Tamlana carrageenivorans: C1A40_17055
Help
Entry
C1A40_17055 CDS
T05295
Name
(GenBank) glycoside hydrolase
Organism
taj
Tamlana carrageenivorans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_43
GH43_C2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AUS07046
UniProt:
A0A2I7SMB6
LinkDB
All DBs
Position
complement(3883741..3885375)
Genome browser
AA seq
544 aa
AA seq
DB search
MKYYFFLLTIICYHIGFSQNNNNFVSDVWVSDLGDETYQNPIIHADYSDPDVVRVGDDYF
MTASSFNCVPGLPILHSKDMVNWKLVNYALKKQVPEDVFNIPQHGNGVWAPSIRYHNDEL
YIYWGDPDFGVYMVKTKDPFGNWDAPVLVMPAKGAIDACPLWDDNGRVYLVHGWAGSRAG
VKSILTVRELNKEGTAVIDEGQHVYDGHEIDPTVEGSKFYKRNGYYYIFAPAGGVSTGWQ
LALRSKNVYGPYERKVVLEQGKTDINGPHQGAWVDTPSGESWFYHFQDVEAYGRIVHLQP
MSWSNDWPLMGEDLDGNGIGEPVKSHKKPHIGKTYPIVTPQDTDMFTGNNIGLQWQYQAN
TNILWHSKLRGSDNLRLFSIKTPKKSKNLWMTPNLLLQKFPAKNFVATTKIKLIPEEAVS
DKAAGLIIMGMDYASLQITHQENNYYIQQIVAKKAIKGGEEEIIESQKLKTNEAYFKVEV
TGHGLDAICQFSYSENGKKYKKIGKPFTALPGKWIGTKVGLFSVRGEESTRGGYADVDWF
KVSK
NT seq
1635 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaagtattacttttttttattaactatcatatgttatcatattggattttctcaaaat
aataacaattttgtgtcagatgtttgggtgtccgatttaggtgatgaaacttaccaaaat
cctattattcatgccgattactccgatcccgatgtggtgcgtgttggagacgattacttt
atgacggcatcaagttttaattgtgttcctggattaccaattttacattctaaggatatg
gtgaattggaagttggttaattatgctttaaaaaaacaagttccagaagatgtttttaat
atcccgcaacatggtaatggcgtttgggcacctagtattcgttaccataacgatgagttg
tatatctattggggcgacccagattttggggtatatatggtgaagaccaaagatcccttt
ggaaactgggatgctcctgttttggttatgcctgccaaaggtgcgattgatgcttgtccg
ctttgggatgataatggacgtgtttatcttgttcatggctgggctggaagtcgtgcaggc
gtaaaaagtatcttaaccgttagagaattaaataaggaaggaacagcggtaattgatgaa
ggtcaacatgtatatgatggccatgagatagacccaacagttgaaggatctaaattctat
aaaagaaatggttattattacatttttgcgccagcaggtggagtttctacaggttggcag
ttggctttaaggtctaaaaatgtatatggaccttatgaaagaaaagttgtgttagagcaa
ggtaaaacagatataaacgggcctcatcaaggggcttgggtcgatacacctagtggagaa
tcttggttttatcattttcaagatgtagaagcttatggtagaattgtgcatttacaacct
atgtcttggagtaacgattggcctttaatgggggaggatttagatggaaatggtatagga
gagccagttaaatcgcataaaaaaccgcatataggaaaaacataccctatagtaactcca
caagataccgatatgttcacaggtaataatattggcttacaatggcagtaccaagccaat
accaatattttatggcactctaaactgcgtggttccgacaacttaaggttgttttcaata
aaaacacctaaaaagtccaagaatttgtggatgacacctaacttattattgcaaaagttt
cctgctaaaaatttcgtagcaacaacaaaaattaaattaattccagaggaagccgtttcc
gataaagctgcgggattaataattatggggatggactatgctagcttacaaatcacgcat
caagaaaataactattacatacaacagattgtagccaagaaagctattaaaggaggagaa
gaagaaattatagagtctcaaaaactaaaaacaaatgaagcctattttaaagtagaggtt
actggtcatggtttggatgctatatgtcaatttagttattctgaaaacggaaaaaaatat
aagaaaataggaaagccatttaccgcattacctggtaaatggattggtacaaaagttggg
ctttttagtgtaaggggagaagaatcaacaagaggtggttatgccgatgtagactggttt
aaagtttcgaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
