Shewanella sp. MR-7: Shewmr7_1476
Help
Entry
Shewmr7_1476 CDS
T00389
Name
(GenBank) diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)
Organism
shm
Shewanella sp. MR-7
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
Y_Y_Y
PAS_3
PAS_9
Reg_prop
PAS
PAS_4
PAS_8
WD40
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABI42475
UniProt:
Q0HWN0
LinkDB
All DBs
Position
complement(1714777..1719069)
Genome browser
AA seq
1430 aa
AA seq
DB search
MASSDNTKNNTMPKILLKIVLIAFFGIHALEDVNASPFSNKSPIILQSQSFGVPEGLSQS
TVTSIVQDHDGYLWIGTFNGLNRFDGKHFRHFYSNDPRTGLPSSFIRSLLVDAQGLLYVG
TDNGLVVYDKLKDSFSPYSISAKNAPIWSLNSSTNSLIVGTNNSIIDISNKEKTYELLSK
GLGEIKKVIKVNDTYYIRDYAGKLFSLTNDELKEVANHTIDFDEIKQSEVIVSFSNGLYE
YNENKSLKITEESFSQFAKYESTVYGFNDGKIINVSNGTTIGSIPSEKADKISSFLATED
MFVLGTIDKGFIIVKNVNNLVQQTNLVQDNAWHLTKNTQGFLVSSESERIDLFDMDFNRI
NSFDTQSQGYKYAILNKDGLYFGTHSGLFLKNKENLVLISEKSISSLSSSKDNSIITAGT
SDGKVLIIKNKEVTNIIDTQKNEPIFDIELVTLNDIYIAGQGGFKKYENGLLQNLGEEIT
YSIVDGDDGIYFGTSTSLMFYNRENNNVSQVFTNKKEIYSITNNNDLVIAASLGEVVIYE
KKSKKIYTLNTANGSQYEYNSPSAIDVNGYVLLAGINGVSILHPKNVINYIKNKEINKTE
ISDFLVFNVPQENDSIFFNNKNSIINEITLKYSDYPFSFNFISPLSEDSSTDYHYRMYGL
SDTWISANGTNSATYTNLSPGKYQFQVYAVNSLSSKQSPVKEVTVIITPPWWSSTQAKVF
YFIILMLFSLFIFKAILRKREIQRQIALSEERLKLSLWGSGDEMWDWDIETGNIFRSNIW
GALEFPRDGHRSGNSDEESNIHPMDQERVREALNKHFYGETDHFEAAYRVKGKDDSWIWI
LDRAKIVERDDKDNALRMTGTIKNISQFKQKEEQLKLFEKAIENISEGMFILDSEYRFVE
VNEACCRISQRNRTDFIGNLLTFDLYPESFTNQIRTMLKQQGRWASEVEASRGDKSHFHM
ELTIDAIYDELGELSHYVGVFSDISRRKQQEEELRKLTNNDLLTGLPNRSNLQVTLGNLV
NKEITHALMVLDLDNFKRINDSLGHQIGDQLLKLVSVRIKSVVPKNTSIYRLGGDEFAIV
LDKTSDISACAAIAGRVIEAFKTIFEIGNEQLVLGVSIGIVFYPEDEQSEQALLRKADIA
MYHAKSAGGNCYQFYSESLNQHAIKQLEIENLIREGLKEDLFEVYYQPKVDLKSGHVAGM
EALVRLNHPTRGLVPPNDFIPLAEENGLIIEIGEIVLRKACFAAQKWREQGLFKGRVAVN
LSSRQFALPDLQQRIEAILRLTQLPAAHLELEITEGTVIKQPEMAITVMQQLAKMGVSLA
LDDFGTGYSSLSYLKRFPIHTLKIDKAFVDDIDKSDRDLKMVDSIITIAHNMGLSVVGEG
VEQAAQLNILRALNCEEIQGYIFSKAINETEFTQLLQDDRSKFMPHHNII
NT seq
4293 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcatcctcggacaatactaagaacaacactatgccgaaaatactcttaaaaatcgtc
ttaatcgctttttttggcattcatgcgttagaagacgtaaacgcatctccattttcaaat
aaatcacctattattctccagtcacaatcgtttggtgtaccagaagggctttcccaaagt
acagttacatcgatagttcaggaccatgatggctatctatggattgggacatttaatgga
cttaaccgctttgatggaaaacacttcagacatttctattcaaatgatcctagaacaggt
cttcctagttcttttattagaagcttactcgttgatgctcaaggtctattatatgttgga
acagacaacggcttagttgtttacgataaacttaaagactcattctctccttatagtata
tcagcaaaaaacgcccctatttggagcctcaactcatctactaatagcttaatcgttggc
acgaataattcaataatcgatataagtaacaaagaaaaaacatacgaactcttaagtaaa
ggactaggtgaaataaaaaaggtcatcaaagtaaatgatacttactacataagagattat
gcagggaaattattttctttgacaaatgatgaattaaaagaagtagcaaatcatactata
gatttcgatgaaataaaacaaagtgaagtgatagtatcattcagcaatggattatatgag
tataatgaaaataaatcactaaagataactgaagaatcattttctcaattcgcaaagtac
gaaagtacagtttacggttttaatgacggcaaaataattaatgtttctaatggaaccact
atcggttctattccttcagaaaaagctgacaaaatatcttcattccttgcaactgaggac
atgtttgtactaggaactattgataagggatttatcattgtaaaaaatgtgaacaactta
gtacaacaaactaatttagtacaagacaatgcgtggcatcttacaaaaaatacacagggt
ttccttgtatcatctgaatctgaaagaatagatctgttcgatatggatttcaaccgaatt
aatagctttgatactcaatcacaaggctacaaatatgcaattcttaataaagatggatta
tattttggaactcattccggtttgtttttaaagaacaaagaaaatttagtactaattagt
