Tetrahymena thermophila: TTHERM_00266600
Help
Entry
TTHERM_00266600 CDS
T01020
Name
(RefSeq) AAA domain protein
KO
K27391
NFX1-type zinc finger-containing protein 1
Organism
tet
Tetrahymena thermophila
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_12
AAA_11
AAA_19
AAA_30
DEAD
PhoH
AAA_22
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
7846375
NCBI-ProteinID:
XP_001015895
TGD:
TTHERM_00266600
UniProt:
I7M177
LinkDB
All DBs
AA seq
2173 aa
AA seq
DB search
MYTGNRQSGFNINANNEEQVRGFGINSEGKIPKKKNNFTPQQISDQEMQKYLNQQRLNDF
RNEEFNFQSQLNNSQQKGFQTKNNDDDQKNKDKGKKNRNHGYNNVQNRKNDDNDQRKKEK
RSKSRNKTGQSSYDYNAINKQQQNNRMHSSLLNNQRSQQLNSTGIQQYRNLNTKSYLNNQ
IDEQQQQYFYRQQNDNLQPQQQTKNPNQNSRLRKQNKSDRMNFQQFKSLIQKDSQELIDF
FSQFQDVKQCLPEIKQIDGYTILFDLCERMMYYDEQNQDSQIREYLKSILLSDQFKKSIS
WILADFYEMEINLKKKILENYARIFIYIKDYLNPVEYEKEIKIYLNSMLKVFKIERINNN
FLQREFIELEKWVQDQEQKKQQIQYKRLIQQFRPQQQQITPLSEIDISSENIFVIPNREE
FANNLQNTNRYSVVPIKGSYISRYVYLMNNFFLLREDFFKEIKLSLSTLIQNGMLDHQKL
DKNIQGVFYIYCNSIIKDIQFDRAGIFFTINTQPLFIRNKKNYKWDDSRRLMNGSLLILT
NDKFDKFFYLVVKRKAKNIDQEFKEKNTVTITAELEMDTMQGDEIVNILDDLQRFFSQSN
VTIFEAKYYWEAYSHFLRGIKNMIQQQTILPFERIIIDCQKRVDNPDFINYNTTYLMKID
INQPKLGNNLILIRQNWNTVNKGTFDDSQFECLTNILTKQVSIIQGPPGTGKTFVGSMAV
KVLVDNYHVWNKQGRPILMICKTNHALDQFLKHILKFEDKIVRIGGRCQEQSLQNYLIKN
IKDQYKQSNKKFHTPSLRFLREQIEIIEQLYQKITQNVEDYVLLDDDYDIYQDDFDFNLK
NYIMDSFQKFGNFQLERKNINYYTLQDLIVKFWWQCNIESSKLEQFKIITDNQLRQIQEK
SKDWNKKMKSEKQKYQQKIINEKKIDVQQLEQQKLLEEQRLRNPNLQMQDLANKSNQNQL
EEEEEQSDEEENYFENKNEFNVEGNMNIKFLEKQAQESYLLKVKCDENELEKLIQQIKTG
KLNLFKLDYSQVYNLKAYAIQYQQEQTFQEIKKSLKLYSQYQQQFKEEFNQDDARIIVES
KCKIVGMTLNGASINSHLIKYLRSPIVIIEEAGEVLESLLIPVLQPSTQQLILIGDHQQL
KPSVNNYELEKKYNFNTSLLERLVKNEVEYAQLKVQRRMNPSFADYIRLIYSDYQDHFDL
IRYQKNVVGMPSNMYLISHRENEENIENSTSKRNIYEANYAIKLAKYILMQKQFKQQEIT
ILSMYLGQSQLIRKLAKKEDIAQVKISSVDNYQGEENEIIILSLVRSNQSKKLGYTKTEN
RINVSFSRAKRGFYVIGNFNMIRQVQDAQLWQKIINLAEKKKHLVETIYFQCSKHKDVNK
VTHYKDFDSMPKGGCQKKCNTMKQCGHACSQFCHPDECENYKCNNSCIRLIQDCGHACQQ
KCFEKCKCTSRVYKTLLCGHQKLCFCASDIKNEKCETDVQIILRCGHQKQVKCYEANLNT
HQCDELIQIRLLCGHLKEVKCFQRNQSNHQCLTQIEHTLPCSHQIVIKCCDKNKQYQCQK
EVSFFCPNCNISIQKKKCFQNSTNANCTFLVKKLLKCNHYKEIPCNMKPEDAKCEQEVQK
LLNCGHQNLLKCFQDPSKENKCSALVQKSLKCNHQFIMQCCESPDNFICQAKTQKQLKCG
HFIEAQCSESVENVVCKILVNRELQCGHYAQNIPCNEIQNGSYQCKEQSRKYLQCGHILL
YTCYQKDKARQCDKLIQLQKSCCSLIYNVSCPDYLKKQYVIPQCNCSKQFIFCPHNVNGF
RKENLCNQKCGVILECGHMCQSTCEQCAFGLLHKPCKQEVVIEYICGHKKSKECGQDPEF
