Solanum stenotomum: 125863634
Help
Entry
125863634 CDS
T08385
Name
(RefSeq) probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570
Organism
sstn
Solanum stenotomum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_8
LRR_4
LRRNT_2
ABC1
TMIE
APH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125863634
NCBI-ProteinID:
XP_049399636
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(7737383..7740432)
Genome browser
AA seq
980 aa
AA seq
DB search
MTDIEALFAIKNEIIDPFESLSSWNESVPLCQWRGVVCGTRNQRVIELNLLDHKLAGVLS
PFVGNLSFLIRLDIGNNTISGNIPPELGRLTRLRHLYLQNNSFYGEIPVNLSFCSNLVEL
WAYKNNFVGVLPRELGLLTKLKYFDFGYNKLIGEIPKSYGNFSSLLEMYLLDNDLEGKIP
DEFGKLKSLEIFDADFNWLSGRIPSSLYNLTSLKVIDVSFNQLEGTLPRDLEINLPNLEC
LSISENQFSGSLPYSLFNLTGLAYLYVGKNDLGARVPRFDKLHNLYILSMENNQFDNDLT
LMSSLTNATNLNRLYMQNNAFGGTFHEFFSNLSSNLAFVDLSSNQFSGHIPIDIGKFVNL
EELRLSGNQLTGIIPSTIGKLYKLRYLHLSQNRISGSIPFSIANLSLLTELNLDYNNLRG
RIPSSVAKCQSLLYLNLNQNNLIGSIPKEICLISSLVVLNLSSNNLTGALPKEIESLKNL
LSLDVSLNNLNGEIPSTLGSCVTIVNLTMKRNLFRGIIPSTFSSLKSLQVLDLSRNKLSG
MVPKYLEGFALHFLNLSFNDFEGGLPQRGIFENASVDSFVGNPRICGGVPGLKLPNCNFS
HSKKMNFKLVILVILGILGLVVMVCAFFFYRFERSKRTFPSLDNNLNQLMIAMSYQSILK
VTNGFSTSNLIGVGSYGYVYKGILETDGKHVAIKVLNLLQYGAIKSFIAECEALRNVRHR
NLVKLLTACSGVDYHGNEFKALVYEFMANGSLEDWLYPDNSRPNVQPRRLGFLQRMNIAI
DVASAIHYLHNDCQISIVHCDLKPSNILLDNELVAHVGDFGLARFLHLTDETTCRIQTSS
STFKGSIGYIAPEYGMGSEASTQGDVYSFGIVLLEMLTGKRPTDDMFGGDLSLHDFVRNA
MPDGALEIVDPVLNFEEEEISRERSQIPRFVRRQKMVEGLISLFGVGIDCSMYDSSKRKN
MKEVVRELCSIRDSLVGCTI
NT seq
2943 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacagatattgaagcactctttgctatcaagaatgaaataattgatccctttgaatca
ttaagttcatggaatgagtctgttcctttatgtcaatggcgtggcgttgtatgtggaacg
cgaaatcaacgagtcattgaactaaaccttcttgaccataagctagccggtgtgttatca
ccctttgttggaaatttgagcttcctcatacgcctagacatcggaaacaataccatttct
ggcaatatccctcctgaattaggccgtttgacaagattacgccatctatatttgcaaaac
aattcattttatggtgaaattcctgtcaatctatcgttttgtagtaacctcgttgagtta
tgggcgtacaagaacaattttgtaggtgttcttccaagggagcttggtttacttaccaaa
ctcaaatattttgatttcggttacaacaagctcattggtgaaatcccaaaatcttatggt
aacttttcaagtctattggaaatgtaccttttggataatgatctcgagggtaaaatcccc
gatgagtttgggaaactgaagagtttggaaatatttgacgcggactttaattggttatct
ggtagaattccgagctcattgtacaatcttacctccttgaaagtcattgatgtgtcattt
aaccaactcgaaggtactctgcctcgggatttagagatcaaccttcctaacctggagtgt
ctcagcattagtgagaatcaattcagtggatcgcttccttattcacttttcaacctcaca
ggactcgcgtacctttatgttggaaaaaatgacttaggagcacgtgttcctaggttcgat
aagttgcataatttgtatattttaagcatggaaaataaccaatttgataatgacttgacc
ctcatgtcctccttgacaaatgcaactaacctcaaccgtctgtatatgcaaaacaacgcg
tttggagggacatttcatgagtttttcagcaacctttcaagtaatctggcgtttgtagac
ttgtcaagcaatcagttttcaggacatatcccgatagacattgggaaattcgtcaacttg
gaagagcttaggctgagcggaaaccaactcacaggtatcatcccttcgactattgggaag
ctttataagctacgatatttacacctgtcccaaaacagaatttcgggtagtatacccttt
tccattgcaaatctgagccttttaacagagttaaatcttgattataacaatcttagaggt
agaataccttcaagtgttgcaaaatgtcaaagtttgttgtatcttaacctgaaccaaaac
aatttaatcggttcgatacctaaagaaatttgtctcatctcttccttagttgttctaaac
ctttctagtaacaacttgactggcgcccttcccaaagaaatcgaaagcctgaaaaatctc
ttatcattagatgtctctttgaataatctcaatggtgaaattcctagtacacttgggagt
tgtgtgacaattgttaacttaacaatgaaaaggaatttattccgcgggattattccttcc
actttcagttcactaaagagtcttcaagttttagatctttcgcggaataagctatcaggt
atggttccaaagtacttggaaggatttgccttacatttcttaaacttatcgtttaatgat
tttgaaggtggccttccacaacgaggcatctttgagaacgcgagtgtagattctttcgtt
ggaaatcctagaatctgtggtggtgtacctggcttgaaacttcccaattgcaacttcagt
cattcaaagaaaatgaactttaagcttgttattttagtaatattaggaattttggggcta
gttgttatggtttgtgcttttttcttctatcgattcgaaaggtccaaaagaacatttcct
tcattagataacaatctaaaccaactcatgatagctatgtcctatcaaagtattctcaaa
gttaccaacgggttttctacgagcaacttgattggtgttgggagttatggatatgtttat
aagggaattttagaaacggatggtaagcacgttgctataaaagtattgaatcttttacaa
tatggagctatcaaaagtttcatagcagaatgtgaggccttgagaaatgttagacatcgg
aatttagttaagctacttactgcatgttctggtgttgattatcatggcaacgaattcaag
gcattggtttacgagtttatggccaacggaagtttggaggactggttgtatccagataat
tcaagaccaaatgttcagccaagaaggttaggatttctacaaaggatgaatattgctatt
gatgttgctagtgcaattcattatcttcataatgattgtcaaatatcaatagttcattgt
gatctcaaaccaagcaatattctccttgacaatgaattggttgcccatgttggtgatttt
ggattggcaagattcctacatcttactgatgaaaccacttgtagaattcagacaagctct
tcaacttttaaaggatctattggctacatagctccagagtatggtatgggaagcgaggca
tcaacgcaaggtgatgtgtatagttttggtatcgtcttgcttgaaatgttaactgggaaa
agaccaacagatgacatgtttggcggcgatttaagccttcatgattttgttaggaatgcc
atgcctgatggagcacttgagatagtagatccagttcttaattttgaagaggaagagata
agcagagagaggtctcaaattccaaggttcgtgagaaggcaaaaaatggtagagggtttg
atttccttatttggagttggtattgattgttcaatgtatgattcaagtaaaagaaaaaac
atgaaggaggttgttagagagttgtgttctataagagattctcttgttggttgtacaata
tga
DBGET
integrated database retrieval system