Viruses: 30854098
Help
Entry
30854098 CDS
T40000
Symbol
BWT79_gp1
Name
(RefSeq) Shahe picorna-like virus 7; hypothetical protein
Virus
1923450
Shahe picorna-like virus 7
Taxonomy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Vog
Vog cluster
Motif
Pfam:
RdRP_1
CRPV_capsid
RNA_helicase
Dicistro_VP4
IBD
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
30854098
NCBI-ProteinID:
YP_009336768
RS:
NC_032871
UniProt:
A0A1L3KJ69
LinkDB
All DBs
Position
NC_032871:975..9914
Genome browser
AA seq
2979 aa
AA seq
DB search
MNPLNIEDEDVWVFPTSQIGDRLYYEDENYDWVLDDPRLWNPEMGPARVIDLMHPYCWNL
SLSTDIVDNHIWTWNYDGSPPMGRLPCGCAMYRVNPISPARFYAVYTIHYPYCEYMDWIS
DDTYITQYDRVDRQLEEDQEYYDHFFRNQSEEIENDEIPEKVGTSDIKYGKTVYEHLSKA
RVMDAVKATSTLTARIKKRAKRLTFQGFKNQSNKSYDMRDTHLTPAEISGIETIMAPIWK
KYESFTMSDIGWTIYEYAMFFTNIWCTTNEYQLAVNLFGFAKIFKTSKFNFPPSITAAIG
MLDKEKKVPLSGPTNQALSLSSILDKCRALRLTLQGIETIPFIKMLTRVMTVASLIRWMP
KSIKCQSEWLEMAYSSWQDTIQKTYENPTSLLDLVLDTTSAAMDFVLCTMSDGMFASLQP
HSFASNVSTALARGRAYRTGTLETSHGITRAQFMRDTEAVLRVAKEYASTKANLGMHTLA
LRNLTDLKVLYAELLNDKSNSDLRVAPLAIAFTGESGCGKSIIVHETINLAGHIGGFSTE
DSDIHYVNTADAYDSGADSGKTVLVIDDMASEHPDISKYKGAVMIRYSNTIPQVTVQAEA
DKKGKIVFRHHFCAITSNVPDLNLQASMSFPQAGFNRCVLVEVSFNPKLERKKYYKNGKI
DWEALKRDGIEKEAQVFRFYHYETTNSTARVLSSFKQIFHNEGKYLNKEQFFEEFTRLLL
EKEKSGEEYLAAIAEVRKRKFCKKCVKYFDYCPCVETTVPKPVITELKSDVAQKILDDQA
VGLNSIPIVSTECTSVENELWNIYDIDEWIRQTLYFWLAIDNWQERFWIAIMPGIWAGRD
ASIRIWLTSLWRFIQTQLIRLYASVSSRLAFALWFYPWVVSLTLFVVSYPLSHYQCTTPV
FLGLYFDDDLCGVGGYLMQIITFLLFLSTVWMAVCALAIGTAIKSRAVDIFFNEISMERS
TFAISMLLGTVGVSWLAFKSYYALFNTAISTVANQGNLSPTTMEEIESRNAEKNMWIDKA
HFVHPEAEPTNHNATCDQIKKKISRNVVNVEIYDLEDKIKRVRTCGFYVCSDVLMINQHS
LQNFITIKNVFVSIRRASEDVGGFIKKVAVEEFYNIPNTDITFITTSKGPTYTNMRSYFL
AEHMKVDSFTPAMMLTRDKLGNMDERTFIWTSTDKAYNENRNQYHMGSFHRYDHPTHGGD
CGSIAFSTSRPYGLLGIHTAADTRTNVGVTFAVTQDMISDAINAMSKSFRLRNESAFNID
RPELPTMLYDNPFPAYDTNLHFRDCVNFIPVSVSQEPMIDIYGSISNMRVSRKSEVRDTM
LKEHLLIQGVPDEHGPPKFDTNRNHADGFQQSLEGIHALPADDIRWAIQDYTDELIAQMM
LLNYSCQPLTPYEAINGIRGHRFVKALNMNTSSGMGLPSPKRKHFIETLYPDHVVYVPED
YLQKELDNIENLLCSNQVPASVFVSALKDEPTDIGKDKVRVFQVATVAMNIKIREYLLPI
LAFLYANPLLSESAVGINCTNDEWESLNNFLFDFHPDNVLEGDFSKYDLRQSGQTIMAGG
TVFMKLAAALGYSPKDVEKVGLLMNSLSYKFMVWNGTLFATSNIMPSGSPITIALNTTTN
CLLHRTGWVQICRELSIPLVPFREVAHLMCMGDDSIGTSKHPAFNMKNLQAFFVQYNMPY
TDAHKSIVAKPFTTRLEARFCKRGFRSDERVGGVLAPLEIKSILKSLFHYMESKTPEEEI
VIMNVDGAMREFSRHDRETFERYAHIVRTAAEAAKISHMTKLLYYSYEDWGLIHLKNYRI
IDIGDNGLKPTGTGSDEDSESQAMATLNSSDDLWLRLCGSGRTERLIITNQSQNIQRQGS
VLIFEINKINASNYNNNNNANDVNIIYKTSPKDSVMNLEFNSNSSGWGAGVNTFRDSTWN
IASTSGGPQDFFQRPVKIFEYSWPINTTVFETVNPWEKYFGDPKVLERISHYKNLSADLK
