Theobroma cacao (cacao): 18612835
Help
Entry
18612835 CDS
T02994
Name
(RefSeq) LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RCH1
Organism
tcc
Theobroma cacao (cacao)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
Pkinase
LRR_4
PK_Tyr_Ser-Thr
LRRNT_2
LRR_6
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
18612835
NCBI-ProteinID:
XP_007049852
LinkDB
All DBs
Position
1:17803368..17807142
Genome browser
AA seq
1082 aa
AA seq
DB search
MPRQSKTYKQQPMPRQSFTTQHHYHLLPLFLLVLLPYAVSAANNEVLALLYWLHSSPSPP
DALSNWHPSDPDPCSWSYITCSSKNSVIEINIQFIELALPFPSNLSSLPSLQKLVISGAN
LTGTIPPNIGDCIQLTVIDVSSNSLVGGIPSSIGKLQNLQDLILNSNQLTGEIPAEIGEC
SSLMNLLIFDNFLSGNLPVELGKLSNLEVIRAGGNKDIAGKIPEEIGDCQNLKVLGLADT
KISGSIPVSLGKLSKLQVLSVYTTMLSGEVPPHIGNCSELVDVYLYENDLSGSVPPELGK
LQKLEKLLLWQNNFDGSIPEEIGNCKSLITIDLSLNYFSGSIPRSFGNLSNLQELMLSNN
NITGTIPPVLSNATSLVQLQLDTNQISGFIPKELGMWTKLAVFFAWQNKLEGSIPAALAG
CRSLEALDLSHNALTGSLPSSLFQLQNLTKLLLTSNDISGIIPPEIGNCSSLIRVRLANN
RISGEIPKDIGFLDNLSFLDLSNNHLGGSVPDEIGNCTQLQMLNLSNNTIGGSLPSSLSS
LTRLQVLDVSVNQFKGQIPQSFGQLTSLNRLILSRNSLSGSIPSSLGHCLNLLFLDLGSN
ALSGTIPEELFDIQALDIALNLSWXALSGVIPPQISTLNKLSILDLSHNKLEGDLVVLSG
LENLVSLNISYNNFTGYLPDSKLFQQLSATEMAGNHGLCSKGHESCFLSNATATRLQNDN
GFRRSQKLKIAIALLITLTIALTIFGAFAVLRARKIIGDYNDSEMGGDSWPWQFTPFQKL
NFSVDQVLKCLVEANVIGKGCSGMVYRAELGNGEIIAVKKLWPTTMAAGYDCHSDKIGIG
GVRDSFSAEVKTLGSIRHKNIVRFLGCCWNRSTRLLMYDYMENGSLGSLLHERSGSCLEW
ELRYRIVLGASHGLAYLHHDCVPPIVHRDIKANNILIGPQFEPYLADFGLAKLVDSGDFA
WSSSTVAGSYGYIAPEYGYMMKITEKSDVYSYGVVVLEVLTGKQPIDPTIPDGLHIVDWV
RQKRGRIEVLDPSLQARPESEIEEMLQTLGVGLLCVNPSPDDRPTMKDIAAMLKEIRQER
EC
NT seq
3249 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccgaggcagtccaaaacttacaagcagcagccaatgccaaggcaatcttttaccact
cagcatcactatcaccttctaccactcttcctccttgtacttttaccatatgcagtttct
gcagcaaataatgaagtccttgccctactgtactggcttcacagctccccttcacctcct
gatgcactctccaactggcatccttcagaccccgacccttgtagctggtcttacatcact
tgttcttccaaaaactctgttattgaaatcaatattcagtttatcgagctagctcttccc
ttcccttccaatctttcgtctcttccttcccttcaaaagcttgtcatttctggtgctaat
ctcactggaacaatcccacctaatattggagattgcatccaactaactgttattgatgtc
agctcaaacagtcttgttggtggtattccttcaagtatagggaaactccaaaatctacag
gacttgattttaaactccaaccaacttactggggagatccctgcagagattggtgaatgc
agcagccttatgaatctcctcatatttgataactttttaagtgggaatcttccggttgaa
cttggtaaactgtcaaatctggaagttatacgtgcaggagggaacaaggatattgcagga
aaaatcccggaagagattggagactgccagaacctgaaggtgttgggtcttgcagataca
aaaatttcaggttcaattcctgtttcattaggtaagctaagtaaacttcaagttctatct
gtatatactactatgctatcaggtgaggttccacctcatattggcaactgttcagagctt
