Scleropages formosus (Asian bonytongue): 108939013
Help
Entry
108939013 CDS
T04919
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
KO
K02599
Notch 1
Organism
sfm
Scleropages formosus (Asian bonytongue)
Pathway
sfm04330
Notch signaling pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sfm00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
04330 Notch signaling pathway
108939013
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
Ank_2
EGF_2
Ank
Notch
NOD
NODP
Ank_3
Ank_5
Ank_4
EGF_3
cEGF
DL-JAG_EGF-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
108939013
NCBI-ProteinID:
XP_018615604
LinkDB
All DBs
Position
17:1709838..1739042
Genome browser
AA seq
2508 aa
AA seq
DB search
MYYFLEKVLTLLMSLAAIGQGLRCSLPTESCLNGGRCIASPHGDGECRCMESFVGNRCQF
SNPCSYSPCKNGGTCRAVIHENTVDFTCACHLGFSDRFCLTPTNNVCMSSPCRNGGTCEL
ISLKEYKCRCPPGWSGKLCQQADPCAANPCANGGQCTPLESHYICTCTPFFTGQTCKQDV
NECALSPSPCKNGGVCVNQFGSYHCSCPQEYTGAHCEVPYMPCSPLPCHNGGTCVQKGDA
TYECICLPGFTSQNCEHNIDDCPEHRCQNGGTCVDGVNTYNCQCRPEWTGQFCTEDVDEC
QLMPNACQNGGTCHNTHGGYHCVCVNGWTGDDCSENIDDCANAACYHGATCHDRVASFFC
ECPHGRTGLLCHLDDACISNPCQRGSNCDTNPVNGKAICTCPLGYFGSACDQDVDECSLG
GNPCEHGGKCLNTKGSFQCRCLQGYSGPRCEMDVNECLSNPCKNDATCLDQIGGFHCICM
PGYEGVFCEVNTDECASMPCLNNGKCVDRINTFHCECPTGFSGNLCNVDFDECASTPCKN
GAKCTDGPNKYTCECAEGYTGQHCETDINECYSDPCHYGTCKDGLASFTCNCWPGYVGRL
CETNVNECLSQPCQNGGICQDRENTYVCTCPKGTTGLNCEINLDDCKSKLCDYGTCIDRI
DGYECACEPGYTGATCNIDIDDCAPNPCHNGGTCVDGINSFKCDCPEGYNDATCLYQVNE
CISNPCIHGYCEDEVKSYKCVCDLGWSGINCEINNNECESNPCMNGGTCKDMTAAYVCIC
PMGFSGPNCQTNINECASNPCLNQGTCIDDVAGYKCNCLLPYTGENCQKVMAPCSSKPCK
NGGVCQASEDYRSFSCVCPEGWQGQTCEADINECVKNPCHNGATCQNMIGGYRCSCKPGF
TGPICETNIDDCKPNPCSNGGFCKDEVNNFVCTCLPGFRGQKCEEDINECNSNPCKNGAN
CTDCVNSYTCTCPAGFSGIRCENNTPDCTESSCFNGGTCVDGINSFTCLCPPGFTGNYCQ
HDINECDSRPCLNGGTCLDTYGTYKCTCPQGYTGPNCQNLVRWCDSSPCKNAGTCWQTGI
SYSCECQSGWTGLYCDVPSVSCDVAAKQQGLDVAQLCKNSGQCLDTGNTHYCHCQAGYTG
SYCEEQVDECSPNPCQNGAICTDYLGGYTCECVPGYHGVNCSKEINECLSYPCQNGGTCI
DLINTYKCSCPRGTQGVHCEINMDDCTPFVDPITHEPKCFNKGKCVDRVGGYSCICPPGY
VGERCEGDVNECLSNPCDPRGTQNCIQLTNNYHCECRMGYTGKHCEAVFDGCQGKPCHNG
GTCAVASNTPRGFICKCPAGYNGSTCENDARSCGSLHCQNGGTCISGHKSPKCLCTEAFT
GPECQYPVDSPCNSNPCYNGGTCQYMVETHLYHCICPMNFNGLLCHILDYTFLGGFGRDI
TPPPEISVSCEIAQCEERRGNKICDSLCNNHACGWDGGDCSLNFDDPWQNCTASLQCWRY
