KEGG   Shewanella sp. MR-4: Shewmr4_0431
Entry
Shewmr4_0431      CDS       T00388                                 
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
she  Shewanella sp. MR-4
SSDB
Motif
Pfam: EAL GGDEF Reg_prop PAS_9 PAS_3 PAS_4 PAS PAS_8 PAS_7 Y_Y_Y LexA_DNA_bind
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABI37511
LinkDB
Position
482077..486561
AA seq 1494 aa
MYEVSHQMQTRISKTLLACFILFVSGLNMVWAGGFVQRVFTDRDGLAATSIRGLTLDDHG
FIWAATEQGLYRVSNSKVRRIDKTGSESRLADDFLNSVVNVGQDKLLVSTNAALYLYDIR
NNQFTLFGSPDLFPHFPGGAMLSAARMDAQHWLLLIDNGQIYQYSPTTSELTLVTQLAVN
RDLPWRKLLVLPNEQILLAGQFDLLLLDKTGKTLSKYPWTESMGSILDMLEDTKHRVWLA
TSRGVYRFDPSSQQLEAVAELPDWSTVIVEDPKGALWFASRFGLLKWSPETHQIESYQEE
LKKQANMEILKAMLFDDSGLMWVGGSGDGLALLASQPDFILETYTADKPYALSDAMIWSI
LAAPEGLWFGSSNVMFIAKDTQQAIDIPIEGLLSHESIYDIRAFSEHYLLVSTTSGLFVV
DRTTLKGQSFAQWINGQDEFKNKLVYRTYIDPLLKGRVWIASSNGLYFWELGLKAPQAFN
IDKLSEGDVEPKRPAIRTLYRASDGKLWIGGKRVFGYLDEANEFHDQRSLFNGLSAMPTV
SHIEEMSPGIMWFGSYEKGLFEYHLNSSELVSLTALWQVSCSSVFFIQKTPKANLVACAD
SLIRQDIATGHIEMFNQLDGLISDEMNEGAYFYSPELGLYLGTPDGVMHLDVDKLTNRIT
DDHVMLESVSVYYDNSTEVSLLPQPMMQIKPDASMVSLQITNLDYLDDSPIQFKYRLRYQ
GEDDNYVLLQGESQINLAGLAAGEYGLEILSQVNGIWSDKPFVYPFYVEQHWWLTQGFKG
ILLLVFSIIALSLAWYRQRQVRTFMAMNQALTESDDRLRQSLRGSDSDLWEWHRDTQSFY
LDNRGSVLGSHANEIVATLETLPVHPEDRGKALAQWNSMLAGEIDRFEAEYRYQRRSGNW
GWLRVRGRPVARNKQTQVIERVAGIYSDITLQRQLEDEINLLAQAFENTSEGVLILDVDE
NIRVANHAAQQIIGSEQHNLVGQSFSQFVQMKDGLSAEVHQLLGQDSSWTGERELVGQNG
VICPVWLNVSVMQSASDSSLHYVIVFSDITERKRTEADLRRLANYDVLTGLPNRSLFSSR
LLQSIQMAQQSGEKLALLFLDLDRFKHVNDSYGHSMGDALLVEASNRLQSCIGSEHLLCR
FGGDEFVILLRNANNLNEINHIAERLLAQIVAPFKLFGREFYISTSIGISIWPDDAVQPE
AFIKNADLAMYHAKEEGRGNFKYYSSERNAQALYHLRLEADLRKAIEREEFELYYQPQID
ILRGDKFIGMEALIRWRHPKEGYIRPDIFIKVAEACGLVVEIDRWVFRRACLDGAKWVKR
CATQFKLSVNISAVHFRQPDFIDGIKKILADTQMPASSLGLEITEGVLMKEVQAAKSHLT
QLKELGIEVAIDDFGTGYSSLAYLRHFDVNTLKIDRSFLIDIATNSADQAIVSSIIELAR
NLKLTVVAEGVETVEQLEQVFSRGCYIVQGYYFAKPMSVTDFERYLLQKCTLSS
NT seq 4485 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatgaagtaagtcatcaaatgcaaacaagaatatctaaaacacttctggcatgtttc
atcctttttgtctctggtctgaacatggtttgggccggtggatttgtgcagcgtgttttc
accgacagagatggactagccgccactagtatccgtggcttgaccttagatgaccatggt
ttcatctgggcggcgacggagcagggcttatatcgggttagcaattctaaggtcagacgc
atagacaaaacgggcagcgagtcccgtcttgcggatgatttcctcaactcagtggttaac
gtagggcaagacaagctgctggtgagcaccaacgcggcgctttacctctacgatatccgc
aacaatcaatttaccctgtttggctcccccgatttgtttccgcactttcccggtggcgcc
atgttgtctgctgcgcgcatggatgcacagcattggctattactgattgataatggccag
atttatcaatattcgcctacgacttctgaactcactctggtgactcaactggcggttaat
cgcgatctgccttggcgcaagctattggtgctacccaatgagcaaatactactggcgggg
caatttgatttattgctgctggataagacaggtaaaaccttaagcaaatatccttggact
gagtctatgggaagcattctcgatatgcttgaggatacaaagcatagagtttggttggcg
acgagccgcggcgtgtatcggtttgatcccagctcgcagcaacttgaggctgtggcagaa
ttacccgattggagcacagtgattgttgaggatcctaagggggcgttgtggtttgccagc
cgttttggtctgttgaaatggtcacctgagacgcaccagattgagagttatcaagaggaa
ctaaaaaagcaggccaatatggaaatcctcaaggccatgctgttcgatgactcaggctta
atgtgggtgggcggctcgggtgatggtttggcattgttggcatcacagcccgattttatc
ttagagacttatacggcagataaaccttatgcgctgagcgatgccatgatttggtcgatt
ctagcagcaccagaggggctctggtttggctcatccaatgtgatgtttattgccaaggat
actcagcaagctattgatattccgattgaaggcttgctctcccatgagagcatttacgat
atcagagcattttctgagcattatttgctggtctctaccactagtggtttgtttgtagtc
gataggacaaccttaaagggacagagctttgcacaatggataaatgggcaggatgaattt
