Scleropages formosus (Asian bonytongue): 108919855
Help
Entry
108919855 CDS
T04919
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 2-like
KO
K20994
Notch 2
Organism
sfm
Scleropages formosus (Asian bonytongue)
Pathway
sfm04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
108919855
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
EGF_2
Ank_2
Ank
Notch
NOD
Ank_5
NODP
Ank_3
Ank_4
EGF_3
JAG1-like_EGF2
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108919855
NCBI-ProteinID:
XP_029110431
LinkDB
All DBs
Position
9:4229795..4274835
Genome browser
AA seq
2456 aa
AA seq
DB search
MDRFPRITSGKGIIFVLFIACCIPFSGALQCLDATKPCVNNATCITFKNGTGHCRCTPGF
LGEYCHHRDPCHPGYCLNGGNCSSSWSGVPGSPTCSCPLGFTGQNCQTPQNSACYPNNPC
ANGGVCSLLSLDKYKCHCPPGWTGSRCLQEDSCISNPCANGGTCNTLSGGKFNCICSKEY
QGLHCLNDTDECAQSPDVCYNGGVCVNTLGSFYCSCPAGFTGRNCETPYVPCSPSPCVNG
GTCRPTSDTTYWCHCLPGFNGTNCEINIDDCPDHRCQNGGTCMDGVNTYNCQCPPEWTGQ
FCTEDVDECRLQPNTCQNGGTCSNTPGGYNCVCVNGWSGTDCAENIDDCATAACTEGSTC
IDRVASFICTCPFGKTGLLCHVDDACISNPCREGAQCDTNPINGKFNCNCPPGYVGSTCK
DDINECTMGSNPCEHGGQCVNTEGSFTCNCARGYSGPRCEQDLNECASNPCRNDATCLDQ
IGDYTCICMPGFEGVHCEIDVNECASSPCLNSGKCFDQVNRFVCHCPPGFSGDMCQVDND
ECASTPCHNGAKCIDRPNGYECECAEGFTGTLCEENVDDCDPKPCHHGVCRDGIAMYTCD
CHPGYTGLICNTQVQECQSNPCQNRGRCIDLVNKYQCNCLAGTTGVNCEINFDDCASNPC
VYGECQDGINEYKCVCTPGYTGEKCDVQINECDSNPCLNGGTCEDGLNEFSCVCPPGTHG
LLCYSGADLCASRSCGHGECIELHDGYRCDCVQGWMGQHCEQEVDECQSDPCQNGGTCTD
RPSGYTCKCTRGFTGVNCAINIDECKSNPCMNRGTCVDGVNGYKCICSLPYTGPQCIEKI
DECGTNPCQNRGHCITSQGSYQCKCEPGYSGINCEVNIDDCTPNPCLNGGSCLDGVGGYS
CDCQPGFEGERCETEVNECLSNPCRNNGKCNDYVNSYSCKCPPGYNGIHCEHNIPECTES
SCLNNGTCIDGINTFSCHCRPGFTGAFCQYEINECDLQPCKNGGTCTDGLGSYYCSCPVE
YTGPNCQFLTDFCSQPLCVNGGTCIQNGTVWMCRCTTGWAGLYCDVPSMSCHAVAVRQGV
SVDMVCQHAGRCLDVGNAHRCHCQAGYTGSYCETEVDECLSNPCRNGATCVDYQGAYECK
CKPGYQGVNCQYDVDECQSQPCLHGGTCINLVNHFSCSCPPGTHGVRCEMDEDDCEPEPG
SLAPRCLNGGQCVDAVGHFTCSCPPGFAGERCEGDINECLSAPCHAPGSLDCIQLANDYQ
CRCRLGYTGRHCESMVDLCKSKPCHNGGTCSMNTSSVHGYICICQIGFSGFNCGEVEGYG
CTSLRCQNGGRCHDSAGGQIQCLCPPGFSGPHCEVALSCQSRPCLNGGVCSPDPRSPNQY
TCQCPPAFSGRNCEMLRSAPPLSPVPTCPYDECKKHAGDRVCDMDCNRHECAWDGGDCSL
HWEQPWERCDATVECWKLFRNGRCDPQCDNPQCLFDSFECQSSPFLCKYDKYCADHYANG
HCNQGCNTEECGWDGLDCAGDIPPQVADGTLVVVVLLQPDELLGDLRGFLRALGTLLHTN
LRVKLDAQQKPMVYPYFGPDPESDTGAPSERRWKRELVNKEVIGSKAYLEIDNRQCSQVS
ESCFSNTKLAASYIAAEYLKKELPYPVIAVNSEPREPPHPPHLLYVVAVAVGIILLILVL
GVLVAKRKRKHGILWLPDGFLTKKDAKRREPVGQDDFGMKNMGKPQDGGMMDANQNQRWP
EEESQAKKSRTEDKPLLPVGVDGGVDRREWTLQHHKAADITLTPPQAELDVDCLDVNVKG
PDGFTPLMLASLRSGGSDDCGSLMGDEEEESGADEPGANIITDLIAQGATLMAQTDRTGE
TALHLAARYARADAAKRLLDAGADPNARDNMGRTPLHAAVAADAQGVFQILIRNRATELD
ARMNDGTTPLILAARLAVEGMVEELVHCHADVNAVDDHGKSALHWAAAVNNVEATLVLLK
NGANRDMQDNKEETPLFLAAREGSFEAAQILLDHYSNRDITDHLDRLPRDTAQERMHHDI