IKILLNGSSFHYGQLLVSYQPLHNNDEIFTYNALHGNMLINLSQMPSVYVNACQGRGGEL
TLPFFCPKNAVNIPSKEWENLGRLHIASVAPLAHVNGSLEPITVTIFAMAENVDVSTPTG
CYVNYFENQCEFVNQSDEYVKPSALANNVAKAAGFLSQVPAISPFMLATQAAASATGQLL
ALFGMSKPRLVDKPVYVRYNIGMELAPTNVADPISVLALDAKKEINVDPRTVGLGPEDEM
AITPIAMRESLLTTFNWNSSMTPETHLFSMRITPMAGNKGSTSEYHMTPSAFVTLPFCYW
KGTMYVRFDFIGTPFHKGRVLFKWDPVTNLPENAGVYNTNYSAIMDINELTDKVFEIGWG
QEIPFLPNGGLLTLPNFSSTEYTERSLNCNGVLSCYVVNELTCPSDELTEVTIRVSTWMG
DDFEVAAPDSSAFEGTMIKLDPPPPITNSEPIVPKIPANPPPAPPPGINTNIDYTTSTPT
TFIPLGANPAWPAGGTGRMEVPINGPFVPQVTTGTKLAFAIATGEPSGGNEEISLTISGP
PAYTSSSMSVPINVLWLNGTADILEPPTCYRQASGDYLVSFRIGSPLTGPTYGVVNLTLP
ISGTWKLTSLIMGPAYGKFKYMGSTPAATTTATYAPITTGSFSGNTVDMTSGFVDFEIPP
ADRFFSTSSTAAVHALVTGENGKVYKANLIYSDGTLSTTSVRFSTIPPSAGMLAATSWAV
LHNKPTLGIKGVRFTSDDASPGSLSFYSVGVNLGLNMTNQSSFSNQSGEVEEEGNNNAPL
SDKIDVSMGNMLPGVEINSTHFGEKVTSIRQCVKRYVTTKRLTNASTIVETMSDVNYPGV
GDISLVQLHPMDYFRAAYLAYRGSWRVKVLNRRSATATSVAVQQGSILFSRPSRQFMKTG
NVNYLDWISWCGSSYGRISDQSNGVEVPYYSPLRFMPARRATGVDPANWQNDLLLGRDRS
YINIVTRNPLAAQDYEILKAAGEDYSFFFFLTTPVVTLY
NT seq
8940 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatcctttgaatattgaagacgaagatgtgtgggtttttcccacctcccaaataggg
gatcgattgtactatgaagatgagaattatgattgggttttggatgatccacggttgtgg
aatccagaaatgggtccagcacgcgttatagatcttatgcatccttattgttggaattta
tccctcagtaccgatattgtagacaatcatatatggacatggaattacgatggatctccc
cccatggggcgtttgccttgtgggtgtgctatgtatcgagttaatcctatttcacctgct
agattttatgcagtttatacgattcactacccgtattgtgagtatatggattggatatct
gacgatacctacataactcaatacgatagagttgacagacaactcgaagaagatcaagaa
tattatgatcactttttccgaaatcaatcagaggagattgaaaatgacgaaattcccgaa
aaagtgggaacatccgatataaaatatgggaaaacagtttacgagcatctttctaaagct
cgtgttatggatgctgtaaaagcaacatctactcttacagcacgcattaaaaagcgtgcc
aaacggctcacgtttcaagggtttaagaatcaatctaacaaatcatatgatatgcgtgat
acccatctcactcctgcagaaatctcgggaatagagacaattatggctccaatttggaag
aaatatgaatcttttactatgtccgatatagggtggacgatttatgaatatgcgatgttt
ttcacgaacatttggtgtacaactaatgaataccaattggctgtgaatttgtttggtttt
gcgaaaatcttcaaaacttcgaaatttaattttccaccatccattactgcagcgatcggc
atgcttgataaggagaagaaagttccactctctggtcctacaaatcaggccctaagtttg
tccagtattttggacaagtgccgcgcccttcgtttaactcttcagggtattgagactatt
ccttttattaaaatgctaaccagagttatgacagttgcaagtttaataagatggatgcct
aaatcaatcaagtgtcaatctgaatggttagaaatggcatactctagttggcaggacact
attcagaaaacctacgagaatcccacttctttattagatttagttctagatactactagt
gctgctatggattttgtattatgcacaatgtcagacggtatgttcgctagtttgcaacca
cattcgtttgcttctaatgtgtctacggctttagcccgaggtagggcatatcgtaccggc
actttggaaacttctcacggaataactagagctcaatttatgagagatacagaagccgtt
ttaagggtggctaaagagtatgccagtacaaaagctaatttaggtatgcacactttagcc