FNDGKCDEQCNSAGCLYDGFDCQSMEGQCNPLYDQYCKDHYADGHCDQGCNNAECEWDGL
DCANNMPEKLAEGSLVLVVHILPEQLKNNSFGFLRELSRVLHTNVVFRKDSHGGPMIYPY
YGSQQELKKHNIKRSVDTWTQIPGDVFSQMKMSMHTVVNARHRRELDTMQIKGSVVYLEI
DNRQCYQQTTECFQSATDVAAFLGALASSGHLKVPYIIEAVTSENETQPTSEMYPVYVVL
AGLILLAFIGVGMVVSRKRQREHGQLWIPEGFKTSDPNKKKRREPVGEDSVGLKPLKNSL
DMSLIDDNQSEWEEDMASDTKRFRFETAMLDLSDQTDHRQWTQQHLDAADLRIPSIAPTP
PQGEIESDCIDVNVRGPDGFTPLMIASCSGGGLEMGNSEEEEDASANVISEFLYQGANLH
NRTDRTGETALHLAARYARSDAAKRLLEASADANIQDNMGRTPLHAAVAADALGVFQILI
RNRATDLDARMYDGTTPLILAARLAVEGMVEELINCHADVNAIDDSGKSALHWAAAVNNV
DAVIVLLKSGANKDMQNNKEETPLFLAAREGSYETAKVLLEHFANREITDHMDRLPRDIA
QERMHHDIVQLLDEHSLGRSPAIHSGPISATLSPQLCSPNSYLGSMKPSGQSKKLRKPNA
KGICCKDGKDMKVKKKKNQDGKGSLLDSSAVLSPVDSLDSPHGYMSDSASPSLITSPFQQ
SPSMSLNHLQGMSDTHVGISSSGIVGKQDLGGMQFDHGPPRLSHLPVSSPSSLVSMTQGM
GRPGGVMTSQCDWLSRMHTGLGQQGLFNPMNGAGGLQHGMLPSLQNDMPVTTLSTMIGYR
GLQSNHLNMQTHVIQVQQMPQVQQNQQQQSLQVQHQNSNTATNGPVISQSFISSDLNSSD
VQPVSGSIAVHTLLPQETHVLPSPLSQTMASTQFLTPPSQHSYTAPLDNTPSHQLQVPDH
PFLTPSPGSPDQWSSSSPHSNMSDWSEGISSPPTSMQSKIGHVPDQFK
NT seq
7527 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtattatttcttagagaaagtattaacacttctgatgtcactggccgctataggacaa
ggtttgcgatgttctctgcccactgagtcgtgcctgaacggagggaggtgcatcgcctcc
ccacatggcgatggagagtgcaggtgtatggagagttttgttgggaacaggtgccagttt
tctaacccttgtagctattctccttgcaaaaacggtggtacgtgtcgagcggtcattcat
gagaacacagtagacttcacctgcgcctgccacctgggattttctgaccgcttctgcctg
acaccaaccaacaatgtatgtatgagctccccctgcaggaatggaggaacttgcgagctg
attagtctcaaggagtataaatgccgctgtcctccaggctggtcaggtaaactgtgccag
caggcagacccctgtgctgctaacccttgtgccaatggtggccagtgcactccccttgaa
tctcactacatctgcacctgcaccccatttttcacagggcagacatgcaagcaagatgtc
aatgaatgtgccctcagcccttccccatgcaaaaatggcggggtgtgtgtgaaccagttt
ggctcctaccactgcagctgtcctcaggagtacacaggtgcacattgtgaggttccctac
atgccctgcagccccttgccttgccataatgggggtacatgtgtccaaaaaggagatgcc
acttacgaatgcatctgtctgccaggcttcacaagtcaaaactgtgagcacaacattgat
gactgtccagagcaccgctgtcagaatggtgggacatgtgttgacggagtgaatacctat
aattgccagtgtcgacctgagtggacaggccaattctgcacagaggatgtggatgagtgt
cagcttatgcctaatgcatgccaaaatggtggaacttgccacaacactcatggtgggtat
cactgtgtttgtgtgaatggctggaccggtgatgactgcagcgagaacatagatgactgt
gctaatgcggcctgttaccatggtgctacctgtcatgatcgggtggcctccttcttctgt