VRLLDQYNLVHSPHAGQSHVSGGGAHSSMVCGTNGVGFVGMRQGPQGKKSRRGGAKVGGA
AGGVAKELKDMKAKRRKKPAGGEGPLAGAAGGGSSTATTKTKSGLSESSVTLSPVDSLES
PHSFAGDTTNAVSAATSPPLLGSPSSRPLLPPVSHMLGQQQGWVSLAKQGYGGHMFGLVP
HQLSTSHTGLAQPHASSLLTPMNVTMSREQLPPIVTFQMMPPGSGQALLKQPQPGQVQSQ
SQPHAQQIPPHLQSTQGMIYQLPEVGLPPPLSHTLPHPQPHSHAIPHSNGLMDAQSRQLP
PYHSLQSPVDKYPTPPSQHSCTTGGSEGTTPGHPAHPPSEHPYLTPSPESPDPWSSSSPH
SNSDWSDVTTSPTPLGNSHALPSSRHTHIPEQAQLQPQAQQMQSQQPQHGSMQVYA
NT seq
7371 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaccggtttccccgtattacttcgggcaaaggcatcatcttcgtcctattcatcgcc
tgctgcatcccgttctcgggagctctgcagtgtctagatgccacgaagccctgcgtgaac
aatgcgacctgcatcacctttaaaaatggcacaggacactgcaggtgtacccctggcttc
ttaggggagtactgccatcacagagacccctgtcacccaggctactgcctcaatgggggc
aactgcagttccagttggtctggggtgccaggtagccccacctgttcgtgtcccctaggt
ttcactggtcagaattgtcagaccccgcagaattctgcttgctatcccaataacccttgt
gcgaatgggggtgtctgcagcctgctgtccctggacaaatataaatgtcactgccctcct
ggttggacaggctcccgatgcctccaagaggacagctgcatctcaaatccttgtgccaat
ggtggcacctgcaacaccctatctggggggaagttcaactgcatttgctccaaagaatac
caaggactccactgcttgaatgacacagacgaatgtgcccagtcaccagatgtgtgctat
aatggtggagtatgtgtgaacacattgggctccttctattgttcgtgtccagcaggtttt
acagggcgcaattgtgagactccctatgtgccctgctcaccctcaccgtgtgtcaatggg
ggaacctgccggccaacttctgacaccacgtactggtgccattgtctcccagggtttaat
ggaacaaactgtgaaattaatattgatgactgccctgatcaccgctgccagaatgggggc
acctgcatggatggtgttaatacttacaactgtcagtgtccacctgagtggacaggtcag
ttctgtactgaagatgtggatgagtgtcgcctgcaaccaaacacttgtcagaatggaggc
acttgcagtaatacgccagggggctacaactgtgtatgtgtaaatggctggagtggcact
gactgtgcagagaacattgatgactgtgccacagcggcctgcacagaaggctccacctgc
attgaccgtgtcgcctctttcatatgcacctgtccttttgggaagactggcttgctttgt
catgtggatgatgcttgcatcagtaacccatgtcgtgagggggcgcagtgtgacaccaat
cccatcaatggcaagtttaactgcaactgtcctcctggctatgtgggcagcacttgtaaa
gatgacatcaatgaatgcaccatgggttctaacccttgtgaacatggtgggcagtgcgtc
aacacggaagggtccttcacgtgtaactgtgcccggggctactccggaccccgttgtgaa
caggacctcaatgaatgtgcctccaacccttgccgcaatgatgccacctgtctggaccag
attggtgactacacctgcatctgtatgccagggtttgaaggtgtgcattgcgaaatcgat
gttaatgagtgtgcaagttccccttgtctaaacagcgggaaatgctttgaccaagtgaac
cgatttgtgtgccactgccctccaggcttcagtggggacatgtgccaggtggacaatgat
gaatgtgccagcacaccatgccacaatggtgccaagtgcattgatcgccccaacggctat
gagtgcgagtgtgctgaaggcttcacagggacattatgtgaggagaatgtggatgactgt
gacccaaagccctgccaccatggtgtgtgccgtgatggcattgccatgtacacttgtgat
tgccacccaggctacactggcctcatttgcaacacacaggtacaggagtgccagagcaac
ccctgccagaaccgtggccgttgcatcgaccttgtcaacaagtaccagtgcaactgcctt
gctgggaccaccggagtgaactgtgagatcaactttgatgactgtgccagtaacccatgt
gtatacggagagtgtcaggatggtatcaatgagtataagtgtgtgtgcaccccaggatac
acaggcgagaagtgtgacgtgcagatcaatgaatgcgactcaaacccatgcctgaatggg
gggacatgtgaggacggtttgaatgagttctcctgtgtttgtccccctggcacccatggg
