Spiroplasma litorale: SLITO_v1c06640
Help
Entry
SLITO_v1c06640 CDS
T04047
Symbol
ganP
Name
(GenBank) arabinogalactan oligomer / maltooligosaccharide transport system permease protein
KO
K15771
arabinogalactan oligomer / maltooligosaccharide transport system permease protein
Organism
sll
Spiroplasma litorale
Pathway
sll02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
sll00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
SLITO_v1c06640 (ganP)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
sll02000
]
SLITO_v1c06640 (ganP)
Transporters [BR:
sll02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
Arabinogalactan oligomer/maltooligosaccharide transport system
SLITO_v1c06640 (ganP)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_1
TM_PBP2_N
DUF6518
EMC6_arch
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKX34293
UniProt:
A0A0K1W2A2
LinkDB
All DBs
Position
complement(732259..734496)
Genome browser
AA seq
745 aa
AA seq
DB search
MNSFINSQIDFLNKEKQLTQLESSKKNNDYAKKIYLELKSTIKNDLTFLVNVKQMQFINN
GDVNNKNLFSSKKINSYLENKDEQFIRRFFYKKSELKNIKADTFNNEKELEYIEKKEHYW
TLRWYSLKNKYIKKINILFLSLAHRSALKIVKKFDILLNNDGDIMYSKKVKYSSETIQNN
LLLQKKEYKNLIISIKNDDKLEKLNKIKSHYENYKDFNYDYEYKYKKCIVDIEYYNEINN
IKESHLNNIKNFRKQIFKTNATEKINLFTKIKIYKKNYDDYRSEKFTYISEIKKNKLNRA
HGMQRINNEIPIENKSRTIWLATLFMLIPGASQFIHKQNLKAIIYLLLLPLNIIFLIYSL
GIINIGGNGIFGLGDFGKSTPGPDTDGRYYLVEGVLSIVFLTFVLGYWICNIYDSIIVNK
QINMGARPHNNSQTRNFLSSQGVPYIVSLPAILSIIFLSLVPIFATVLIAFTNYGKGNDP
AKLNQYISWVGFENFTTLFAGEYKNSFAYVLQWTLIWTILASVGGIIAGWAASFLMNNKR
VMCKPLLRLVMMLPWAIPSFITILVFSILLGSKQVNDFTQKYLGVSGWRTKESEARTAII
FIQAWLAQSNFFLLVTGIRQTISKDLEEASIVDGTSRAGFNIKIVIPIIATQIAPMLLAT
FIANFGNFNMIALYNANVIATDAAGIPLKGNPGVVDIFISFIYKLSTTASFYNYGISAAM
LLISSSIVVALNAISLRRMKVFKNK
NT seq
2238 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatagttttatcaactcccaaatagattttttaaataaagaaaagcagctaacacaa
ttagaaagctctaaaaaaaataatgattatgctaaaaaaatatatttggaactaaagtct
acaataaaaaatgatttaacctttcttgtgaatgttaaacaaatgcaatttataaacaat
ggcgatgtaaataataagaatttattttcttctaaaaaaataaattcttatttagaaaat
aaagatgaacaatttatacgaagatttttttataaaaaaagtgaacttaaaaatataaaa
gctgatacatttaataatgaaaaagaattagaatacattgaaaaaaaagaacattattga
actttaagatggtattctttaaaaaataaatacattaaaaaaattaacattcttttctta
agtttggcacatagatcggccctaaaaattgttaagaagtttgacattttattaaataat
gacggcgatattatgtactcaaaaaaagttaaatattcatctgaaactatacaaaataat
ctattgttacaaaaaaaagaatataaaaatttaataataagcattaaaaatgatgataag
ttagaaaaattaaacaaaattaaaagtcattatgaaaactataaagattttaattatgat
tatgaatataaatataaaaaatgtattgtcgacatagaatattataatgaaataaataat
attaaagagtcgcatttaaataacataaaaaattttagaaaacaaatatttaaaactaat
gctacagaaaaaataaatttatttacaaagattaaaatttataaaaaaaattatgatgat
tatagatctgaaaaatttacatacatttcagagattaaaaaaaataaattaaatagagca
catggtatgcaaagaataaataatgaaataccaatagaaaataaaagcagaacaatttgg
ttagcaacattatttatgcttattccaggagcgtcgcaatttatacataaacaaaattta
aaagcgattatatatttattattgctacctttaaatataatattcttaatttacagttta
ggaataataaatataggaggtaatggtatttttggtttaggtgattttggtaaaagtaca
ccaggaccagatactgatggaagatactatttagtagaaggtgtattatcaatagtattt
ttaacatttgttttaggttattggatatgtaatatatatgattcgataattgtaaataaa
caaataaatatgggtgcaagaccacacaacaatagtcagactagaaattttttatcaagt
caaggagtaccctatattgtaagtttaccagctatattatcaataatatttttatcatta
gtgccaatatttgcaactgtattaattgctttcacaaattatggaaaaggtaacgaccct
gctaaactaaatcagtatatatcttgagtgggatttgaaaactttacaacattatttgca
ggagaatataaaaattcatttgcttatgtattacaatgaactttaatttgaacaatttta
gcttctgttggaggaattattgcagggtgagccgcatcattcttaatgaataataaaaga
gtaatgtgtaaaccgttgctaagattagttatgatgttaccttgagccataccttctttt
ataacaatacttgtatttagtattctattaggatctaaacaagttaatgattttactcaa
aaatatttaggtgtttcaggttgaaggactaaagagtctgaggcaaggacagcaataata
tttattcaagcttgacttgcgcaatctaatttctttttattagtaacaggaataagacaa
acaatatcaaaagatttagaagaagcatcaattgttgatggaacttcaagagctggattt
aatataaaaattgtaatcccaataatcgcgacacaaatcgcacccatgttacttgcaaca
tttatagctaactttggtaactttaatatgattgcactttataatgcaaatgttattgca
actgatgccgcaggtattccattaaaaggaaacccaggagttgtagatatatttatatca
tttatatataaattatcaacaacagctagtttttataattatggtatctcagctgcaatg
ttattaatttcttcatcaatagtggttgcattaaatgcaatttcattaagaagaatgaaa
gtttttaaaaataaatag
DBGET
integrated database retrieval system
