Tetrahymena thermophila: TTHERM_00037680
Help
Entry
TTHERM_00037680 CDS
T01020
Name
(RefSeq) transmembrane protein, putative
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ISP3_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7840506
NCBI-ProteinID:
XP_977168
TGD:
TTHERM_00037680
UniProt:
Q22M52
LinkDB
All DBs
AA seq
2605 aa
AA seq
DB search
MVWVNKQLTCLITISFFIKVIFTQGGCNISYCQQCDALNLNCLQCQADFILNPQSNICLS
KCLFGTYYDFNVSSCIPICNNGYAQDETHRVCIQTQPCHSLQSPNGLVYKYNKIAQIYKN
YVIVCGSDDNTSNSNTLNLLSYDLTTGTALSHIGYLSQNGGPIIFFHISTNSQNQDIIYS
FSRTQITAFELNSGMQINSYTLLNGFFVDASTYYIDNNYLIVFCYRNQQFAVLQYQQQLS
NNCGSQQCLITFQRVHINPIIGFILDSQGNIISYAPDGMIIQWSIQNQSYQTILSNQNYE
ISSLCLSIIQQNQQVFAFSIQNDSNNQVYINVNNKVNSFQLGFTSPILEILDYNQLIQSS
SKNMNSYSIIIIRSSSQLMLVKFQFGQQITTQNLLSASINPIITKAIKGYFYLVLQANGI
YSINQSNGQYSLQLINQIQLSSFNYISDLEPFTLNNTSSGYSFLLVAKQLKIIAPQTQTT
VDPYNGIQQQVSPSYQQHHKWINGVLYDPTLNVYLSFSQDGSFAVWDIFMYDIFKMKPLF
FVFPPWCQQYQTCSTSIINALLFQTGIFICQYSNSVIISWNYNRIQAFVRQTYVMQNQTD
TIKQFKMLGLKYLFFCNTNEIRIYDFSQSETNIINNNYQFIQDYLIKIELGLDNNNILYL
IELARQQSDQYILRLRITDQYYSQINLVNLTRKGVDLYYNYQNQRLFVNVEQDLIGACYF
PQLQFIYLFNVGNSNNWIRTFSYSWQTDQFITINQNGQMCLWKYIIQYKTYNVVIRLQYP
IPRTNYQLLEQKQILAASQGFVMYQNTQSQLIDNQVIGMDFIYLKPCFVYPFKNEINGIY
ISDDSTLFISFTNGDLYFTQYSCSIEQYVFGQANTTQIIHNQYLRKSYLFQKQQMVIVDY
YSQEVAYNNYPHQLNTYQALEDTQNNFLVTYSQEQSTNLYKYSMVANTYIQFLNGHMYSV
NYAFLDIDNDVLISFSSDPRDLNLILWEYSSTSQIVQFSDIQMHVSTNSSIQIVNLLIYK
QQNLVYALLSDGYLFQFNYVQKAVNFLQIDPGAINFWIDETYGNVFILLNSNALQVRTIK
TFQIIAQLIFTQNVNNPQNIMYTNNYVFVFLSNALSIVSRTKLSQIQQIDCSAQPCLDAC
FSEKLDQLFLYSSYQSDSVYVYQAISGQLLYSIYGVSDLNKGQISSVIIDDDDYLLIIGK
LDNFISVFFNYYTKQEVGYFFDSIVQYKYSKFIPELNVFIQSQFYNFEPFSIQNMITSTF
QTQSFYISKWLDYYTDSKNNIYYVDGSNIMRNINLLLLASGDIWNYNFNLNINQNQVSVS
NQQQCSLFINDPSKSFQVENQLLQLQNYFSDTGNIQSQPNVVIQGAEFLFYSNIMNDLKA
LVVYQGDSTDSLLMLYNDSFSKNSLYTLNIKNTFITISKQSAQITLNPQTQEIKFYNVTI
SQEQPNTPSQASILITQIENAILKNITIQNITISNNTTFLNFNSATNLNIQNLVISNVQM
HINSTLISFQQITSLQINNLTLQNVTILTDNSSNSSSLANQIFVFNKVKQLQVLNTTFSN
IKSQIRSVIFQLIQNLECAFQGLLVDQLYNIQFIKNKNYDSSTQFTYIDTQDTFQIMNSK
FSNYFSDLDSLICYQGSLLNIQNTTFQNSSCKSCTGTVLQIQGSSQILINSSTFQNNSGY
NGGAISISDCQNSNIQINQCNFTSNYAWFSGGAIYLMDSEIQMQQTIFTSNIAFIGGAIR
YLTYKPQIFYSSSLQSQVQFIQNKAYIHSQNWGSYPQSINVIFINSISSRVLTTKTYNFK
RNTNQNSDFTLKNIQSGGFLNLSFQLLDEEGNLVTYDYQNCLNKIYSQDLCNEIQQISIN
LISQDDSKMRVLGSYITKYQEFIIQNKTFQINGVQLVGNPLSNQTMLVYVSGIVTYSSNL
QISNPYYAQVQVEFRDCLIGELIEQSNDFYECNPCPYGTYSIQKPQINQAQKCIKCPQEA
QFCQQNQMTLIKGYWKSSNFSDSIYSCTQSKNCEGNQTTNYCSIGHAGPLCQFCDEKGAI
WGEQYQFTVSNQCDLCSGQSQTQSLGVAFLVCLGLIIYCTINIFTMIASGEKISQSYYLR
RMKLVSLSNTCYKQIQINLSIKSLTNFMQMLKLMSTQTLQLPVSITIAPDLIGSPSSSYV
FSTSCFLATLQTDTFKPLFIKLISVSISPFIYILSLIVIYLFINPFLKGFQFSKSKIISI
IVFVFWFLKPSIVYTLIQGISCVNFDGKKYIQLDYTYECYTETHLQFIYYLLIPSLIFYI
IIVPGIILKKISSNKNNLDYATVRQSYGYIYQDYRKVGFYWEFVRFTVQLIVIFYQNLEL
ISSNTKSLLTMSILIVYYIALSIIKPFMMKKYQRVEEQSTIVLIFISVLNLALANNSSST
