Breviolum minutum: v1.2.015992.t2
Help
Entry
v1.2.015992.t2 CDS
T04349
Symbol
symbB.v1.2.015992.t2
Name
(OIST) -
Organism
smin
Breviolum minutum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Form_Nir_trans
PPR_2
PPR
PPR_3
PPR_1
PPR_long
COX5A
Motif
LinkDB
All DBs
AA seq
1506 aa
AA seq
DB search
MHDPMESARAPGRGKCQWQRCVPKGFCLFGMLLAFPAFRCFSAVLLVFKLAIVSSDCEVP
ARSNQLLQTNAASHNVRRTSPIFHFDDTKMWGLDKNLSWRVSKSDCKLQFPSIENASRKI
ESRLSLGVCLTPWTPLQRWRLDLALPASHGRTHPGANPSMIPLPETLQEVFPFGKWFVVS
RPGWARCPGMQDFDHGRDGPFLINLWCSGSHAAVLDAEFNVEAVSKIQLEGVEGAWWDNA
ISDVRLWPSGDGEIIVSFLPYLFHEVYHTHMAKLYVSGADGVLNVWIDPREVRRAESCHN
KKVAKKNLGFFRSGSDVFLLDKVFPTAVSAMNLSLLDRDSELEIENSHTYMPEANEGWKP
VTLPSICMKSVVTGNESSHSPWYGRGQEHDTFLHNGPSPIWIQEMQVFLGIGHLARGTRP
SLTLRFLPDHYSHQFFAISASPPFRLVALSPEFCFSSAQDPGDCENIQYASTLLRDGDHL
LVAYGVEDCDSYVQQFLLSDILHSMVNVHQIRDRKSNAEQITAAAEELREKHLIEDSDTY
RLVLNTLTKRSAWNDALSIWDEMRWIGTELKEPDFVLAMKAFSRGSQWQATLAVFAELLG
QEEMHLTTGRHREDLRPDCRAYTTAIDACRRVGAWMQAVQVLEDMEEMMVTPDVVAYNAV
MAACEKGRNYPAARHVLAEFDRYALDPDMVTYNTLIGACGWGQEWKAAVGYLRQMQEKSY
FDYDLISYTVATTCGSNLCCRAGPGALTMLGDIFKSPVLGELKSPSSVFDFRWSVGSLGS
LGSQTSPQVPEKVEKTPGPVGPVIKVGPCKCCSGNGSAAFDEDLLEASGPSFRVSNVNDV
MQHWADVDGDFLKATPTPGCTSKAPDSQNSQNSNLHSHHSPADDWISEMLNDMEQFGQTN
GLEHLWLKRAARARQNEKSLENVQLSHFSGIPSGRFRCCWARFVASCPEGCEHAAAISAC
AKATEWETALALIHEETYNAALSACASAGKCEHAMLLIEQLLDFDLFPNLMTYRYAIASC
EANGEWELALDLMSEMSEAKLEPREMIYRSVAKACRAGGQANVAEAMEMKAIPAKVSFPP
DGDGADGPLRLAAVTGTKSVLLCFDIEEASLLDGLLGFALCRIALTQDGPDGEEVWMGDP
RRGPWGNDRLELCSRCGNAPSAFAHERPRDSMSGVAFVAPVAPSISTVAKHDLRGAQFSK
GPALVSGYSEDPSVQHAMTSMAAMFVVAGGVRWRERRSALRAGGGPSTAVVGSPPETYQE
LVDKSEYLRDQPWQKTFHAAFMGGAYVGMAGLLSLVLGGNMASQFITQKAVFAALFPINL
LLVLTTGGQLFTGNSATMAIGIYEKKCTVKDLIRNWSIAYIGNICGCLLIDAVARYTGMF
TAGAAEMAVHTVMKKCSATFGQTVVKGIMCNWLVCMAVWLCTMAKDMTGKMVGVWFPISM
FIAIGFEHSVANMFILPAGLFSGAPLTWGDILIKNLIPVTIGNAIAGAFVVGAGMSFMFG
KLGKKE
NT seq
4767 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
tcgcggcccatggtgagcaccaggaaggcataaagagagccttacaaaggcattcaaaga
ccaagctaccacagagtgactagcagactagcatgcatgaccccatggaaagtgccagag
ctcctggtcgaggaaaatgccagtggcaaaggtgtgtgccaaaaggcttctgcttgttcg
gcatgctgcttgctttcccagccttcagatgcttttcagctgtgctcttggtttttaagc
ttgcaattgtgagctcggactgcgaagttccagccagatccaatcaactcttgcaaacga
atgctgcatctcacaatgtacgtcggacaagtcccatttttcactttgacgatacaaaga