ttacggaatttgactgacttaaaagttttgtacgcagagctattaaatgataaatctaat
tctgatttacgtgtagcccctttggcaatagcatttactggagaatccggttgtggaaaa
tctattattgtacatgagactattaatttagcaggtcatatcggtggtttttctactgaa
gattctgatatacactacgtcaatactgccgatgcttatgactcgggagccgatagtgga
aaaaccgtgttagttatagatgatatggcttctgaacatcccgatattagtaagtataag
ggagctgttatgattaggtatagtaatactattcctcaagtaactgttcaagcagaagct
gataagaaaggtaaaatcgttttcagacaccatttttgtgccatcacatcaaatgtacca
gatcttaatttacaagcctctatgtcatttccacaagctggttttaaccggtgtgtctta
gtggaagtttcatttaatcccaaactcgagcgtaaaaaatattataagaatggtaagata
gattgggaagctttaaaacgagacggaatcgaaaaagaagctcaagtttttcggttttac
cattatgaaaccacaaattctacagctcgtgttctttcttctttcaaacaaatcttccat
aatgagggaaaataccttaataaggaacaattttttgaggagtttactcgattgcttctt
gagaaggaaaaatctggggaggaatatttagctgctattgcagaagttcgcaaaaggaaa
ttttgcaaaaagtgtgttaaatactttgattattgtccttgtgtggagacgactgtaccc
aaacctgtcattactgagttaaaatctgatgtcgctcagaagatattagatgatcaagct
gtaggtttaaattcgattccaatcgtttccacagaatgcacttccgttgaaaatgagtta
tggaacatttatgatatagatgaatggattcgacaaacgctttatttttggttggctatt
gataattggcaggaaagattttggattgccattatgcctggtatttgggcagggagagat
gcttctatacgtatttggctaacttccttgtggagatttatccaaacccaattgattcgt
ttgtacgcttcagtgtctagccgattagctttcgctttatggttttatccatgggttgtt
agtttaactctttttgtagtgagctatcctttgtcccactatcaatgtaccaccccggtg
tttttgggtttgtatttcgatgatgatttatgtggagtaggaggatatttgatgcaaatt
atcacttttttgttattcctatcaacagtatggatggctgtatgcgctttggctattgga
actgctattaaaagtagagcagttgatattttctttaacgagatttcaatggaacgttct
acattcgctatttctatgttgttaggtacagtaggtgtttcgtggctggcttttaagagt
tattatgctctatttaatacggctatatcaactgtggctaatcagggaaatttatcaccc
accacaatggaggaaattgaatcccgtaacgccgagaagaacatgtggatagataaagct
cattttgtacaccctgaagccgaaccgacaaatcataatgcaacatgtgatcaaattaaa
aagaaaattagcagaaatgtggtcaatgttgagatatatgatttagaggacaaaataaaa
cgtgtgcgaacttgtggtttttatgtttgttctgatgttttgatgattaatcagcatagt
ctacagaattttatcactattaagaatgtttttgtttctattcgaagagctagcgaagat
gttggtggttttattaagaaagttgctgtggaagagttttataatattcctaacactgat
ataacttttatcacaacatcaaaaggacctacatatacaaatatgcgttcgtattttttg
gcggaacacatgaaagttgattcttttacacctgctatgatgttaactcgtgataaattg
ggtaatatggatgaacggacatttatttggacatccactgataaagcgtataacgagaat
cgtaatcaatatcatatgggatcttttcatcgctatgatcatccaactcatggaggtgat
tgcggttcgatcgctttttcgacttccagaccatatggtttgttaggcattcataccgcc
gctgatacgcgtactaatgttggtgtaacatttgcagtaacacaggatatgatatctgat
gcgataaatgcgatgtcaaaatcttttcgtttgagaaatgaatctgcctttaatatcgat
cggcccgaattacctactatgttgtatgacaacccttttccagcgtatgacacgaatttg
cattttcgagactgtgtaaattttattccagtttcggtttctcaggagcctatgattgat
atctatggttccatatctaatatgcgagtgagtagaaagagtgaagttcgagatactatg
