Styela clava (leathery sea squirt): 120329943
Help
Entry
120329943 CDS
T07291
Name
(RefSeq) sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1-like isoform X1
Organism
sclv
Styela clava (leathery sea squirt)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Sushi
WAP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
120329943
NCBI-ProteinID:
XP_039252679
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1100 aa
AA seq
DB search
MGSWTFYLVFFASSLWQLCNGDHRCGGACLDYRFTVCPAGYQTGKCSGGSFRRCCLPCDA
TCQSNEDSYNDDACEIALEGNCQDNTNYCPQGYIAGRCGGPAGRQCCPGGDYRCLQQGGT
CQDVVSNRCTRLYEPGFCSGNQFRQCCLPCDGACQNEINSYDNTACENLGGVCMHNSNYC
PRDYITGKCDGQGRDCCPGPDWQCLDIGGTCQNWIINVCIAGYEEGLCTEANSKCCRACD
STCQTTEQSYTDPACQNVPGTCRHSSNFCPLAYDSATCEGSGERSCCPLVSCGTTGFDNT
NGQENCDNNFFAESTCRFTCNIGSRLDGPGSMTCSMYDSGSWTPANAPMCSQISCPDLSF
TGDGTTFDCTNGNLWGSVCTYGCMDGYDLNPTPTLGSTIDVTCTDDTSWQPSPPSNPVCI
IRTCPELQFEGFITCVPPNSRDYETICSYTCPIGKEPAGGDGITLCGADSQWSGDQLQCD
DVNCGETGFDKTNGQENCDKNYFAGSKCDFTCNDGFRLVGTDSMTCLNSQSWEPGDAPTC
SQITCMTLSFVGQGTTFVCTTGNLWGGVCTYGCMDGYDLSPTPTLGSTIDVTCTDTSLWQ
PSPPSNPSCIIRTCTELQFEGTIDCTPPDSRNFGTICSYTCPDGKEPIGGSDKTLCESDG
QWSGDQLQCGVVMCQQLVFPPGIFVCTNGFDYHSECSFKCPIGTEPDVTGKVMKCEIDKQ
WSGSMPSSCDPISCGDYGEVENGQANCDSINFGGRCTVSCNFAYKAAGPDYVECEASKEW
SDPPLRCERIYCPALDFSDQPGTMTCDDNLPRFSYPSTCSFECVSGHDLTGTSSLTCQGS
GDWNGNVPTCKDVFCPDLTIEDGVIECTDGQNYASLCTFSCASGITLFGESILFCQSNSK
WSHDIPQCKLFDPDCPTSTATEPCIDECNNNGDCNEGKICCPNACASICMAVPTPEPPNR
NRNLLRTLTVFQLLQRRQRPVSSAPVCPPGRPPSPGCGSYLCNGIRCATNSQARCRVYSC
GGCWLQFFDSFGRRVSCSRTASCQPGLNQFSLCPTQCTRASCPRYPRAHCRVTCPWCPPQ
FYDQRTNRPITNCYNLIRLH
NT seq
3303 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaagttggacattttatttggtctttttcgcgtcatcattatggcaactgtgcaat
ggtgaccaccgatgcggaggtgcttgcctagattatcgcttcaccgtgtgccctgcagga
taccaaactgggaagtgttctgggggtagtttccgaagatgttgccttccatgcgatgcg
acttgtcagagtaatgaagatagttacaatgatgatgcttgcgaaattgccttagaagga
aactgtcaggataacacgaactattgtccacaaggatatatagcaggaagatgtggcgga
ccagccggccgccaatgctgtcctggtggtgattatagatgcttgcaacagggagggact
tgtcaagatgttgtttcaaatcgatgcacgagactttatgaacctggattttgttcagga
aatcagtttaggcaatgttgcttaccatgtgatggggcatgccaaaatgaaataaatagt
tatgacaatacagcttgtgaaaatcttggtggcgtttgcatgcacaattcaaactattgt
cctcgagactatatcacaggaaaatgcgatgggcagggacgcgattgctgccctggtcca
gactggcaatgtttggacattggagggacttgtcaaaattggattataaacgtatgcatt
gctggttacgaagaagggttatgtaccgaagcaaactcaaaatgctgtcgtgcttgtgat
agtacatgtcagacaaccgaacaaagttatactgatcccgcatgtcaaaatgttcccggt
acttgcaggcattcttcaaatttctgtccactagcgtacgatagtgcaacatgtgaagga
tcgggtgaacgtagttgttgcccccttgtcagttgtggaacaacgggatttgacaataca