tgtggggcttggacaagaacttgtcgtggcgagtctcgaagagcgattgcaagttgcaat
ttccaagcatcgaaaatgcctcaaggaaaattgaatctcgactttctttaggtgtatgtt
tgactccatggactccactgcaacgttggcgtttggatttggccttacctgccagtcatg
ggagaactcatccaggtgcaaatccttcaatgattccattgcccgagacgttgcaagaag
tttttccatttggaaaatggttcgttgtgagtcgtcctggttgggcaaggtgcccaggga
tgcaagattttgatcatggtcgtgatggcccttttctcatcaatttgtggtgttctggct
cccatgctgccgttttggatgcagaattcaatgtggaagcagtatccaagattcaattgg
aaggagttgaaggagcttggtgggacaatgccatctccgatgtacggctttggccatcag
gggatggagagattatcgtcagcttcttgccttatctttttcatgaggtttaccacactc
acatggcaaaactctatgtcagcggtgccgacggtgttctcaacgtttggatcgatccac
gtgaagtgagacgagcagagagttgtcataataaaaaagtcgccaagaagaacttgggtt
tcttccgttctggctccgatgttttcctcctggacaaggtcttccctacagctgtcagtg
ctatgaatctctcgctgttggatcgtgactcggagcttgagatcgagaattctcacacct
acatgccggaagcaaacgaaggctggaagcctgtaactttgccatccatctgcatgaaat
cagtcgtgactggcaatgaatccagtcactctccatggtatggcagagggcaagagcatg
acacatttttgcataatggtccatctccaatttggatccaagaaatgcaagtctttcttg
gaatagggcatttggcacgtggaacacgtccatctctcactctacgctttttgccagacc
actactcacatcagttctttgcaatttcagcatctcctccttttcgcttggtggctttat
cgcctgagttttgcttcagcagcgctcaagatcctggcgattgtgagaacatacaatatg
ccagcactttgcttcgagatggtgaccatttgctggttgcgtatggcgttgaagattgcg
actcttatgttcagcaattcctcctctccgacatcctacattctatggtgaatgtgcacc
agatccgcgatcgaaaaagcaacgcggagcagatcactgcggcggccgaagagcttcggg
agaagcatctcatcgaggactcagatacatatcgcttggtgctcaacaccttaacgaaaa
gatccgcctggaacgatgctttatcgatttgggacgagatgagatggattgggacggaac
tgaaagaaccagatttcgttctggccatgaaagccttctccagaggcagtcagtggcagg
ccactcttgccgtttttgcggagctcttgggtcaagaagagatgcacctcacaacaggtc
gccatagagaagatcttcgacccgactgtcgcgcctacactactgccattgatgcgtgtc
gtcgagtgggagcatggatgcaggcagtgcaggtgctggaagatatggaggaaatgatgg
tcactccagatgtggtggcgtacaacgccgtcatggcggcctgcgagaagggccggaact
acccggcggcgcggcacgtcctcgcggagttcgaccgctacgccttggatccagatatgg
tgacctacaacacattgattggtgcttgtggatggggccaagaatggaaggcagctgttg
gctacttgcgtcaaatgcaggagaagtcttactttgactacgacctcatttcctacactg
ttgcgaccacatgtggctcaaatttgtgctgccgggccgggccgggtgctctgacaatgc
ttggggatatcttcaaaagtcccgtgctgggagaattaaaaagtcccagttctgtctttg
atttccgttggtcagtgggttcattgggttcattgggttcacagacttcaccacaggttc
cagaaaaggtcgaaaagacccctggacctgtcggacctgtgatcaaagttggaccctgta
aatgttgcagtggcaatggcagtgccgcctttgatgaagatcttcttgaagctagtggcc