cttaaagaacatttattgattcaaggtgttccagatgaacatggacctccgaaatttgat
acaaatcgtaatcatgcggatggttttcagcaaagtttagaaggtatacatgcattgccc
gcagatgatattcgatgggctattcaagattacacggatgaattgatagctcaaatgatg
ctattaaattattcatgtcaaccattaactccatatgaagcgataaatggtataagagga
catcgttttgttaaagctcttaacatgaatacttcctctggaatgggcttaccctctcca
aagaggaaacatttcatagaaacattgtatccagaccatgttgtgtatgttcctgaagat
tatttgcagaaagaactagataatattgaaaatctactatgttcaaatcaagtgcctgca
agtgtatttgtttcagctctgaaagatgaacccactgatattggtaaagataaagtgcga
gttttccaagtagctactgtagctatgaatatcaagatccgtgaatatttacttcctatc
ttggcttttctatatgctaatccgctattgtcagaatctgctgtgggaataaactgtacc
aatgacgaatgggaatcgttgaataattttctattcgattttcacccggataatgtcctt
gaaggtgatttctcaaagtatgatttgcgccaatcaggccaaactattatggccggcggt
acagtctttatgaaattagctgctgctttggggtattcgcccaaagatgtggagaaagta
ggtttgttgatgaatagtttatcatataaatttatggtttggaatggaacattgttcgca
acgtccaatattatgccctctggatctcctatcactattgctttgaataccactacaaat
tgtttgttacaccgaacagggtgggtgcaaatttgtagagaactaagtatcccattagtg
ccctttcgagaagtagctcatttaatgtgtatgggcgacgactcgataggaacttcaaaa
catccagcttttaacatgaaaaatttacaagctttcttcgtgcagtataacatgccttat
acagatgctcacaagagcattgttgctaagccttttactacacgtttagaagcccgattt
tgtaaaagaggttttcgtagcgatgagagagttggaggagttttagctcctttagaaatc
aagtctattttaaaatctctttttcactatatggaatctaaaacacctgaagaagaaata
gtgattatgaacgtagatggtgcaatgcgagaattttcaaggcatgatagagaaactttt
gaacgttatgctcatatagtgcgtacagctgcagaagcagctaaaatatctcatatgacg
aaattactatattattcatatgaagattggggcttaatccacctcaaaaattatcgaatt
attgatatcggtgataacggattaaagcccacgggcacaggttccgatgaagattcggag
tctcaggctatggccacgttaaattcttctgatgatctatggttacggctgtgcggaagt
ggacgcacagagcgcttgatcatcacaaatcaatcccaaaacattcaaagacagggtagc
gttctaatctttgaaataaataaaatcaacgcttctaattataataataacaataacgca
aatgacgttaatatcatttacaaaacatcacccaaagatagtgttatgaatttggaattc
aacagcaattcatctggttggggagccggcgtgaacacatttcgtgatagtacatggaat
atagcttctacgtctggtggtccccaagactttttccagcgaccagttaagattttcgaa
tacagttggcccattaatacaacagttttcgaaacagttaatccctgggaaaagtatttt
ggcgaccctaaagttttagagcgcatctctcattataaaaatttgagtgctgatcttaaa
attaaaattttacttaatggatcgtcttttcattatggacaactgctggtttcgtatcag
ccgctacataataatgatgaaatctttacgtataacgcattacatggaaatatgttaatt
aatctttcccaaatgccatcggtatacgttaacgcatgtcaaggacgggggggagaatta
acccttcccttcttctgtcccaaaaatgcggtcaacatcccatccaaagagtgggaaaat
ttaggtcgattgcatatcgcttctgttgctcctttagcacatgttaatggtagtttggaa
cccattacagtaacaatatttgccatggctgaaaatgttgacgtctcaacacctactggt
tgttatgttaattattttgaaaatcagtgtgaatttgtaaatcagagtgatgagtatgta
aaaccttcagcactagctaacaatgtagcaaaagcggctggtttcctatctcaggttcca
gctatttcgccttttatgctagcgacacaagcggcagcatctgcaacaggacagctgttg
