Tetrahymena thermophila: TTHERM_001170561
Help
Entry
TTHERM_001170561 CDS
T01020
Name
(RefSeq) kinase domain protein
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
Brite
Pattern recognition receptors [BR:
tet04054
]
Cytoplasmic pattern recognition receptors
NOD-like receptors
TTHERM_001170561
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_6
Kdo
Kinase-like
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
24441862
NCBI-ProteinID:
XP_012650937
UniProt:
W7XFC8
LinkDB
All DBs
AA seq
1732 aa
AA seq
DB search
MSKKLQNELIETISSKVSKDCQIQKPAIKELVKLMFSQKKYFKNYEYLSSGAYALVLKAQ
NSQQNRQVALKFLGCSNKDDKDGIESLKKEYEMLQKFSQSEFLVKVYDCFYLMEEKEDED
DDGNDIIVQTQNKSYFVMEMELCEKNLKQLFDFLRKQQVPPSNVIKEVIAIQMIEGLNNL
HVKNIMHRDIKPQNFLVCPSQEYGFSIKLCDLGFASAVSKSKSFLSKKGTDAYFAPEVEK
GQSRIQSDLFSLGLVLLELDNLKTLNENWIDVEIKNNLFKGQEIPNDIYQIDKKSNIYKI
AQICLKPSYLDRTSAGELLSKLIQMHGQPLKFVLTSMILEEQIPKQAQQIFDSINQQQQK
EQNNQFDEYAQLILKNTNEKIIQKDLKAQFTKVEVLSNLFKSLYENKKYTNNFQILSFGS
FGIVLSTKKVKLDNKEIVLKIQKIVDEQEIQNEISIMQKLKEPLVVQIYDSYIIENKLGP
DRYSVFELEKCSCSLDEYLERSNIDGQFNEDDKFQIAIQIIDSVNYIHSFNILHRDIKPE
NFLVYLEGKQPEIKLCDFGLSAQIPDNEDSIQTIEHIGNLGYSAPEILNKKDNELKFYTK
KSDSYSVGLLLALLDNYQDLKTNTTSNFALMTLKQLDKPFEKSNIQINKNSQIYKFINLL
VVSDSSQRASLYDIVEQSDIKFLTNSKEMKQIVQKTLLVQNDKKIEQNATIEINSMNDLS
KAQNYNIVKISFTGQKYYYKKQCTSFKSQYTKSYKYKTVEAKNLNLQAKKTLSNFDIDQK
FIFIYHLKQNLVIINQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXPFSSNLFYQF
IIYSYLQRENSIRCIGVQKIQAQEQRSARISQCNSIGAQGAKDLGTGIAQCKNITSLTLD
LRDNSIGEVGAKDLGTGIAQCKNITSLTLQLYRNSIGAQGAKDLGTEIAQCKNITSLTLD
LYCNSIGAQGAKDLGTGIAQCQNITSLTLDLSGNIIGHVGAKYLGLGIAQCKNITSLTLS
LSFNSIGDVGAKYLGLGIAQCKNITSLTLGLQGNSIGAQGAKDLGTGIAQCKNITSLTLQ
LYYNSIGAQGAKDLGTGIAQCQNITNLTLDLRENSIGAQGAKDLGTGIAQCKNITSLTLD
LYCNSIGAQGAKDLGTGIAQCKNITSLTLDLRQNSIGAQGAEDLGTRIAQCKNITSLTLD
LQVNSIGAQGAKDLGTGIAQCKNITSLTLDLRSNRIGDVGAKDLGTGIAQLKNITSLTLD
LYYQNLGDEGAFELGKALSNLQELSYLKLILLNNQIGDEGAQAISLAFRQCKNIADLRFF
FNKNKVSDIGISAITQGISLCISIESLCLSLQENNLTEDGYHILGQGIASIPKLTSFQAW
IKGEYEYYLNSKEIINCKNIKELVLYLYNSQIGNKGILGLGIALANCTNLSNLKLDLTHN
SIGQKGSKLLCIALANCINLSKLILGLSLNRIVDQGASDIVSALAKCNKLSNLKLDFSYN
QLENVYVDFALANLTNLSNLTLNFHENIICYTDIGYALTNCTNLKNLKLDLSYNNLGSND
VSNIGSALENLTNLSKLTLNLRNNKFYDASKLGSSLAKCTNLSNLSLNLSATEISQQGAI
ELGKDLANCHKLSNLTLKLRSNEILDTCALDLGSALANCTNLSNLTLDLYNNSIYDKGAL
DLVSSLANLTNISNLTLDLRNSKKQINKSQQSLKLKRKCLKLKRLVAFKIQF
NT seq
5199 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctaagaaactttaaaacgagttaatcgaaactatctcaagcaaagtatccaaagat
tgctaaattcaaaaaccagcaataaaggaattggtcaagttaatgttcagctagaaaaaa
tacttcaaaaattatgagtacttaagcagtggcgcttatgctcttgtcttaaaggcttag
