Breviolum minutum: v1.2.015992.t1
Help
Entry
v1.2.015992.t1 CDS
T04349
Symbol
symbB.v1.2.015992.t1
Name
(OIST) -
Organism
smin
Breviolum minutum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Form_Nir_trans
PPR_2
PPR
PPR_3
PPR_1
PPR_long
COX5A
Motif
LinkDB
All DBs
AA seq
1281 aa
AA seq
DB search
MHDPMESARAPGRGKCQWQRCVPKGFCLFGMLLAFPAFRCFSAVLLVFKLAIVSSDCEVP
ARSNQLLQTNAASHNVRRTSPIFHFDDTKMWGLDKNLSWRVSKSDCKLQFPSIENASRKI
ESRLSLGVCLTPWTPLQRWRLDLALPASHGRTHPGANPSMIPLPETLQEVFPFGKWFVVS
RPGWARCPGMQDFDHGRDGPFLINLWCSGSHAAVLDAEFNVEAVSKIQLEGVEGAWWDNA
ISDVRLWPSGDGEIIVSFLPYLFHEVYHTHMAKLYVSGADGVLNVWIDPREVRRAESCHN
KKVAKKNLGFFRSGSDVFLLDKVFPTAVSAMNLSLLDRDSELEIENSHTYMPEANEGWKP
VTLPSICMKSVVTGNESSHSPWYGRGQEHDTFLHNGPSPIWIQEMQVFLGIGHLARGTRP
SLTLRFLPDHYSHQFFAISASPPFRLVALSPEFCFSSAQDPGDCENIQYASTLLRDGDHL
LVAYGVEDCDSYVQQFLLSDILHSMVNVHQIRDRKSNAEQITAAAEELREKHLIEDSDTY
RLVLNTLTKRSAWNDALSIWDEMRWIGTELKEPDFVLAMKAFSRGSQWQATLAVFAELLG
QEEMHLTTGRHREDLRPDCRAYTTAIDACRRVGAWMQAVQVLEDMEEMMVTPDVVAYNAV
MAACEKGRNYPAARHVLAEFDRYALDPDMVTYNTLIGACGWGQEWKAAVGYLRQMQEKSY
FDYDLISYTAAISACAKATEWETALALIHEETYNAALSACASAGKCEHAMLLIEQLLDFD
LFPNLMTYRYAIASCEANGEWELALDLMSEMSEAKLEPREMIYRSVAKACRAGGQANVAE
AMEMKAIPAKVSFPPDGDGADGPLRLAAVTGTKSVLLCFDIEEASLLDGLLGFALCRIAL
TQDGPDGEEVWMGDPRRGPWGNDRLELCSRCGNAPSAFAHERPRDSMSGVAFVAPVAPSI
STVAKHDLRGAQFSKGPALVSGYSEDPSVQHAMTSMAAMFVVAGGVRWRERRSALRAGGG
PSTAVVGSPPETYQELVDKSEYLRDQPWQKTFHAAFMGGAYVGMAGLLSLVLGGNMASQF
ITQKAVFAALFPINLLLVLTTGGQLFTGNSATMAIGIYEKKCTVKDLIRNWSIAYIGNIC
GCLLIDAVARYTGMFTAGAAEMAVHTVMKKCSATFGQTVVKGIMCNWLVCMAVWLCTMAK
DMTGKMVGVWFPISMFIAIGFEHSVANMFILPAGLFSGAPLTWGDILIKNLIPVTIGNAI
AGAFVVGAGMSFMFGKLGKKE
NT seq
4092 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
tcgcggcccatggtgagcaccaggaaggcataaagagagccttacaaaggcattcaaaga
ccaagctaccacagagtgactagcagactagcatgcatgaccccatggaaagtgccagag
ctcctggtcgaggaaaatgccagtggcaaaggtgtgtgccaaaaggcttctgcttgttcg
gcatgctgcttgctttcccagccttcagatgcttttcagctgtgctcttggtttttaagc
ttgcaattgtgagctcggactgcgaagttccagccagatccaatcaactcttgcaaacga
atgctgcatctcacaatgtacgtcggacaagtcccatttttcactttgacgatacaaaga
tgtggggcttggacaagaacttgtcgtggcgagtctcgaagagcgattgcaagttgcaat
ttccaagcatcgaaaatgcctcaaggaaaattgaatctcgactttctttaggtgtatgtt
tgactccatggactccactgcaacgttggcgtttggatttggccttacctgccagtcatg
ggagaactcatccaggtgcaaatccttcaatgattccattgcccgagacgttgcaagaag
tttttccatttggaaaatggttcgttgtgagtcgtcctggttgggcaaggtgcccaggga
tgcaagattttgatcatggtcgtgatggcccttttctcatcaatttgtggtgttctggct
cccatgctgccgttttggatgcagaattcaatgtggaagcagtatccaagattcaattgg
aaggagttgaaggagcttggtgggacaatgccatctccgatgtacggctttggccatcag
gggatggagagattatcgtcagcttcttgccttatctttttcatgaggtttaccacactc
acatggcaaaactctatgtcagcggtgccgacggtgttctcaacgtttggatcgatccac
gtgaagtgagacgagcagagagttgtcataataaaaaagtcgccaagaagaacttgggtt
tcttccgttctggctccgatgttttcctcctggacaaggtcttccctacagctgtcagtg
ctatgaatctctcgctgttggatcgtgactcggagcttgagatcgagaattctcacacct
acatgccggaagcaaacgaaggctggaagcctgtaactttgccatccatctgcatgaaat
cagtcgtgactggcaatgaatccagtcactctccatggtatggcagagggcaagagcatg
