Streptomyces nodosus: CP978_08215
Help
Entry
CP978_08215 CDS
T06839
Name
(GenBank) lipopolysaccharide biosynthesis protein
Organism
snq
Streptomyces nodosus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEV38542
UniProt:
A0A0B5DFI6
LinkDB
All DBs
Position
1806054..1809674
Genome browser
AA seq
1206 aa
AA seq
DB search
MSDTTTTAQDDQAAPEVPERSRRRLRLPTGGGGGNQLFRNAYALMLNTGVSAVLGLGYWL
VAARYYSDSAVGQGSAAIAAMKLLAGLTAVTLTGALARFIPVAGRATGRLIFRTYAGSSV
VVALAAGVFLLTLDVWGPSYRFLHGPLNGLGFVVAVVAWSLLTLQDGVLTGLRSALWVPV
GNTVFSAVKLALLIGLAVAIPTTGVFVSWVAAIATSVIPLGWLVFRRLVPRHVKATEDRA
RPPSPKEIGRFLAGDYTGSLFSLAVVYLVPVIVAAQVGSADNAYFYITTTIGGTTNLLAI
NMGASLTVEGSHDPARLAANTRAALRRMARIMLPVSGLLFVGAPFILRVFGQGYADAATP
LLRWFAVGALLRVVMETYFAVLRAQSRTSGLAYLQGLLCVLVLGLTLLLLPRMGLTGAGV
AEISSLAVIVAIAAPRLYTVMRAAPADAVPEDTAPDGDLADLGPAEVPAPRSGPSWARKP
DAETLALGTRPSTGNPAAAVGMEGAEAESVTEEQAGAGAAEAVCSAAPSLRERLRPTRVG
LLLGGLLATALLLYWVPALRLDDGSLTRMGGLGLISVLPLPTLAGAALLVVVFATLLGRV
RESRGLLLVTLLATVVSLHALPAVIETEPRFPTAWQHLGFLDYIDRTGSAVPDLDARWSW
PGFFAAAAFMAKACGVTDLTEVIRWWPLTIQLLYLAPMFLLLRSLRASWRAKWTGLWIFV
LGSWVGQDYFSPQGFTYLFYLVFVAILLVWFRAPHVIWTKARPGEAEVEPAGRGQRAVLL
LVLIGLYAASVPAHQLTPFVMLGVLAVLVLVGRSELRGLPLLFAVLVAFWVGFMAEPYWS
GHFDELFGGVGGVGSNVSTSVSGRIQGGDSTHQLVLYARVLLAGTVLGLACWGWWRRREH
GYRERSLLVLTFVPFLGFGMQSYGGEMALRVFMFALPGAALLAGLALFPRTGVTEEERGK
DRTSLAPLAALLAGLLLMGGFLVARWGNEPFERIRPGEVAAMDFVYAHDDPTVQLLWLSS
DPVENVTPAMPWGARDMEKVQYVPTLAPVDPVLVSGLVTSLQDAGPNSYLMINASQVTYL
RMDVGYSATWESRLIRHLDEHQELEKVLVNDDVTLYALRAQPTGRVAGPDPGPIGPRVTW
TPWSVVGGLSAVALVLLLTAREVVRVAMRPSVRQLRLLQSGLWFSLPLMAVLLASLVQRF
LTLGNG
NT seq
3621 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtctgacacgacgaccacagcccaggacgaccaggccgcacccgaggtaccagagcgg
tcccgccgccgtctgcgcctgcccaccggcgggggcggcggcaaccagctgttccgcaac
gcctatgcgctgatgctgaacaccggtgtctccgcggtgctcggcctcggctactggctg
gtggccgcccggtactactccgactccgcggtcggccagggctcggccgcgatcgccgcg
atgaagctcctcgccgggctcaccgcggtgacgctgaccggcgccctggcccgcttcatc
ccggtcgcgggccgggccaccggccggctgatcttccgtacgtacgcgggcagttcggtg
gtggtggcgctcgcggcgggcgtcttcctgctgaccctggacgtctgggggccctcgtac
cgctttctgcacgggcccctcaacgggctcgggttcgtcgtggccgtcgtcgcctggagt
ctgctcaccctccaggacggggtgctgaccgggctgcgcagcgcactgtgggtgccggtg
ggcaacacggtgttctcggcggtgaagctggcactgctcatcgggctcgccgtggccatc
ccgacgaccggtgtcttcgtctcctgggtcgcggccatcgccacctccgtgataccgctc
ggctggctggtgttccggcgcctggtgccccggcacgtcaaggcgaccgaggaccgcgcc
agacccccgtcgcccaaggagatcgggcggttcctggccggcgactacaccggctcgctg
ttctcgctcgccgtggtctatctcgtcccggtgatcgtggccgcgcaggtgggctccgcg
gacaacgcgtacttctacatcaccaccaccatcggcggcacgaccaatctgctcgccatc
aacatgggcgcctcgctcaccgtcgagggctcccacgatccggcgcggctcgccgccaac
acccgggccgcgctccgacgcatggcccggatcatgctgccggtgagcgggctgctgttc