aattcttaacaaaatcgctaagtagctctcaaattcttaggttgttccaacaaagatgac
aaggatggtatcgaatctttgaaaaaggagtatgaaatgcttcaaaagtttagccaatca
gagtttttagtaaaggtctatgattgcttctatttaatggaagaaaaagaagatgaagac
gatgatggaaacgatattatcgtttaaacttaaaacaaatcctacttcgtaatggaaatg
gagctttgcgagaaaaatctcaaatagctatttgatttcctccgaaaataataagttcca
ccttcgaatgtgatcaaggaagtaatagccattcaaatgatagaagggctgaataacctt
catgtcaaaaatattatgcacagggatatcaagccttaaaatttccttgtttgcccttct
caggaatatggtttctctatcaaactttgtgatctaggctttgcatcagctgtgtctaaa
tcaaaaagcttcctgtcaaagaaaggaactgatgcatattttgctccagaagtggaaaaa
ggataatctagaattcagtcagacctcttttcactgggactcgttttactagagcttgat
aatctcaagactctaaatgagaattggatagatgtggaaataaaaaataacctgtttaaa
ggataagaaatacctaatgacatatattagatagataagaaatctaatatttacaaaata
gcttaaatatgcttaaaacctagttatttagatagaacttcagcaggagaattactatct
aaactcatctaaatgcatggttaaccattgaaatttgtgttgacttctatgatactagag
gaatagatacctaaataggcacagtaaatatttgatagtattaatcaacagtaataaaag
gaatagaataattaatttgatgagtatgcttagttaatactaaagaacacaaatgagaaa
attatacaaaaagatttgaaagcacaatttacaaaagtagaagtattatctaatctgttc
aaaagtctctatgaaaataaaaaatatactaataatttccaaattcttagctttggaagt
tttggaatagtattatcaactaaaaaagttaaacttgataataaagaaatagtgttaaaa
atacaaaaaatagtagatgaataagaaatctaaaatgaaattagtattatgtagaaatta
aaagagccactagtggtatagatttatgatagctatataatagaaaataaattaggacct
gatagatactcagtctttgaattagaaaaatgttcatgttcattagatgaatatcttgaa
agatcaaacatagatggataatttaacgaagatgacaaattttaaatagctatctaaatt
attgattctgtcaattatattcattcatttaatatccttcatagggatattaaaccagaa
aattttttggtttatttagaaggaaaataaccagaaataaaattatgtgatttcggctta
tctgcttagattccagataatgaggattcaattcaaactatagaacacataggaaattta
ggatattcagcacctgaaatattaaataaaaaggataatgaacttaagttttatacaaag
aaatctgattcatattcagtaggattattgctagctttgttagataattattaagatcta
aagacaaatacaacttcaaatttcgcattaatgacactaaagcagttagataagcctttc
gaaaaatcaaatatttaaataaacaaaaattcataaatttataaatttattaaccttctt
gttgtttctgatagtagttagagggcatctctctatgatatcgttgaataaagcgatata
aaattcttaactaattcaaaagaaatgaaataaattgtacaaaaaactcttttggttcaa
aatgataaaaaaatagagtaaaatgcgactatagaaattaattctatgaatgatttgagc
aaagcttaaaattacaatattgttaagataagttttactggataaaaatactattacaaa
aagcaatgtactagctttaagtcataatatacaaaatcatataaatataaaacagtagag
gcaaaaaatttaaatttgtaagcaaagaaaactttgagtaattttgatattgatcaaaaa
tttatttttatttatcatctcaaacaaaatttggttataattaattaaannnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnn
nnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnntcctttctcctccaatttattttattaattc
attatttattcttacctttaaagggaaaatagtattaggtgcataggagtgcaaaagatt
taggcacaggaatagcgtagtgcaagaatatcacaatgtaatagtattggtgcatagggt
gcaaaagatttaggcacaggaatagcgtagtgcaagaatatcacaagtttgacacttgat
