Thermosipho africanus: THA_949
Help
Entry
THA_949 CDS
T00797
Name
(GenBank) alpha-amylase
KO
K01176
alpha-amylase [EC:
3.2.1.1
]
Organism
taf
Thermosipho africanus
Pathway
taf00500
Starch and sucrose metabolism
taf01100
Metabolic pathways
taf01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
taf00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
THA_949
Enzymes [BR:
taf01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.1 alpha-amylase
THA_949
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
hDGE_amylase
EF-hand_8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACJ75408
UniProt:
B7IH44
LinkDB
All DBs
Position
complement(976587..979517)
Genome browser
AA seq
976 aa
AA seq
DB search
MRKKMSYSRFTFLLILALFIFFSGCISEVKNESQILNSKQKVLVKVNVNTPFIENDTTNT
WNVSKESFIDYLSKVIITVKDVNDQIVFTKETTNKTNIYFEIELLPGTYTFEVKGYEEDL
VIFSGEKVNQIIDEKNNIVNIETFFVNGIVRTIIEIDDIIYENYDITSATLILKKDTAQE
DYEEVPVTITGTSTLINKELYPGMWTVKFEVDLKSKDASMLPENVHLENEFSIEVLPAKT
KSLTFNVVFDTEVNEPKLVVIFPQIELPFVDPVTNLKAEVNELEGNLSINWDYSDPNAEF
YIYKEIEEQGEYLYEFVGKTSEKSYTIENFTKQEYDKFSGIAINVYANGKESGLVVLKKE
NIKLIDLESVDGISATYNVDTNKLKLDWNYANSNVTFEVLKKSINSNEYEIISQLTQNSF
STEFTGRQFWDLEKIAIRVVANGFESKINEISRDDITITSLNLPLTSSTMYTLFIRSYFD
TDGDGVGDFSGVAEKVDYLKSLGVDTVWFLPFNKSKSYHGYDVEDYYDVEPDYGTLQDLD
NMIKVLNENGIKVVMDLVVNHTSDTHPWFLDAVENTTNSPYWNYYIMSLDEPQNKNHWHY
KVNSKGQTVWYFGLFDSSMPDLNYDNPKVMDEVKKIIDFWADMGVDGFRLDAAKHYYGFD
WNDGIEQSASVAKEIEDYIKDKLGENAIVVSEVYDGDSNVLLKFAPMPVFNFSFMYNLRG
NFEGRDNLISDSISWIDSSLYNLNVFHFPFIDSHDLDRFISELVDSKYQGDVISATKQYL
LVNALLLSLTGMPTIYYGDEIGLRGWKWHSEPWDIPVREPMQWYKDQKGNGQTYWTKEFY
EGITEGSANEDGAIYDDPDDGVSVEEQENGYSILNFFKEFINLRKEYPALAFGNTTIERD
WKNLYVLKKSNNFQDVLVLINLDPTYSNTYEIPEGYKWVWYAFFDGENYEFGEKDEMILQ
NTSWTINPRQIYIFVK
NT seq
2931 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaagaagatgtcgtattctagatttacttttcttttaatcttagcactttttatt
ttcttctctggttgtatttcagaagttaaaaacgaaagccaaatactaaattcaaagcaa
aaggtccttgtaaaagtaaatgttaatacgccatttattgagaatgatactactaatacg
tggaatgtttcaaaagaatcttttattgattatcttagtaaagtgattattactgttaag
gatgtaaatgatcagattgtatttactaaggaaacaacaaacaaaacaaatatttatttt
gaaattgaacttcttcctggaacttatacatttgaggtaaaaggatatgaggaagattta
gttatcttttcaggggaaaaagttaatcagatcatagatgagaagaataatatcgttaat
attgaaactttttttgttaatggaatagttaggacaataattgaaattgacgatattatt
tatgaaaattatgatattacatcggcaacgttgatcctcaaaaaagatacagcacaagaa
gattatgaagaggtacctgtaacaattacgggtacttccactttaattaataaagaatta