gtcggcgcgcccttcatcctgagggtgttcggccagggatacgccgacgcggcgaccccg
ctgctgcgctggttcgcggtcggcgcgctgctgagggtggtcatggagacctacttcgcg
gtgctgcgggcgcagagccgcacctcgggactcgcctatctccagggtctgctctgcgtt
ctggtgctcggactcaccctgctgctgctcccccgcatggggctgaccggagcgggggtc
gcggagatctccagcctcgcggtgatcgtggcgatcgccgctccccggctgtacaccgtg
atgcgcgccgccccggcggacgccgtgcccgaggacaccgcaccggacggggacctcgcc
gacctggggccggccgaggtgccggcgccgaggagcggcccgtcctgggcgaggaagccc
gacgccgagacactcgcgctcggcacccgcccgagcacgggaaacccggcggcagcggtc
ggcatggagggcgcggaggcggagagcgtcacggaggagcaggccggggcgggcgcggca
gaggcggtgtgttccgccgcaccctccctgcgggagcggctgcggcccacgcgcgtcggg
ctgctgctcggcggtctgctggccaccgcgctgctgttgtactgggtgcccgcgctgagg
ctcgacgacggctccctcacccggatgggcggactgggcctgatctcggtgcttccgctg
ccgaccctggcgggggcggcactgctggtcgtggtcttcgcgacgctgctggggcgggtc
cgggagtcccgggggctgctgctggtcaccctgctggccaccgtcgtctccctgcatgcg
ctgcccgcggtgatcgagaccgaaccgcggttccccacggcctggcagcacctcggcttc
ctggactacatcgaccgcaccgggtcggccgtacccgacctggacgcccgctggagctgg
ccgggcttcttcgcggcggccgcgttcatggcgaaggcctgtggggtcaccgatctcacc
gaggtcatccgctggtggccgctgaccatccaactcctctatctggcaccgatgttcctg
ctgctgcgatcgctgcgggcgagctggcgcgccaagtggaccgggctatggatcttcgtc
ctcgggagctgggtcggccaggactacttctccccgcagggcttcacttatctcttctat
ctggtgttcgtggcgatcctgctggtctggttccgggcgccccatgtcatctggacgaag
gcgcgccccggcgaggccgaggtggagccggccgggcgcggtcagcgggccgtgctgctg
ctggtgctgatcggcctgtatgcggcgagcgtgcccgcccatcagctcaccccgttcgtg
atgctgggtgtgctcgcggtgctcgtgctggtgggccgctccgaactgcgcgggctgccg
ctgctgttcgcggtgctggtcgcgttctgggtcggtttcatggccgagccgtactggtcc
gggcacttcgacgagctcttcggcggggtcggcggcgtcggcagcaatgtgtcgacctcc
gtctccggccgcatccagggcggcgactccacgcaccagctggtgctctacgcacgggtg
ctgctcgccggcacggtgctgggcctggcctgctggggctggtggcggcggcgcgagcac
ggataccgcgagcggtcgctgctcgtgctcaccttcgtgccgttcctgggcttcggcatg
cagtcgtacggcggtgagatggccctgcgggtcttcatgttcgccctgccgggcgcggcg
ctgctggccggactcgctctcttcccccgtaccggggtgacggaggaggagcgcggcaag
gaccggacgagcctcgccccgctcgcggcgctgctggcgggcctgctgctgatgggcggc
tttctggtggcccgctggggcaatgagcccttcgagcggatccgccccggcgaggtggcc
gccatggacttcgtgtacgcccatgacgacccgaccgtacagctgctgtggctgagcagc
gaccccgtcgagaacgtcactccggcgatgccgtggggcgccagggacatggagaaggtc
cagtacgtaccgacgctcgcccccgtcgatccggtgctggtgtcggggctggtcacctcg
ctccaggacgcgggcccgaactcgtatctgatgatcaatgcgagtcaggtgacctatctc
cggatggacgtcggctactcggcgacctgggagtcacggctgatcaggcatctggacgaa
catcaggagctggagaaggtcctggtcaacgacgatgtgacgctgtatgcgctgcgcgcg
cagcccaccggacgggtggccggacctgatccggggccgatcggcccccgggtgacctgg
acgccgtggtcggtcgtcggcgggctctccgcggtggccctggtgctgttgctcacggcg
cgtgaggtggtgcgggtcgcgatgcggccgagcgtgcgtcagctgcggttgcttcagtcc
ggcctctggttctccctgccgctgatggcggtgctgctggcctcgctggtgcaacggttc
ctgacgctgggcaacggctga
DBGET
integrated database retrieval system
