Solanum lycopersicum (tomato): 101263386
Help
Entry
101263386 CDS
T02665
Name
(RefSeq) leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
Organism
sly
Solanum lycopersicum (tomato)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
LRR_8
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRR_6
LRRNT_2
LRR_9
ABC1
APH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
101263386
NCBI-ProteinID:
XP_004235172
UniProt:
A0A3Q7GAV2
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(55996615..56001196)
Genome browser
AA seq
1018 aa
AA seq
DB search
MKHFSPFFLTTLLFFLTKISLVFSITNLPLQLTSLLTLKSSLHDHQNTFNDWDPTLAFAR
PGSHIWCSWSGIKCDKKTNQITSLDLSNRNLSGTIPEDIRNLVHLHHLNLSGNALEGTLQ
IVIFQLPFLKTLDISHNLFNSTFPSGVSRLKSLTYLNAYSNNFIGPLPEEVAQIPNLEYL
NFGGNYFKGLIPKSYGGLAKLKFLHLAGNLLNGPVLPELGFLKQLEHVEIGYQNFTGVIP
AEFSSLSNLTYLDISLANLSGNLPVGLGNLTNLETLFLFKNHFYGTIPLSFVRLTSLKSL
DLSDNHLSGTIPEGFSGLKELTVLNLMNNNFTGEIPQGIGELPNLELLALWNNSLTGILP
QKLGSNAKLQKLDVSSNHLSGPIPPNLCLSNNLVKLILFSNQFVGEVPSSLANCTALFRF
RIQNNRLNGSIPLGFGVLPNLAYLDLSKNNFSGPIPEDLGNAVTLEYLNISENSFNSELP
EGIWSSPSLQIFSASYSGLVGKIPNFKGCKAFYRIELEGNNLTGSIPWDIEHCEKLICMN
FRKNSLTGIIPWEISAIPSLTEVDLSHNFLTGTIPSNFANSTTIENFNVSYNQLTGPVPS
SGSIFSSLHFSSFIGNEGLCGAVLQKPCGTDGLAAGAAEIKPQTKKTAGAIVWIMAAAFG
IGLFVLIAGSRCFHAKYSQRFSVEREVGPWKLTAFQRLNFTADDVLERLAMTDKILGMGS
TGTVYKAEMPGGETIAVKKLWGKHKETIRKRRGVLAEVDVLGNVRHRNIVRLLGCCSNNE
CTMLLYEYMPNGSLDDLLHGKNKDANLVADWLTRYKIALGVAHGICYLHHDCDPVIVHRD
LKPSNILLDGDLEARVADFGVAKLIQCDESMSVIAGSYGYIAPEYAYTLQVDEKSDIYSY
GVVLLEILSGKRSVEPGFGDGNSIVDWVKTKIKTKNGVNDVLDKNAGASCHSVREEMMLL
LRVALLCTSRNPADRPSMRDVISMLQEAKPKRKLPGTVGVGDNAIAAKPLAQKANVEC
NT seq
3057 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaacacttctctccattctttctcactacacttctcttcttcttaacaaaaatttca
cttgttttctccattaccaatctacctctacaactcacatctcttttgactttaaaatct
tctttgcatgatcaccaaaataccttcaatgactgggatcccaccctcgcattcgctaga
ccaggttctcacatttggtgttcctggtctggtatcaaatgtgacaagaaaactaaccaa
atcacctctcttgatctgtcgaaccgcaatctctctggtacaattccagaagatatcaga
aacttggtacaccttcatcacttgaatttgagtggaaatgctttggagggtactcttcaa
atagtcatttttcaattgccttttctaaagacacttgatattagtcacaacttgtttaat
tcaacttttccctctggtgtatcaaggctcaagtctctaacatacctaaacgcttatagt
aacaatttcattggccctttgcctgaagaagttgctcaaatccctaatcttgagtatctt
aactttgggggaaactatttcaagggtttgattccaaaaagttatggtgggttagcaaaa
ctgaagtttttgcacttggctgggaatttattgaatggtcctgttttgcctgagttgggt
ttcttgaaacaacttgaacatgtagaaattggttaccagaatttcactggagttatccct