taccctggtatgtggactgtaaaatttgaagttgatcttaaatcaaaggatgcaagtatg
ttaccagaaaacgttcatcttgaaaatgaatttagtatagaagtacttcctgcaaagaca
aaaagtttaacatttaatgtagtctttgatacagaggttaatgaaccgaaattagtagtt
atatttccgcaaattgagttaccgtttgtagatcctgtaacaaatttaaaggcagaggta
aatgaattagaagggaatctttcaataaattgggactattcagatccaaatgcagaattt
tatatatataaagaaatagaggaacaaggggaatatttgtatgaatttgttggaaaaaca
agcgagaaaagttatacaatagaaaattttaccaagcaagaatacgataaatttagtggg
attgctattaatgtttatgctaatggtaaagagagtggtttggttgttcttaaaaaagaa
aatattaaacttatagatttagaaagtgttgacggtataagtgctacttataacgttgat
acaaataagcttaagttggattggaattatgctaattcaaatgttacttttgaagttttg
aaaaaaagtataaatagcaatgaatacgaaataatttctcaactaacacaaaattctttt
tcaacagaatttacaggcaggcaattttgggatcttgagaaaattgcgattagagtagtt
gctaatggatttgaaagtaagattaatgagatttcaagagatgatataactataacatca
ttgaatcttcctcttacatcgtctactatgtatacactattcatccgttcatattttgat
actgacggtgatggtgtaggagactttagtggagttgctgaaaaggtagattatctaaaa
tctcttggagtagatacagtctggtttttgccatttaataaaagtaaatcttatcatgga
tatgatgttgaagattactacgatgtagaaccagattatggaacactacaagatcttgat
aatatgataaaagttctaaatgaaaatggaataaaggtagtaatggatcttgttgttaat
catacgtcggatacacatccatggtttcttgatgcagttgaaaatactactaattctcca
tattggaactattacattatgagcttggatgagcctcaaaataagaatcattggcattat
aaggttaattcaaaaggacaaactgtgtggtattttggattgtttgattcatcaatgccg
gaccttaattacgacaaccctaaagtaatggatgaagtgaaaaaaataatagatttttgg
gcagatatgggagtagatggatttagattagatgcagcaaaacattattatggttttgat
tggaacgatggaattgaacagtcagcaagcgttgcaaaagagatagaagactatataaaa
gataaactaggggaaaatgcaatagttgtgagtgaggtgtacgatggagattcaaatgtt
cttttaaaatttgctccaatgcctgtgtttaattttagttttatgtacaatttgagagga
aattttgaaggaagagataacttaatttctgactctattagttggattgattcctcgttg
tataatttaaatgtttttcattttccatttattgatagtcatgatcttgacagatttatt
tctgagcttgtagatagtaaatatcagggagatgtaatatctgccacaaaacaatattta
ctagttaatgctttactactctcattaacaggcatgccaactatttactatggtgatgaa
ataggacttaggggatggaagtggcattcagaaccatgggatatacctgtgcgtgagcca
atgcaatggtataaggatcaaaaaggaaacggtcaaacttattggacaaaagagttttac
gaaggtattactgaaggaagtgctaatgaagatggagcaatatacgatgatccagatgat
ggagtatctgtagaagaacaagaaaatggatattctattttaaacttttttaaagaattt
atcaatttaagaaaagaatatccagcccttgcatttggaaatactacgattgagagggat
tggaaaaatttgtatgttttgaaaaagtcgaataacttccaggatgttcttgtattaatt
aaccttgatccaacgtattcaaatacatacgaaattcctgaggggtataaatgggtttgg
tatgcattttttgatggcgaaaactatgaatttggagaaaaagatgaaatgattttacag
aatacaagttggacgataaatccaaggcaaatttatatatttgtaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system