Vagococcus carniphilus: H9L18_08505
Help
Entry
H9L18_08505 CDS
T06797
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 13 protein
Organism
vcp
Vagococcus carniphilus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
DUF5696
Malt_amylase_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QNN71933
LinkDB
All DBs
Position
complement(1729639..1731426)
Genome browser
AA seq
595 aa
AA seq
DB search
MNSTVNFNIKVDSEEYIKSVALIVKKQGEKVEIEECSMKPYETNKYKYHYQVSKGSGLYL
YCFKITAINHEGQEFCLYYGKSKDSGEGYQYVNEASIRWYQLTCYEENDQAPDWYQQGIF
YQIFPDRFFNGNENKTINSPKPNTFIYGTENDLPMYIKDESGDIKRWDFYGGNLKGIKNK
IPYFNQLGVTGLYLNPIFEANSNHRYDTNDYFNIDPVLGTNEEFKELVDALHENGIRIIL
DGVFSHVGRNSQYFNYSGLFGDHEGAYRNPHSKYRDWFTFLHYPDEYESWWGIADLPEIN
KHNKSYQDFIYGKSGSVLSFWQRYNIDGWRLDVADELPNFFLEGIRKNINQTDGKVLIGE
VWEDASNKVAYGESKEYASHPVLHGVMNYPLREQILDLVNERKTIQHVAREMLEMKENYP
DYFYYNLFNNIGTHDTKRILSECDGSFQKVALAFALLFMTPGVPCIYYGDEVGLYGEKDP
DNRRFYPWETPNKELMKVCQNWATIRRSHDSLLTGECHFLYHTKDNLFAIYRFTQGEESI
CFFNFSNFEKDLSIDNWLCDELDPVVVTEIIKRFDVPRLTISKRHHLFLVKQLLK
NT seq
1788 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaattcaaccgtaaattttaatattaaagttgattcagaggaatacattaagtctgta
gcgttaattgtgaaaaaacaaggggaaaaagttgaaattgaagaatgctccatgaagcca
tatgaaaccaataaatataaataccactaccaagtatcaaaaggtagtggtttgtatttg
tattgttttaaaattacggcaattaatcatgaaggacaagagttttgtttgtattacgga
aaaagtaaagacagtggtgaaggatatcaatatgtcaatgaagctagcattaggtggtat
caattaacttgctatgaagaaaatgaccaagcacctgattggtatcaacaaggcattttt
tatcaaatatttccagatcgattttttaatgggaatgaaaataaaacaatcaactcacct
aaaccgaatacgtttatttatggaactgaaaatgatttacctatgtatatcaaagatgaa
tcaggtgatataaagagatgggatttctatggtggtaatttaaaagggattaagaataag
attccttatttcaatcaattaggagtaacaggtctttacttaaaccctatttttgaagct
aacagtaatcatcgttacgacacaaatgactattttaatattgatccagttcttggaacg
aatgaagaattcaaagaattagttgatgcacttcatgaaaacggtattcgtattatttta
gatggtgttttttctcatgtcggtcgaaatagtcagtatttcaattattcagggcttttt
ggtgatcatgaaggagcttatcgcaatccgcactctaaatatcgagattggttcactttt
ttacattaccctgatgagtacgagtcttggtggggaatagcagatttaccagaaataaat
aagcataataagagctatcaagattttatatatggtaaatcaggcagtgttttaagcttc
tggcaaagatataacattgatggttggcgtttagatgtagccgatgaattgcctaatttc
tttttggaaggcattagaaaaaatattaatcaaacagacgggaaagtgttaattggtgaa
gtctgggaagatgcttctaacaaagttgcgtatggagagagtaaagagtatgcctctcat
ccagttctacatggggtgatgaattatccgttgcgagaacagatcttggatttagttaac
gaaagaaaaacaatccaacatgtcgctagagagatgttagagatgaaagagaattatccg
gattatttctattataatctttttaacaatatcggaactcatgatacaaagagaatatta
agcgagtgtgatggttcgtttcaaaaagtagcattagcatttgctttacttttcatgact
cctggagtgccctgtatttattacggggatgaagttgggttatacggtgagaaagatcca
gataatcgccgattttacccttgggaaactcctaacaaagaattaatgaaagtttgtcaa
aattgggcaactattagaagaagtcatgattcgttactaacaggtgagtgtcacttttta
tatcataccaaagataatctttttgctatttatcgttttacccaaggagaagaaagtatt
tgcttctttaattttagtaactttgaaaaagatttaagtattgataattggttgtgcgat
gagttagatccagtagttgtaacagagattattaaacgatttgatgtccctcgtttaact
atttcaaagcgccaccatttgtttttagtaaaacaacttttaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
