Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin): 105436743
Help
Entry
105436743 CDS
T01019
Name
(RefSeq) neurogenic locus notch homolog protein 1-like
Organism
spu
Strongylocentrotus purpuratus (purple sea urchin)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF
hEGF
EGF_2
EGF_CA
CUB
DL-JAG_EGF-like
EGF_3
cEGF
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
105436743
NCBI-ProteinID:
XP_030855040
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
2048 aa
AA seq
DB search
MAEMRLILVIFCFLVPLVVSQDCTPTTCENGGTCVPRPSGGVPMCLCTFSYHGETCGELY
DLGANCGEDFFNETRGDLLSPDHPDQYPSRRACYYFVYFPGAQKIRLVYNVIDIEPQKDD
IYIGGGPTASIDEATSLASYNGLYGTIVNPLPPPLDVSNDIVWISFITDKNDPNGPFAGF
NITFMVDGNECVLNSNPCPAGFSCVDLDFDYACQEIDECMSDPCINGGSCTDLVNAYSCS
CPSSYAGDRCEILINPCISGPCVAANTRNCVNDVTSYQCVCVPGYNGVMCQNEINECTSD
PCRNGGTCTDLINSYRCTCVAGYTGPLCRTDINDCSPNPCANGGFCTDMVNSYTCQCAAG
FEGTDCTTNINECVSNPCQNGAVCTDLVNGFQCTCLPGYTGTTCAENIDECESSPCQNAG
TCIDRVNGFDCDCPAGFAGVLCGININECDPDPCVFGQCTDLINMYMCTCDPGYTGTNCN
ININECTPDPCVNGDCTDLVNGYTCACNPGYTGRNCELDINECQSSPCVNGGFCVNQENM
YQCNCLDGFDGVNCGNNIDECASGPCLNGATCVDQINGYICNCATGFQGLTCGENVDDCQ
TDSCSLQGDCVDQLNGFTCNCYPGWTGGFCRISVDDCNPQPCLNGGNCVDGHQSFTCNCQ
PGYSGTLCEIDNNECASTPCRNNGACTDAINSYTCTCPAGWTGVICQTNIDECGSSPCRN
VGNCIDEVNGFRCSCAAGWTGVVCNEDIDECLSSPCLNGATCRNEQNMFTCVCAAGFTGI
TCATDIDECVSSPCGANGICNNGKNLYTCTCFPGYTGLTCNTEIDLCQNNPCSNMATCNN
FRVYYTCDCAAGFEGPNCNIDTDDCIGQPCNNGGVCSDQVNDYMCTCTAGWTGRNCEINI
DECASGPCLNQGICRDKVNGYECICTSAFSGVICEIPVDPCSSSPCQNGGNCNDFDTYFT
CDCLRGFADFDCGININECASGPCRNGAPCDDLIADYQCNCLPGYRGKDCGENINECLTA
PCLNGGQCIDGVNSYVCRCRSGFTGTNCATNIDECASNPCENGGVCRDQIDKYVCDCPVE
WTGLRCRISARPCGSSPCQNEGTCVDGEAGFSCICVQGWTGDICTLDVNECQSSPCQNGG
TCVNEAEVNQFTCICTSAWMGNKCTEPVNECLSGPCQNGGTCFDQVDSYTCACPPAWTGT
HCQQEVLFCISNPCKNGGACTDDTNGYLCTCSGGYTGDRCELEIDECLTTANPCNSNGGC
LDMVNSFVCMCYSGWTGERCQIDIDECESDPCQNGGACINLENSFQCVCVTGFIGVFCEI
NNDDCAPTNPCLNGGVCTDLINAFTCQCAAGFEGPTCATNINDCISPNPCQNGGVCQDGV
NDFTCLCLSGYTGRLCAIVIDLCETNPCLNGGVCNSEINAFSCTCQPGYRGTLCGEDIDE
CASNPCRNGGICTDGVNMYSCFCTTGWTGPQCAIAGPCSRNFTLTASNPTIDITSTNYPA
NYPNNEECIWFVSGPDGKHIYVEVINFNTELLYDLVTIGNLLNINDLGSATISTSGNLEQ
TGTERPPAFLSTGEIVWARFVSDGSKTEDGFTIRFSTRDDADVTDECQAMDECICQNGGT
CINSLEFCTCQCTRYFTGTNCETEIEINLCASNPCPAETHCESGDGAFICLCPSDFEDES
