Saccoglossus kowalevskii (acorn worm): 100373485
Help
Entry
100373485 CDS
T04123
Name
(RefSeq) laminin subunit beta-1-like
KO
K05636
laminin, beta 1
Organism
sko
Saccoglossus kowalevskii (acorn worm)
Pathway
sko04512
ECM-receptor interaction
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sko00001
]
09130 Environmental Information Processing
09133 Signaling molecules and interaction
04512 ECM-receptor interaction
100373485
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Laminin_EGF
Laminin_N
Anti-adapt_IraP
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
100373485
NCBI-ProteinID:
XP_006820868
LinkDB
All DBs
Position
Un
AA seq
1592 aa
AA seq
DB search
MAADTGCNFRIPHPHFRFKRWTFLLVFLTLLHNTRTQENVNSQACEKVLSSGTVTYHACI
SKIEFLSFLNLDPIIEPENSTCGYETDPKNNEYCTLGYDQDCSECDATQPDLAHPAPYVI
DTASSGGELTWWQSRSWLDFVSEDDDFIINVTLSMRKGYELSDKIKITFKSGRPQKMVIL
KSSNNGETWDPYQYYARDCVSAFGMEPKADPSDITDVTEVICTPAYSGSLPEKDGIVEFD
LNFRLEKLFADTVGSDNDLSLFYEVFESDEIRNYIDVTDIRISLMYPATDGLETTLKPEN
LRNYFYAISDIYSSVRCQCNLHAENCNELSGGQYSCDCKHNTMGVNCELCLPLYNNRPWQ
AGSYLPYPSGTANECQLCDCNEHAANCSYDETVGKGVCEGCEDNTAGLFCEICVAGYYRN
QSEPVNSPDVCIGCDCEPLGTLPTSENVTECSQYENDVTGQPVGQCSCIDFVTGRRCDEC
IDEYYGLKQVESAGLCKECGCKILGTVNASNVCEKTEGQCPCKPNTFERDCSRCKDGFYA
FPSSTEMDCLACRCDYGGSYTQICNIVSGLCDCRPNLIGQRCNMVDSGYFYNYLDANSYD
SWDAVSACSRESDLPIDYTGVGYLVCQDNTNVLFQNVKAFSVMSDIQKYLPVIRYSYNSS
DNWYSASLSLSATGDSANQDLLHELAGDVDPDTSSGNTTDAPTTADITCSVQAGIIMSIA
VVFTPGQDISWQPVNVEDDLLDVDRRCNYELNLQLMSSGDGADNIQIDSLVLMPVLTDFQ
VYKYGACDCNMNYSMGDTCTAHGGQCVCKTGVYGRQCDRCQPGYYNLTEDGCTPCNCDPL
GSASLVCDFESGQCPCQEGVAGLSCQECSTGFKRASPDDGSYSICEACECPYIDPSADPN
TQPSAQRATECEPDTGICIDCSSGSTGDFCEICKENVKGPDCDRCISFFYGFDTELFGGA
CNACNCNTTGTGGVMECDNGSGQCTCIGNYGGKQCARCKDNFYDYDSGCVPCDSCYDVID
EEMTKLRELTQNLTDFVGYLSSQDNTTELGPFYIRLQETEDVIMELAANINEAVAEEDDL
NARIESLNGTMQTLMSLLSNDITNAVNETNVDINEAVDNVAGSKDTIDTIEQRITDSYNM
LNSGTLEQAQITLQALQSDLNKLDIQITSAASSTTGDIADLEAQVDDMSTKTEAARQSAL
QALQTVQEAQLLHDNTTNRVSDLRSAATFVQQKSENLDSQATEMLSRAQSTNQEATAALT
KAMSPNDNADTDVENLIDSASVKIAQAGAIENQATQALEQNLYIIDEVADAGNITDITLA
EVNTVTADVTARYDRSTNAYTLANSALELSGATFDAANEMLNTLENFESIVDEVEQAADT
AMDTVASVVELSNSATLEARAIQSELSDSELHADSALSIADEAFNMAEAERESVAPANNR
ANQLAEEAAAKLTDTDSLIQDVKSINTTLVAPQQAICNDYATTMDTLEATVLEATDQSNQ
ALVMVAQTETDLKLLLASLENIGTIDTSQLSGYAERIAAARNTFTETDFAASIAALKIAV
DEQQTWLDRTRLKVDSLQSQVDALESFRVTSG
NT seq
4779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggcagataccggctgcaactttcgaatcccacacccacattttcgttttaagcga
