Streptococcus infantarius subsp. infantarius: Sinf_1270
Help
Entry
Sinf_1270 CDS
T01765
Name
(GenBank) peptidoglycan linked protein(LPXTGmotif), pullulanase
Organism
sif
Streptococcus infantarius subsp. infantarius
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PUD
Alpha-amylase
SpuA_C
YSIRK_signal
CBM_48
Gram_pos_anchor
DUF3459
Pullul_strch_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEZ62583
LinkDB
All DBs
Position
complement(1293412..1300068)
Genome browser
AA seq
2218 aa
AA seq
DB search
MKKVSRLSFPEKQEYFGIRKLKVGVASVAIATALFWGAGLTSVSADQITAQAATSEVVSE
TSSPDDSSEALLESEKAVDVNQTIETVNASDVVDNSESQSTEPESPVVEETEPESQPQEV
ISQTQEVQGTAATAEIADVKTVTSAENSNQVNLLKSSQPDNQVSNPPIAEDTIRMHFQAV
TDDNYTQYDLWTWGAVAEPSDGNNWPAAATPFSANQKDDFGYYIDVRQAASHGDIGYLLL
KNGEKTSDSDQSIKPLSKDVNEVWVTSDFMTYSYKPLADDRIIRINYKRDDGNYDGWGLW
AWGDVAGQFGAWPSDALDFTQEGAYGRYIDLPLSKLLDSNIGFLLVNQNDPEKAGNKTLD
MSFSDRDIHSQIFLHNDDATVYTNPYYIATVTGQDFSKATPGVHNISVSASSYRPFNYNE
TDLIDVTVTNPENVEITRMQIDTAQIGGRVIEISPELNRVTITATSDTQPGTYDLPVRVF
DKDNGYYDTTVSVTITKRVKQAGEVDWDEQVIYFMLTDRFYNGDPSNDNPYHQDYAGAVN
QAGVYKGGDFKGVTAKLDYLKQLGVTSIWVTPIVDNIPQDVSTEAGKEYYAYHGYWADDF
EKFNPHLGTLDDFHELIDQAAERGINIIVDVVLNHSGYGTEDKFTGMVRTPEEDKGDDIQ
GSQSGLPDFKTEDAAVREQLVAWQTAWLEKSTTAKGNRIYAFRVDTVKHVDDTTWQYFKN
ELALKDADFHLVGESWGANYKDTKGDLGTGSMDSLLDFGFKDIAKLLVNGRLKEANDELI
ARNDALTSVYTLAQFLGSHDEDGFLYSIGGDLKKLKLAATLLLTAKGQPVIYYGEELGQS
GANNWPYYDNRYEFDWDDVAGNAILEHYQKLLAFRRDNSELLVRGSHSTVAVNDSQGWLL
AKRANDSDAAYILYNLKDQSQKLHLLLSEAATVTDYYTGTTYQALLGQDGQYYLDIEAPA
ISTGGTMLLKVSAGAITQASIAQTEEEPIAENTLRVHFKTLPSDDLASLGLWTWEDVEHP
SESWPNGAINLSNLKHDAYGYYIDVKLVNGNRHKVGLLINNTSGENVSGEKVVNLISQDM
NEVWFDEDYNANYYAPLEKGKIRINYYRSDGNYKNLAIWLWGSADSSITSRLGSWPDGVD
FENFGKYGAYIDVPLADFNEIGFLLLDESKEGDAAKIQLDNYTFKDLANQTQIFLKDEDK
TIYTNPYFVSTIRLTSAQQISQSELVAIISNLADADKAELLENLKVTDKAGNVVAITDIT
LDKASNKVIIEGDFSSDGLYTVSYNGDQYQAQQSWQYTDSKYAYDGDLGERVFDNGVRVD
LTVWSPNADNVSVVLYDKNDQTKVVGKIAMIKGDKGQWSASLTSSLGLGISDYRGYYYHY
EITRGKETVLALNPYAKSLAEWNSDLIGTDPSYKVAKAAIVDTSAIGNQDLTYADIKGYK
DREDAIIYEAHVRDFTSDTAISEELRNQFGTFAAFAEKLDYLQSLGVTHIQLLPVMSYYY
VNEVMNNKRLTDYASSNTNYNWGYDPQSYFALTGMYSENPADPAKRIEEFKNLINEIHKR
GMGVILDVVYNHTADLAILEDLEPNYYHFMEADGKAKTSFGGGRPGTTHYMTRRMVLDSI
AYWTKEFKVDGFRFDMMGDLDAETVQMAYDKAKALNPNVIMLGEGWITYAGDANDSRQPA
DQTWMAHTDSVASFSDDIRNLLKSGYPSEGAPCFITGGVKNLQELFNSIKAQPNNFTADD
PGDVIQYIAAHDNLTLHDIIAKSIHKDPSVAENEAEILRRQRLGNLIILTSQGTAFIHSG
QEYGRTKQFRDEAYKTPVATDQVPAKSDLLTNADGTPFVYPYFISDSYDSTDAINHFDWA