CVIKVIDEEEPCDSSPCANGGTCLESGSGYTCECTPEWTGDYCNIDVDECSSSPCFNGGT
CVNGFGAFECRCCDSLFSGDRCEIVLADSVCDAEPCFNGGVCIRDDQDTSGQYICQCRPG
YIGANCEEDIDECASNPCLNGYACEDLVNGFVCNCDVSMGITCRGSNCLPLPCQNGGTCR
EVLVLGDFECQCPEGWTGKTCSLVDGTVCSANEINNCENGATCIKQNGNTQCVCAPEYTG
RTCTEAIVTEMCSDRTCTNGRCSNGECICDAGYEGMYCERDTDDCLSNPCENGGTCYDRL
NFVRCDCQSGFTGDLCRQQFVTSAPLTSAGELEQQWIVVFAVAGTLAFILLVLLIIGCVY
FSGKDEKN
NT seq
6147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggctgagatgagattgattttagtgattttctgctttctggtgccattggttgtttca
caagattgtacgccaactacttgtgaaaatggagggacttgtgtaccaagaccatctggg
ggcgttccgatgtgcttatgcacttttagttatcacggcgaaacctgtggtgaactatat
gatctaggagcaaactgcggtgaggattttttcaacgagactagaggagatcttctctca
ccagaccacccggatcagtatccatcacggcgagcctgttattattttgtctactttcct
ggagcccagaagatccgccttgtttacaacgttatagatatcgaaccacagaaggacgat
atttacataggaggtggcccaaccgctagtatcgacgaagcgacatctttggcgtcttac
aatggcttgtacggcaccatcgttaatcctcttcctcctcctctggatgtttcaaatgat
atcgtgtggatttcgttcattaccgacaaaaatgatcctaatgggccttttgctggattc
aatatcaccttcatggttgatggtaatgaatgtgtgcttaacagcaatccctgtccagct
ggcttttcatgtgtggatttggatttcgattatgcttgccaagaaatcgacgaatgtatg
agtgatccctgtataaatggtggctcttgcacagatcttgttaacgcctacagttgtagt
tgtccttcaagctacgccggtgaccgatgtgaaatactgattaatccttgtatcagcggg
ccttgtgttgctgccaatacacggaattgtgttaacgacgttacatcataccagtgcgtt
tgtgtccctggttataacggtgtcatgtgtcaaaacgaaatcaacgaatgcacttccgat
ccatgcaggaatggtggcacttgcactgatctcatcaattcgtatagatgtacatgtgtt
gctggatacaccgggccgctctgtcgaacagatatcaacgactgtagtcccaatccgtgt
gccaacggtgggttttgtacggatatggtcaatagctacacctgccaatgtgctgccgga
tttgagggaacagactgtacaacaaatatcaatgaatgcgtctcaaacccctgtcaaaat
ggagcagtctgtacggatttagtcaatggatttcaatgtacctgtctccctggatatacc
ggaaccacgtgcgctgaaaatattgacgagtgtgagagctcaccttgtcaaaatgcgggc
acctgtattgatcgtgtaaacggcttcgattgtgactgcccggctggatttgcaggggtc
ttgtgcggaataaatatcaacgaatgcgatccggatccttgtgtttttggacagtgcacg
gaccttattaacatgtacatgtgtacatgtgatccagggtatactggtactaactgcaac
attaatatcaacgagtgcacgccagatccttgcgtaaatggtgactgcacagatttagtc
aatggatacacatgtgcatgcaacccgggttatacaggacgtaattgtgaattagatatc
aacgaatgtcagtcgagtccatgtgtaaatggcgggttttgtgtgaaccaggagaacatg
tatcaatgtaactgcttagatggttttgatggtgtcaactgtgggaataatattgatgaa
tgtgcgagtggaccttgcttgaatggagccacctgcgtggatcaaatcaacgggtacatc
tgtaattgcgctacaggattccagggactgacttgcggagagaatgttgacgactgtcag