RTLAFQVVLFVPYYMNMGYLIYLIITTSLIPQLQNCYRKFLGVISNEKKLTNNSLQMQNQ
IIKQRVLYLWKQAYLKLFICQMNQSKKIDQMNQTLVNINQQSTIAQKKFSINLANNINRK
TRISSFSPSPTNIKSKFAATFEMKNSISRQRSIYSNDSFILKQRSDSIETDMNNLYTRPL
ETLEQVIKDQRNPYMQNATKDKPEQ
NT seq
7818 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtttgggtaaataaataactaacttgtttaataacaatttcatttttcattaaagtg
atttttacttaaggtggatgcaatatcagctattgctaataatgtgatgctttaaattta
aattgcctttaatgtcaagctgattttatactaaatccttaaagcaatatttgcctatct
aaatgtctttttggaacttactacgactttaatgtaagctcatgtattcctatttgtaac
aatggatatgcttaagatgaaactcatagagtatgtattcaaacttagccttgtcatagc
ttataatcgcctaatggtttggtctataaatataataaaattgcataaatttacaaaaat
tatgtgatagtctgcggctctgatgataatacaagcaactcaaatactttaaatttactc
tcctatgatttaacaactggtacagctctttctcatataggatacttaagctaaaatgga
ggaccaattatcttttttcatatctcaacaaattcttaaaatcaagacattatatactct
tttagtagaacttaaattactgcatttgaattaaattcaggaatgtaaattaattcttac
actcttttgaatggattttttgtggacgcttctacttactatatagacaataattactta
attgtgttctgctatagaaactagcaattcgcagtcttataataccaacagtagttaagc
aataattgcggttcttaatagtgcctaattacattttagagagttcatatcaatcctatt
ataggtttcatactagatagttagggaaatatcatatcttacgccccagacggaatgatt
atataatggagtatttagaattaaagctattaaactattctttcaaactaaaactatgaa
atatcaagtctatgtctctctataatttagcaaaactaataagtatttgcattttctatt
taaaatgatagcaataattaagtgtacataaatgtgaataataaagtaaattccttctaa
ttgggttttacatctcctatccttgaaatattagattataatcaactaatttaatctagt
tccaaaaatatgaattcatactcaataataattattagaagctcatctcaactcatgcta
gtaaaattttaatttggtcagtaaataactacttagaatttgttatcagcatcaattaat
cctattatcactaaagcaattaaaggttatttctatttggtactttaagctaatggcata
tattcaatcaaccaaagtaatggttaatattcattatagttaataaactaaatttagcta
agtagttttaattacatatctgatctagaaccatttacattaaacaatacctcatctggg
tatagttttcttttagttgcaaaatagttaaaaattattgccccataaacttaaactact
gtagatccatataatggaatataataataagtaagtccctcttattaataacatcacaaa
tggataaatggtgttttgtatgatccaactttaaatgtatatctaagttttagtcaagat
gggtcatttgcagtttgggatatttttatgtatgatatatttaaaatgaaacctctattc
ttcgtatttcctccttggtgttagcagtactaaacctgttctacaagcataatcaacgca
ttattgttttaaacgggaatatttatatgctaatattccaattctgtaataatatcttgg
aactacaataggattcaagcatttgttagataaacatatgttatgtaaaattagactgat
actattaaacagtttaagatgcttggcttgaaatatctcttcttttgtaatactaatgaa
ataagaatttatgatttttcataaagcgaaactaatataattaacaataattatcaattt
atttaagattatcttattaaaatcgaattagggttagataataataacattttgtacttg
attgaattagccagataataaagcgattaatatatattaagactgagaataacagattaa
tattattcataaattaatttagttaacttaacaagaaaaggagtagatttgtactacaat
tatcaaaattaaagactcttcgtaaatgtagaataggatttaataggggcatgttacttt
ccctagttataatttatttatctattcaacgttggaaactcaaacaattggattcgtacc
tttagttattcttggtaaactgattagtttattacaattaattaaaatggttaaatgtgt
ctctggaaatatataatttagtataaaacttataatgttgttataagattacaatacccg
ataccgagaacaaattattaacttttagaataaaaataaattttagcagcaagtcaaggg