ctcctctgctattcaggggccgacctctgtgcctcacggtcctgtggccacggtgaatgt
attgagctgcatgatgggtatcgctgcgactgtgtgcaaggctggatggggcaacactgt
gagcaagaagtggatgagtgccagtcagatccgtgccagaatgggggcacctgtactgac
cgaccaagtggatacacctgcaagtgcacccgtggtttcacaggtgtgaattgtgcgatc
aacatagatgagtgcaagtccaacccttgcatgaatcgggggacctgtgtggatggagtt
aatggctacaagtgtatctgctccctgccatatacaggtccacagtgcattgaaaagata
gatgagtgtggcaccaacccgtgccagaacaggggccactgtattaccagccaagggagc
tatcaatgcaagtgtgaacccgggtacagcggcataaactgtgaggtcaacattgatgac
tgcactcccaatccctgtttaaacggaggttcatgtttggatggagtggggggctactcg
tgcgattgccagcctggttttgaaggtgaacgttgtgagactgaagtgaatgagtgttta
tccaatccatgtcgcaacaatggcaaatgcaatgactatgtgaacagctactcatgcaag
tgcccaccgggctacaatggaattcactgtgagcacaacatccctgaatgcactgagagc
tcctgtttaaataatggcacatgcatagatggaataaataccttctcatgtcactgtcgt
cctggcttcactggtgccttctgtcaatatgagatcaatgaatgtgacttgcagccctgc
aagaatggaggcacttgcacggatggccttgggtcctactactgctcttgtcctgtagag
tacacaggccccaactgtcagttcttgacagacttttgcagccagcccctatgcgtcaac
ggtgggacctgcatacaaaatgggacagtgtggatgtgccgctgcaccacaggctgggca
ggcctttactgtgatgtgcctagtatgtcttgtcatgccgttgctgtccgtcaaggtgtg
tctgtggacatggtgtgtcagcacgctggccgctgcttagatgtgggaaacgcccaccgc
tgccactgtcaggctggctacaccggcagctactgtgagaccgaggtggatgaatgcctg
tcaaacccatgccgcaatggcgccacctgtgtggactaccagggggcatatgagtgtaag
tgcaagcctggctaccagggggtcaactgtcagtatgatgtagatgagtgccagtctcag
ccctgcctgcatggggggacttgcatcaacctggtcaaccacttttcctgctcctgcccc
ccaggcacacatggtgttaggtgtgagatggatgaagacgactgtgagccagagcctggc
tctttggcaccccgttgcctgaatgggggtcagtgtgtggatgctgtgggccatttcaca
tgctcttgccctcctggttttgctggtgagcgctgtgaaggtgacatcaatgagtgtctg
tctgcaccctgccatgcccctggcagccttgactgcatccagctggccaatgactaccag
tgccgctgccgcctgggctacacaggacggcactgtgaatcaatggtggatctgtgcaag
tctaagccatgccataacggtggtacctgctccatgaacactagttcagtacatgggtac
atctgcatctgccaaattggtttctcagggttcaactgtggggaggttgagggctatggt
tgtaccagtttgcgctgccagaatggtggccgctgccatgactcagcaggagggcaaatc
cagtgcctctgtccacctggcttcagtggcccacattgtgaagtcgccctaagttgtcaa
agtcggccctgcctcaatgggggtgtctgctctccagaccctcgcagccccaaccagtac
acctgccagtgtccccctgccttctctggcaggaactgcgagatgctacgctctgctcca
cccttatcccccgtacctacctgcccgtacgatgagtgcaaaaagcatgccggtgacagg
gtttgtgacatggactgtaaccggcatgagtgtgcctgggatggtggtgactgctcactg
cactgggaacagccatgggagcgctgcgatgccactgttgagtgttggaagctctttcgg
aatggccgctgtgaccctcagtgcgacaacccacagtgcctctttgacagctttgaatgc
cagtcctccccgttcctctgcaagtatgacaagtactgtgcagaccattatgccaatggc
cactgcaaccaggggtgcaacacagaagagtgtggctgggatggcctagactgtgcaggt
gatatcccaccacaggtagctgacggcacacttgtggtggtggttctgctgcagccagat
gagctgttgggggacttgcgtggcttcctgcgtgcactggggacactgctccacaccaac
ctgcgtgtcaagttggatgcccagcaaaaacctatggtgtacccctactttggcccagat
ccagagagtgacactggggccccatctgaacgtagatggaaacgagaactggtcaataaa