accgatagttgcagcttgcaaggtgactgtgttgaccagctcaacggatttacatgtaac
tgctatcctggttggactggaggcttctgcagaatatccgtcgatgattgtaacccgcag
ccgtgcttgaatggagggaattgtgtagatggacatcaatcattcacatgtaactgccaa
cccggctacagtggaaccctttgtgaaatagataacaacgagtgtgccagtactccgtgc
cgaaacaacggagcttgtacggatgctatcaactcttacacttgtacctgcccagctggt
tggactggcgttatttgtcaaaccaatatcgacgagtgtggatcctcgccttgcaggaat
gtgggcaactgtattgatgaagttaacggtttcaggtgctcatgcgccgcagggtggact
ggtgtagtgtgtaacgaggatattgacgaatgtttgtccagtccctgcctgaacggtgcc
acctgccggaatgaacaaaacatgttcacctgtgtgtgcgcggctggattcacaggcatt
acttgtgctacagatatcgacgaatgtgtgagtagtccatgtggtgcaaatggaatatgt
aacaacgggaagaacctctacacctgtacttgtttccccggatacaccggccttacctgt
aacactgaaatcgatctttgccagaacaacccgtgctccaatatggcaacgtgtaataac
tttagggtctactacacctgcgattgtgcagccggtttcgaaggacccaactgcaatata
gatactgatgactgcatcgggcaaccgtgtaataacggcggggtgtgttcggatcaggtt
aatgactatatgtgcacttgcacagctggctggacaggcagaaactgtgaaataaatatc
gacgaatgtgccagtggaccgtgcctaaatcaaggcatatgcagagataaagtcaatgga
tatgaatgtatctgtaccagtgcattttcaggcgttatctgcgaaatccctgtggaccca
tgctcctcttccccatgccaaaatggcggaaactgcaacgacttcgacacttactttacg
tgtgattgtctgcgaggctttgctgattttgactgcggaataaatatcaatgagtgtgct
agtggtccatgcaggaacggcgctccttgtgacgatctaatagctgactaccagtgtaac
tgcctccccgggtacagagggaaagactgcggagagaatatcaacgaatgtttgaccgcc
ccctgcctgaatggaggtcaatgtatagatggagtcaattcctacgtatgtcgctgccgt
tctggctttactggtactaactgtgccacaaatattgatgaatgtgccagcaatccttgt
gaaaatggtggtgtctgccgagatcagatcgataaatatgtctgtgactgccctgtggaa
tggacaggccttcgctgtcgaataagtgcgcgcccctgtggaagctcaccctgccagaat
gaaggaacttgcgtggatggtgaagcgggctttagctgtatctgtgtgcagggatggact
ggagacatctgtaccctagatgtcaacgaatgtcaaagctcaccgtgccagaatggtgga
acttgcgtgaatgaagcggaagttaaccagttcacgtgcatctgtacttccgcctggatg
ggcaacaagtgtactgaacctgtcaacgagtgtttaagcggcccgtgtcaaaacggtgga
acttgctttgatcaggttgatagttatacatgcgcctgcccaccagcatggactgggaca
cattgtcaacaagaggtcctgttctgtatcagcaacccgtgtaagaatggtggcgcgtgc
accgatgacacaaatggatatctgtgtacatgttctggaggatacacaggtgaccggtgc
gaacttgaaattgacgaatgtttaaccaccgcaaacccatgcaactccaatggtggctgc
cttgatatggtgaatagcttcgtgtgcatgtgctacagtgggtggaccggggagcgttgc
caaattgatatcgatgagtgtgagagtgacccttgtcagaacggtggagcatgcataaac
ttggagaattccttccaatgcgtttgtgtcactggttttattggtgtcttctgtgagata
aataatgatgactgcgcaccaaccaatccctgtctgaatggaggagtctgtactgatcta