KATDGKVYPENAKTQAYTKGLIALRRSTDAFTLKTKADVDSKVKLITIPNENGVGQEDLI
IAYQTQASNGDIYAVFVNADSKAREFVLSDDYKALLNAEVLADADTAGVDAILNPKGVAF
TENSITLNPLTATILRLRKENAETERTLYDQESGVSVILAPGEREEITQIEVHHKETDDS
QIPSVLQGKDYDLYDIKPEDAYGHVVSTTQKDQVILPIDAGKAVAEVFYLPKNAQPQLLA
FREVSKLVAGQVVKFVIFDVDHFNQYGIVYQDQVAKTEVPANSNQVSKAIAPAKTQTGVR
NQAASRVLSDLQKVAVTENSTVALPETGQKDSKTLTFVGLLSLASLAVLEVKRRQKSH
NT seq
6657 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaggtgagtcggctttctttcccagaaaagcaggagtactttgggattcgtaag
ctaaaagttggtgttgcttcggttgcaattgcaacagctttgttttggggtgctggatta
acaagcgtttcagcggatcagattactgctcaagcagctacttcagaagtagtcagtgag
acgtcttctccagatgatagcagcgaggcgcttcttgagtcagagaaagccgttgatgtt
aatcaaacgattgaaacagttaatgcttctgacgtagttgataatagcgaaagtcaatca
actgagccagagagtccagtggtagaagaaactgagccagagtcacagcctcaagaagtt
atttcacagacacaagaggttcaaggaacagcagcaacagctgaaattgctgatgtaaaa
acagtaacaagtgctgaaaacagcaatcaggtgaatctcctaaaatcttctcaacctgat
aatcaagtgtcaaatcctccaattgctgaagatacgattcgtatgcatttccaagcagtt
acggatgataattacactcagtatgacttgtggacttggggagccgtagctgaaccgtct
gatggcaataattggcctgcagcggcaacgccattttcagcaaatcaaaaagatgatttt
ggttattatattgatgtgagacaggcagccagtcacggtgatattggttacctccttctt
aaaaatggcgagaaaactagtgactctgaccaaagtattaaacctttatcaaaagatgta
aatgaagtttgggttacgtctgattttatgacttacagctataagccgttggcagatgat
cgcattattcggattaattataagcgtgatgatggtaattatgacggttggggtctctgg
gcttggggcgatgtagctgggcaatttggtgcatggccatcagatgctcttgatttcact
caggaaggtgcttatggtcgctacatcgacttacctttatcaaaattattagattcaaat
attggttttttattggtcaatcaaaatgacccagaaaaagctggcaataaaacgcttgat
atgagtttttctgatcgtgacattcatagtcaaattttcttgcataatgatgatgcgact
gtttataccaatccgtactatattgctacggtgacaggacaagatttttcaaaagcgaca
cctggagtccataatatttcagtatcagcaagtagctatcgtccttttaattataatgaa
actgatttaattgatgtgacagttactaatccagaaaatgttgagattacacgcatgcaa
attgataccgcacaaatcggtggtagggttattgagatttcgccagagctcaatcgtgtc
acaattacagcaacgtcagatactcagccaggaacttatgacttaccagttcgagtcttt
gataaggataacggttattacgatacaacagtatcagttacgataacgaaacgtgttaaa
caagctggagaagtagactgggatgaacaagtaatttacttcatgttaactgaccgcttt
tataacggagacccaagtaatgacaacccatatcatcaagattacgctggcgcagttaat
caagctggtgtttataaaggtggagactttaaaggggtgactgcaaagcttgattacctc
aaacaacttggtgtcacaagtatttgggttaccccaattgtggataatattccgcaagat
gttagcacagaagctggtaaagaatattatgcctaccatggttattgggcagatgatttt
gaaaagtttaatccgcatcttggcacacttgatgatttccatgagttaattgaccaagct
gctgaacgtggcattaacatcattgtcgatgtggtgcttaaccattcgggttatggtacg
gaagataaatttaccggaatggtgcgtacgccagaagaagacaaaggtgatgatatccaa