aaaaacaagctggtttaccgcacctatatcgatcctttgttaaaggggcgagtgtggatt
gccagttccaatgggctgtatttctgggagctcggcttaaaagcgccacaagcatttaat
atcgataagctctctgaaggggatgttgagccgaagcgcccagcgattcgaaccttgtat
cgtgcctccgatggcaaactttggattggcggtaagcgagtttttggctatctagacgag
gcgaatgaattccatgatcagcgcagcctatttaatggcttgagtgccatgcccaccgtt
agccatatcgaagaaatgtctccagggatcatgtggtttggctcctacgaaaagggatta
ttcgagtatcacctcaatagcagtgaactggtttctctaaccgcgctgtggcaagtgagt
tgcagctcagtgttttttatccaaaagacgcctaaagccaatctggtagcctgcgccgat
tcgcttatccgccaagatatcgcaactgggcatatcgaaatgtttaatcaactcgatggg
ttaatttccgatgaaatgaatgaaggtgcgtatttttattcgcctgagttgggcttgtat
cttggcacaccggatggcgtcatgcacctcgatgtggataagctgaccaaccggatcacc
gacgatcatgtgatgctcgagtctgtgtctgtctattacgataacagtacggaagtctcc
ctactgccccagcccatgatgcagattaagcccgatgccagcatggtgagtttgcagatc
acaaaccttgattatctcgatgattcgccgattcaatttaaatatcggctgcgttatcaa
ggagaagatgataactacgtactgctccaaggcgagtcacagataaacctcgccggactc
gctgcgggcgagtatgggctggagattttaagccaagtgaatgggatctggtcggataaa
cccttcgtttatcccttctatgttgagcaacattggtggctaacgcagggctttaagggc
atattactgttggtgttttcgataattgccctgagtctggcctggtatcgtcagcgccaa
gttcgtacttttatggcgatgaaccaagcgctgaccgagagtgatgatcgcttgcgccag
tcgttgcgcggcagcgattccgatctctgggaatggcaccgagatacccagagcttttac
ctcgataaccgcggttctgtgcttggcagccacgccaatgagatagttgcgaccctagag
acgcttccagtccaccctgaggataggggtaaagccttagctcagtggaacagtatgctg
gcgggggaaattgacagatttgaggctgaatatcgttatcagcgtcgcagtggtaattgg
ggctggttaagggtgcgcgggcgtcctgtggctcgtaataaacaaacccaagttattgag
cgggtagcgggtatttatagtgatattaccttacagcgtcagctagaggatgaaatcaat
ctcctcgctcaagcctttgagaatacctccgagggggtgttgatcttagacgtggatgaa
aacattcgggtggcgaaccatgcggcgcagcaaattataggttcggagcagcataatctt
gttggccaatcattttcccaatttgtgcaaatgaaggatggcctatcggcggaagtacat
cagttactcggtcaagacagttcgtggacgggggaacgtgagttagtggggcagaatggg
gtgatttgccccgtatggcttaacgtctctgtgatgcaatctgctagcgatagttcactg
cattatgtcattgtattttcagatatcaccgagcggaaacgtaccgaggcggacttaaga
cgactggctaattatgatgtgttaactggattgccgaaccgctctttattttcttctagg
ttattacagtcgatacaaatggcgcagcaaagcggtgaaaagctggcgttgttatttttg
gaccttgatcgatttaagcatgttaacgactcctacggccacagtatgggcgatgccttg
ttggttgaagcttcaaaccgcttgcagtcttgtatcggcagtgagcatttattgtgtcgt
tttggcggcgatgagtttgtaatcctgcttagaaacgctaacaatctcaatgaaattaac
catattgccgagcgattactcgcgcaaattgtcgcgccattcaaattgtttggtcgggag
ttttacatttcgaccagtatcggcatcagtatttggcccgatgatgcggtgcagcccgaa
gcctttattaaaaatgccgacctggccatgtaccacgccaaggaagaagggcgcggcaac
tttaaatattattcctcggagcgcaatgcccaagccttatatcatttacgcttggaggcg
gatttacgtaaggccatcgagcgggaagagtttgaactctattaccagccgcaaattgat
atcttacggggcgataaatttattgggatggaagccttaattcgttggcgccatcctaag
gaaggttacatccgtcccgatatttttattaaggtcgccgaagcttgtggtttagtggtt
gaaatcgaccgctgggtatttcgtcgagcctgtttagacggtgctaaatgggtaaaacgt
tgtgccacacagtttaaattgtcggtgaatatttcggcggtacatttccgccagccagat
tttattgacggcataaagaaaattttggccgatacacaaatgccggcttcatccctcggg
ttagaaatcaccgaaggggtgttgatgaaggaagtgcaagcggcgaaaagtcaccttact
cagcttaaagaattggggattgaagtcgctatcgacgactttggcactggctattcttct
ttggcatatttacgtcattttgatgtgaacacattaaagatcgaccgctcattcttaatt
gatatcgccaccaactctgcggatcaggccattgtcagtagtattattgagctggctcgt
aacttaaaattaaccgtagtagctgaaggagtcgaaaccgttgagcagttggagcaagtc
tttagccgcggttgttatattgtgcagggctattactttgcaaaacctatgtcggtcact
gactttgagcggtatttattgcaaaaatgtacgttgagctcttaa

DBGET integrated database retrieval system