gctgaattttcttctttgtcaaatctgacctatcttgatatctcattagccaatctttct
ggtaatctacctgttggactaggcaacttgacaaaccttgaaactctatttcttttcaag
aaccatttctatggtacaattccattgtcttttgtcagactgacatccttgaaatcgttg
gatttgtctgataaccatctctccggaacaatccccgaaggattttcaggattgaaggag
cttactgtcttgaatttgatgaacaataactttactggtgaaatcccacaagggattggt
gagcttcctaatcttgaattattggctctatggaataactcactcactgggattttgcca
cagaagttgggttcaaatgcaaagctacaaaaacttgatgtctcttcaaatcatctctca
ggtcccattccaccaaatctctgtctcagcaataacttagttaaacttatcctgttttca
aatcagtttgttggtgaagtcccttcttccttagcaaattgtactgcattattcaggttt
agaattcaaaacaacagactcaacgggtccataccattgggcttcggtgttttgcccaat
ttagcttacttggacttgagcaaaaacaatttcagtggtccaattccagaagatttaggg
aatgctgtgacattggagtatttgaacatatcggagaattcattcaacagtgaattaccg
gagggtatctggagttcaccatctctacagatcttttcagcaagttacagtggtctagta
gggaaaatccccaatttcaaagggtgtaaagctttctacagaatcgaactggaaggaaat
aatctcacaggaagcattccatgggatattgaacattgtgagaagctcatttgcatgaat
tttcgaaaaaattcgctaaccggaattattccttgggaaatttctgcaattccttcctta
acagaggttgatttgtctcacaattttctcactggaacaattccttcgaatttcgccaat
tccactaccatagaaaacttcaacgtatcctacaatcagctcactggtccagttccttct
tcaggctcaattttctccagtctacatttctcctccttcatcggaaacgaaggcctttgt
ggtgctgtccttcaaaagccttgcgggactgacggacttgctgctggagcagcggaaatc
aagccacagaccaaaaaaacagctggcgctattgtctggatcatggcagcagcattcggt
attggtttattcgtcctcatcgccggtagccgctgtttccacgcgaaatacagtcagcga
ttttcagtagagagagaagttgggccatggaaattaaccgcatttcaaaggttaaacttc
acggcagatgatgtacttgagagattggcaatgacagataagatcctgggaatgggttca
acaggtacagtgtataaggcggaaatgccaggcggtgagactatagcagtgaagaagcta
tggggtaaacacaaggagacgatcaggaaaagacgaggcgttttagctgaggtggatgtg
ttaggcaatgtgaggcacaggaacatcgtgaggttgttaggctgttgcagcaacaacgag
tgcacgatgttgctgtacgagtacatgcctaacggtagcctggatgatctgttgcatggt
aagaataaggatgctaatttggtggctgattggcttactaggtacaaaattgcacttggc
gtggctcatggaatttgttatcttcatcatgattgtgatcccgtcattgttcatcgtgat
cttaagcctagtaatattcttctggacggcgatctggaggctagagtagctgattttggt
gttgctaagttgattcagtgtgatgaatccatgtccgtgattgctggatcttatggctac
atcgcacctgaatatgcatatacattgcaagttgatgagaagagtgacatctacagctac
ggggtggtgttacttgaaattttatcagggaaaagatcggtggaaccaggatttggcgat
ggaaatagcattgtggattgggttaaaacgaagatcaagactaaaaatggcgtaaatgat
gtgttggataaaaatgctggcgcttcatgtcattcagtgagggaggaaatgatgttgctg
ctgagggtggcattgctgtgtactagtcgtaacccggctgataggccatcgatgagggat
gttatatctatgttgcaagaggctaagcctaagaggaagttgcctggaactgttggcgtg
ggtgataatgcaattgctgctaaacctttggctcaaaaagctaatgtggagtgttga
DBGET
integrated database retrieval system
