Shewanella livingstonensis: EGC82_01325
Help
Entry
EGC82_01325 CDS
T05875
Name
(GenBank) EAL domain-containing protein
Organism
slj
Shewanella livingstonensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EAL
GGDEF
PAS_3
HAMP
PAS
PAS_9
G1_gp67_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZG71528
UniProt:
A0A3G8LS12
LinkDB
All DBs
Position
295222..297705
Genome browser
AA seq
827 aa
AA seq
DB search
MPRLPKLSLSILVPVCIFILYLGLVSGEYFYEHAELNEQLALRQSEQIQKDLFRMRHVVE
TSLLIQDLERIEQEVALVSTDQNMMVYVILDSASEIQFANHIIWRESNATNVLEGYSADL
HRSVISNNKSYIKVNFERLSIQAYYPLNANSRYSNSNSVELIYLEYDIANLLAEAVDSLL
KRFIEIWGIGALLLSLFCVMLHYLLIRPLTQLSQAAKNLDSPDFNTDILCASTELINLRD
YLNQVNGRLSRSKKRLNDAEQRWLFAVEGARNGIWDWCISTGDVFVSDRWKDILGYQPYE
LDNDYSVWESRLHRDDKAQVLNTLQNYINNQHEYYESVHRLRHKDGRYIWILDRGKIVEW
DERGRPSRIIGTITDVSGDVKSQNITNDKQGHNGLTDLINRDVLADQLYDLQVFSRKTGQ
FSALLMINLDNFKLINDALGRQLGDRLLMQIAARLSGTFSSAGLVARLGADEFVILAKNF
GNEIDQANKRALALASEVRQLIGRGFTISDQNLTISARIGLVVFDGIESLEPQVLLARAD
SALEQAKDSRSNGCAIYQAELDQNQVQPFKLQNELKLAIHNQQMSLVYQPVVDQAGQLNS
VEVLMRWYHPQYGYISPRKFIASAELSDCIFELELWALDKVCEVIRELQQANATVPIMSL
NVSSRHFHQDHFVNVIMNRINAAQISPTLLQFELAEDVFVVNANVARNKIAELQRFGVNI
AMDNFGSGSCAVHLLQGIRFSQVKLAAVYLEDIEFNPETFNIISAIVEFAAKLNFPVVAK
QIENKQQLNLLTHAKCTWFQGYIISRPLVHDDIIQLIKTQLSLSVVP
NT seq
2484 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgcctcgtttgccaaaactttctctgtcgatactcgttcctgtatgcatttttatcctt
taccttggtctagtctcaggagagtatttttatgagcacgctgagctaaatgaacagctt
gcattaaggcagtcagagcaaatacagaaagacttatttcgaatgcgtcatgtagtcgaa
acgtctttattgatacaagatcttgaacggatagagcaggaggttgcgttagtttcaacc
gatcaaaatatgatggtctatgtgatacttgattctgctagtgaaattcaatttgcaaat
catattatttggcgagaaagtaatgctactaatgttttagaggggtattctgctgacttg
catagaagtgttatcagtaacaataaatcttacataaaggtaaattttgaacgtttatct
attcaagcttactatcctctaaacgccaattcacgttatagcaattctaactcagtagag
cttatttatttagaatatgacattgctaatctattagcagaagccgttgatagtctttta
aaacgcttcattgagatatggggaataggtgctttattattgtcactattttgtgtcatg
ttgcattatttacttatccgcccgttaactcaattaagccaagccgctaaaaatctagat
tctcccgatttcaacactgatattttatgtgcctcaaccgagttgattaatttacgtgac
tacctaaaccaagttaatggtcgattatctcgtagtaagaaacgtcttaatgatgcagag
caacgctggctatttgctgttgagggcgcacgtaatgggatttgggattggtgtatttct
actggtgatgtgtttgtctcagaccgctggaaagacattttaggctatcaaccttatgag
cttgataatgattattctgtgtgggaatctcgtttacatagagatgataaagctcaggtc
ttaaatactttacaaaattacataaacaaccaacacgagtattatgaaagtgttcaccgt
ttacgccataaagatggtcgttatatttggatacttgaccgaggtaaaatagttgaatgg
gatgagcgcggtcgaccatcacgaattatcggtacgataacagatgtttctggtgacgtt
aaaagccagaatattacaaatgataagcaaggtcataatggccttaccgatttaattaat
cgtgatgtactggctgatcagctttatgacttacaagttttcagtcgcaagacaggtcag
ttttctgcgttattgatgattaatttagataattttaaattaatcaatgatgctttaggt
cgtcaattaggtgaccgattattaatgcagatagctgcgcgattgtcaggtacattttct
agtgctggtttggtggctcgccttggtgctgatgagttcgttattttagccaaaaatttt
ggtaatgaaattgatcaagcaaataagcgtgcgttagcattagctagtgaagtaaggcaa
ttaattggccgtggctttacgatttctgatcaaaacttaactatttcagctcgtatcgga
ttagttgtttttgatggtattgagtcgttagagccgcaggtattgttggctcgtgccgac
agtgctttggagcaagcaaaagacagtcgttctaatggttgcgccatttatcaagcggaa
ttagatcagaatcaggttcaaccatttaaattacaaaatgaattgaaactagctatccat
aaccaacaaatgtcattggtttatcaaccggttgtcgatcaggccgggcagcttaatagc
gttgaagtgctaatgcgttggtatcatcctcaatatggctatattagtcctcgcaagttt
attgcatcagctgaattgtctgattgtatttttgagttagagttatgggcattagataaa
gtctgtgaagttattagagaacttcagcaggctaatgcgactgttccaattatgtcgtta
aatgtgtcctcacgacactttcatcaagatcacttcgttaatgtgattatgaatagaatc
aatgcagcacaaatatcacccacattacttcagtttgagttagctgaagacgtgtttgtt
gttaatgctaacgttgccaggaataaaattgctgagttacaacgatttggtgtcaacatt
gcgatggataattttggcagtgggtcttgtgctgtccatttattgcagggtattcgtttc
tcacaagtgaagttagcggcagtttaccttgaggacatagagtttaaccccgaaactttt
aacattatcagtgccattgttgagtttgccgcaaaattaaactttcctgttgtagctaaa
cagattgagaataagcaacaacttaatttactgactcatgctaaatgtacatggtttcag
gggtatattattagcagaccgttagttcatgacgatatcattcaattgattaagacgcag
ttgtctttgagtgtagtgccataa
DBGET
integrated database retrieval system