Triticum urartu (red wild einkorn wheat): 125544098
Help
Entry
125544098 CDS
T08232
Name
(RefSeq) putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g09950
Organism
tua
Triticum urartu (red wild einkorn wheat)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR_2
PPR
DYW_deaminase
PPR_1
PPR_3
E_motif
Eplus_motif
PPR_long
RNPP_C
ECSIT_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
125544098
NCBI-ProteinID:
XP_048563620
LinkDB
All DBs
Position
3:397597015..397601199
Genome browser
AA seq
1057 aa
AA seq
DB search
MNRKLPPFPHLTLRFSSSSSASPSPPPPRRLPPPVPLRDLLAHRLPLLHSPAPPPRSSPP
VHPHADLLLRRRSGEATPESLHLELVKRGLTNDLFLSNHLVNSYAKSSRLACARQVFDCM
LERNAVSWTCLVSGYVLSGITDEAFRVFRAMLGVGSECSRPTSFTFGSVLRACQDAGPDK
LGFAVQVHGLVSKTVYALNTTVCNALISMYGNCSVGLPIQAQQVFDSTPVRDIITWNALM
SVYAKKGHVVSTFTLFTAMLRDDSAIELRPNEHTFGSLITATTVSSCSSRVLEQVFARVL
NSGSSSDLYVGSALVSAFARHGMLDEAKNIFLSLKERNAVTLNGLIVGLVKQHCSEEAVG
IFMGIRDSVVVNADTYVVLLGAIAEFSVPEDGLMKGTELHGHVLRTGLIDLKIAISNSLV
NMYAKCGAIDKACRVFQSLCTRDRVSWNTIISVLDQNGYCEGAMMKYCMMRQDCISPSNF
AAISGLSSCASLRLLSVGQQVHCDAVKWGLDLDTSVSNALVKMYGECGARSECWEVFNSM
AQHDVVSWNSIMGVMANLRAPIAESVEVFSKMMRSGLAPNKVTFVNLLATLSPLCVLELG
KQVHAVVLKHVAIEDTAVDNALMSCYAKSGDMDSCEQLFSEISGRRDAVSWNSMISGYIY
NGHLQEAIDCVWLMMHSDQVMDCCTFSIVLNACASVAALERGMEMHAFGIRSQLESDVVV
ESALVDMYSKCGKIGYASKVFSSMSQKNEFSWNSMISGYARHGLGRKALEIFEEMQQSGA
NPDHVTFISVLSACSHAGLVDRGLEYFEMMEDHGILPQIEHYSCVIDLLGRAGKLIKIRE
YIRRMPMKPNTLIWRTVLVACRQSKDRDKIDMGLEASRMLLELEPQNPVNYVLASNFYAA
TGRWEDTAKTRAAMGGAAVKKEAGRSWVTLGDGVHTFIAGDRSHPNTKEIYEKLSVLIQK
IRNAGYVPMTEFALYDLEEENKEELLNYHSEKLAVAFVLTRSSSGVPIRIMKNLRVCGDC
HTAFRYISHAIGRQIILRDAIRFHHFEDGKCSCGDYW
NT seq
3174 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaccgcaaactcccgccgttcccccacctcacactccgcttctcctcctccagctcc
gcatcgccttccccgccgccgcctcgccgcctcccacctccagtgccactacgtgacctc
ctcgcccaccgtctcccacttctgcattcgcccgcccctcctcctcgatcgtcaccgccg
gtgcaccctcacgctgacctcctcctccgtcgccgcagcggagaggctacaccggagagc
ctccaccttgagctcgtgaagcgagggctcaccaatgacctcttcctctcaaaccatctc
gttaattcctacgctaaaagctcgcgtctggcctgcgcgcgccaggtgttcgactgtatg
ctggaacggaacgccgtttcctggacctgcctggtatctgggtacgtgctgtcagggatc
accgatgaggccttccgggtgttccgcgcaatgctgggggtcggttccgagtgcagcagg
cccacgtcatttaccttcgggagcgtgctccgggcgtgccaggatgctggaccagacaag
ttgggatttgcggtgcaggtccatggattggtatcaaagactgtgtatgcattgaataca
acggtgtgcaacgccttgatctcgatgtacggtaattgctctgttggtctgcccatccaa
gcgcagcaggtgtttgattccacaccagtcagggacatcatcacgtggaatgccttgatg
tctgtctatgctaagaaagggcatgtggtttcgacatttaccttgttcacggcaatgttg
