Tripterygium wilfordii (thunder duke vine): 119998658
Help
Entry
119998658 CDS
T07256
Name
(RefSeq) E3 ubiquitin-protein ligase PRT6-like isoform X1
Organism
twl
Tripterygium wilfordii (thunder duke vine)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PRT6_C
zf-UBR
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
119998658
NCBI-ProteinID:
XP_038701922
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(8715735..8751734)
Genome browser
AA seq
2066 aa
AA seq
DB search
MDIDSPPERSNLRPLDRIVGRLALLGVPGEYLGMLQEGIVAFAIRNPSRIPELVTTILPA
DEEVVEVLQAKAGSKKTSVDPTMKNIFRESLVWLQWLMFKGEPLKVLKNLSKMSAGRGVC
GAVWGNNDIAYKCLTCENDPTCAICAPCFQNGNHKDHDYSIIYTNGGCCDCGDVTAWKRV
GFCSKHKGAEQMQPLPEEIANSVGPVLDVLLSCWKDRLISAENSMASDRAVLYKKYANEV
TFAMVETLLEFCMYSESLLSFVSKRVISSAGLLDILVRAERFLSEIVMRKLHELLLKLLG
EPIFKYEFAKAFLTYYPFIVNEAIKESGDVFLWKYPLLSSLSVQIFTVPTLTPRLVKEMN
LLGILLGSLASIFVSCTGQDGHLQVSKWGNLYEATIRVVEDIRFVMSHSVVPKYVTYMQR
DVLRTWMSILAFVQSMNPLKRETGLHIEEESGHANLPFGLRHSIGNIHSLLVDGAFSDVI
SEETDDVLFGTCEPDVDDGDRLRHAKVGRLSQESSVCSASGRISAFASGSMVTAFEANSF
FHRLIPSSVTWLTFECLRAIENWLGVDNTLGSLSNVSSPNSRSISGGNFLALKKTLFNIR
KGKYIFGRFTSLGDGNSRPYFSPWLSSLQTHAETENLRSIECGESDSYVHGSAVSDHNAM
EVDCEREVDALHFLSFSEWPNIIYDVSSQDVSINIPLHRFLSMLLQRALRRCYGESTMPD
ITSACSTNQSSAVYSDFFKYVLGGCHPYGLSAFIMEHPLRNRVFCAQFHAGMWRKNGAAA
VLSYDWYRSVRWSEQGLELDLFLLQCCAALAPIDLFVSRIVERFGLSDYLSLNVERPSEY
EPVLVQEMLTLIIQIVQERRFSGLTKAENVKRELILKLAIGDATRSQLVKSLPCDLSKFE
KFQEILDTVAAYSNPSGINQGMYSLRWVYWKELDLYHPRWNSRDLQFAEERYTRFCSVSA
FTTQLPRWTKIFPPLNGVARVATCRTVFKIVHAVLFYAILSDKLSEKRVPDSVLLTALHL
LSLALDICIQQKESIEKPSYIQDSAPILALACEDTCNGLNSCNGDQSLLSLLVSLMRMHN
KENVSNLLEAGNCNLSALVESLLKKFAEIDTGCLTKLQQLAPEIVIHLSKTVLSEEKAML
TSASDSEKRKARARERQATILEKMRAEQSKFLSCMNSSEDDGSTSETEASNSDVGQDLEK
SGQDVCSLCHNTNSRSPLSFLVLLQKSRLLSFVDIGPPLWDQVFGSDKEHVVVTTNRMSD
QKTINRVIDNSGINFLSSELGMISSAQLAQFVEYSINEFSAYGHPEEVIAILEYVKAVFP
NVGNIQVPCLSNDERDRGIDTLDTLEQNTYVSIRRNMCDSMLNETLPAAEHGGLGVSKNA
DSVLVGKYMAALSGEMTEYPSASENAQNDMVPVESTLEVRAYDGFGPGDCDGIVMSSCGH
AVHQGCLDSYLSSVRERYVRRIVFEGGHIVDPDQGEFLCPVCRRLANSVLPAFPGDFRKV
LKQPMLSTVDSSIVLGLSATSVEENETLLLRQALSLLQSAAIVVDQGEILKAFPQKKSEK
MEPNIERVSRLLVKMYFQNKYDKFSGSSRVSHSMILWDTLKYSLICLEIAARCGKTSLSP
AYGIDSLYKELKSSSGFVLSLLLRIVQSLRSQNFLHVLQRFRGIQLFADSICSGILRDYP
DRKFGRGGRMLSILKYPEDVLLPDVQFWDCASEPILAQDPFSSLMWVIFCLPCPFISCED
