Saccharothrix syringae: EKG83_44900
Help
Entry
EKG83_44900 CDS
T06258
Name
(GenBank) ABC transporter permease
Organism
ssyi
Saccharothrix syringae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsX
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QFZ23635
UniProt:
A0A5Q0HCG7
LinkDB
All DBs
Position
10581691..10583874
Genome browser
AA seq
727 aa
AA seq
DB search
MTRWVADLALGVRLAVGGSRTSWARLALTATGVGLGVTVLLLAASVGPAREAKSERVRAA
AVTATGDGPAVLKVRRVTVPWQGRGINGVELAATTPDAPAPPGVGRIPGPGELVVSPELL
DLMRADDAVRALFPESVIGVIADAGLPRPKSLLFYAGLSQVHLDDAADATGFGGDLPRYT
LLPAYRLLMLAAISALLVPLGIFVVVATRLGATGRARRLAAIRLVGASHRQLRRFAAGET
LAGAVLGLFVGVALFFAARPLARFVEVEGVGFFPTDLLPDPLLGALVGLGVPVVAVGSAL
LALRTEELGPLGLVREVRPPARRAWWRFALLGAGTAVLVVITVVGDFWEAMTDSRVAVGL
GLGIALVLAGTGAVLPWLVGQVARRLQPDGVAPLLALRALRFDTGTPRVLSGVVVVLTGS
LTLQVLLGVAAQVSAAPPVDEPDRWVLDLSRHTPLRSLEESIALVGGVGRVSEVRRYRTA
GASLLSTDCAELAERLRVDDCAPGSAYLVGDGPAPGTEVVVEGQRWVVPRHRPVEGAAGP
PGLFVAGGADPVLSALPPVELVVRGAPDESFGDRLLAATGRVDRAVTLRRPFEAGQVELF
TSLRGGVIGGSALLTLLAVVGLAAAAADQVLERSRPTAVLAANGVPHRVLAVSALWQSAV
PAALGTGLAVPIGLGTAWLVAPSGRFRVEWTEVATTVGSAVVIVLAVSLCTLPALRSAIL
PTGLRTE
NT seq
2184 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgaggtgggtcgccgacctggccctgggcgtccggctggccgtcgggggcagccgg
acgtcctgggcgaggttggcgctcaccgcgaccggcgtcggtttgggcgtgaccgtgctg
ctgctggccgcctcggtcggccccgcccgggaggccaagtcggagcgggtgcgggccgcg
gccgtcaccgccaccggtgacgggccggccgtgctcaaggtccgccgggtcaccgtcccg
tggcagggccgcgggatcaacggcgtcgagctggccgccaccacgcccgacgcgcccgcc
ccacccggggtcggccgcatcccgggcccgggtgagctggtggtctcgcccgaactgctc
gacctcatgcgcgcggacgacgccgtccgcgccctgttcccggagagcgtcatcggcgtg
atcgccgacgccggcctgcccaggccgaagtcgctgctcttctacgcgggcctgtcgcag
gtccacctggacgacgccgccgacgccaccggcttcggcggtgacctgccgcggtacacg
ctgctgcccgcgtaccgcctgctgatgctcgccgcgatcagcgccctgctggtgccgctc
gggatcttcgtcgtggtcgccacccgcctcggcgccaccggccgcgcgcggcgcctcgcc
gcgatccgcctggtcggcgcgtcgcaccggcagctgcgccggttcgcggcgggcgagacg
ctggccggggcggtgctcggcctgttcgtcggcgtggcgctgttcttcgccgcccggccg
ctggcccggttcgtcgaggtcgagggcgtcggcttcttcccgacggacctgctgcccgac
ccgctgctgggcgccctggtcgggctgggcgtgccggtggtcgcggtcgggtccgcgctg
ctcgccctgcgcaccgaggaactgggcccgctgggcctggtccgcgaggtccgcccaccc
gcccggcgggcgtggtggcggttcgcgctgctcggcgccggcaccgccgtgctggtggtg
atcacggtggtcggcgacttctgggaggcgatgaccgactcgcgcgtggccgtgggcctc
ggcctgggcatcgcgctggtcctggcgggcacgggcgcggtgctgccgtggctggtcggg
caggtcgcccgccgcctccagccggacggtgtcgcgccgctgctggccctgcgcgcgctc
cgcttcgacaccggcacgccccgcgtgctgtccggtgtggtggtggtcctgaccggttcg
ctgacgctgcaggtgctgctcggcgtggccgcgcaggtcagcgccgcgccgccggtggac
gagcccgaccggtgggtgctcgacctgtcccggcacaccccgctgcggtcgctggaggag
tcgatcgcgctggtcggcggcgtggggcgggtcagcgaggtgcgccggtaccgcacggcg
ggcgcgtcgctgctcagcaccgactgcgccgagctcgccgagcgcctgcgggtcgacgac
tgcgcgcccggctcggcctacctggtcggtgacggcccggcgccgggcaccgaggtggtc
gtcgaggggcagcggtgggtcgtgccccggcaccggccggtcgagggcgccgccgggccg
ccgggcctgttcgtcgcgggtggcgcggaccccgtgctgtcggccctcccgccggtcgaa
ctggtcgtgcgcggcgcgccggacgagtcgttcggcgaccgcctgctggccgcgaccggg
cgcgtggaccgggcggtgacgctgcgccggccgttcgaggcggggcaggtcgagctgttc
acgtccctgcgcggcggcgtgatcggcggttcggcgctgctcaccctgctcgccgtggtg
gggctcgcggcggcggccgccgaccaggtcctggaacgctcccggcccacggccgtgctc
gccgcgaacggcgtgccgcaccgggtgctcgcggtgtccgcgctgtggcagtcggccgtg
cccgcggcgctcggcaccggcctggccgtcccgatcggcctgggcacggcgtggctggtc
gcgcccagcggccggttccgggtcgagtggaccgaggtcgccaccacggtcggctcggcg
gtggtcatcgtgctcgcggtgtcgctgtgcacgctgccggcgctgcgctcggcgatcctc
ccgaccggcctgcgaaccgagtag
DBGET
integrated database retrieval system