tttgttatgtattaaaacactcaatcttaattaattgacaaccaagttatcggtatggat
ttcatttatttaaaaccatgttttgtatatccatttaaaaatgaaattaatggtatttac
atctcagatgatagtaccctctttatttcattcactaatggagacttatattttactcaa
tactcctgttcaattgagtaatatgtgtttggataggccaatactacttaaattattcat
aactaatatttaaggaaatcttatttattttagaaataatagatggttattgtcgattat
tatagctaggaggtagcttacaataattaccctcactaactaaatacttattaagccctt
gaagatacttaaaataattttctagtcacatattcacaagaacagtctacaaatctatat
aaatattccatggtagctaatacttacatttagtttctaaatgggcatatgtactcagtt
aactatgcatttttagatattgataatgatgtcctaattagtttttcaagtgatccaaga
gatttaaacctaattttgtgggaatatagtagcacttcctaaatagtataatttagtgat
attcaaatgcacgtttctactaactcatcaatttaaattgtaaatttattaatatataag
taataaaatctggtttatgctctattatcagatggatatttgttttagtttaattatgtt
taaaaagcagtaaacttcttatagatagatcctggagctataaatttttggattgatgag
acatacggaaatgttttcattttattaaattcaaatgctttgtaagttagaaccattaag
acattttaaataattgcataattaatatttacgtaaaatgttaataacccttaaaatatt
atgtatacaaataattatgtttttgtgtttctttcaaatgctctttctatcgtgagcaga
acaaaattgagccagatctaataaatagattgctctgcttaaccttgccttgatgcatgc
ttctctgaaaaattagactaattattcctatattcttcttattaaagtgattcagtatat
gtctatcaagcaatatctggataattactatattcgatatatggagtatccgatctaaac
aaaggataaataagctcagtgataatagatgatgatgactatttactaattattgggaaa
ttagacaatttcatatcagttttttttaactattataccaaacaagaagtaggttatttt
tttgattcgattgtatagtataaatacagtaaatttataccagagttgaatgttttcatt
cagtcccaattctacaattttgagcctttctctattcagaatatgataacaagtacattt
taaacttagagcttttacatctcgaaatggttagattactacacagactctaaaaataac
atatattacgttgatggtagcaatattatgagaaatattaatttattgcttttagcatca
ggagatatttggaactacaattttaatctgaatataaatcaaaattaagttagtgtttct
aactaataataatgttctttatttattaacgatccctcaaaaagcttctaagtagaaaat
taacttctttaactataaaactacttttctgatacaggaaatatttaaagccaacctaat
gtagttatttaaggggcagaatttctcttctatagtaatatcatgaatgatttaaaagca
ttagttgtttactaaggtgattcaacagattctctactaatgctttataatgattcattt
tctaaaaatagtctttatactctgaatataaaaaatacttttattactattagtaaatag
tcagcctaaataacactcaatccataaacataagagataaagttttataatgtcacaata
tcttaagaataacctaatacaccttcataggctagtattttaataacataaattgaaaat
gctattttgaaaaacatcactatctaaaatattacaatttctaataacacaactttttta
aactttaactctgctacaaacttaaatatttaaaatttagtaataagtaatgtctaaatg
catatcaattcaactttaatcagtttttagtaaataactagcttataaattaacaatctc
actttataaaatgttacaatacttacagataattcgagcaactcaagttcacttgctaat
taaatatttgtttttaataaagtaaaatagctataagtgttaaatactacttttagcaat
attaaaagctaaataaggagtgtgattttttagttgatacaaaatctcgaatgtgctttt
tagggattgttagtagatcaactttataatatttaatttatcaaaaataaaaactatgat
tcaagtacttagtttacttatattgatacataagacacattttagataatgaactcaaaa
ttctcaaattactttagtgatttggatagtttaatatgttattaaggaagcttgttaaat
atataaaatactacattctaaaattcaagctgtaaatcatgcactggaactgttttataa
atctaaggtagtagttaaattctaataaactcctcaactttttaaaataatagtgggtat
aatggaggggcgatctctatttcagattgctaaaattctaatatataaataaattaatgc
aactttacaagcaactatgcttggttcagtggaggtgcaatatacctgatggattcagaa