ttaagggataatagtattggtgaggtgggtgcaaaagatttaggcacaggaatagcgtag
tgcaagaatatcacaagtttgacactttagttatatcgtaatagtattggtgcatagggt
gcaaaagatttaggcacagaaatagcgtagtgcaagaatatcacaagtttgacacttgat
ttatattgtaatagtattggtgcatagggtgcaaaagatttaggcacaggaatagcgtag
tgctagaatatcacaagtttgacacttgatttaagtggaaatattattggtcatgtgggt
gcaaaatatttaggcttaggaatagcgtagtgcaagaatatcacaagtttgacacttagt
ttaagctttaatagtattggtgatgtgggtgcaaaatatttaggcttaggaatagcgtag
tgcaagaatatcacaagtttgacacttggtttatagggaaatagtattggtgcatagggt
gcaaaagatttaggcacaggaatagcgtagtgcaagaatatcacaagtttgacactttag
ttatactataatagtattggtgcatagggtgcaaaagatttaggcacaggaatagcgtag
tgctagaatatcacaaatttgacacttgatttaagggaaaatagtattggtgcataaggt
gcaaaagatttaggcacaggaatagcgtagtgcaagaatatcacaagtttgacacttgat
ttatattgtaatagtattggtgcatagggtgcaaaagatttaggcacaggaatagcgtag
tgcaagaatatcacaagtttgacacttgatttaaggcaaaatagtattggtgcatagggt
gcagaagatttaggcacaagaatagcgtagtgcaagaatatcacaagtttgacacttgat
ttataggtaaatagtattggtgcatagggtgcaaaagatttaggcacaggaatagcgtag
tgcaagaatatcacaagtttgacacttgatttaaggtctaatcgtattggtgatgtgggt
gcaaaagatttaggcacaggaatagcgtagttgaagaatatcacaagtttgacacttgat
ttatattatcaaaatttaggagatgaaggagctttcgaattaggaaaggctttaagtaat
ttataggaattgtcttatttaaagctaattcttttaaacaattaaataggtgatgaagga
gcttaggcaatcagtttagcttttagataatgcaaaaatattgcagatttaagatttttc
tttaacaaaaacaaagttagtgatataggaatatctgctattacttaaggaataagcctt
tgtatctcaattgaatctttatgtctgagtttataggagaataatttaacagaggatgga
tatcatattcttggttaaggtattgcaagtataccaaaattaacttctttctaagcttgg
attaaaggagaatatgagtattatttgaattcaaaagaaatcatcaactgtaaaaatata
aaagagttggtcctttatctttacaatagttaaattggtaataaaggtatattaggctta
ggtattgctttagcaaattgcactaatctctcaaatttgaagcttgatcttacccataat
tcaattggtcagaaaggctcaaaactcttatgtattgctttagcaaattgcattaatctc
tcaaagttaatacttggtcttagtttgaatagaattgtggattaaggtgcatcagatata
gtttctgctttagcaaagtgtaataaactatcaaatttgaaacttgattttagttataat
tagttggaaaatgtttatgtagattttgctttagcaaatttaacaaatctctcaaatttg
acgcttaattttcatgaaaatataatatgttatactgacataggttatgctttaacaaat
tgcactaatctcaaaaatttgaaacttgatcttagttacaataatttaggaagtaatgat
gtatcaaacatagggtctgctttagaaaatttaactaatctctcaaaattgacacttaat
cttcgtaacaataaattttatgatgcatcaaaattaggctcttctttagcaaaatgcact
aatctctcaaatttatcacttaatcttagtgccactgaaattagttaataaggagcaata
gaattaggtaaagatttagcaaattgccataaactctcaaatttgacccttaaacttcgt
agtaatgaaattttggacacatgtgcattagacttaggttctgctttagctaattgcact
aatctctcaaatttgacacttgatctttataataattcaatttatgacaaaggtgcatta
gacttagtttcttctttagcaaatttaactaatatctcgaatttgacacttgatcttcgc
aatagtaaaaaataaatcaataagtcataataatcattgaaattaaaaagaaagtgttta
aaattaaaaagattagttgcttttaaaatctaattctga
DBGET
integrated database retrieval system