gctttgtttggtatgtccaaaccccgtctggtggacaagccagtgtatgtgagatacaat
attggtatggaattagctccaacaaatgtggctgatcctatttcagtattagcattagat
gctaagaaagaaatcaatgtcgatccgcgtacagttggacttggcccagaagatgaaatg
gccattacgcccattgcaatgcgtgaaagtttattaacaactttcaactggaattcgtct
atgactcctgaaacacatttgttttctatgaggataactcctatggctgggaataaaggc
tcaacatctgagtatcatatgacaccctcagcttttgtcactttgcccttttgctattgg
aaaggaacaatgtatgttcgctttgatttcattggaactcctttccataagggacgagtt
cttttcaaatgggatccagttacaaatttacctgaaaatgctggagtatacaatacaaat
tattcagcaattatggatattaatgagttaactgataaggttttcgaaatcggatggggt
caagagattccttttttgccaaatggagggttattgacgttacctaatttctccagcaca
gaatacactgaacgtagtcttaattgtaatggagtattgtcatgttatgtcgttaacgaa
ttgacatgtcctagcgatgaattgacagaagtcaccattcgagtatcgacgtggatggga
gatgattttgaggtggccgcccctgatagttcagcgtttgagggcacaatgattaaattg
gacccacctccgcccattacaaactcggaacctatcgttccaaaaattccagcgaatcct
cctccagccccaccaccaggtatcaatactaatattgattatactacatctacgcccact
acctttattcctttgggcgccaatcccgcttggccagccggaggaactgggcgaatggaa
gttcctattaatggaccattcgttccccaggttacaaccggcacaaaattagcttttgca
attgccaccggagaaccttctggtggaaatgaagagatatcattgactatttcaggacca
ccggcatatactagttcttcaatgtctgtgcctattaacgttctgtggttgaatggaact
gctgacattttagagcctccaacttgttacaggcaagcgtcaggagattatcttgtatct
ttccgcatcgggtctccattaacgggtcccacttatggggtggttaatttaactcttccc
atttctgggacgtggaaattaacctccttgattatgggaccagcctatggaaagtttaag
tatatgggttctacacctgctgcgacaactaccgcaacttacgcaccaattacgactgga
agtttttctggtaacacggtagatatgacttcaggctttgtggacttcgaaattccaccg
gctgatcgctttttctcaacttcttctactgcggctgttcatgctttagtaacaggagag
aacggaaaggtgtacaaggcaaatttaatttactcagatggcactctaagtacaactagc
gtgagattctctaccattccaccttctgccggtatgttagcagccacttcatgggctgtg
ttacataacaaaccaactcttggtattaagggtgtgagatttacttcagatgacgcatct
cctggctcgttaagcttctattcggtcggggtcaatcttggtcttaatatgaccaatcaa
agttctttttccaatcaatcaggagaagttgaggaagaaggtaacaataatgctccatta
tctgataagatagatgtttcaatgggcaatatgttgcctggagttgaaataaattctact
catttcggagaaaaagttacgtctattcgacaatgtgtgaaaagatatgttaccaccaag
cgcctaacgaatgctagtaccatcgtagaaactatgtcagatgtaaattacccgggagtt
ggtgatatttcactagttcaattacatcccatggattattttagagctgcttatctagca
tacagaggctcatggcgagttaaagttttaaatcgccggtcggcaacagctacgtcagta
gcagtgcaacaaggaagtattctcttttcccgcccctcgagacaatttatgaaaaccgga
aatgttaattatttagattggatctcatggtgtggttcaagttatggtcgtatttcagac
caatcaaatggagtggaagtgccttattactctcctttgcgttttatgccagcgcgccgg
gccacaggagtggacccagccaattggcaaaatgatctcttattagggagggatcgtagt
tacattaatattgttactagaaatccattggcggctcaagattatgagatcttaaaggct
gctggagaagattattctttcttctttttcttgacaacaccagttgtcaccctatattaa
DBGET
integrated database retrieval system