atttaaatgtaataaactatttttacaagcaatatagcttttataggaggagctattcgc
tacttgacatacaaaccataaatcttttactcttcatcattataaagtcaagtacaattt
atccaaaataaagcttatattcatagttaaaattggggatcgtatccacaatctataaat
gtaatttttattaattcaataagttcaagagttttaactactaaaacctataactttaaa
agaaatactaatcaaaatagtgattttactcttaaaaatatataaagtggtggtttttta
aatttatcattttagctactagatgaagaaggtaatttagtaacttatgattactaaaac
tgtttaaataaaatatatagctaagacttatgtaatgaaatacaataaatcagcattaat
ttaatttcataagatgattcaaaaatgagagttttaggatcatatatcactaaatattaa
gaatttataatttaaaataaaactttttaaattaatggagtctaattagtaggaaatcct
ctttctaattaaactatgctagtatatgttagtggaatagtaacatatagtagcaattta
tagatttcaaacccatattatgcccaggtttaagtagaatttagagattgtttaattgga
gaattaattgaatagtcaaatgatttttatgaatgtaatccatgcccttatggcacttat
tcaatataaaagccacaaataaattaagctcaaaaatgtattaaatgcccataagaagct
tagttttgctagtagaattaaatgactttgatcaaaggttattggaagagctctaatttt
tcagatagtatatactcttgtacttaatcaaaaaactgtgaaggtaattaaacaacaaat
tattgtagcataggacatgctggacctttgtgtcaattttgtgatgaaaaaggagcgatt
tggggagaacaatattaatttacagtatcaaatcagtgtgatctgtgttcaggttaatct
caaactcaatcacttggagtcgcttttttagtttgcttaggtcttataatttattgtacg
ataaatatttttacaatgatagcctcaggcgaaaaaatatcttaatcttactatttgaga
agaatgaaattagtaagtttaagcaatacatgctataagtaaatttaaataaatttgagc
ataaaatcactcacaaactttatgtaaatgctaaaattaatgtcaactcaaactcttcaa
cttcctgtttcaattacaatagcccctgacttaattggttctccatcatcttcatacgta
ttttcaacgtcttgctttttagcaactctttaaacagatacttttaagccactttttatc
aaattgatctccgtttcgatatcgccatttatatatattttatcattgatagttatctac
ttatttattaatccatttttaaaaggcttttaattttcaaaatctaaaattatcagcata
atagtcttcgttttctggtttttgaaaccaagtatagtttatactttaatttaaggaata
tcatgtgtgaattttgatgggaaaaaatacatacaattggattatacatatgagtgttat
actgaaacacatctataatttatatactatctactaatacctagcttgatattttacata
ataattgtacctggaataatcttaaaaaagatctcaagcaataaaaataatttagactac
gctacggtaagatagagttatggatatatttatcaagattaccgtaaagtaggtttttat
tgggagtttgtaagatttactgttcagctgattgtaattttctattaaaatctagaattg
atatcttcaaatacaaaatctctccttacaatgagtatcctgatagtctactacatagca
ttatctatcataaaaccttttatgatgaaaaaatattaaagagtggaggagtaaagtaca
atagtacttatatttatttcagttttaaatttagcacttgctaataatagcagtagtaca
cgtacattagccttttaagttgttctttttgtgccttattatatgaatatgggctattta
atatatttaataataacgacatcacttatcccttagctttaaaactgttatagaaaattc
ttaggagtgataagtaatgaaaagaaattgacaaataactctttataaatgcaaaatcaa
atcattaaataaagagttttgtatctttggaaataagcttatcttaagttatttatctgt
taaatgaattaatcaaagaaaatagattaaatgaattaaactttagtaaacataaactaa
taaagtacaatagcttagaaaaaattttccataaacttagccaacaatataaacaggaag
acaagaataagctccttttcacctagtccaaccaatatcaaaagcaaatttgcggcaact
tttgaaatgaaaaatagcatttctagataaagatctatttattcaaatgatagtttcatt
ttaaaataacgttcagattcaatagaaactgacatgaataatctatatactagaccttta
gaaactttagaataagtaataaaggattaaagaaatccatacatgtaaaatgcaaccaaa
gataaacctgagtagtga
DBGET
integrated database retrieval system