SLLSLVHMFYAVSVAQAIITYCARYPDKISAEVFRDCLIADISKALGESRWVQQYFVSNY
IDSGYDVADTIRKLSFPFLRRCALLWKLLKSSVSAPFCESDYAADGFCHDIIEKTESTAG
ELVDLNKVKELEKMFKFPPLNAILKDEMLRSLVKNWLNHLRSECEDYGFQFVLHCTPAVP
FKLMRLPHLYQDLLERYVKQCCSDCKSVLDEPALCLFCGRLCSRNLKPCCRKSGCQTHAK
SCGAGTGVFLLIRRTTILLLRSARQSPWPSPYLDAFGEEDIEMQRGKPLYLNEERYAALT
HMVASHGLDQSSKVLGQTTIGTFFLD
NT seq
6201 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatatagattcgcctccagaacggagcaatctcaggcctcttgatcgaattgtaggg
aggcttgctctccttggagttcctggtgagtatcttggaatgctccaagaggggatagtt
gcttttgccattaggaacccttcccgcataccagagctggtaaccaccatcttacctgct
gatgaggaagtggtggaggtactccaagctaaggcagggtctaagaaaacttcagttgat
cctaccatgaaaaatatattcagggaaagccttgtttggctgcagtggctgatgtttaag
ggtgaacctcttaaagtgttgaagaatctttctaaaatgagtgccgggcgtggcgtttgt
ggtgctgtttgggggaataatgatatagcctacaagtgtcttacatgtgaaaatgatcca
acatgtgcaatctgtgctccgtgctttcaaaatgggaaccacaaggaccatgattattct
attatttacacaaatggtggttgctgtgattgtggtgatgtcacagcgtggaaacgtgtg
ggattctgctcaaagcataaaggtgcggagcagatgcaaccacttccggaagagattgcc
aactccgtgggtcccgtccttgacgtccttctttcctgctggaaagacaggctaatttct
gcggaaaattctatggcaagtgaccgtgccgttttatataaaaagtatgcaaatgaggta
acctttgcaatggttgagacgcttttagaattttgcatgtatagtgagagtttgcttagt
tttgtttccaagagggtgatctcatcggctggtttattggatattctggtgagggcagag
aggttcttgagtgaaattgttatgaggaagcttcacgagcttctcttgaaattgcttgga
gaacctattttcaagtatgagtttgctaaagcatttttaacatactatcccttcattgtc
aatgaagccattaaagaaagcggcgatgtttttctttggaagtatcctctgctatctagt
ttatctgtgcaaatcttcacagtgcccacccttaccccacgtctggtgaaggagatgaac
ctgctgggcattctattgggatccttggctagcatttttgtttcttgtacaggacaagat
ggccacttacaggtttctaaatggggaaatttatatgaggccaccattcgagtggttgaa
gacattcggtttgttatgagccactctgtagtgcccaaatatgtaacttatatgcagcga
gacgtcttgagaacatggatgagcattttggcctttgtgcaaagcatgaaccctttaaaa
agagaaactggccttcatatagaagaagaaagtggccatgcaaatttgccttttggttta
aggcattctattggaaacattcattctcttttggtggatggagcattttctgacgttatc
agtgaagagacggatgatgttttatttggcacatgtgaaccagatgttgatgatggagat
cgcctgaggcatgcaaaagtaggacggctgtctcaggaaagttctgtatgcagtgcaagt
gggaggatcagtgccttcgcttctggttcaatggttactgcatttgaagctaattcattt
tttcatcgtctaattccttcgtctgtaacttggttgacctttgagtgcttgagggccatt
gagaactggctgggagttgataatacattgggttctctatccaatgtgtcatctccaaat
tctaggagcatctctggtggcaattttctagcattgaagaaaacattatttaatataaga