gagtgtcctcacggccgtacaggactgttatgtcatttggatgatgcatgtatcagtaac
ccatgtcagcgaggctctaactgtgacaccaaccctgttaatggaaaagccatttgcact
tgtcccttgggctattttggctctgcctgtgaccaggatgttgatgaatgctcccttggt
ggcaacccctgtgaacatggaggaaaatgcctgaacaccaagggctcctttcagtgtcga
tgcctgcagggctattcagggccgcgttgtgaaatggatgtcaacgagtgcctttccaac
ccttgcaagaatgatgctacctgcctagaccagataggtggcttccattgcatctgcatg
ccagggtatgaaggagtgttctgtgaagtcaacacagatgagtgtgccagcatgccctgc
ctgaacaatgggaagtgtgtggacaggatcaacaccttccactgcgagtgccccacaggg
ttttctggaaatctgtgcaacgtggactttgatgagtgtgccagcacaccctgcaaaaat
ggggccaagtgcacagatggacctaataagtacacctgtgagtgtgctgaaggatatact
gggcaacattgcgagaccgatatcaatgagtgttactcagacccatgtcattatgggacc
tgcaaagacggccttgcctccttcacctgtaactgttggcctggctatgtcgggcgccta
tgtgagaccaacgtcaacgagtgtttgagtcagccatgtcagaatgggggcatctgccag
gacagagaaaacacatatgtctgtacatgcccaaagggcaccacaggattaaactgtgaa
atcaaccttgatgactgcaagagcaaactgtgcgattatgggacgtgcatagacaggatt
gatggatacgagtgtgcctgtgagcctggctacacgggagcaacgtgcaacatcgacatt
gatgactgtgctcccaacccgtgtcacaatgggggcacctgtgttgatggcatcaacagt
ttcaagtgtgattgccctgaagggtataatgatgccacatgtctctatcaggtcaatgag
tgcatcagtaacccttgtattcatggatactgtgaagatgaagtcaagagctataaatgt
gtttgtgacttgggatggagtggcataaattgtgaaatcaacaataatgagtgcgaatca
aacccctgtatgaatggaggtacctgcaaggatatgactgctgcctatgtctgcatctgc
cctatgggtttcagtggtccaaactgccaaactaacatcaatgagtgtgcctctaaccca
tgcctgaatcaagggacctgcattgatgacgtggctggctacaagtgcaattgcttgcta
ccatatactggagagaactgtcagaaagtaatggctccatgcagctcaaaaccttgtaaa
aatggaggagtttgccaggcatcagaggactacaggagcttctcctgtgtatgccccgaa
ggatggcaagggcaaacatgtgaagccgacatcaatgagtgtgtaaaaaatccttgtcac
aacggtgccacatgccaaaacatgattggtggctaccggtgcagctgcaagcctgggttt
actggtccaatctgtgagacaaacattgatgactgcaagcccaatccttgcagcaatggt
ggtttctgcaaagatgaggtcaacaattttgtgtgcacttgcctgcctggcttccgtggc
caaaaatgtgaggaggacatcaatgagtgtaacagtaacccatgtaagaatggagctaac
tgcactgactgtgttaacagctacacctgcacttgtccggctggtttcagtggcattcgc
tgtgagaacaacacgcctgattgcacagagagttcctgcttcaatggtgggacatgtgtc
gatgggatcaacagcttcacctgcttgtgcccacctggctttacaggcaactattgccag
catgatatcaatgaatgtgactccagaccctgtttgaatgggggcacttgcctagacact
tatggaacctacaagtgcacctgtccccagggttacacagggccaaactgtcagaacctg
gtacgctggtgtgattcatccccctgtaagaatgctggcacctgctggcagactggcatc