tggacgtttctgctggtgtttttaactctgcttcataatacgaggacgcaagaaaatgtg
aattcccaggcgtgtgagaaggtattgagcagtggaaccgtcacctaccacgcctgcatc
agtaaaatcgaatttctgtcgtttttgaacctcgacccgataatagaaccagaaaacagc
acttgtgggtacgagacggaccctaaaaacaatgaatattgcacattgggttacgaccaa
gattgttcagaatgtgatgctactcaaccagacttggctcatccagcaccctatgtgata
gatacagcatctagtggaggtgaattaacttggtggcagtcacgatcatggctagacttt
gtttccgaggacgatgatttcatcattaatgtaacattatcaatgaggaaaggctacgag
ttatcagataaaattaagataactttcaaatctgggcgtcctcagaaaatggtaattctg
aaatcatcaaataacggtgaaacatgggatccttatcagtactacgctcgtgactgtgta
agtgcttttggtatggaaccaaaagccgatccctcggatataactgatgttacagaggtc
atctgtactcctgcctatagtggatcgcttccagagaaagatggtatcgtggaatttgat
cttaattttaggctagaaaaactatttgcggacactgttggttcagacaatgacctcagt
cttttttatgaagtatttgaaagtgatgaaattcgaaactatatcgatgtcacagatatc
cggatttctttgatgtacccagcgacggacggtttggaaaccactttgaaacccgaaaat
ttgagaaattatttttatgccatctcagatatttattctagtgtaagatgtcagtgtaac
cttcatgctgagaactgcaatgaattatcaggtggacagtattcatgtgattgcaaacat
aacactatgggtgtgaattgtgaattatgcttaccactgtacaacaatcgaccgtggcaa
gctggaagctatcttccttatcctagtggtacggctaacgagtgccagctttgtgattgc
aatgaacatgcagctaactgttcatatgatgaaactgttggtaagggtgtgtgtgaaggt
tgcgaagacaacacagcaggattgttttgcgaaatctgtgtcgcaggttattatcgaaac
cagtctgagcctgtgaacagtcctgacgtctgtataggatgtgactgtgaaccgcttgga
actcttcctacgtctgaaaatgttacggaatgctcgcagtatgaaaatgatgtcaccggg
cagccagtcggtcagtgttcatgcatcgactttgttactgggagacgatgtgatgaatgc
attgatgagtattacggtctgaagcaagtggaaagtgcgggactctgcaaagaatgtgga
tgtaagattcttggcacggtgaacgccagtaatgtgtgcgagaaaaccgagggacagtgt
ccgtgtaaaccaaacacttttgaaagagactgtagtaggtgtaaggatggtttctatgcg
tttcctagtagtactgaaatggactgtctcgcgtgtcgttgtgattatggtggttcttat
acacaaatctgtaacattgtatctggtctgtgtgattgtcggccaaatttgattggacag
cgatgtaatatggttgacagtggatacttttacaattacctagatgctaacagttatgat
tcttgggatgctgtttctgcctgttcaagagaatctgatttacccattgactacaccgga
gtgggttatcttgtctgtcaagataacacaaatgtgttatttcagaacgtgaaggcattt
tctgtcatgtctgatatacaaaaatatcttccagttatacgatactcatacaattcctct
gacaactggtactctgcaagtttgtcgctctctgcaactggtgactcggccaatcaagac
ttattacatgagttagctggtgacgttgacccggatacttcatctggcaataccactgat
gcaccaacaactgccgatatcacatgttcagtacaagctgggattattatgagtattgca
gttgtgtttacacctggccaagatatttcgtggcaacctgttaatgttgaagacgacctc
ttagatgtggatcgcagatgtaactatgaattgaatctccaactaatgagttctggagat
ggtgctgataacattcaaatagatagtctagttttgatgccagttttgacggattttcaa
gtttacaaatatggggcatgcgattgtaatatgaactactctatgggtgacacatgtact
gcacatggtggtcaatgtgtatgtaaaactggtgtctacggcagacagtgtgatcggtgt
