Stylophora pistillata (Smooth Cauliflower Coral): 111330543
Help
Entry
111330543 CDS
T05774
Name
(RefSeq) fibropellin-1-like
Organism
spis
Stylophora pistillata (Smooth Cauliflower Coral)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_CA
EGF_3
EGF_2
DL-JAG_EGF-like
EGF_MSP1_1
cEGF
JAG1-like_EGF2
EphA2_TM
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
111330543
NCBI-ProteinID:
XP_022791147
EnsemblRapid:
LOC111330543
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
1251 aa
AA seq
DB search
MGHFLFYRERITSRIITTTVLLWSGFLKGYDSTCLPTSCLNGGTCVITASGQQVCHCAAG
FTGSSCSVDTNECAAHPCRNNGTCIDQMNSFRCQCRKGFTGIICETNIDDCQGNPCKNGA
TCQDLVSAFRCHCQPGFAGRFCETDIDDCVGLPCLHSSTCIDGVNGFSCTCLPGYTGVFC
EVNYNECGSNPCQNGGICADGVNDYLCVCKTGFSGKNCDRDIDDCEQAPCKNGGSCHDQV
NDFQCDCAVGFKGATCEVNIDDCLSTPCDNNATCVDLVIGFSCNCMSGFTGPKCEIDIDE
CRDHKCMHNSACVDGINSYRCICKPGYAGQFCEVDIDDCVLQPCKNQGICVDSVDDFRCV
CQTGFTGKDCAVNIDDCANSPCHYNATCVDLVSDYNCTCPSGYTGKNCHVIVNNCANLPC
LNGGTCINSHDGQGYDCICRNGFTDATCVLNIDDCSPNPCQSGDCIDLVDNFKCNCSGGI
TGRTCAGSVDACSAFFCRNGGTCMSFNSSHNCVCPEGITGTYCEVDINHCQSHICQNNAT
CVDGVKNFTCLCAKGYAGQYCEIDFDDCKVDPCSNGGTCVDLVNDFKCICAPGFQGHTCT
VDINECYSFPCYHDGLCTDLVNGFNCTCKLGFTGKKCEKNIDDCASDSCLNGGYCFDGIN
KFQCFCSPGFWGNNCEINIDDCARQPCKNSGNCTDFVNSFECMCSPGYTGKQCDVDIDDC
VNQQCRHGGSCIDLVNGFTCNCPLGYTGVHCETDIDECQSQPCVNGTCLDEVGGYKCVCQ
GGFTGDNCEVNVDDCAGSPCHNGGKCFDMVDDFLCVCPLGFKGKTCRVNIDDCLFEPCQH
NGSRCVDGVNSFSCVCAAGYTGVNCSVEVDQCAVSPCQNNGTCSNEISEFTCWCPSGFKG
RNCEVKETDNCASFICLNDGRCRQTGNGSECICPGGYHGNHCEIKNDRCQSSSCVNGATC
VDNGKGLFCKCAVGYVGKRCEKAFDHCIVRVADSNMTFPSNICGPHGACVSHRSGFTCMC
YQGYSGLLCQHEIDECLSNPCGKNMNCIDGIDSFTCHLVAEVDNAAFSGSPTKSSYAIPV
VVAAVVLVLLAVFGLFIFKLRAYRRRNGRMKLKDHHADTLPHPYIEEKTFENPIYQPSDE
VISVERRDDIDSLNALRIQIDRELLDLSFLSDAESMGQRELTKSSSAPDLRNFHVTVADM
ETSSVCSVDDLSHGSLGTECFLGANTSARENRNGFVPADVKRSKEWLDTCL
NT seq
3756 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggtcatttcctattctacagagaaaggataacttctaggataatcaccaccactgtt
ttattatggagtggctttctcaagggttatgatagtacctgtttacccacctcatgtctg
aatggaggtacctgtgttataactgccagtggacagcaggtgtgtcattgtgcagcagga
tttacaggaagtagctgctcagttgacacaaatgaatgtgctgcacatccatgtcgtaac
aatgggacctgtattgatcagatgaactcatttagatgtcaatgccgtaagggatttact
ggaattatttgtgagacaaatattgatgactgtcaaggcaatccgtgcaagaatggggca
acatgccaagatcttgtttctgcttttcgctgtcactgtcagcctggatttgcgggaagg
ttctgtgagactgacattgatgactgtgttggcttaccttgccttcacagtagcacctgt
attgatggggtaaatgggttttcctgtacatgcttgccaggatacacaggagtcttttgt
gaagtaaactacaatgaatgtggtagtaatccttgccagaatggaggaatatgtgcagat
ggggtgaatgattatctttgtgtgtgtaagactggtttctcaggaaaaaattgtgatagg
gacatagatgattgtgagcaagcgccctgcaagaatgggggatcctgtcatgatcaggtg
aatgattttcagtgtgactgtgcagtgggcttcaaaggagcaacctgtgaagtgaacatt
gacgactgcttatccacaccatgtgacaataatgctacctgtgttgacttagtcattggg
ttttcttgcaattgcatgagtgggttcactggtccaaagtgtgagatagatattgatgaa
tgcagagaccataagtgtatgcacaactcagcttgtgttgatggaataaactcatacagg
tgcatctgtaagcctggctacgcaggacagttctgtgaagttgacattgatgactgtgtt