tcatacagctgtgaatgtcagagtggctggactggactctactgtgatgtaccaagtgtc
tcctgtgatgtggcagccaaacagcaaggactggatgtggctcaactgtgtaagaattct
gggcagtgtctggatactggcaacacccactactgtcattgccaagcagggtatacaggc
agctattgtgaggaacaggtggatgaatgcagccccaatccttgtcaaaatggtgccatc
tgcacagactatctgggaggatacacctgcgagtgcgtgccggggtaccatggggtgaac
tgctccaaggagatcaatgagtgcctctcctacccctgccaaaatggaggcacctgtatc
gacctaatcaatacctacaagtgctcctgcccccgagggacacaaggtgtccactgtgaa
attaacatggatgactgcacaccatttgttgaccccatcactcacgagcccaagtgcttc
aacaagggcaagtgtgtggaccgtgttggtggctacagctgcatttgtccaccagggtac
gtgggagagcgctgtgagggggatgttaatgagtgcctttctaacccctgtgacccacga
ggcacccagaactgcattcagctcacaaacaactatcactgcgaatgtaggatgggctac
acagggaagcactgtgaagcagtgtttgatggctgtcagggcaagccctgtcacaatgga
ggtacttgtgctgtagcaagcaacactccacggggtttcatctgcaaatgcccagcaggc
tacaatggttctacctgtgagaatgatgctcgttcctgtggcagcctgcactgtcaaaat
gggggaacttgtatttcagggcacaagagcccaaaatgtctatgtactgaagccttcacg
gggcctgaatgtcagtacccagtggacagcccctgcaattctaacccctgctacaatggg
ggcacttgccagtatatggttgagacacatttataccactgcatttgccccatgaacttc
aatggtcttctctgtcacatccttgactacaccttcttggggggatttgggcgggatatc
acacccccacctgagatctcggtgagctgtgagattgcacagtgtgaggagcgccggggc
aacaaaatctgtgacagcttgtgtaataatcatgcttgtggctgggatggtggggactgc
tcgctcaactttgacgacccctggcagaactgcacagcctcactgcagtgctggagatac
ttcaatgatggcaaatgtgatgagcagtgcaacagtgctggctgcctgtacgatggattt
gactgccaaagcatggagggccagtgcaacccactttatgaccagtattgtaaggaccac
tacgcagatggtcattgtgaccagggttgcaacaatgcagagtgcgagtgggatggcctg
gattgtgccaacaatatgccagagaagctggcagaagggagtctggtgctggtagtgcat
attctaccagaacagttgaagaacaactcctttggttttctgcgtgaattaagccgagta
ctacacaccaatgtggttttccgcaaggacagccacggaggtccaatgatctacccctat
tatggcagccagcaggaactgaagaagcataatatcaaacgttcagtagacacctggacc
cagatccctggtgatgtcttcagccaaatgaagatgagcatgcacaccgttgttaatgct
cgtcaccgcagggaactggacaccatgcaaatcaaagggtcagttgtgtaccttgaaatt
gacaatcgccagtgctaccagcagaccactgagtgtttccagagtgccacagatgtggct
gcattcctgggagcattggcttccagtggccatctgaaagttccctacatcatagaggcc
gtcaccagtgaaaacgagactcagccaacctcggaaatgtacccagtttatgtggtgctg
gcaggcttgatcctcctggcctttatcggcgtgggcatggtggtctcccgtaaacggcag
cgtgaacacggacagctctggatcccagagggattcaaaacaagtgatccgaacaaaaag
aagaggagagagccggttggggaggactctgtgggactaaagccactgaaaaactcctta
