KEGG   Thamnophis sirtalis (common garter snake): 106544700
Entry
106544700         CDS       T06107                                 
Symbol
COL1A1
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(I) chain
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
tsr  Thamnophis sirtalis (common garter snake)
Pathway
tsr04510  Focal adhesion
tsr04512  ECM-receptor interaction
tsr04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:tsr00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    106544700 (COL1A1)
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    106544700 (COL1A1)
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    106544700 (COL1A1)
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:tsr00536]
    106544700 (COL1A1)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:tsr00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   106544700 (COL1A1)
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC CFC
Other DBs
NCBI-GeneID: 106544700
NCBI-ProteinID: XP_013916526
UniProt: A0A6I9XRZ8
LinkDB
Position
Unknown
AA seq 1454 aa
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NT seq 4365 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system