aaggggaaatatatatttggtagatttacaagtttgggtgatggtaatagtaggccatat
ttttcaccatggcttagcagtttgcagacacatgcggagacagaaaatttgagaagtatc
gagtgcggtgagagtgattcatatgtccatggttctgcagtttctgatcacaatgcaatg
gaagtagattgtgagagagaagtagatgccttacattttttgagtttttctgagtggcca
aacataatttatgatgttagttcacaagatgtatctattaacatcccattacatcgattt
ctttccatgcttttacaaagagcgttgagaaggtgttatggtgagtctacaatgccagat
ataactagtgcttgctctacaaatcaatcatcagcagtctatagtgacttttttaaatat
gtgcttgggggttgccacccatacggattatctgcttttattatggagcatccgttacgg
aaccgggtattttgtgctcaatttcatgctggaatgtggaggaaaaatggggctgctgct
gttctatcttatgactggtacagatcagtgcgctggtcagaacagggcttagagcttgat
ctattccttctgcagtgctgtgctgcattggcaccaatcgatcttttcgtcagtagaatt
gtggaacgatttggactgtcagattatctttctctgaatgtggaacgacccagcgagtat
gaaccagttttagtgcaggagatgctgactctaattatacagattgttcaagaacggcga
ttttctggcctaacaaaagctgaaaatgtgaaaagagagttgattcttaaattagccatc
ggagatgccacccgcagtcaactggtgaaatccttgccttgtgatttatccaagtttgag
aagttccaggagattttggatactgttgcagcctactctaatccatctggcattaatcag
ggaatgtattcattgcggtgggtatactggaaagaactagatctgtaccatcctcgttgg
aactcaagggatctgcaattcgcagaagaaagatatacacgcttctgtagtgtatctgca
ttcactactcagctgccaaggtggacaaagatatttcctcctctcaatggtgtagctaga
gtagcaacttgtagaacagtcttcaaaattgttcatgctgtgttattctatgctattttg
agtgataaattaagtgagaagcgtgttcctgatagtgttcttctgactgcattgcacttg
ctctcattggctttagacatatgtattcagcagaaggaatcaatcgagaagccgtcttat
attcaggattcagctccaattcttgctttagcttgtgaagacacttgtaacggattgaat
tcttgtaatggggaccaaagtctgttgtcacttcttgtttcattaatgaggatgcacaat
aaagaaaatgtgtcgaatcttttggaagcaggaaattgtaacctttctgctctagttgaa
agtttgttgaagaagtttgcggagattgatacgggatgcctgaccaaactgcagcaactt
gcgcctgaaatagtgattcatttatcaaaaactgttttgagcgaggaaaaagctatgttg
acatcagcttctgatagtgagaaacgaaaggctagagctcgagaaaggcaggctacaata
ttggaaaaaatgagagctgaacagtccaaattcttgtcatgcatgaattcctctgaagat
gatggttctacttctgaaacagaagcaagtaactctgatgttggacaagatttggaaaaa
tctgggcaagatgtatgttctctttgccataatacgaattccagaagtcctttatctttc
ctggttcttctacagaaatctaggcttctgagctttgttgacataggtcccccgttgtgg
gatcaagtttttggttcagacaaggagcatgtcgttgtaactactaacagaatgtccgat
caaaaaactattaacagggtgattgataactctggaataaattttttgtcaagtgagttg
ggaatgatttcgtctgctcagttggcacagtttgtagagtattccatcaatgaattttcc
gcttatggtcatcctgaggaagtaattgctattcttgaatatgtcaaggccgtgtttcct
aatgttggaaacattcaggtgccatgcttgtctaatgatgaaagggatagaggcatagat