aatggacaagaaaattgtgataacaacttttttgctgaaagtacatgccgctttacgtgc
aatattggttctcgattggatggcccaggttctatgacatgttctatgtatgatagcggg
agttggacacccgcaaatgcaccaatgtgttcacagatctcttgcccggacttaagcttt
actggtgacggaacgacatttgattgtacgaatggtaacttatggggaagcgtatgcaca
tatggatgtatggacggatacgacctaaatccaactccaaccttaggatccactattgat
gttacatgtaccgatgatacttcatggcagccttcacctccatcgaacccagtatgcata
ataaggacttgccctgaactgcaatttgaaggatttataacttgtgtgccgccaaatagc
agagactatgagacaatttgttcgtatacttgtccgatcggcaaagagccggcaggagga
gacggaataactttgtgcggagctgatagtcaatggtctggtgatcaacttcaatgcgac
gatgtaaattgtggagaaacaggatttgacaaaacaaatggacaagaaaattgtgacaaa
aactattttgctggaagtaaatgcgactttacctgcaatgacggttttcgattggttgga
acagattctatgacgtgtttaaatagtcagagttgggaacccggcgatgcaccaacatgt
tcgcaaatcacctgcatgacattaagctttgtcggccaaggaacaacatttgtttgcacg
actggcaacctatggggtggtgtctgcacatatggatgtatggacggatacgacctaagt
ccaactccaacattaggatccactattgatgttacatgtacagatacttctttatggcag
ccttcacctccatcaaacccttcatgcataataaggacttgtactgaactccaatttgaa
ggaacaatagattgtactccaccagatagcagaaactttgggacaatttgttcatatact
tgtccagacggcaaagaaccgataggaggaagcgacaaaacgttgtgcgaatctgatggt
caatggtcgggtgatcagctacaatgcggagtcgttatgtgtcaacaacttgtttttccg
cccgggatctttgtatgcaccaatggttttgactatcatagcgagtgcagttttaaatgt
ccaattggtacagaaccagacgtgaccggaaaggtcatgaaatgcgaaattgataagcaa
tggtcaggatcaatgccatcgtcatgcgatccgatcagctgtggtgattatggcgaagtt
gaaaacggacaagcaaattgtgacagtattaattttggaggccgttgcactgtttcatgt
aatttcgcttacaaagctgctggtccagattatgtagaatgtgaggcatcaaaagaatgg
agtgatccgccgctaagatgtgaacgaatttattgtcctgcactagactttagtgatcaa
ccgggtactatgacttgcgatgataatttgccacgatttagttatcccagtacttgcagc
ttcgagtgtgtttctggacatgatctgaccggaacatcatctttaacttgccaaggaagt
ggagattggaatggaaatgtacctacatgcaaagacgtgttctgtcccgatctgactata
gaggatggggtgatcgaatgtacagatggtcagaactatgctagtctatgcacattttcg
tgcgcatcggggattacattatttggagaaagtatattattctgccagtcaaattcaaaa
tggtctcacgatatacctcaatgcaaattattcgatcctgattgtccaacatcaactgct
actgagccttgcatagacgagtgcaataataatggagattgcaatgagggtaaaatttgt
tgtccgaacgcttgtgcatcaatttgcatggctgttccaacaccggaaccaccaaatcga
aatcgaaatctcctgagaactttaacagtatttcaattgctacaacgacgtcaacgacca
gtctcttctgctcctgtgtgtccacccggtagacctccatcgccaggatgtggaagttac
ctgtgtaatgggattagatgtgctaccaattctcaggctagatgccgcgtatacagctgt
ggtggatgttggcttcagttttttgatagctttggacgacgtgtatcatgctctcggacg
gcatcgtgccagccaggactgaatcaattttctctatgcccaacacaatgtacaagagcc
tcatgtccaagatatccaagagctcattgcagagtgacttgtccatggtgtccaccgcag
ttttatgaccagagaacgaatcggcctataactaattgttataaccttatacgcttgcat
taa
DBGET
integrated database retrieval system
