Sorghum bicolor (sorghum): 8062429
Help
Entry
8062429 CDS
T01086
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein DOT4, chloroplastic
Organism
sbi
Sorghum bicolor (sorghum)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
PPR_1
DYW_deaminase
PPR_3
E_motif
PPR_long
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
8062429
NCBI-ProteinID:
XP_002445851
UniProt:
A0A921QPJ5
C5YI98
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(63226343..63230049)
Genome browser
AA seq
1084 aa
AA seq
DB search
MATPPLSSVSTHHRAPPPWPPPKTATSPRTNFRCGVLAPPAGQVIEAAAAAPSPRNPPSR
VLSSDVNLRIQRLCQAGDLAAALRLLGSDGGVGVRSYCAVVQLCGEERSLEAARRAHALV
RAGTGGIIGSVLGKRLVLAYLKCGDLGGARMVFDEMPPRVADVRVWTSLMSAYAKAGDFQ
EGVSLFRQMQCCGVSPDAHAVSCVLKCIASLGSITEGEVIHGLLEKLGLGEACAVANALI
ALYSRCGCMEDAMQVFDSMHARDAISWNSTISGYFSNGWHDRAVDLFSKMWSEGTEISSV
TVLSVLPACAELGFELVGKVVHGYSMKSGLLWDLESVQSGIDEALGSKLVFMYVKCGDMG
SARRVFDAMPSKGNVHVWNLIMGGYAKAAEFEESLLLFEQMHELGITPDEHALSCLLKCI
TCLSCARDGLVAHGYLVKLGFGTQCAVCNALISFYAKSNMIDNAVLVFDRMPHQDTISWN
SVISGCTSNGLNSEAIELFVRMWMQGHELDSTTLLSVLPACARSHYWFVGRVVHGYSVKT
GLIGETSLANALLDMYSNCSDWHSTNQIFRNMAQKNVVSWTAMITSYTRAGLFDKVAGLL
QEMVLDGIKPDVFAVTSVLHGFAGDESLKQGKSVHGYAIRNGMEKLLPVANALMEMYVNC
RNMEEARLVFDHVTNKDIISWNTLIGGYSRNNFANESFSLFSDMLLQFKPNTVTMTCILP
AVASISSLERGREIHAYALRRGFLEDSYTSNALVDMYVKCGALLVARVLFDRLTKKNLIS
WTIMIAGYGMHGCGKDAVALFEQMRGSGVEPDTASFSAILYACCHSGLTAEGWKFFNAMR
KEYKIEPKLKHYTCIVDLLSHTGNLKEAFEFIESMPIEPDSSIWVSLLHGCRIHRDVKLA
EKVADRVFKLEPENTGYYVLLANIYAEAERWEAVKKLKNKIGGRGLRENTGCSWIEVRGK
VHVFIADNRNHPEWNRIAEFLDHVARRMREEGHDPKKKYSLMGANDAVHDEALCGHSSKL
AVTFGVLHLPEGRPIRVTKNSKVCSHCHEAAKFISKMCNREIILRDSSRFHHFEGGRCSC
RGHF
NT seq
3255 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcgacgcctccgctctcctccgtttccactcaccaccgtgccccaccaccatggccg
cctcccaagactgccaccagtccacgaacaaacttccgttgtggcgtgctggcgccaccg
gccggccaagttatagaggcggccgccgctgctccaagcccaagaaacccgcccagtcgg
gtcctgagctccgacgtgaacctgcgaatccagcgcctctgtcaggcgggtgacctcgcg
gccgctctgaggttgctgggctctgacggcggcgtcggtgtgcggagctactgcgcggtc
gttcagctctgcggggaggagcggtcgttggaggctgcgaggagagctcatgccttggtt
cgtgctggaactggtggaataatcgggagcgtccttgggaagaggttagtgctagcgtac
ctgaaatgcggcgacttgggcggggcaaggatggtgtttgatgaaatgcctcctcgagtc
gctgatgtccgtgtctggacttcgctgatgagcgcgtacgcgaaggctggtgatttccag
gaaggcgtttcgctgttcaggcagatgcagtgctgcggggttagtccggacgcgcatgct
gtttcctgtgtcctcaagtgcattgccagtttgggcagcattacagaaggcgaggtgatt
catggattacttgagaagttgggtcttggggaagcatgtgcggttgctaatgctctgatt
gcgttgtactcaaggtgtggttgtatggaggatgccatgcaggtatttgacagtatgcat
gcccgggatgccatctcttggaattctacgatcagtggatatttttcaaacggatggcat
