Solenopsis invicta (red fire ant): 105194836
Help
Entry
105194836 CDS
T03916
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC105194836
Organism
soc
Solenopsis invicta (red fire ant)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Trypsin
Sushi
Ldl_recept_a
DUF6625
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105194836
NCBI-ProteinID:
XP_039314707
LinkDB
All DBs
Position
16:19374264..19387045
Genome browser
AA seq
1170 aa
AA seq
DB search
MRIILRISTLLIIYACIDGDLLCNGAANCTDRSDEDSKLYSRIGWPLSLQTVRPPTETIR
PSPVQTPRRIRSPVTPAPNTCKVPSQPQNGQWKLHPDQCSSEQECNVAQKTELGLGSLLV
YSCFSGFKIRGLPYVSCIIGGKWINIPDCIPDIRCKPLSTASVDATCTYDGEWVSCESPV
QPRTTAVLQCRNSYRPETNPLSEQRNNVRCNENGQWEPEPMRCIPVCGTIPPDIVPLIMG
GNRPNITEFPWHASLYRNVNEQKQFFCGATIIQENLLITAAHCVYDESTRKLIQAKSIYV
LTGNIFRDYDHPAHDQRIVKKNQVKRIYIIRNYLGLIGNYIWDIAILELTRPFVLSTWLV
PVCIDTLNSNNRNVLEVDSYGKVAGFGRTTHGGSSAVLQALTVPMIPLSQCRFTSQQFET
EQLITVDKFCAGYTNGSSVCDGDSGGGLVFKTNSLWYLGGIVSVSLGTFRESDGSIRCGN
SYSLFTKVSSHISWIEDVVSKIERNQIQMLCSSESQTKCSYFDNKYSLLYELGFFYQYLV
GIWTVEKAETIYFMPGKGKRFGGEDIREFSINMNMNYFSVQTKDAYGGECDDVDYASLTP
AEPEEQCGWTAVNARTTIYKEARIAVSKTLRTVCFNMRIVRQISTLLIIYGVCIDGLLCI
GATNCTDRSDENSKLCSRIGWPSFLKLIRPPMETIRPPPVQISRRIRSPVTSASNTCKVP
PQPQNGQWKLHPDQCSGEQECNVAQKTELGLGSLLVYSCYSGFKIRGSVHVTCIIGGKWI
NIPDCEPDVRCKPLSTESVDATCTYDDEWVSCGSSVRPETKATLKCRNGYRPETNSLSRQ
RNNVRCNVNGQWEPEPMRCISVCGTIPPDIVPLIVGGNRPNITEFPWHASLYRNVDEQKQ
YFCGATIIQENLLITAATCVYNEETRKPVQAKSIYVLTGNIFRDYDSPLHDPRLVHKNQV
KRIYIRRSYLGLVGNYLWDIAILELVRPFVLSTWLVPICIDILNDRDNVLEVGSLGKLAG
FGRTAHGESSALLQALTVPVISLSQCRSASQNANTEQFITIDKFCAGYTNGSGVCDGDSG
GGLVFKTNSLWYLRGIVSVSLGTIQEGGNAYCDYNLYSLYTKVSSHISWIQDVITKIEEN
QIQILCSSESETKCSYFDNKYSLLYELGFF
NT seq
3513 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcggattattctacgaatttctacactactaataatttatgcctgtatcgatggtgat
ctactgtgtaacggagcagctaattgcactgacagatcggatgaagattcgaaattatac
agcagaattggatggccattatctctacaaacggtacgaccaccaacggaaacgatacga
ccgtcaccagtacagactcctagacgaatacgatctcctgtgacgcctgcacccaacact
tgcaaagtaccttcgcaaccacaaaatggtcaatggaagttacatccagaccaatgctca
agtgaacaggaatgtaacgtcgcacaaaaaacggaattgggattaggatctcttctcgtc
tactcttgtttttcaggatttaaaataagaggtttgccctacgtgagctgcattattggg
ggaaaatggattaatataccagattgcataccagatatacgctgtaaacctttaagtaca
gcatctgttgacgctacatgtacgtatgatggtgaatgggtttcatgtgaatctcctgta
caaccgagaacaacagcggtattgcaatgccgaaatagttatcggccagaaacaaatcca
ctttccgaacaaagaaataacgtgagatgtaatgaaaatggtcaatgggaaccggaacct
atgcgatgcatcccagtctgcggcactattcctcctgatattgtaccactcattatgggt
ggtaatcgaccaaatatcacggaatttccatggcatgcctcactataccgcaatgtaaac
gagcaaaagcaatttttttgtggagcgactattattcaagaaaatctcttgataacggca
gcacattgtgtatatgatgagagcactaggaaactaattcaagccaagtcaatttatgta
ttaacggggaatatctttcgtgattacgatcatcccgcacacgatcaaagaattgttaaa