gaaaaatcaatatcatctttatctagcagtaaagataactctatcataaccgctggaaca
tcagatggtaaggtattgataataaaaaataaagaagtaaccaatataattgacacccaa
aaaaatgagcctattttcgatattgaattagtgacattgaatgatatttacatagcaggc
caaggtggtttcaaaaagtatgagaatggattattacaaaatttaggggaagaaataaca
tatagcatagtcgatggtgatgatggcatttactttggaacatctacatcactaatgttt
tacaatagagaaaacaacaatgtttcccaagtgtttaccaacaaaaaagaaatttattca
atcacaaataacaatgacttagtgatagctgcatcattaggtgaagtagttatatatgaa
aagaaaagtaaaaaaatatatactttaaatactgcgaacggaagtcagtatgaatacaat
tcgccgagcgcaatagatgtgaatggttatgttctacttgcaggaataaatggtgttagt
attttacacccaaaaaatgtcataaactatattaaaaacaaagaaatcaacaaaacagaa
atatctgatttcctagttttcaatgtgccacaagaaaatgatagcattttctttaataac
aaaaattcaattattaatgaaataaccttaaaatattcagactacccattttcctttaac
tttatttcacctctgtcagaagattcgtctactgattatcattataggatgtatggcctt
tctgacacatggatatcggcgaatggaacaaattcagctacatatacaaatttgtctcct
ggaaaatatcagtttcaagtatatgcagtcaattctctttccagtaaacaatcccccgta
aaggaggttactgtcattattactcctccatggtggtcttcaactcaagccaaagtattt
tatttcattattttaatgcttttctctctctttatcttcaaagcaatcctacgcaaacga
gaaatccaacgacaaattgcattaagcgaagaacgcctaaagctttctttatggggaagt
ggcgatgaaatgtgggactgggatattgagaccggcaatattttccgttcgaatatttgg
ggggcattggaatttccgagggatggtcaccgttctggcaacagtgatgaagaaagtaat
attcatcccatggatcaagaacgtgtaagagaagcgctcaataaacacttctacggtgaa
accgatcattttgaagcggcatatagagttaaaggcaaagatgatagttggatctggatc
ctagacagagcgaaaatcgtagaaagagacgacaaagacaatgcgctacggatgacgggg
acaattaaaaacatcagccagttcaagcaaaaggaagaacaattaaaactgttcgaaaaa
gccattgaaaatatttccgaaggtatgtttattctcgacagtgaatatcgatttgttgag
gtgaacgaagcgtgctgtagaatctctcagcgtaatcgaactgattttattggtaatctg
cttaccttcgatttgtatccggagtcctttactaatcaaattcgtaccatgttaaaacaa
caaggtcgttgggccagcgaagttgaagcaagccgtggtgacaagagccatttccatatg
gaactcacaattgacgccatttacgatgaattaggtgagttatcgcattacgttggagta
ttttctgatatatcaagacgtaaacagcaagaagaagagcttcgtaaactcaccaacaat
gacctattaacggggctgcccaatcgctcaaacttgcaagtcacattaggaaacttggtt
aataaagaaattacccatgccttaatggtactcgatctcgacaattttaagcgtatcaat
gactcattaggccatcaaattggtgatcagttactcaaacttgtttccgtcagaattaag
tctgttgtacctaaaaacaccagtatctatcgcctaggtggcgatgagtttgcgattgta
ctagataaaacatctgacattagtgcctgtgccgcgattgcaggacgtgtcattgaagcc
tttaaaaccatatttgaaatcggcaatgagcagctggttttgggcgtaagtattggtatt
gttttctaccctgaagatgaacagagtgagcaagcacttctgagaaaagcagatattgcc
atgtatcatgctaaatctgccggcggtaattgttaccaattctactcagaatcccttaac
caacatgcgattaaacaattagaaattgaaaacctaattcgtgaaggattaaaagaagat
ttatttgaggtgtattatcaacccaaagtcgatcttaaaagtggtcacgtcgcggggatg
gaagccttagtccgtttaaatcatcccacccgtggactggtcccaccaaatgattttatt
cctcttgcggaagaaaatggtctcattatcgaaatcggtgaaattgtgcttaggaaagcc
tgttttgctgcgcagaaatggcgtgaacaagggctatttaaaggaagagtcgccgtcaat
ttatcgtcacgtcagtttgccctacccgatttacagcaacgaattgaagctattttacgg
ttaacacaattgccagcagcacatcttgaactcgaaatcaccgaagggacggttattaag
cagccagaaatggctataaccgttatgcaacaattagcgaagatgggggttagtctagcg
ttagatgacttcggtacgggttactcttcgctttcttacttaaaacgattccctattcat
acgctcaaaatcgataaagcctttgtcgatgatattgataaatctgaccgagatttgaag
atggtcgattcgatcatcaccatcgctcacaatatgggtctgtcggttgtcggtgaaggt
gttgaacaagccgcacaactaaatatcctgcgcgcccttaactgcgaagaaatacaaggt
tatatctttagcaaagcgattaatgaaaccgaatttactcaattgctgcaagatgatcga
agtaaattcatgccccaccacaacattatttga
DBGET
integrated database retrieval system