cgtgatgactcagcaattgagttgagaccaaacgagcatacttttgggagcttaatcact
gcgacaactgtgtcctcctgcagctcaagagtgcttgagcaagtgtttgcaagggtgctc
aattcgggcagctcaagtgacctctatgtggggagcgctcttgttagtgcattcgcgaga
catggcatgcttgatgaagctaagaacatttttctcagtttgaaagagagaaatgcagtt
accttgaatggtttgatcgtgggcttggttaagcagcactgcagtgaagaagcagttggg
attttcatggggattagggattcagttgttgtcaatgcagacacatatgttgtgttgctc
ggtgcgatagcggagttttctgtaccagaagatgggttgatgaaaggtacggaactccat
gggcatgttcttagaactggacttattgatttgaaaattgctatcagtaatagtctggtt
aatatgtacgccaaatgtggtgccattgataaagcctgtagagttttccagtcgctttgt
acaagggatcgggtttcctggaacaccattatctcagttcttgatcagaatggttactgt
gaaggtgcaatgatgaagtactgcatgatgagacaagattgtataagtccgtcaaacttt
gcagcaattagtggcttgagttcatgtgcaagtttgagacttttgtctgtgggccagcaa
gtgcattgtgatgctgtaaagtggggactggatttagacacctctgtttcaaatgcactg
gttaaaatgtatggagaatgtggagctaggtctgagtgctgggaagttttcaactctatg
gctcaacatgatgtagtttcctggaactctatcatgggtgtcatggccaatttgcgagca
cctattgctgaatcggtagaagttttctccaaaatgatgaggagtgggctggccccaaat
aaagttacattcgttaacttattggctacattgtcgccattgtgtgtgcttgaattggga
aagcaggttcatgctgtggtgctaaagcatgtagctatagaagatactgcagttgataat
gctctaatgtcctgttatgctaagtcaggagacatggattcttgtgagcagctgttttcg
gaaatttctggcagaagggatgctgtctcatggaattcaatgatttcagggtacatctac
aatggccatttgcaggaggctatagactgtgtttggcttatgatgcacagtgaccaagtg
atggattgctgcaccttctccattgtactgaatgcatgtgcctctgtggcagcgttagag
cgtggaatggagatgcacgcttttggtattaggtcacagctcgagtctgatgttgtggtt
gagagtgctcttgttgatatgtactcaaagtgtggaaagataggctatgcctcaaaggtg
ttcagttccatgagtcagaaaaatgagttctcatggaactctatgatttctggttatgca
agacatggtcttggaagaaaagctttggagatatttgaagaaatgcagcaaagtggagca
aatccagaccatgtcacatttataagtgttctatctgcctgtagtcatgctggattggta
gacagaggtctagagtactttgaaatgatggaggaccatggtatattacctcagattgaa
cattattcttgtgttatagaccttcttggtcgagctggcaagctcatcaagatacgagaa
tacatcagaagaatgccaatgaaaccaaatactctcatatggaggactgtattagttgct
tgtcgacaatcgaaggacagggacaagatagatatggggctagaagcttcaaggatgctt
ttggaactagaacctcaaaatcctgtaaactatgttcttgcatctaacttttatgcagca
acaggaaggtgggaagatacagccaaaacccgagctgcaatggggggagcagcagtgaaa
aaagaggctggtcgcagttgggtaaccctaggtgatggggttcatacctttattgctgga
gatagatcacatccgaacaccaaagaaatatatgaaaagctgagtgttttgattcagaag
ataaggaatgctggttatgttccaatgacagagtttgccctgtatgatcttgaagaagag
aacaaagaggaattgctaaattatcatagtgaaaagcttgcagttgcctttgttttgact
cgctcctcctcaggtgtccccataagaatcatgaagaaccttcgggtttgtggagattgt
cacacggcatttagatacatatctcacgctattggccggcaaatcattttaagggatgcc
atccgattccaccattttgaggatggtaagtgttcttgtggggattactggtag
DBGET
integrated database retrieval system
