Shewanella psychrophila: Sps_01189
Help
Entry
Sps_01189 CDS
T05063
Name
(GenBank) signal transduction histidine kinase
Organism
spsw
Shewanella psychrophila
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HATPase_c
HK_sensor
HisKA
HAMP
HATPase_c_3
HATPase_c_2
PGP_phosphatase
LOH1CR12
Exonuc_VII_L
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AQS36360
UniProt:
A0A1S6HLH2
LinkDB
All DBs
Position
1310079..1311518
Genome browser
AA seq
479 aa
AA seq
DB search
MFINKTGLFSSLQLKLFSYFAFSLLAILLIATGIERVVINRLLTLPQSTQAQINDLALQA
TDLVNKGELASLTRWENNQEFRVYVLDKDLTSITKSALHPHFIFKLQYMRQLHLPMGNSV
RKPLIGIPLPNAHFSNGPLTLVVQLKPELHPAQKLTQSLWIIRVLVGISVLLVFTSILTR
YLITPLKHLKMGTQALASGRLDTRIAQHFSVNEPEFYHLATEFDHMAEQVQQSMQNQKRL
LRDVSHELRTPLARQELALHLLAKQASPEQSKFVKRLGQENQQMASLITSILDYSRLNNA
YVELTYALVSLKDIRSRVLSDIQFEAKDGQTITWTELGRDLSIMTDASFLIRAIDNVLRN
ALKYAGEHCNVVINSHVCDGKLVIDIQDDGPGIPESELDNLFNPFTRMDEARHSSQGGYG
LGLAIVKQSLKLLGGEVNATNQYRGGLCISFNLPLNLMETAKAECLHAMKQQNYEVSTS
NT seq
1440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttcataaataaaaccgggctattttcaagcctgcaacttaagctattcagttacttt
gccttttcattattggctattttacttatcgctacagggattgaaagggtggtgatcaac
cgattactgactctgcctcaatccactcaggcgcaaattaacgacttggcattacaagca
accgacttagtcaacaagggggagctggcatcattgacaagatgggaaaataatcaggaa
tttcgtgtttatgtgctagacaaagaccttacttctatcaccaaatcagcattgcatcca
catttcatctttaaattacaatatatgcgtcaactccatctccctatgggtaacagtgtc
agaaaaccgttaatcggtatcccactgcctaatgcacactttagcaatggtcccttaacg
ttagtggtgcaactaaaacccgaactccatccggctcaaaaactcacccaaagtttgtgg
attattcgtgttctggtgggaatatcggtattactggtatttacttccattttaacccgt
tacttaattacgccccttaaacatttaaaaatgggcactcaagctctggcaagtggcaga
ttagacactagaatcgcacaacatttctcagttaacgagccggagttttatcacctcgct
acagagttcgaccatatggcagagcaagtacagcagtcgatgcaaaaccaaaagcgttta
ttgagagatgtgtcccatgaactgagaacccccttagccagacaggaactcgcactacac
ctcttggcgaagcaagcgagtcctgagcagagtaagtttgtaaaacgtttaggacaagaa
aatcaacaaatggcgtccctaatcactagcatcttagattacagtcgactcaataatgcc
tatgtggagttaacttacgctttggtttccttaaaggatattcgttcgagagtcttgtca
gatatccagtttgaagctaaagatggtcagaccatcacttggacggagttaggccgtgac
ttgagtatcatgactgacgccagttttcttattcgcgccatcgataatgtactgagaaat
gcgctcaaatatgcaggtgaacactgtaacgtagtcattaactcacatgtctgcgacggc
aagttggttatcgatatacaagatgacggtcccgggatcccagaaagtgaattagataac
cttttcaacccctttaccagaatggatgaagccagacactctagtcaggggggatacggt
ctggggctcgcgatagtgaaacagagccttaaactgctggggggggaagtgaatgccaca
aaccaatatagagggggtctatgtatcagctttaacttgcccttaaatctcatggagaca
gcaaaagccgaatgtctccatgccatgaagcagcaaaactatgaggtatcaaccagctga
DBGET
integrated database retrieval system