CEEQCQIQECIHKKKKCLKKCLEKCSLQITKSSCKQCENKDIHELSCGHKFQNLDEIFSQ
QFQQNPLRLPECQICKLPINVLKYKISLKDIKVNQYFFAKGIKNIMKKIIEDFKISDEEM
KILSNEYKAFENFSNFFDKFRLCHLYQSIKYLKQFEKDFQDIENQDTNTQKILNTIKLQV
EILQNTYLKQNQVKLSIDHVRKFVNSIIYLKGMYNYFYKKLDIKFEQLKEFRTFQMPEEL
KYNIVVYQVFEYEKLIQLHLITRNIWCQPILMPILMSICPNQHICQQENTKCQLQICGQK
TDLQEFYYIVSSQ
NT seq
6522 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtatacaggcaatagataaagtggttttaatataaacgctaataatgaagagtaagta
aggggatttggaataaatagtgaaggaaaaataccaaaaaaaaagaataatttcacacca
taacaaatttcagattaagaaatgcaaaaatatctaaattaacaaagattaaatgacttc
agaaatgaagagtttaatttttagtcctaactcaataatagttagcaaaaaggctttcaa
acaaagaataatgatgatgattaaaaaaataaagataaaggaaaaaaaaatagaaatcat
ggatacaataatgtctaaaatcgtaaaaatgatgataatgattaaagaaaaaaagagaaa
agatcaaaaagtagaaataagacaggttaaagcagctatgattacaatgcaataaataag
taataataaaacaatagaatgcattcatctttactaaataattagcgaagtcaataatta
aattcgactggcattcaataatatagaaacctaaatacaaaaagctacttaaataattaa
atagatgaataataatagtaatatttttatagataacaaaatgacaatctataaccataa
taacagacaaaaaatccaaattagaattctagattaaggaaataaaataaatctgataga
atgaatttttagtaatttaaatcattaattcaaaaagattcataagaattaattgatttc
ttttcctaattttaagatgtaaaataatgtttacctgaaatcaaataaatcgatggatat
acaattctttttgatttatgtgaacgtatgatgtattatgatgaataaaattaagacagc
taaattagagaatatttaaaatctattctattatctgatcaatttaaaaaatctatttcc
tggattctggctgatttttatgaaatggaaataaatcttaaaaaaaaaatacttgagaat
tatgcaagaatttttatttacattaaagattacttaaatcctgttgaatatgaaaaagaa
ataaaaatttaccttaactcaatgttaaaagtatttaaaatagaacgaattaataacaat
tttttataaagagaatttatagaattagagaaatgggtataagattaagaataaaaaaaa
taataaatttagtataagagattaatataataatttagaccataatagcaataaattaca
cctttaagcgaaatagatataagtagtgaaaatatttttgttataccaaatagagaagag
tttgctaataacttgtagaacacaaacagatattctgtagttcctattaaaggatcatat
attagtagatatgtatatttgatgaataatttcttcctcttaagagaagattttttcaaa
gaaataaaattatctttatcaaccttaattcaaaatggaatgttagatcatcaaaaatta
gataaaaacatataaggggttttttatatttattgtaatagcattattaaagatatctaa
tttgatagagcaggcatatttttcactatcaatacctaacccttattcataagaaacaaa
aagaactataaatgggatgattcaagaagattaatgaatgggtctttgcttattttgaca
aatgataaatttgacaaatttttttatcttgttgttaaaagaaaagctaaaaatatagat
taagaatttaaagaaaagaatactgtcacaataacagcagagttagaaatggataccatg
taaggcgatgaaattgttaacatactagatgacttataaagattcttttcttaatcaaat
gttacaatatttgaagcaaaatactattgggaggcttattctcattttttaagaggaatc
aaaaatatgatttaacaataaacaatactgccttttgaaagaataataattgattgctag