gaggtcatcgggtccaaggcatacctggagattgataaccgccagtgttctcaggtctcc
gagtcctgtttctcaaacacaaagctagctgcctcctacatagctgcagagtatctgaag
aaggagctgccctaccctgtcattgctgttaacagtgagcccagggaaccgccacaccct
ccccatttgctgtatgtggttgctgtagcagtggggatcattctgctcatcttagttctg
ggtgtgctggtcgctaagcggaagcgcaagcatggcatcttgtggctccctgatggcttc
ctcaccaagaaggatgccaagcgccgtgagcctgtgggccaggatgattttggaatgaag
aacatgggaaaaccacaggatgggggtatgatggatgccaaccaaaaccaacgctggcca
gaagaagaatcacaggctaagaaatcaagaacagaggacaagccccttctacccgttgga
gttgatggaggtgtggaccgcagggagtggacactacagcatcacaaggctgctgacatc
accctgacacccccccaggctgaacttgatgttgactgtctagatgtcaatgttaaagga
ccagatggatttacccctctgatgctggcctccctgcgtagcggggggtcagatgactgc
ggcagcttgatgggagatgaggaggaggagagtggggcagatgagccaggggcaaacatt
atcactgacctcatcgcccaaggtgctacgcttatggcacagacagaccgcactggtgag
acagcgctacatctagctgctcgctatgcccgtgctgatgcagccaagaggctgttggat
gctggagctgatcctaatgcacgcgacaacatgggtcgcaccccactgcatgctgctgtg
gctgcagatgcccagggtgtgttccagatcctgattcgaaaccgagcaactgagctggat
gcaagaatgaatgatggcaccacacccctcatcctggcagcacgcttggcagtggagggt
atggtggaggagcttgtgcactgccatgctgatgtcaatgcagtagatgaccatggtaag
tctgcattgcactgggcagcagctgtcaacaatgtggaggccactctggtgttgctgaag
aatggagctaacagagacatgcaggacaacaaggaagaaacaccgttgttcctggcagct
agggaagggagctttgaggcagcccagatactgctagaccattactccaacagggacatc
acagaccacctggaccggctgcctcgagacactgcacaggagcgtatgcaccatgacatt
gtgcgcctgctggatcagtacaaccttgtccacagccctcatgcaggccagagccatgtg
tctggtgggggtgcacactcttccatggtctgtggcactaatggggtgggctttgttggc
atgcgccaagggccccagggcaagaaaagtcggaggggcggtgccaaagtgggaggagct
gctgggggtgtggcaaaggagctgaaggacatgaaggcaaagcggaggaagaagccagct
ggaggagagggacccttagcaggggctgcaggaggtggcagtagcacagccaccacgaag
accaaaagtggcctgtcagaaagctctgttaccttgtctcctgttgattctctggagtct
ccacactcatttgccggagataccactaatgcagtcagtgcagccacctccccaccactc
cttggcagcccttcatccaggcccctcctacctccagttagtcacatgctggggcaacag
cagggctgggtgagccttgccaagcagggatatgggggccacatgtttgggcttgtaccc
caccagctgagcacctcccacactgggctagctcagccacatgcctccagccttcttact
cccatgaatgtcaccatgagccgtgagcaattgcccccgatcgttaccttccagatgatg
ccaccaggcagtggacaggccttgctgaagcagccacagcctggccaggtgcaaagccag
agtcagccccatgcccagcaaattccacctcatctgcagtccacccaaggtatgatatac
cagctgcctgaggtagggctgccaccccccctgtcccacaccctcccgcacccccaaccc
catagccatgccatcccccacagcaatggcctgatggatgcccagtcccgccagctgcct
ccctaccacagtttgcagagccctgtggataagtaccccacaccaccatcccagcacagc
tgcaccacaggtggatctgaaggcacaacaccagggcacccggcccaccctcccagtgag
cacccctacctcactccgtcaccggagtcccctgacccctggtcatcgtcctctccccac
tccaactcggactggtctgatgttaccaccagccccacacccctggggaactcacatgca
ctaccctcttcccggcacactcacattccggagcaggcacagctgcaaccgcaagcgcag
cagatgcagtcacagcagcctcagcatggcagcatgcaagtgtatgcataa
DBGET
integrated database retrieval system