ggctcgcaatcaggtcttccagatttcaagacagaagatgcagctgttcgtgagcaatta
gttgcttggcagacagcttggcttgaaaaatcaacaaccgccaaaggaaacagaatttat
gcttttcgtgtcgacactgttaaacacgttgatgatacgacttggcagtatttcaaaaat
gagctagcgctaaaagatgctgatttccatctagttggagaaagttggggtgccaattac
aaagataccaagggtgatttaggcactggtagcatggatagtttgcttgattttgggttt
aaagatattgctaagttgctagttaatggtcgcttgaaagaagcaaatgatgaattgatt
gctagaaatgatgcgctcacaagtgtctataccttggcgcaatttcttggaagtcatgat
gaagatggtttcttgtacagtattggtggcgatttaaagaaactaaaactagcagcgacg
ctcttactaacagccaaaggacagccagtcatttattacggtgaagaattaggtcaatct
ggtgctaataactggccatattatgataatcgttatgagttcgactgggacgacgtggct
ggaaatgcaattttagaacactatcaaaaattattagccttccgtcgtgataacagtgaa
ttgttggtgcgtggtagtcacagtacagtagcagttaatgatagccaaggctggcttctt
gccaaacgagcaaatgattcagatgcagcttatattttgtataatttgaaagaccagtca
caaaaacttcacttacttttatctgaggcagcaacggtgactgattattacacaggaacg
acttatcaagctcttcttggacaagacggtcagtattatcttgatattgaagcgccagcc
atttcaacaggtggtaccatgttgctaaaagtgtctgcaggtgctattacacaagcttct
atcgctcagacagaagaagagccaattgctgaaaatacgctgcgcgttcattttaagacc
ttgccatcagatgatttggcaagtcttggtttgtggacttgggaagatgtcgaacatccc
tctgaatcttggccaaatggtgcgattaatctttctaatcttaaacacgacgcttacggt
tattacatcgatgtgaaattggtcaatggtaatcgtcacaaagttgggttgctcatcaat
aatactagtggtgagaatgtttcaggggaaaaagtggtgaatcttatcagccaggatatg
aatgaagtttggtttgatgaggattataatgctaactattacgccccacttgaaaaagga
aaaatccgtattaattactatcgtagtgatggtaattacaagaatttggcaatttggttg
tggggaagtgcagacagttccattactagtcgcttaggttcttggcctgatggtgttgat
tttgaaaactttggcaaatacggtgcttatatcgatgtgccactagccgattttaatgag
attggtttcttgctccttgatgaatcaaaagaaggcgatgcggctaagattcaactagac
aattacacctttaaggatttagctaatcaaacacaaattttcttgaaagacgaggataag
accatttatacgaatccatattttgtaagcactattcgcttaacatccgcacaacaaatt
agtcaatcagaacttgtcgctattattagcaatctagcagacgccgataaagctgaactt
ctagaaaatcttaaagtgactgataaagctggcaatgtcgttgctattacagatattact
ctcgataaggcaagtaataaagttattatcgaaggtgatttttcaagtgacggtctctat
acagtaagctacaatggcgatcaataccaagcacagcaaagttggcaatacacagattct
aagtatgcttacgatggtgatttaggagaacgtgtttttgataatggagtgcgtgttgat
ttgaccgtttggtcaccaaatgcagataacgtttctgttgttctttatgataagaatgac
caaaccaaagtcgttggcaaaattgctatgattaaaggggataaaggtcaatggtcagct
agcttaacatcaagtcttggtttaggtattagtgattatcgtggctattattaccactat
gaaatcactcgcggaaaagagactgttctggcacttaacccttatgctaaatcattagct
gagtggaatagtgatttgattggaactgatccatcttataaagtggctaaggcagctatt
gttgatactagtgctattggcaatcaagacttgacttatgcagatatcaagggctacaaa