aagagagttgacaaccctgattttataaattataatacaacatacttgatgaaaattgat
ataaattaacctaaattaggtaataatttaattttaataagacaaaactggaatacagta
aataagggtacttttgatgattcttagtttgaatgtcttactaatattttaacaaaataa
gtgtcgattatttaaggtcctcctggtactggcaagacatttgttggtagtatggctgtt
aaggtgttagtagataactatcacgtttggaataaataaggaagacctattttaatgatt
tgcaaaacaaatcatgctttagatcagttcttgaaacatattttaaaatttgaagacaaa
attgtgagaattggtggcagatgctaagagtaaagtttgcaaaattacttgatcaaaaat
attaaagactaatacaagcagagcaataaaaaattccatactccttctctaaggtttcta
agagaataaattgaaataattgagtaactctattaaaaaattacataaaatgtagaagat
tatgttttgttggatgatgattatgacatttactaagatgattttgattttaatttgaaa
aattacatcatggattcattctaaaagtttggaaacttttaattagaaagaaagaatata
aattattacactttgtaagacttaatagtaaagttttggtggtaatgtaatattgaatca
agtaagctcgaataatttaaaataattacagataattaattaagataaatttaagaaaaa
tcaaaagattggaataaaaaaatgaaatctgaaaaataaaaatattaacaaaaaataatt
aatgagaaaaaaatagatgtttagtaattagagtaataaaagcttttagaagaacaaaga
cttagaaatcctaatttataaatgtaggatttagcaaataaatctaattaaaaccaatta
gaagaagaagaagaataaagtgatgaagaagaaaattattttgaaaataaaaatgaattt
aatgtagaaggtaacatgaatatcaaatttttagaaaaataagcataggagtcatactta
ttaaaagttaaatgcgatgaaaacgagctagaaaaattaatatagcagataaaaactgga
aaattaaatctatttaaattggactattcttaagtttataatcttaaagcttatgctata
caatattaataagaatagaccttttaggaaattaaaaaatccttaaagttatatagttaa
tattaacaacaattcaaggaggaatttaatcaagacgatgctagaattattgtagaaagt
aagtgtaagatagttggaatgactttgaatggtgcttcaataaactcacatctcataaaa
tatcttagatccccaatcgtaattattgaagaagctggtgaagtacttgagagtttattg
ataccagttttacagccatcaacttaacaattaattttgattggtgatcatcaacagttg
aagccctcggttaacaattatgaattagagaaaaaatataattttaacacatcactttta
gaaaggcttgttaaaaatgaagttgagtatgcacaactaaaggtacaaaggagaatgaat
cctagctttgcagattatattagattaatatactcagactactaagatcactttgatctt
ataagatattaaaagaatgttgttggaatgccttcaaatatgtatttaatatcacacaga
gaaaatgaagaaaatatagaaaactctacttccaaaaggaatatttatgaagcaaactat
gctattaaattggctaaatatattcttatgcaaaaataattcaaacaataagaaataact
atcctttctatgtatttaggttagtcacaattgattcgcaaattagccaaaaaagaagat
attgcttaggttaagattagttcagttgataattattaaggagaagaaaatgaaatcata
attttatcgttagtaagatcaaattaaagtaaaaagcttggttatactaaaacagaaaat
agaattaatgtgtcattttcgagagctaagagagggttttatgtgataggaaattttaat
atgataagataggttcaagatgcataactttggtaaaaaatcataaatttagctgagaaa
aaaaaacatttagtagagactatatatttttaatgtagtaaacacaaagatgttaataaa
gtaacccattataaagattttgatagcatgccaaaaggaggttgctaaaaaaagtgtaac
acaatgaagtaatgtggtcatgcatgttcttaattttgtcatccagatgaatgtgaaaat