ctgcagccatgtaagaatcaaggcatatgtgtggactcagtggatgactttagatgtgta
tgtcagactgggtttacaggaaaggattgtgcggttaacattgatgactgtgcgaatagt
ccttgtcattacaatgccacatgtgtagatcttgtcagcgattacaactgcacttgtcca
tcaggctatactggtaaaaactgtcatgtgattgttaataattgtgctaatttgccttgt
ttgaatggtggaacatgcattaacagccatgatggacaaggatatgactgcatttgtcgc
aacggatttacagatgcaacttgtgtattaaatattgatgactgctctcctaatccttgt
cagagtggagattgcattgatttggtagacaattttaagtgtaactgttctggaggcatc
acaggaagaacttgtgctggttcagttgatgcatgcagtgcatttttctgtcgcaatggg
ggtacttgcatgtcttttaattcttcacataattgtgtttgtccagaaggtatcactggc
acatattgtgaagttgatatcaaccactgtcaatcacacatttgtcaaaacaatgccact
tgtgtagatggtgtcaaaaattttacttgtctctgtgctaagggatatgctggtcaatac
tgtgaaatagattttgatgattgtaaagttgatccatgcagcaatggaggaacttgcgtg
gatttggttaatgactttaagtgcatttgtgccccaggtttccaagggcacacatgcact
gtagacatcaatgagtgttattcatttccttgttaccatgatgggttatgcactgatttg
gttaatggctttaattgtacctgcaaactaggttttactggaaagaagtgtgagaaaaat
attgatgactgtgccagcgacagctgtttaaatggagggtactgttttgatggtatcaac
aagtttcaatgtttttgcagtccaggcttttggggcaacaactgtgaaataaacattgat
gattgtgccaggcagccatgtaaaaactcgggcaactgtactgattttgtgaatagcttc
gaatgcatgtgttcaccaggttacacaggcaaacagtgtgatgtagacattgacgactgt
gtcaatcaacagtgtcgccatggaggctcatgcatcgacttggtgaatggttttacctgt
aactgtcccctggggtatacaggtgtccactgcgagactgacatagatgagtgtcagtca
cagccatgtgtcaatggaacgtgcttagacgaagttggtggttataaatgtgtctgtcaa
ggtggcttcactggagacaattgtgaagttaatgtagatgattgtgccggttccccttgt
cataatggaggcaaatgttttgacatggtagacgactttctctgtgtatgccctcttggg
tttaaagggaaaacttgtagagtgaatattgatgattgcttgtttgagccttgtcaacac
aatggaagcagatgtgtggatggcgtgaacagttttagttgtgtgtgtgctgctggctat
acaggtgtgaactgttctgtagaggtggatcagtgtgcagtgtcaccctgccagaataat
ggaacttgctctaatgagatatctgaattcacttgctggtgtccatcaggcttcaaaggt
cgcaattgtgaagtaaaagaaacagataactgtgcgagctttatttgcttaaacgatggg
agatgccgtcaaactggaaatggtagtgagtgcatatgccccggagggtaccatggcaac
cactgcgaaattaagaacgacaggtgccaatcatcttcttgtgtcaatggtgccacttgc
gttgacaatggaaagggcctgttctgcaaatgtgctgtgggttatgttggaaaaagatgt
gagaaagcttttgaccactgtattgttcgagtggctgatagtaacatgacgtttccatcc
aacatatgtgggccacacggagcatgcgtgagtcatcgctctggttttacgtgcatgtgt
tatcagggatactcaggacttctttgtcagcacgaaatagatgaatgtttgtcaaatcct
tgtggaaaaaacatgaactgtatcgacggaattgactctttcacttgtcaccttgtggct
gaagttgacaatgcagcattctcaggttccccgaccaagtcgtcttatgcaattccagtt
gtcgtggcagcagtcgtattggtgttgcttgctgtctttggtttgtttatatttaaactg
agggcttacagacggagaaacgggcgaatgaaactgaaagaccaccatgcagatacactg
cctcatccctacattgaggagaagactttcgagaaccctatataccaacccagtgatgag
gtaatttctgtggaacgccgtgacgatattgactctctaaacgctctcagaattcaaatt
gaccgagagcttctcgacctctccttcttgagcgacgctgaaagcatgggtcaaagagaa
cttacgaaaagttcttcggcaccagatctccgaaactttcacgtgaccgtcgcagatatg
gagactagcagtgtgtgctcagttgatgatctatcccacggatccttgggaacagagtgt
tttctcggggcaaacacaagcgcccgtgaaaatcgaaacggatttgttcccgccgacgtg
aagcgatccaaagaatggcttgatacttgcctttaa
DBGET
integrated database retrieval system