Thioploca ingrica: THII_1664
Help
Entry
THII_1664 CDS
T03616
Name
(GenBank) ABC transporter, transmembrane region
Organism
tig
Thioploca ingrica
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_tran
ABC_membrane
SMC_N
AAA_16
AAA_29
AAA_28
AAA_25
AAA_22
DEAD
SbcC_Walker_B
DUF5917
RsgA_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BAP55961
UniProt:
A0A090BUZ4
LinkDB
All DBs
Position
2003442..2005295
Genome browser
AA seq
617 aa
AA seq
DB search
MNMLKNSEKVKLFTSTVQTATHLPHHRGYSWQQIINIAMQHKREIILAHLIAVLTTLLSI
PIPLLMPLLVDEVLLNQPATLVNTINGIFPSSWHGPFFTVVVITLVTIWLRLMVLGTGVW
QMRQFTVIAKEVVYCIRQELINRLQRVSMVEYETLGSGQVISHLVTDLDTLDKFIGVSIS
RVMIAALSIIGTAIILFWMHWQLALLIVIINPMVVYLTTFLGRKVKELKRKENEAYSMFQ
QSLTETLEAIQQIRACNREDYYLGRVIDTARQIKNHAIAYAWKSDAAGRFSFSVFLFGFE
MFRAISMFMVLFSDLSIGQMFAVFGYLWFMFGPMQELIDIQYSYHSANAALQRVNRLFSL
SWEPHYPHLMNPFKEQPTTSIRLQEVCFSYNQQDWVLNRVSLNIQAGEKVALVGASGGGK
TTLVHVLLGLYVPQSGNIYFNNIPITQIGMDVVREHVVTVLQHPALFNDTLRMNLTLGRP
LADEQIWQALEIAQLSETVNSLETGLDTLLGQRGVRLSGGQRQRVAIARMILANPKIVIL
DEATSALDTDTEAKLHTALSQFLRDKTTIIIAHRLSAVKQAQRVLVFDEGQIIEEGYHDH
LIRENGLYAKLYGGQVH
NT seq
1854 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatatgctgaaaaatagtgaaaaagttaaattatttacctcaacagtccagacagca
actcacttacctcatcatcgcggttacagttggcagcaaattattaatattgctatgcag
cacaagcgggaaattatcctagctcacttgattgcggtattaacgactttattaagtata
ccgattccactcctcatgccgttactggtagacgaagtattgcttaatcaaccggcgact
ttagtcaacactattaatgggatttttccatcgtcatggcacgggcctttttttacggtg
gtggttattaccttggttactatttggttgcgtttaatggtattaggtaccggggtttgg
caaatgcgccaattcaccgtgattgctaaagaagtagtttattgtattcgccaagagtta
attaaccgcttacaaagggtgtcgatggttgaatatgagaccttagggagtgggcaagtt
atttctcatttagtaactgatttagacacgttggataaatttattggggtgagtattagt
cgagtgatgattgcggctttaagcattattgggacagctattattttattctggatgcat
tggcaactcgcattattgattgtaatcattaatcccatggtggtttatttaaccaccttt
ttaggtcgcaaggtaaaagaattaaaacgcaaagaaaatgaagcctatagtatgtttcaa
caaagtttaactgaaactctagaagcgattcaacaaattcgagcttgtaaccgtgaagac
tattatttaggacgcgttattgatacggctaggcaaattaaaaatcatgctattgcttac
gcttggaaaagcgacgccgctgggcgtttttcttttagtgtatttctatttggttttgag
atgtttcgtgctatcagtatgtttatggtgctgttttccgacttaagcattgggcaaatg
tttgctgtattcggctacctgtggtttatgtttggaccaatgcaggaactgattgatatt
caatatagttatcatagtgccaatgcggctttgcaacgggtcaaccggctcttttccctc
tcgtgggaacctcattatccccatttaatgaatccgtttaaagaacaaccaaccacttca
attcggttacaagaggtttgtttttcctataatcaacaagactgggtattgaatcgggta
tcacttaatattcaagcaggagaaaaagttgctttagttggagccagtgggggtggtaaa
accactttagtacatgtactactcggtttatacgttccgcagtcaggaaatatctatttt
aataatatacccatcactcaaattgggatggatgtggtacgagaacatgtcgttacggta
ttacaacatccggctttatttaatgatacgttgcgcatgaatttaactttaggacgccct
ttagccgatgaacaaatttggcaagcattagaaattgcacaactgagtgaaacagttaat
agcctagaaaccggtttagatactttattaggacaacggggagtccgtctgtctggtgga
caacgccaacgtgtggcaatcgctaggatgatcctcgctaatcctaaaatcgtcatttta
gatgaagcgacttctgccttggatacggataccgaagctaaactacatacggctctcagc
caatttttgcgagacaaaaccacaattattattgcccaccgactgagtgcagttaagcaa
gcccaacgggtattggtttttgatgaaggacaaattattgaagaaggatatcatgatcat
ctcattcgggaaaacggattatacgctaaattgtatggtggacaggtacattaa
DBGET
integrated database retrieval system