Shewanella violacea: SVI_1146
Help
Entry
SVI_1146 CDS
T01206
Name
(GenBank) peptidase M61, glycyl monoaminopeptidase family
Organism
svo
Shewanella violacea
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Peptidase_M61
Peptidase_M61_N
PDZ_2
PDZ_6
PDZ
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAJ01117
UniProt:
D4ZHG8
LinkDB
All DBs
Position
1340083..1341720
Genome browser
AA seq
545 aa
AA seq
DB search
MWRTGKYQVLPLADGIRYFSVKDEAGNSLPYTRTASGEWTVELEQPTSVTVTYQLYANQL
GQRVGHIDGTHAFLDASGSLVYSPEFKGQKVKVELAVPNEWQSYSGMESGGKPHSFVANN
YDVLVDSPIETGISHHRAFSTDGRDYELVIWGEGNYDIEQIVTDLSKLSGQVGAIWDGYP
FERYVYMVHATSGARGATEHLNSTIIQRPRFSYREREDYLGFIKTASHEFIHTWNVKAYR
PQGLVPYDYQKENMSELLWIAEGSTSYFQSQLLLRAGVITPKEFFEDLAKRIARSEKTPG
REVQSVQEASVSKWASTGGDYAVNQSANIYSEGYFASLALDFSLLNDTDLDHSYRDVHKA
LYNQHKLPVGYSVSDVKQILQDLSGEDYQQWWQTHVNSPMSLDFTSLLENVGLKPGYGDD
SKATAYTGMKLSDDSLILSEVLRDGPAWNAGIVLGDEIVAIDGLKVSSKSFESRIKDFKA
GDQVVVSLFSDDRLKQVTLKMGEQQTDKLQVLSVDKPSRGQKAFFKAWLGIDWPFDNKGE
LKSDS
NT seq
1638 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgtggcgtacaggtaagtatcaagtcttacctttggccgatggtattcgatattttagt
gtaaaagatgaagcgggtaacagcttaccctatacacggactgcgagcggagagtggacg
gttgagcttgaacagccaacgtccgtcactgtgacttatcagctatatgctaatcaattg
ggtcaaagggttggtcatatagacgggactcatgctttcttggatgccagtggtagcttg
gtatatagcccagagtttaagggccagaaggtcaaggtcgaattggccgtgccaaatgaa
tggcaaagctattcaggtatggagtctggaggaaaacctcattcgtttgtggccaacaat
tatgatgtgctggtggactctccaattgagaccggcatcagtcaccacagagcattttcc
accgatggtagggactatgaattggtcatttggggagaggggaactatgacatagagcag
atagtgacagacctttcgaaactcagtggtcaggttggggctatctgggatggatacccg
tttgagcgttatgtctacatggtgcatgctaccagtggtgctcgaggtgcaactgagcat
cttaactcgactataattcagcgtcctcgtttcagttatcgtgagagagaagattattta
ggtttcattaaaaccgcttcccacgagtttattcatacctggaacgtgaaggcatatagg
ccacaaggcttagtgccctatgactatcagaaagagaacatgtctgagctgttatggatt
gccgaaggttcgacgagttattttcaaagccagttgttactcagagccggagttatcacc
cctaaagagttttttgaagacctagcgaaacgaatcgctcggagtgagaagacgcctgga
cgtgaagttcaatcagtacaagaggcaagtgtcagcaaatgggcgagcacggggggggat
tatgcggttaaccagagtgccaatatttattctgaaggctatttcgcatccctggccctg
gatttttcattgcttaatgacacagatctcgaccactcctatcgtgatgttcataaggcc
ctctacaatcagcataaactcccggtgggttattccgtttccgatgtaaaacagatctta
caagacctgtcaggcgaagattatcagcagtggtggcagactcatgttaattcacctatg
agtctggatttcacctctttactagaaaatgtgggtttaaagccaggttatggggatgat
tcgaaagctactgcctatacaggtatgaagttgagtgatgactcactgatactttctgaa
gtcctgcgtgatggaccagcttggaatgcgggtatagtgcttggagatgaaatcgttgct
atcgatggcctgaaagtatccagcaaaagttttgagtctagaatcaaagactttaaggcg
ggggatcaagttgtggtgagcttattcagtgatgatcgtctcaaacaggtaacgctgaaa
atgggtgagcaacagactgacaagttgcaggtgttgagtgtggataaaccaagccgaggt
cagaaagccttctttaaagcctggttgggtatcgattggcctttcgataataagggcgag
ttaaaatcggatagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