catcgtttcgggtttcgaatgtcaatgatgtgatgcaacactgggcagacgtcgatggtg
atttcctcaaggcgacacctacacctggctgtacatccaaagctccagattcccaaaatt
cccaaaattccaatctacattcgcatcattcgcctgcggatgattggatttctgaaatgc
taaatgacatggagcagtttggacaaaccaatggtttggaacacctgtggctgaagcggg
ccgcacgggcgcgacaaaatgagaagagcttagaaaatgtgcagttgtctcactttagtg
gcatcccctcgggacggtttcggtgctgttgggcacgcttcgtagcaagttgtcctgaag
gctgcgaacatgcagcggcaatcagtgcatgtgctaaggccacggagtgggaaactgctt
tggccttgatacatgaggagacctacaatgctgccctcagtgcatgtgcttccgcgggca
aatgcgaacatgccatgcttctgattgaacagctcctggatttcgacctttttccaaatc
tgatgacctacagatatgccattgcttcatgcgaagcaaatggagagtgggaattggctt
tggatcttatgtccgaaatgagcgaggcaaagttagaacctcgggagatgatctacagat
ccgtggcgaaggcatgccgtgcaggtggccaagccaatgtggctgaagcgatggagatga
aggcaatccctgcaaaggtatcgttccctcctgatggtgatggcgctgatggtccactgc
gtttagcagccgtcaccggcacgaaaagcgtcctcctatgctttgatatcgaggaagctt
cacttttagatggccttttgggttttgccttatgcagaatcgctttgacccaggatggcc
ccgatggggaagaggtttggatgggagatccccggcgtggaccatggggaaacgaccgcc
ttgagctctgttctcgatgtggaaacgcaccgtccgccttcgcccacgaaagacccagag
acagcatgtcgggtgttgcctttgtcgcaccagtcgcaccaagcatcagcaccgtggcaa
agcatgacttgaggggcgcccagttctctaagggaccagcattggtcagtggatactcag
aggatccatccgttcagcatgccatgacctccatggctgccatgttcgtggtggcgggtg
gcgttcgttggcgtgaacgccgcagtgcgcttcgtgctggtggtggcccttccactgccg
tagtgggctctcctcctgagacataccaagaactggtggacaagtcagagtacttgaggg
atcagccatggcaaaagacattccatgctgcattcatgggtggtgcatatgtgggtatgg
ctggcttgctgtctttggtgcttggtggcaacatggcttcccagttcatcacacaaaaag
ctgtctttgcggccttgtttcccatcaacctcctgttggtgttgaccactggtggacagc
ttttcactggaaacagtgccactatggccattggcatctatgagaagaagtgcactgtga
aggatttgattcgcaactggagcatcgcttacattggcaacatttgtggctgtttgctga
ttgatgcagtggcccgctacacaggcatgttcactgcgggtgcagctgaaatggctgtcc
acactgtgatgaagaagtgctcagcaacttttgggcagaccgtggtgaagggcatcatgt
gcaattggttggtttgcatggctgtgtggttgtgcacaatggcaaaggacatgacaggca
agatggtcggagtttggttccctatttctatgttcattgccattggctttgaacactctg
tggccaacatgttcattctcccagctggcttgttctccggcgcaccactcacttggggag
acattctgatcaagaatcttatccctgtgaccatcggcaatgccattgctggtgcttttg
tggttggcgccggtatgtccttcatgtttggcaagttgggaaagaaggagtgagtacgtt
aagcacaccaggcctagtgaaattgacatttttcctaataagactggcacgacaacaggc
tgccgtcgagacgggtggaattgccagcggataatttaaatgcttgcatggctccacccc
cagcggcgtgacactcaagacccgctt
DBGET
integrated database retrieval system