acacatttttgcataatggtccatctccaatttggatccaagaaatgcaagtctttcttg
gaatagggcatttggcacgtggaacacgtccatctctcactctacgctttttgccagacc
actactcacatcagttctttgcaatttcagcatctcctccttttcgcttggtggctttat
cgcctgagttttgcttcagcagcgctcaagatcctggcgattgtgagaacatacaatatg
ccagcactttgcttcgagatggtgaccatttgctggttgcgtatggcgttgaagattgcg
actcttatgttcagcaattcctcctctccgacatcctacattctatggtgaatgtgcacc
agatccgcgatcgaaaaagcaacgcggagcagatcactgcggcggccgaagagcttcggg
agaagcatctcatcgaggactcagatacatatcgcttggtgctcaacaccttaacgaaaa
gatccgcctggaacgatgctttatcgatttgggacgagatgagatggattgggacggaac
tgaaagaaccagatttcgttctggccatgaaagccttctccagaggcagtcagtggcagg
ccactcttgccgtttttgcggagctcttgggtcaagaagagatgcacctcacaacaggtc
gccatagagaagatcttcgacccgactgtcgcgcctacactactgccattgatgcgtgtc
gtcgagtgggagcatggatgcaggcagtgcaggtgctggaagatatggaggaaatgatgg
tcactccagatgtggtggcgtacaacgccgtcatggcggcctgcgagaagggccggaact
acccggcggcgcggcacgtcctcgcggagttcgaccgctacgccttggatccagatatgg
tgacctacaacacattgattggtgcttgtggatggggccaagaatggaaggcagctgttg
gctacttgcgtcaaatgcaggagaagtcttactttgactacgacctcatttcctacactg
cggcaatcagtgcatgtgctaaggccacggagtgggaaactgctttggccttgatacatg
aggagacctacaatgctgccctcagtgcatgtgcttccgcgggcaaatgcgaacatgcca
tgcttctgattgaacagctcctggatttcgacctttttccaaatctgatgacctacagat
atgccattgcttcatgcgaagcaaatggagagtgggaattggctttggatcttatgtccg
aaatgagcgaggcaaagttagaacctcgggagatgatctacagatccgtggcgaaggcat
gccgtgcaggtggccaagccaatgtggctgaagcgatggagatgaaggcaatccctgcaa
aggtatcgttccctcctgatggtgatggcgctgatggtccactgcgtttagcagccgtca
ccggcacgaaaagcgtcctcctatgctttgatatcgaggaagcttcacttttagatggcc
ttttgggttttgccttatgcagaatcgctttgacccaggatggccccgatggggaagagg
tttggatgggagatccccggcgtggaccatggggaaacgaccgccttgagctctgttctc
gatgtggaaacgcaccgtccgccttcgcccacgaaagacccagagacagcatgtcgggtg
ttgcctttgtcgcaccagtcgcaccaagcatcagcaccgtggcaaagcatgacttgaggg
gcgcccagttctctaagggaccagcattggtcagtggatactcagaggatccatccgttc
agcatgccatgacctccatggctgccatgttcgtggtggcgggtggcgttcgttggcgtg
aacgccgcagtgcgcttcgtgctggtggtggcccttccactgccgtagtgggctctcctc
ctgagacataccaagaactggtggacaagtcagagtacttgagggatcagccatggcaaa
agacattccatgctgcattcatgggtggtgcatatgtgggtatggctggcttgctgtctt
tggtgcttggtggcaacatggcttcccagttcatcacacaaaaagctgtctttgcggcct
tgtttcccatcaacctcctgttggtgttgaccactggtggacagcttttcactggaaaca
gtgccactatggccattggcatctatgagaagaagtgcactgtgaaggatttgattcgca
actggagcatcgcttacattggcaacatttgtggctgtttgctgattgatgcagtggccc
gctacacaggcatgttcactgcgggtgcagctgaaatggctgtccacactgtgatgaaga
agtgctcagcaacttttgggcagaccgtggtgaagggcatcatgtgcaattggttggttt
gcatggctgtgtggttgtgcacaatggcaaaggacatgacaggcaagatggtcggagttt
ggttccctatttctatgttcattgccattggctttgaacactctgtggccaacatgttca
ttctcccagctggcttgttctccggcgcaccactcacttggggagacattctgatcaaga
atcttatccctgtgaccatcggcaatgccattgctggtgcttttgtggttggcgccggta
tgtccttcatgtttggcaagttgggaaagaaggagtgagtacgttaagcacaccaggcct
agtgaaattgacatttttcctaataagactggcacgacaacaggctgccgtcgagacggg
tggaattgccagcggataatttaaatgcttgcatggctccacccccagcggcgtgacact
caagacccgctt
DBGET
integrated database retrieval system
