Solanum stenotomum: 125866837
Help
Entry
125866837 CDS
T08385
Name
(RefSeq) receptor protein kinase-like protein ZAR1
Organism
sstn
Solanum stenotomum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PK_Tyr_Ser-Thr
Pkinase
LRR_1
LRR_8
LRRNT_2
LRR_4
S1FA
TCAD9
ABC1
FeoB_associated
Oxidored_q2
APH
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125866837
NCBI-ProteinID:
XP_049403160
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(38928397..38932586)
Genome browser
AA seq
716 aa
AA seq
DB search
MMWRISVFFVLLLNSHTGFCLTSDGLSLLSLKSAMDDGGGGTVFSDWNENDDTPCTWTGI
SCANISGSSEPRVVGITLSGKNLRGYLPSELGTLLYLRRLNLHGNNIYGSIPDPLFNATS
LHSIYLYDNNISGILPPSVCNLPRLQNLDISDNSLSGTFSKDLRNCRQLQRLILARNKFS
GEIPVGVFPELANLEQFDLSSNLFNGSIPEDIGELKSLSGTLNLSFNHFSGRIPKSVGDL
PLTVSFDLRNNNLSGEIPQTGSFANQGPTAFLNNPLLCGFPLQKNCKNSSNNSTQVQGSS
DNEGTNSRKGLKPGFIILICLADAFGVAFIGLVIIYLYWKKKDSGGCSCTGKGKFGGNEK
RMLCDFPCINGFPNNDSEVESEKGGGGGASGGGVSGGEGDLVAIDKGFSFELDELLRASA
YVLGKSGLGIVYKVVLGNGIPVAVRRLGEGGEQRYKEFVAEIQAIGRVKHPNVVKLRAYY
WAPDEKLLISDFISNGNLASALHGRNGQPSPSLTWSTRLKIAKGTARGLAYLHECSPRKF
VHGDVKPSNILLDTELQPYISDFGLNRLINITGNNPSSSGGFMGGALPYLKPAQPERPNN
YRAPEARITGNRPTQKWDVYSFGVVLLELLTGKSPDLSVPTTSTSTEVPDLVRWVRKGFE
EQNPLSDMVEPMLLQEVHAKKEVLAVFHVALACTEADPDIRPRMKTISENIEKVGA
NT seq
2151 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgtggaggatatccgttttttttgttcttttactcaattctcataccggattttgt
ctaacttccgacggactttcacttctatctctaaaatccgccatggatgatggcggtggt
ggtacagttttctccgattggaatgaaaacgatgatactccttgtacttggactggcatt
tcatgtgctaacatttctggttcttcagagccacgtgtcgttgggattactctttccggt
aagaatctccggggatacttaccgtctgagctgggaacgttactctatctccggcgactg
aatcttcatggaaataatatttacggttctatccctgaccctttattcaatgcgacgtcg
cttcatagtatttatttgtatgataataatatctctggtatacttcctccttctgtttgt
aatcttcctcgtttgcagaatttggatatttctgataattcactttctggaactttctct
aaggatctacgtaattgtaggcagttacagaggcttattctagctcggaataaattctcc
ggtgagattccggtgggggtgttcccggagttggcgaatttggaacaatttgatctttcg
tcgaatttgttcaatggttcgattcctgaagatattggtgaattgaagtcactatctgga
actttgaatctttcttttaatcattttagtggaagaattcccaaatctgttggtgattta
cctttaactgttagttttgatctaaggaataataatttatctggtgaaattcctcagacg
ggttcttttgctaatcaaggtccgacggcttttttgaataatcccttgttatgtggattt
cctttacaaaaaaactgtaaaaatagttcaaacaattcaacacaagttcagggttcgtct
gataacgagggaacgaattcgcgcaaggggctaaaacctggattcattatattgatatgt
ttggctgatgcatttggagtggcatttataggactagtgattatttacttgtattggaaa
aagaaagactctggtggttgcagctgtactggaaaagggaaatttggtggaaatgagaag
agaatgctttgtgatttcccatgtattaatggatttccaaataatgattcggaagttgag
tctgagaagggaggtggtggtggggctagtggtggtggtgttagtggtggggagggtgat
cttgtggctattgataaaggttttagctttgagcttgatgagctgttgagggcttctgct
tatgtattgggaaagagtgggttggggatagtgtacaaggttgtgctggggaacggtatc
ccagtggcagtgaggaggttaggggaaggtggggaacagagatataaggagtttgtcgct
gagattcaggcaatcggaagggttaagcatcctaatgttgtgaagttaagagcttattat
tgggctcctgatgagaaacttctcattagtgatttcatttccaacggcaacttggcttct
gctcttcacgggagaaatgggcaaccatcacctagtttaacatggtcaacgagactgaaa
attgctaagggaacagcgcgaggtttagcctatctccatgagtgtagcccaaggaaattt
gtccatggagacgtcaaaccttccaatattctccttgatactgaactgcagccatatata
tctgattttggcctcaatcgattaatcaatatcacgggaaacaacccctcctcttctggt
ggatttatgggtggagctcttccttacttgaagcctgctcaaccagaacgtcccaataac
tatcgagcaccagaagctcgaatcactggtaacagacccacccaaaaatgggatgtgtac
tcattcggggtggtcttgcttgaactgctgactggaaagtctcctgacctctcagttcct
acaacatccacttcaacggaggttccagatcttgtaagatgggtaagaaagggattcgag
gagcaaaatccactgtcggatatggtagaaccaatgttgcttcaagaagtccatgctaag
aaggaagtactagctgtatttcatgtagctcttgcatgcaccgaggcagatccagatatt
cgaccaaggatgaaaactatctcagaaaacattgagaaagttggagcttaa
DBGET
integrated database retrieval system