gatcgtgaagatgctattatctacgaagcgcacgtgcgtgactttacgtcagatacagct
atttcagaagaacttcgcaatcaatttggtacctttgcagcgtttgctgaaaaattggat
tatcttcaaagcctaggtgtcactcatattcaattgcttcctgttatgagttattactac
gttaacgaagtgatgaataacaagcgcttaacagattatgcctcaagtaatacaaactac
aactggggttatgacccacaaagttactttgctttgacagggatgtattctgaaaatcca
gctgacccagcaaaacgtattgaagaatttaaaaacttgattaatgaaattcacaaacgt
ggcatgggagttatcctagacgtcgtttataaccatacagctgaccttgctattcttgaa
gatttggaaccaaattattatcacttcatggaagctgatggcaaggctaagacaagcttt
ggtggtggtcgcccaggaacaactcactatatgacacgacgtatggtgcttgattcaatt
gcttattggacaaaagaatttaaagtggatggcttccgctttgatatgatgggtgacttg
gatgctgagactgttcaaatggcttatgacaaagcaaaagctttgaatccaaatgttatc
atgcttggtgaaggttggattacttatgctggtgatgccaatgatagccgtcaacctgct
gaccaaacttggatggcacacacagacagtgtggcttcattctctgatgatattcgtaat
ctccttaaatcagggtatccaagtgaaggtgcaccatgctttattacaggtggggttaaa
aatttgcaagagctctttaatagcataaaggctcagccgaataattttacagcggatgat
ccaggtgatgtaatccaatacattgcggctcacgataatttaacccttcacgatattatt
gctaaatcaatccacaaagacccatcagtagcagaaaatgaagctgaaattttacgtcgt
caacgcttgggaaatcttattatcttgacttctcaaggaacagccttcatccattctggt
caagaatatggtcgtaccaaacaattccgtgatgaagcttataagacaccagtagcaact
gatcaagtcccagcaaaatcagatttgctaacaaatgctgatggcacaccatttgtttat
ccttactttatcagtgattcttacgattctacggatgctattaatcattttgattgggca
aaagcaactgacggcaaggtttacccagaaaatgccaaaacgcaagcttataccaaaggg
ctcatcgctcttcgtcgttcaacagatgcctttacccttaagacaaaagctgatgttgat
agcaaggtcaaactcatcaccattccaaatgaaaatggagttggtcaagaagatttgatt
atcgcttaccaaacacaagcaagtaatggtgacatctatgcagtctttgtcaatgctgat
agcaaagcgcgtgagtttgtcttgtcagatgattacaaagctttgttgaacgcagaagtt
cttgctgacgccgataccgcaggtgtcgatgctatcttgaatccaaaaggtgtggcgttt
acggaaaatagcattacccttaatccgttaacagcaacaatcctacgtttaagaaaggaa
aacgcagaaacagaacgtaccctttatgaccaagaaagtggtgtaagtgtcattttagct
ccaggtgaacgtgaagaaattacacagattgaagttcatcacaaggaaacagatgacagt
caaatcccttcagtcttgcaaggtaaagactatgatttatatgatatcaagcctgaagat
gcttatggccatgttgttagcacaactcaaaaagatcaagtcatcttaccaattgatgct
ggtaaagctgttgcagaagttttctatcttccaaaaaatgcacaaccgcaacttctagcc
tttagagaagttagcaagttagtggctgggcaagtcgttaaattcgtcatctttgatgtt
gaccacttcaaccaatatggcattgtttatcaagaccaagtggcaaaaactgaagtgcca
gctaattcgaatcaagtgtcgaaagctatagcgccagccaaaactcagactggagtccga
aatcaagctgcttctcgagtcctttctgaccttcaaaaagttgctgttactgaaaatagc
acggttgccttgccagaaactggtcaaaaagatagtaaaactctaacgtttgttggtctt
ctaagtcttgccagtctagcagtgttagaagttaaaagacgtcaaaaaagtcattaa
DBGET
integrated database retrieval system