ataaatgccttcacatgccaatgtgccgctggatttgagggccctacctgtgcaacgaat
attaatgactgtatcagccccaacccatgccaaaatggtggagtctgtcaggatggtgtt
aatgattttacttgtctttgccttagtggctataccggcagactatgcgccatcgtcatc
gatttatgtgaaacaaatccctgtctgaatggaggtgtttgtaattcagagatcaatgct
ttttcatgtacctgccaacctggatacagaggaacactgtgtggtgaagatattgatgag
tgtgcaagcaacccctgtagaaacggaggaatatgcactgatggcgttaacatgtacagt
tgcttctgcaccacgggttggacgggaccacagtgtgccattgccggtccttgcagccgt
aattttaccctgaccgctagcaatccgacaatcgacatcacctctaccaactatcccgcc
aattaccctaacaacgaggaatgcatttggttcgtaagcggtcccgacggcaaacacatc
tacgtcgaggtaatcaacttcaacaccgagctgctctatgacctcgtcaccatcggcaat
cttctgaacatcaatgacctcgggtcagcaaccatctctacatccgggaacttggagcag
acaggcaccgagaggccccctgctttcctgtcgacaggggagatcgtctgggcacggttt
gtctctgacggttcaaagacagaagatggcttcaccatacgcttttctacgcgagacgac
gcagatgtgacagacgagtgtcaagcaatggatgaatgcatctgtcagaacggtggtact
tgcatcaattcattggaattctgcacgtgccagtgcacacgctactttaccggcaccaac
tgtgaaaccgaaatcgaaattaacctttgtgccagcaacccctgcccagcggaaacccat
tgtgaaagtggcgacggtgcattcatttgtctctgcccatccgatttcgaggacgaaagt
tgcgtcattaaagttattgatgaggaagaaccatgtgattcctcaccgtgcgccaatgga
gggacatgtttggagtcaggctcaggttatacatgtgaatgcacccctgaatggactgga
gattattgtaacattgacgttgatgaatgcagtagttccccctgttttaatggaggtacc
tgtgtcaacgggtttggtgcatttgaatgcaggtgctgtgattcgctcttttcaggagat
cgatgtgagatcgtattagccgacagtgtctgtgacgctgagccgtgttttaatggcgga
gtatgtatacgcgatgaccaagacacatcaggccagtacatatgccaatgtaggccgggc
tacatcggagccaattgcgaggaagatattgatgagtgcgccagcaacccatgtctcaat
ggttatgcatgtgaggatctcgtgaatggcttcgtctgtaactgtgatgtttccatggga
ataacatgccgtggaagtaattgtctccctctgccatgccagaacggaggaacatgtagg
gaggtactcgtgctcggagattttgagtgtcaatgccccgaaggatggacaggaaaaact
tgcagtcttgttgacggaactgtctgtagtgccaatgaaatcaacaactgcgaaaatgga
gcaacatgcatcaaacagaatgggaacacccaatgcgtctgcgcacctgaatataccggc
aggacttgcactgaagcaattgtaacagagatgtgtagcgatcgaacatgtactaatgga
cgatgcagcaacggagaatgcatttgcgacgctggatacgagggaatgtactgcgaaaga
gataccgatgactgcctgagcaacccttgtgaaaatggaggtacatgctacgaccgcctg
aactttgtgagatgtgactgtcaaagcggattcactggcgatctttgtcgacaacagttt
gtgacgagcgcacctctaacttctgctggagagttggagcagcaatggatagttgttttt
gccgtagcaggtaccttagctttcattcttcttgttctcctcatcatcggatgtgtttat
ttctccggaaaggacgaaaaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