gacatgtccttgattgatgacaaccagagcgagtgggaagaagacatggcatctgacacc
aaacgcttcaggtttgagacagcaatgctggatttaagtgaccagacagaccatcggcaa
tggacccagcagcacctggatgcagctgaccttcgaattccatctatcgcgcccacacca
ccacaaggcgagattgaaagtgactgcattgatgtcaatgtccgtgggccagatggcttt
acccccctgatgattgcatcctgcagtggtggaggtcttgagatgggaaacagcgaggaa
gaggaggatgcctctgcaaacgttatatctgaatttttatatcagggtgctaatctgcac
aatcggacagatcgcacaggcgagactgcactacatcttgcagctcgctatgctcgttca
gatgctgcaaagcgcctcttggaggctagcgcagatgccaacatccaggacaacatgggt
cggactccgttgcatgctgctgtggctgctgatgctctgggagttttccagattctgatc
cggaatcgggccacagacctggatgcacgcatgtatgacggcaccactccattgatcctg
gcagctagactagcagtagaaggcatggtggaagagctcattaactgccatgcagatgtc
aatgccattgatgattcaggcaaatcagccctacattgggcagcagcagtgaacaatgta
gatgctgtcatagttttgctgaagagtggtgccaataaagacatgcaaaataataaggag
gagaccccccttttcctcgctgctagagaaggaagctacgagactgcaaaggtcctgttg
gaacactttgccaaccgagagatcactgaccacatggaccgattgccacgggacattgca
caggagcgcatgcaccatgacattgttcaactactagatgagcatagcttggggaggagt
ccagccatacacagtggccccataagtgccacgctctcaccccagctgtgctctccaaac
agttaccttggtagtatgaaaccttcaggtcaaagcaagaagctccgaaagcccaatgct
aagggaatctgctgcaaagatggtaaagatatgaaggtcaagaagaagaaaaatcaggat
gggaaggggagcctactagacagctctgctgtactctcacctgtagactccctggattct
ccacacgggtacatgtcagattcagcatccccgtccttaataacatctccctttcaacag
tctccttccatgtccctcaaccaccttcagggtatgtctgacacccatgttgggatcagt
tcctcaggcatagtaggcaagcaggatctgggtggaatgcagtttgatcatgggccaccc
cgtctctcccatctccctgtgtccagccccagcagtttagtttcaatgacccaaggcatg
ggcagacctggtggggtcatgaccagccagtgtgactggctctctaggatgcatactggc
cttggtcagcaaggactttttaatcccatgaatggggcaggagggctgcagcatggtatg
ttgccctccttgcaaaatgacatgcctgtcaccaccctctctacaatgataggttataga
ggcctgcagagcaaccacctcaacatgcaaacacatgtcatccaagtgcagcagatgcca
caggtacagcaaaaccaacagcagcagagccttcaagttcagcaccagaattcgaacaca
gccaccaatggccctgtcattagccagagttttataagcagtgacctaaatagctctgat
gtacagcctgtgtctggcagcatagcagttcacaccctcctgccccaggagactcatgtc
cttccctcaccacttagtcagacaatggctagcacacaatttcttacgccaccttctcag
cacagctacactgcccctttggacaatactcccagccaccagctacaggtgcctgaccac
cctttcctgacaccctctccaggatcccctgaccagtggtcaagctcttccccacattct
aatatgtctgactggtcagaagggatctccagtcctccgactagcatgcagtcaaaaata
ggacatgtacctgaccaattcaaatag
DBGET
integrated database retrieval system