gatagggctgttgatcttttcagcaagatgtggtctgaaggtacggagattagttcagtg
acagtgctcagtgttttgcctgcttgtgcagaattaggttttgagcttgttggaaaagtg
gtgcatggttattccatgaaatctggattgctttgggaccttgaatctgtacaaagtggg
atagatgaggctcttggatccaaattggtattcatgtatgtgaaatgtggtgacatgggc
tctgcaagaagggtgtttgatgcaatgccctcaaaaggtaatgtgcatgtatggaatctg
ataatgggtgggtatgcaaaggctgctgaatttgaagaaagtctcttgctttttgagcaa
atgcatgaacttggaattaccccagatgaacatgccctttcttgccttctgaagtgtatc
acttgtttgtcatgtgccagggatggcttggtagctcatggatatctagtaaaattgggt
ttcgggacacagtgtgcagtttgcaatgcactgatatcattctatgcaaaatccaacatg
attgacaatgcagtcttggtgttcgatagaatgcctcatcaagataccatttcttggaat
tctgtgattagtgggtgcacttccaatggattaaacagtgaagctattgagttgttcgta
agaatgtggatgcaaggacacgagctggactcaactacgttgctaagtgttttgccagct
tgtgcgcggtcacactattggtttgtaggaagggtggttcatggttactcggtcaaaact
ggattgattggggagacatctcttgcaaatgctcttcttgatatgtactcaaattgctca
gattggcatagcaccaatcagatattcagaaacatggctcaaaaaaacgtggtgtcttgg
acagcaatgatcacaagttataccagggctgggctgtttgacaaagtggctgggttactg
caagagatggtattagatggtatcaaacctgatgtatttgcagtcacgagtgtccttcat
ggttttgctggtgatgaatctttgaaacaaggcaaatctgtccatgggtacgccatcaga
aatggaatggagaagcttcttcctgttgcaaatgcacttatggaaatgtatgtgaattgc
aggaatatggaagaagcacggttggtttttgaccatgtgacaaataaggatataatctca
tggaatacactaataggaggttactccagaaataattttgccaatgaatccttcagtttg
ttcagtgacatgttgctccaattcaaacccaatacagtgaccatgacctgcatccttcct
gctgttgcaagcatttcatctttggagcgaggcagggagatacatgcttatgcacttcga
agaggattcctggaagatagttatacatccaatgcgcttgtggacatgtatgttaaatgt
ggtgcgttactggtagctcgagttttgtttgaccggttgactaagaagaacctcatatca
tggaccatcatgattgctggatatggcatgcatggttgtggaaaagatgctgttgccctc
tttgagcagatgagaggcagtggtgttgaaccagacacggcctctttcagtgccatattg
tatgcttgctgccattctggtcttacagctgaggggtggaaattcttcaatgctatgcga
aaggaatacaaaatagagcccaaactgaagcactacacctgtattgttgacctgcttagc
cataccggaaatctgaaggaggcctttgagttcatcgagtcaatgccgattgaacctgat
tcaagcatttgggtatcattgctgcacggatgtagaattcacagggatgtcaagcttgcg
gagaaggtagcagacagggttttcaagctggaacctgagaacacagggtactatgttctt
cttgccaacatctatgctgaggctgagagatgggaggctgtcaagaagctcaagaacaag
attggtggtcgagggctccgtgagaacactggctgcagttggattgaggtcaggggcaag
gttcatgtctttatcgctgataatcggaatcacccagaatggaacaggattgcagagttt
ctggatcatgttgccagaaggatgcgggaagaaggtcatgatcctaagaaaaagtattct
ctgatgggtgccaatgatgcagttcatgatgaggcactatgtggacacagctcaaagctc
gctgtcacattcggtgtgctgcatttaccggaagggcggccaatccgtgtgacaaagaac
tcaaaagtctgcagtcactgccatgaggctgccaagttcatatccaagatgtgcaacaga
gagatcattctgagagattcaagcaggttccatcattttgaaggaggcagatgttcttgc
agggggcacttctga
DBGET
integrated database retrieval system