acccttgacacactggaacaaaatacatatgtttccatccgtagaaatatgtgtgatagc
atgctgaatgagacacttcctgcggctgagcatggtggtctgggagtaagcaagaatgct
gattctgttttagttggaaaatatatggctgctctttctggagagatgacagaatatcct
tcagcttctgaaaatgctcaaaatgatatggtgccagtagaatctaccttggaggttcga
gcatatgatggatttggtcctggagattgtgatgggattgttatgtcgtcctgtgggcat
gctgtccatcaaggatgtcttgatagttatttgtcctcggtgagggaaagatatgtcaga
agaattgtctttgaaggagggcatattgtggatccagatcagggggagtttctctgccct
gtatgtcgtcgactggcaaattctgttttgcctgcctttcctggggatttccgcaaggtc
ttgaagcagcctatgctttcaactgttgactcatccattgttctaggcttgtcagctaca
tcagttgaggaaaatgaaaccctattgcttcgtcaagctttgtcactcttacaatctgct
gccatagtggttgaccagggtgaaattttgaaagcttttccacagaaaaaaagtgaaaag
atggagcccaatatcgaacgtgtctctcgcctccttgtcaaaatgtattttcaaaacaaa
tatgacaaattttcaggttcttcaagggtaagccactcaatgattttgtgggacacattg
aaatactctcttatttgtttggagattgctgctcgttgtggaaagactagtctgagtcca
gcctatggcattgattccttgtacaaggaactcaaatcttctagcgggtttgtattatcg
ctgttactcagaattgtccaaagccttaggagtcagaattttctccatgtgcttcaaagg
tttagaggaattcagctgtttgcagactctatttgctcaggcattttgcgggattatcct
gatcggaaatttgggcgaggaggtaggatgttatctatcttaaagtatccggaggatgta
ttacttcctgatgtacagttctgggattgtgcgtcagaacctatccttgctcaagatcca
ttttcgtcattgatgtgggttatcttttgtcttccatgcccttttatatcatgtgaggac
tcattattatcccttgtgcacatgttttatgctgtctctgtagctcaggccataataaca
tattgtgcaagatatccagacaagattagtgcagaagtttttcgtgattgcctgattgct
gacatttccaaagctttgggagaatccagatgggttcagcagtattttgtttcaaattat
attgattctggttacgatgttgccgacactattcgaaaattgagtttccctttcttacgg
aggtgtgcgttgctgtggaaattactgaagtcttctgtctcagcaccattctgtgagagt
gattatgctgcagatggattttgtcacgacattattgagaaaacagagagcacggctggt
gagttggtggatcttaataaggttaaggagctggagaagatgtttaagtttcccccattg
aatgctattctcaaggatgaaatgctacggtccttggttaaaaattggttaaatcatttg
cgcagtgagtgtgaggattatggttttcaatttgttctacattgcacacctgcagttcca
ttcaagttaatgcgccttcctcatctttaccaggacctattggaaaggtatgtaaaacaa
tgttgctctgactgcaaatctgttcttgatgagcctgcattatgcctgttctgtggtaga
ttgtgctcacgaaacttgaagccctgctgcaggaaaagtggatgccaaactcatgcaaag
tcttgtggtgccggaactggtgtgtttcttttgataaggagaactacaattcttctacta
aggtctgcccgtcagtctccttggccgtcaccctacttagatgcatttggtgaagaggac
atcgaaatgcagcgcggaaagccactttacctgaacgaagagcgttatgcagctctaaca
catatggttgcttctcatggccttgaccaaagctcaaaggttcttggtcaaacaaccatt
ggtactttctttctggattag
DBGET
integrated database retrieval system