caaccaggatactataacttaactgaagatggctgtacaccgtgcaattgtgatcctctg
ggttctgctagcttggtatgtgactttgaatctggtcagtgtccgtgccaagagggcgtg
gcaggcctatcgtgtcaggagtgttcaacaggattcaaacgagcttcaccagatgatggg
tcttatagcatttgtgaggcatgtgagtgtccttatattgaccccagtgcagacccaaat
acgcagccctcagctcagcgagctactgaatgtgaaccagacaccggtatttgtattgac
tgttcatctggttcaactggtgacttctgtgagatttgcaaggaaaacgtcaagggacct
gactgtgatcgatgtattagcttcttttatggatttgatactgaattgtttggaggtgcc
tgcaatgcgtgtaactgtaatacaactggtactggtggagtcatggagtgtgacaatggt
agcggtcaatgtacatgtattggtaattatggaggaaagcaatgtgctcgatgcaaagac
aatttttacgattatgattcaggatgtgttccatgtgatagttgctatgacgttattgat
gaagaaatgaccaaattaagagagttgacacaaaacttaacagactttgtagggtatttg
agtagtcaagacaacacaacagaacttggaccattctacatcagactacaagagacagaa
gatgtgataatggagctggcagcaaatatcaatgaagcagtcgccgaagaagatgatttg
aatgcaagaatagaatcattgaatggcacaatgcagaccttgatgagtctgctgagtaat
gacatcactaatgctgtcaacgagaccaacgttgatatcaatgaagcagttgacaatgtt
gctggaagtaaagacacaatcgacacaatagaacagagaattaccgactcttacaacatg
ctgaacagtggtacattagagcaagctcagataactctacaagcattgcagtctgactta
aataaacttgatatacagatcacatcggctgccagttctacaacgggtgatatcgcagat
ttagaagcacaagtcgatgatatgtcaacaaaaacagaagccgccagacagagtgcttta
caggctttacagactgtacaggaagcccagctacttcatgataacaccacaaaccgtgtg
tctgatctccgttctgctgctacatttgtacaacagaaaagcgaaaacttagatagccaa
gcaacagaaatgttgagccgtgcacagtccaccaatcaggaagccactgcagcactgacg
aaggctatgtcgccaaatgacaacgctgatactgatgtcgaaaatctaatagactctgct
agtgttaagattgcacaggctggcgctattgaaaatcaggccactcaggcacttgaacaa
aatctatatatcattgatgaagtggcagatgctggcaatataactgacattaccctggct
gaagttaacacagtcaccgcagatgttaccgcaagatatgacaggtcaacaaatgcatat
acacttgcaaacagtgctctggaattatcaggagcaacattcgatgcagccaatgagatg
ttaaatacattagaaaattttgaaagcattgtagacgaagttgagcaggcagctgataca
gcaatggacactgtggcaagtgttgtagaattgagtaacagtgcgacattagaagccagg
gcgatacaaagtgaactatctgattctgaactgcatgccgattctgctttgagtatcgca
gatgaagcattcaacatggctgaagctgaaagagagagcgtggcacctgctaataaccga
gctaaccaacttgccgaagaagctgccgcgaaattaacagacactgactcgttgattcag
gatgtaaaatccatcaataccacgttagtagcaccgcaacaagcgatatgtaatgattat
gccaccactatggatacgctagaagcaacagtcctggaggcaactgaccaatcaaatcag
gctttggtcatggtggctcagacggagactgacttgaaattgcttcttgcgagtttggaa
aacattggaacgattgacacttcccaattgtctggatatgctgaaaggatagccgcagca
aggaatacttttacggagactgattttgcagcgtctatcgctgctttgaaaattgccgtt
gatgaacagcaaacatggcttgataggactagactcaaagttgattcgctacaatcacaa
gttgatgcgctggaaagtttcagagtcacttctggctaa
DBGET
integrated database retrieval system