Candidatus Woesebacteria bacterium GW2011_GWF1_31_35: UR17_C0001G0365
Help
Entry
UR17_C0001G0365 CDS
T04464
Name
(GenBank) putative penicillin-binding protein
Organism
wba
Candidatus Woesebacteria bacterium GW2011_GWF1_31_35
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
Transpeptidase
XTBD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AKM83169
LinkDB
All DBs
Position
complement(316121..318289)
Genome browser
AA seq
722 aa
AA seq
DB search
MAGKIKKTTTAFSLLTKILIVVGKPFYFCLTHILIATIFIFYAIGRIINLTFKIKLKPIK
ISIPKVSVKLPKFKIKKRLLLPFIFLLVFSFTFYFLVLKGLPSPRDLITREQSVSTKIYD
RNGELLYTIYKDKNRTPVTLSQIPENTRLATLAAEDAEFYQHPGFSIRGIIRASIKNLKE
GKLNGGSTITQQLVKNALLSSEKTYVRKLRELILSIGVELNFSKDQILEMYLNEVSYGGT
AYGIQEAARLYFGKDVGSLTLSESALLAGLPQSPTRYSPFGPNPDLTFSRQREVLHLMRV
NKFITSEEEEVFLSERITFAPNKTDIKAPHFVMYVREKLIDEYGEEMVLKGGLIVTTTLD
LKIQEMAEKVVKEELEKLKNLNVGNAAVLVVDPKNGEVLAMVGSKDYFDTKNGGNVNVTT
RLRQPGSSIKVINYALSLSNSLTLASTIDDSPITFSVSGLPPYTPKNYDGTYRGKISVRS
ALAESRNIPAVKILASYGVSKMIDLGEKMGITTWTDRSRFGLSLTLGGGEVKLVDLAQVY
SVIANMGVKNEIKVITEVKNYKENLLSQKESRFNVEDLKVLDPRVAFLLIDVLKDNIARS
PSFGLNSMLVIPNHPEVAVKTGTSNDLKDNLTIGFNKDYLVAVWVGNNDGTPMSRIASGI
TGAAPIWNKITRSLLNNKDSVNWIPPEGLIKKECFSRMEWFLEEKQLSCPKILEPAPSTT
NE
NT seq
2169 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggctggaaaaattaaaaaaaccaccactgcctttagtttacttactaaaatcttaatt
gttgtaggtaaacctttttatttttgcctaacccatattttaatagctactatctttatt
ttctatgcaataggacgaattattaatttaacttttaaaataaaattaaaacctattaaa
atttctattcctaaagttagtgttaaattaccaaaatttaaaattaaaaaaagattatta
ttgccttttatttttctattagttttttcttttaccttctactttttagttttaaaaggc
cttccctcccctagagacttaattaccagagaacaatcagtttctacaaaaatatatgat
agaaacggtgaacttttatataccatctacaaagataaaaacaggactccagtaactcta
tcccaaataccagaaaatacacgacttgcaactttagccgcagaagatgctgaattttat
caacatcccggcttttcaattagaggaataattcgagcttcaattaaaaatcttaaggaa
ggaaaacttaatggtggctcaaccataacccaacagcttgttaaaaacgcacttttatca
tctgagaaaacatatgttagaaaattaagagaattaattttatcaatcggtgttgaatta
aatttttctaaagaccaaatactggaaatgtacctaaatgaagtttcttatggaggtact
gcatatggaatacaagaagcagccagactttattttggaaaagatgttgggagtctaact
ctttcagagtcagcactattagcagggcttccccaaagtcctaccagatattcccctttt
ggaccaaatcctgatctaactttttcaagacaaagagaagttttacacctaatgagagtt
aacaagtttataacttccgaagaagaagaggtttttttatcagaaagaattacttttgct
cctaataaaactgacatcaaagccccccattttgtaatgtatgttagagaaaaacttatt
gatgaatatggtgaagaaatggttttaaaaggaggtttaattgttacaactactcttgat
cttaaaatccaggaaatggctgaaaaagtagttaaagaagagttagaaaaacttaaaaat
ttaaacgtaggaaatgcagctgttttagtagttgatcctaaaaatggtgaggtattagcc
atggttggaagtaaagattattttgatacaaaaaacggaggaaatgtaaatgttacaaca
agattaagacaacctggctcttcaataaaagtaataaactatgctttaagcttgtcaaat
agtttaacacttgcctcaactattgatgattctccaataactttttcagtttctggactt
cctccttacactcccaaaaactatgatggaacttatagaggtaagatttcagtaagatca
gctctagctgaatctagaaatattccagcagttaaaatattggcttcctacggggttagt
aagatgattgatctgggtgaaaaaatgggaattactacctggaccgatagatctagattt
ggcctttcattaacactgggtggaggagaagtaaaattagtagatttagcacaagtttat
tctgttattgcaaatatgggagttaaaaatgaaattaaagtaattactgaagttaaaaat
tataaagagaatctcttatctcaaaaggagagtagatttaatgttgaagatttaaaagtt
cttgatccaagagttgcatttttgttaatagatgtacttaaagataatatagcaagatct
ccatcgtttggattaaattctatgttggttattccaaaccatcctgaagttgcagttaag
actggaaccagtaatgacttaaaagacaatttaacaattggatttaataaagattattta
gttgctgtttgggtaggaaataatgatggaacaccaatgagtagaattgcctcaggaata
acaggagctgcaccaatttggaataaaattacaagaagcctacttaataacaaagattct
gttaattggattccaccagaaggattaataaaaaaagaatgttttagtagaatggaatgg
tttttagaagaaaaacaactgtcttgccctaaaattttagaaccagccccctcaactact
aacgagtag
DBGET
integrated database retrieval system