaagcaccttgaaattacttttgacaagaatttccagattccagac
agcaccgttaactgtgggaccagctatgttaaggtctggggaggaactgctgaaactgct
gaaaccttgttggctactctttgtggaagtgctgctccagggcttgtcatatcaccagct
aatattgtgacagttcggtttcagtctaaaggcagcgtgggaagtggtttctcagcatct
ttcaccgaccgatgtggagcaaattttacggcttcttctggccgaattatatcaccgaac
taccctgacaattatgactcaaacttgaactgcgagtacctcatcaatatatccgatcag
cgacttataatcttacaatttgagtttttcgatgtagaagggtttttatactgtgatgat
gacagtttgaagatatatagtggaactacagcaagtgggcaacctatagctaccctttgt
ggttttcttaccccaagaccaatcagtagctatggcccagtgctactggttttcaaaaca
aatcacgttaacacagaaactggatttgtggtcaactacaatttaatctcctgtggaggt
tcattccagggatcagctggcattatcagcagcccaacttactcatgcattgaaaatcac
agcatgaactgtacgtaccacatcattgttggaaagaacaggattgttaaattgaaattc
aatgaatttgacattgacacctcatcagcatgcaccttgacctatgtggctgtctatgat
ggtccaaactcccttgcaccactattaggtcagttctgtggtgcaaaaatgccacctgtt
ttaaggagcaccaacaactcgatattccttgtgtttaaaataaacagctattgtcccatt
ggaggatggagagcttcatatacagagacgttagggttaaaccaaggatgtggtggatac
ttaagcaacttcaggggcaacatcagttcaccagatattaacttcgatggcaaatatgaa
aataacttagactgcgtgtggtgcatatttgtacctttaaacaaggtcatcaacatgact
ttcacagcctttcaactggaggacccatcggaaggaatttgcaaatctgattatgttaat
atttatgatggagaggatataaacagcccatcagtaaccacttactgtggctctgaactg
ccaccttcctttgtctcatccagtaacttccttactgtgagattcatctctggctcctca
gttgaattagctggcttcaaagcaacatatgtagccaatgatctggtctgtggtggaaat
ttcaattctaccgacacaactcagatcattacgtctcctggctacccgcatgattatccg
cccctcaccaaatgtgattggatcatcgatgctcctgcgcaggaacaaatctgggtgaca
gtacaggaattcaatttgccaaccagcccaaactgtactggagattacctggagattaaa
gactggccattgagtgattttgggcaaatttatcgattatgtggctccaattcaacgttc
ccagatttctattcatatggtcgcaccattaagattgcctttatatcaaaggcataccag
agtggaaacaaattccagttaatgcacaaagttgcaggctgcagcagacaatacaaccag
tcatttggttacctgaagagtcctggctggcccaatgtctatccacattattgcaattgc
acaatcattctgagggccccagagagccacaagatctccctcttctttcatgccttcagc
atcgaatattttcctggttgcaacgctgactatttagagatcaaaaatggcacagaaagt
aatggacaactgcttgtcaggttgtgtggtaaaaaactgccaaatcccattttctcaaat
ttccacgcacttactttacattttaaatctgacgtcttgggaagtcacaatggttttgag
atcacttggacatcttctccaaatggctgtggtggaacattatttggctccactgggtct
ttttacagtcccaactacccagccacctacagcaacaataccgactgtgaatggataatt
gaggcaccaattggacatgtactaacaatacacttcacatcccttaatattgatgaccct
ggtgactgtatcaagaactatttgaagttgtatgatggtccagattccaattcaccacca
actggaccatactgtggaatggaaagtaacattgctcctttcacttctacatcttaccgt
gtgtttgtgaaattccatgctgaatatgcagttataccatctggattcagattacaatgg
accagttaa

DBGET integrated database retrieval system