tataagtgtaataactcatgtataagattaatttaggattgtggtcatgcctgttagtag
aaatgttttgaaaaatgtaaatgcacttctcgtgtttataaaactttgctatgcggtcat
caaaagctttgcttttgcgcaagtgatattaaaaatgaaaaatgcgaaacagatgtttag
attatacttagatgtggccactaaaaataagtaaaatgctatgaagcaaatttaaatacc
cattaatgtgatgaattaattcaaataagacttttgtgtggtcacttaaaagaagttaag
tgtttttaaagaaactaaagtaaccattaatgtttaacttagatagaacatacattacct
tgctctcactaaattgtcattaaatgctgtgataaaaataaataatattagtgctaaaaa
gaagtttcatttttttgtcctaattgcaacatatctatttaaaaaaaaaagtgcttttaa
aattcaacaaatgctaattgtacatttttggtaaaaaaactcctcaaatgcaatcattat
aaagaaattccttgtaatatgaaacctgaagatgctaagtgcgaataggaggtgtaaaaa
ttgttaaattgtgggcattagaatcttttaaagtgcttctaagatccaagtaaagaaaat
aagtgttcagctttagtctaaaagtcattaaaatgtaatcattagtttataatgtaatgc
tgtgaaagccctgataattttatatgctaggcaaaaacttaaaaacaattaaagtgtggc
cattttatagaagcttaatgctcagagtctgttgaaaatgttgtctgcaaaatcttagtt
aatagggaattataatgtgggcattatgcataaaatataccatgtaacgaaatataaaat
ggatcatatcaatgtaaagagtaatctagaaaatatttacaatgtgggcatatattgtta
tatacatgctatcaaaaagataaagctcgttaatgtgataaacttatttaactataaaaa
agctgttgtagcttaatatataatgtgagttgtccagattatttaaaaaagtagtatgtg
atccctcaatgcaattgttctaagcaatttatattttgtccccataatgtgaatggtttt
aggaaagaaaatttatgcaatcaaaaatgtggggttattttagagtgtggtcatatgtgt
taatcaacctgtgaataatgtgcatttggtcttcttcataagccatgtaagtaagaagtt
gttattgaatatatttgtggacacaaaaaatctaaggagtgtggctaagatcctgaattt
tgtgaagagcagtgttaaatataagaatgcattcataaaaaaaaaaaatgtttaaaaaaa
tgtttagaaaagtgttcactttaaataaccaaatcttcttgcaaataatgtgaaaataaa
gatattcatgaactaagctgtggacataaattttaaaatttagatgaaatattttcataa
cagttttaataaaatcctctaagattacctgagtgctaaatctgtaaattaccaataaat
gttttgaaatataaaattagtttaaaagacattaaagtaaattaatacttttttgctaaa
ggaataaaaaacataatgaaaaaaattattgaagatttcaaaatttcagatgaagaaatg
aaaatcttatctaatgagtataaagcctttgaaaatttttccaacttctttgataaattt
agactgtgtcatttatatcagtcgataaaatatttaaaataatttgaaaaagatttttaa
gatatagaaaattaggatacgaacacacaaaaaattttaaatacaattaagttgtaagtt
gaaattctttaaaatacatatttaaagtaaaattaggtaaagctaagcattgatcatgtt
agaaaatttgttaattcgatcatttatttaaaaggaatgtacaattatttctacaaaaaa
ttagatattaaatttgaatagctgaaggagtttagaactttttagatgccagaagaactt
aaatataatatcgtagtttactaggtttttgaatatgaaaaattaatataacttcatttg
atcacaagaaacatatggtgttagcctattttaatgcccattcttatgtcgatatgccca
aattaacatatttgctagtaagagaatactaaatgttagctttaaatatgtggtcaaaaa
acagatttataagaattttattacatcgtatcctcctaatga
DBGET
integrated database retrieval system