gtggacgtatatctgtatgagaatgatctctccggatcagttccaccggagttgggtaag
cttcagaaactggagaagttgttgctgtggcagaacaactttgatgggagtattcctgag
gaaataggaaactgcaaaagcttgataacaattgatctttccttaaattatttttctgga
agcatacctcggtcatttggaaacctctcaaatcttcaagagctcatgcttagtaacaac
aacatcactggcactattccaccagttctttctaatgctacaagcctagtacagttacag
cttgatactaatcagatatcaggctttattccaaaagagcttgggatgtggacaaagctg
gcagtcttctttgcatggcagaacaaacttgaaggaagcattccagcagcattggctggt
tgcaggagcctcgaggctctagatttgtcacacaatgcactcactgggagcttgccatct
agtttatttcagcttcaaaatctaacaaagcttctcttaacttctaatgacatctcgggc
atcatacctcctgagattggtaattgcagttctcttatcagagtccggcttgctaataac
agaatcagtggagagatcccgaaagatattggtttccttgacaacctcagtttccttgac
ctgtctaacaaccatcttggaggctcagtgccagatgagataggtaactgcactcagttg
cagatgttgaacctgagcaataacaccattggaggttctttgccttcctctttatcttct
cttacaagacttcaggtattggatgtttccgttaatcagtttaagggacaaataccccag
agttttggccaacttacttcactcaatagacttattcttagcagaaactctctctcggga
tcaatcccctcctctcttggtcattgtttaaatctcctatttcttgatcttggcagtaat
gcactatccggtacaatcccagaggaactgtttgacatccaagctcttgatattgctctg
aatctaagttggnatgcactatctggggtaatcccacctcaaatttctacgctgaacaag
ctatctatattggacctttcacacaataagcttgaaggtgacttggtagtgctttctggg
cttgaaaatcttgtttctctgaacatctcctacaacaatttcactggctatcttccagat
agcaagttgttccaacagttatcagcaacagaaatggcaggaaaccatgggctgtgttct
aagggccacgagtcatgtttcctcagcaatgccacagcaactcgtttgcaaaatgataat
ggtttcagacggtcacaaaaacttaaaatagctattgcgttgcttattaccttgaccatt
gcattaacaatctttggggcttttgcagtcttaagagctaggaagattataggagattat
aatgattctgagatgggaggggattcatggccttggcaattcacaccattccagaagtta
aatttctcagttgatcaagttttgaaatgtttagtggaagccaatgttattggaaagggt
tgttcagggatggtttatcgtgcagaacttggaaatggggaaatcattgctgtaaagaag
ctttggccaacgacaatggcagctggatatgattgccatagtgacaaaattggaataggc
ggagttcgtgattccttttctgctgaggtaaaaactcttggttcaatccgccacaaaaac
atagtcaggttcttaggctgctgttggaaccgaagcacaagattgcttatgtatgattac
atggaaaatggaagtttgggtagtcttcttcatgagcgcagtggcagctgcttggaatgg
gaacttaggtatcgaattgtcttgggggcatctcatggtttggcttatctgcaccatgac
tgcgttcctccaatcgttcacagggatatcaaggccaacaacattctcattggtcctcaa
tttgaaccttaccttgctgattttggacttgccaagcttgtcgatagtggagatttcgct
tggtcttccagcacggttgctggttcctatggctacattgctccagagtatggctatatg
atgaagataacagagaagagtgatgtgtatagctatggagttgtggtgttagaagtgcta
acaggaaagcaaccaattgatccaaccataccagatgggctccacattgtagattgggta
agacagaaaagaggaaggattgaagtcctagatcccagcttacaagctaggcctgaatct
gagatcgaggaaatgttgcagaccttaggggtgggtttgctctgtgtaaacccttcccct
gatgataggcctaccatgaaagacatagcagctatgctaaaggaaataaggcaagagagg
gagtgctag
DBGET
integrated database retrieval system