aagaatcaggtgaaacgtatttacatcatacgcaattatttaggacttataggaaattat
atttgggatattgcgatattagaactcaccaggccgttcgtattgtcaacttggttggtt
cctgtatgcatagatactttaaacagtaacaacaggaatgtattggaagtcgattcttat
ggaaaggtagcaggatttggtagaaccacgcacggtgggtctagcgcggtcttacaggct
ctgacagtgcccatgattccacttagccaatgcaggttcacgagtcaacaatttgaaacg
gaacaacttatcaccgttgacaaattttgtgcaggctacacgaatggttctagtgtttgt
gatggtgatagtggcggtggattagtttttaaaaccaatagtttgtggtacctcggtggt
attgttagcgtttctctcggcacatttcgagagagtgacggaagtattcgttgtgggaat
tcatattccttatttacaaaagtgtccagccatatttcatggatagaagatgttgtttca
aaaatagaacgaaatcaaatccaaatgttatgctcatctgagtctcaaactaaatgctcg
tattttgataataagtattcccttttatatgaactcgggttcttttaccagtatctggtt
ggaatctggacggtggagaaagcggaaactatatactttatgccaggaaagggcaaaaga
tttggcggggaagatatcagagagttttcaataaacatgaatatgaattatttttctgtg
caaaccaaggatgcatatggaggtgaatgcgatgatgttgattatgcatctcttacacca
gcagaaccggaagaacaatgtggatggaccgcagtgaatgctcgaacaacgatatataag
gaagcgcggattgcagttagtaaaactttacgtacggtgtgttttaacatgcggattgtt
cgacaaatttccacgctactaataatttatggagtctgtatcgatggcctactatgtatc
ggagcaactaattgtaccgatagatcggatgaaaattcgaaattatgcagcagaattgga
tggccatcatttctaaagttgattcgaccaccaatggaaacgatacgaccgccaccagta
cagatttctagacgaatacgatctcctgtgacgtctgcatctaatacttgtaaagtacct
ccgcaaccgcaaaatggtcaatggaagttacatccagaccaatgctcaggtgaacaggaa
tgtaacgtcgcacaaaaaacggaattgggattaggatctcttctcgtctactcttgttat
tcgggatttaaaataagaggttcagtccatgtgacttgcattattggaggaaaatggatt
aatataccagattgcgaaccagatgtacgctgtaaacctttaagtacagaatctgttgac
gctacatgtacgtatgatgatgaatgggtttcatgcggatcttctgtacgaccggaaaca
aaagcgacattaaaatgtcgaaatggttatcggcctgaaactaattcactttccagacaa
agaaacaatgtgagatgtaatgtaaacggtcaatgggaaccggaacctatgcgatgcatt
tcagtatgtggcactattcctcctgatattgtaccgctcattgtgggtggtaatcgacca
aatatcacggaatttccgtggcatgcctcactataccgcaatgtagacgagcaaaagcaa
tatttttgtggggcgactattattcaagagaatctcttgataacggcggctacttgtgta
tataatgaggaaactaggaaaccagttcaagccaagtcaatttatgtattaacgggaaac
atctttcgcgattacgatagtcccttgcacgatccaagactcgttcacaagaatcaggtg
aaacgtatttacatcagacgcagttatctaggacttgtaggaaattatctttgggatatt
gcgatattagaacttgtcaggccgttcgtattgtcaacttggttggttcctatatgcata
gatattttaaacgatagggataatgtattggaggtcggttctctgggaaaattagcggga
tttggtagaaccgcacacggtgaatctagcgcgctcctacaggctctgacagtgcccgtg
atttcacttagccaatgcaggtccgcaagccaaaatgctaatacggaacaatttatcacc
attgataagttttgcgcaggctacacaaatggttctggtgtttgtgatggtgatagtggt
ggtggattagtttttaaaaccaatagtttgtggtacctccgtggtattgttagtgtttcg
ctcggcacgatacaagagggtggaaatgcttattgcgactataacttgtattctttatac
acaaaagtatccagccatatttcgtggatacaagatgtcattacaaaaatagaagaaaat
caaatccaaatcttatgctcatctgagtctgaaactaaatgctcgtattttgataataag
tattcccttttatatgaactcgggttcttttag
DBGET
integrated database retrieval system
