Breviolum minutum: v1.2.039130.t2
Help
Entry
v1.2.039130.t2 CDS
T04349
Symbol
symbB.v1.2.039130.t2
Name
(OIST) -
Organism
smin
Breviolum minutum
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Alpha-amylase_C
CBM_48
DUF6566
hDGE_amylase
Motif
LinkDB
All DBs
AA seq
650 aa
AA seq
DB search
MIALQLQLLGKPLPNRVETMQMAIGMWVADMSMGPSDSYAPQWKLAHACGPEWLSAEECA
FRVWAPHGEDVTVELQCGESSVQEIRLTREGDFWIGQARCAPGDRYRIAMGSTWNDCFQQ
EGAKLFRRDPCARECDFNSAWCIVHPPVQPLPSFTAPNFNELVIYELHIGSFVSEADEKR
AFAATTEKLEHISSLGFNCIQFMPTAEFGGIWGYNSRQLLASHGPWGSAAEMRVMVEKSH
SLGMAVLFDVVLNHGSSKMNVLWNWDGFGPDNCGGIYFEGEKDTPWGKRFAFHKAEVQDY
LKQACRTWIEEYGVDGLRFDSVHNMPWWLLQSLTFELKTHYPNKILIAEITPENPAVLHD
AGFHSCWLHATHFDSIKIMKGSDGGGDPHKRIGMLKNMVAPHGFGNVGGVHSVLGSHDQI
GDRHHGKQDGHGTHRYYVSRLGGKGNWHARAQMRAWFGFQNCCKGLPMTFMGTENLQEDW
WHVDPHHRMNWGLVDGADPQTMEMRAFVTASNKLRTSCEALTRDEVKFVHEDGNNTILAF
MRWTPEMAALCIVHLGESQWENDSYGLNTSWGGGRQWKLALTSQAKEFGGWDGSSTPEAK
SDDGDGPGHCQIVGNYFHFNPVGGWKNIQSVDISKTPQSNPMWVVTAVKA
NT seq
2966 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
acgcttgaacatctctgatgccaactgggccgtcagcgacaagcaggaagcttgttccgc
acttttgccgggtgccagcggagaaggtggctggaaagattgtgagctcacgaaatcggg
acactttgtgcgggccatgttgcgaggtgaggccatgcccagccaactacctgaaccgtg
tcctgctttgacgacgcctccaccgggacaatgctccgattccactgatgactgctctga
gaccatgtgttgtaacgaactgggcgccaaatgctaccagaagaacgactactgggcttc
ttgcaaaaccagctgcacagagggtattgatccaacggatccacctgaatttgccacacc
ttggacatgcaaggtgctgtctaaggaggcatatcagctggtgaaagcataaggatgtcc
ttcctgagctgccatttgcaactaattcaatgccattcagtcaaggtaattcatagctcc
cagaacttcaaacaggggttctttcggaacaagttgccggtgggggcaacttaggcgaaa
tgttgccactccaaatctgaggaaaggtatgacaggtatggaagggtaattggcttgatg
gttgtccccccactggcggatcaagatccagtgcatatagtgatttgcacttttgggtgg
ctgctggggcgtcaggctacagttggcccatttttgaccagaaccccagccgaaagatgc
tgagtcctggtaggtgctgttaggctgatggagcacggcaaaatacattgtaaaaaatcc
gccctccatcagctttgcagattccttcaatttgaaggtgggcaatcttgagctcttgag
atctcaatgattgccctacagctgcaactgcttggaaagcccttacccaacagggtggaa
accatgcagatggctattggcatgtgggtggcagatatgagcatgggccccagtgacagc
tatgcacctcaatggaagttggctcatgcctgtggacctgaatggctgtcagcagaggaa
tgtgcatttcgtgtttgggctcctcatggtgaagatgtcacagtggaattgcagtgtggc
gaatcttcggtgcaagagatccgtttgacacgtgaaggggacttttggattggccaagca
cgttgtgcacctggagatcgctacaggattgctatgggttctacttggaatgattgcttt
caacaggagggtgccaaactctttcgtcgtgatccttgtgctcgagaatgtgatttcaac
tccgcctggtgcattgtacatccaccggtccagccattgccatccttcacagctcccaac
ttcaatgaattggtcatctacgagttgcacattggcagttttgtctctgaagctgatgag
aaacgagcttttgctgccactaccgaaaagttggaacatatctcatcattgggtttcaac
tgtattcaattcatgcccactgcagaatttggaggcatttggggctacaactcccggcag
ctgttggcctcgcatggcccatggggttcagcagccgagatgagggtcatggtggagaaa
tcgcacagtctgggcatggctgtgctgtttgatgtggtgttgaatcatggctcctccaag
atgaatgtgctatggaattgggatggatttggtcctgacaattgtggtggtatctatttt
gaaggtgaaaaagataccccttggggcaagcgttttgctttccacaaggctgaggtacag
gactatttgaagcaagcatgtcgaacctggatcgaagaatatggggttgatggtttgcgc
ttcgactcagtacataacatgccttggtggttgcttcaatcattgacttttgagctcaag
acacattaccccaacaagatcttgattgctgaaatcacccctgagaatccagcagtcctc
catgatgctggcttccactcttgttggcttcatgctactcattttgattctatcaagatt
atgaagggatctgatggtggaggtgaccctcacaagcgaattggcatgctgaagaacatg
gttgcaccacatggatttggaaatgtgggtggtgttcattcagttcttggctctcatgac
cagattggtgatcgacatcatggcaagcaggatggacatggaactcaccgttattatgtt
agccgcttgggtggcaaaggcaactggcatgctcgagcacaaatgcgtgcttggtttggc
ttccagaattgctgcaaaggtttgcccatgacattcatgggaacagagaacttgcaagaa
gattggtggcatgtggatccacatcatcgtatgaattggggtttggttgatggcgctgat
ccccagaccatggaaatgcgcgcttttgtcacggcttccaataagttgcgcaccagttgt
gaagccttaaccagagatgaggtgaagtttgtacatgaggatggcaacaataccattttg
gcctttatgcgttggactccagaaatggctgcactttgtattgtccatttaggtgaatca
caatgggaaaatgatagttatggtttgaatacctcctggggaggtggacgccaatggaaa
ttggcattgacttcacaggctaaagagtttggtggttgggatggaagtagcactcctgaa
gccaagtcggatgatggtgatggtccagggcattgtcaaattgttgggaactattttcat
ttcaatcccgtgggtggctggaagaatattcaatcagttgatatcagcaagactccgcaa
tccaatcccatgtgggttgtcaccgcagtgaaagcctgatccacagaagatgtcggctct
ccctgcaaaatctttgacttagtagattcggtagcttatggacatgcttcatgtgaagca
ggaatgaactcggcaaacctgccgtggcagctcgactgctcgtacgcagatctagcatgc
cagctgtataaatgtaggcgggtcaa
DBGET
integrated database retrieval system
