Ziziphus jujuba (Chinese jujube): 107422039
Help
Entry
107422039 CDS
T04794
Name
(RefSeq) probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
Organism
zju
Ziziphus jujuba (Chinese jujube)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_4
LRR_8
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRRNT_2
DUF751
Pkinase_fungal
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
107422039
NCBI-ProteinID:
XP_048332622
LinkDB
All DBs
Position
3:join(18994720..18998035,18998556..18998926)
Genome browser
AA seq
1228 aa
AA seq
DB search
MAPCILNLVVRSLAQFLLFIIVLLFLLCSSSTCFAISGEAEALVKWKDSLDMNPTTHSLL
RSWNLNSTHSTSHHLYNNTPCTWVGITCNNFGSVINITLHSSNLKGTLHNFNFSSFPNLL
VLSLYNNSLYGSIPMHIGNLSTLTSLDMGFNHLSGNIPSQICLLPRLRFLAFPNNYLNGF
IPPQIGMLVSLEVIYAYSNNLSGSIPMSIGNLSKLTELSLSGNKIVGSIPNEIGQLKSLT
ILYLNDNQLTGPIVVSIGNLSRLTDLAFSGNKIVGSIPNEIGQLTSLTTLYLYDNQLSGS
IPISIENLSKLTKLSLGGNKIVGSIPSEIGQFKSLTILYLYDNQLTGLIPVSFGNLRKLT
GLELSGNKIVGSIPNEIGQLKLLTILFLYDNQLSGSIPISIGNLSKLTELSLGGNKIVGS
IPNEIRQLKSLTVLDLNDNQLTGPIPVSIGNLSKLTDLELVGNKIVGSIPNEIGQLKSLT
TLYLYDNQLSGSIPMSIGNLSKLIELRLGGNKIVGCITNEIGQLKSLSILYLSDNQLIGS
IPMSIGNLSRLTALELGGNKIVGSIPNNICLNGKLTWFTAGDNNFRGSIPKSIRNCSSLV
HLSVGGNQLIGNISQEFGIYPDLDYMDLSTNKFFGELSKNWGRFAKLTMLNISNNKISGR
LPPELRKATQLRELDLSSNLLVGKIPKELGQLKLLYILKLNNNSLSSNVPGEIGMISDLE
TLDLAANQLSGPIPMHLEHCSKLLHLNLRNNKFSGNIRFQLGNLLSLENLDLSNNFLSGE
LPSELGHLDKLETFNLSHNNLSGSIPSMFNELLSLTTVDISYNQLEGPLPHIKAFTEAPM
EALEGNKGLCGNNTSLKPCLTPKDKNRNQAVIAIIVSISGILFLLFIIVGMLFICQKRVT
NMVEPRETQTEAFFTAWNHDGKKVHEEIVAATENFDSKYCIGVGENGSVYKTLLSTGQIV
AVKKFHENDGIDHQQAFKSETSILPKVRHRNIIKIFGFCVHTRYSFLVYEFMEMGSLVKI
LSDNEKAMELEWLKRVNIVKGLANATCYLHHECLPAIVHRDISSKNVLLDDDCEAHISDF
GSATTLDPDSSNWTPFAGTLGYSAPELAYTMEVNEKIDVYSFGVVALESLMGEHPGDLIS
SLLSSPLHAADVLLKDVLDQRLSPPKRQIADQVVSIAEIAFVCVRQSPQSRPTMKQVSQK
LSTPLQSLSVPFHMVTIKQLFESPAWTS
NT seq
3687 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcaccttgcattctaaacctcgttgtacggtcacttgctcagtttttgttgtttatc
atcgttctactgtttcttctttgttcttctagtacttgttttgcaataagtggagaggca
gaggcccttgtgaaatggaaggacagccttgatatgaatccaactactcattctcttctc
cgctcttggaatctcaattctactcattcaacttctcatcatctctataacaatactcct
tgtacctgggttgggatcacgtgtaacaattttggaagtgtcatcaatattactcttcac
agcagtaatttgaaaggtacgcttcacaacttcaacttctcctcctttcccaacttactc
gtgcttagcctatataacaactccctttatggaagtatccccatgcacattggaaacctt
tccacactcacctcacttgatatggggttcaatcatctctccggaaacattccttcccaa
atatgccttttgccaagattacgtttccttgcttttcctaacaattatttgaatggcttt
ataccacctcaaataggcatgttggtgtctcttgaagtgatttatgcttatagtaacaat
ctttcaggttcaattcctatgtccattggaaacttgagcaagttaactgaattgagtctt
agtggaaacaaaatagttggttccatccccaatgagattggacagctcaaatcactcact
atcctttatttgaatgataaccaactcactggcccaattgttgtgtctattggaaactta
agtaggttaactgatttggcatttagtggaaacaaaatagttgggtccattcccaatgag
attggacagcttacatcactcactaccctttatttgtatgataaccaactcagtggctca
attccgatatccattgaaaacttgagcaagttgactaaattgagccttggtggaaataaa
atagttgggtccatccccagtgagattggacaatttaaatcactcactatcctttatttg
tatgataaccaactcactggtttaattcctgtgtcctttggaaacttgaggaagttaact
ggtttggaacttagtggaaacaaaatagttgggtccattcccaatgagattggacagctt
aaattactcactatcctttttttgtatgataaccaacttagtggctcaattcctatatcc
attggaaacttgagcaagttaactgaattgagccttggtggaaacaaaatagttgggtcc
atccccaatgagatcagacagcttaaatcactcacagtccttgatttgaatgataaccaa
ctcactggcccaattcctgtgtccattggaaacttaagcaagttaactgatttggaactt
gttggaaacaaaatagttgggtccattcccaatgagattggacaacttaaatcactcact
accctttatttgtatgataaccaactcagtggctcaattcctatgtccattggaaacttg
agcaagttaattgaattgaggcttggtggaaacaaaatagttgggtgcatcaccaatgag
atagggcagcttaaatcactctctatcctttatttgtctgataaccaactcattggctca
attcctatgtccattggaaacttgagcaggttaactgctttggaactcggtggaaacaaa
atagttgggtccattccaaataatatttgtcttaatgggaagcttacatggtttacagca
ggtgataacaactttagaggttccattccaaaaagcataagaaactgcagttcattagtc
cacctttcagttggtggaaatcaactaataggaaatatatctcaagaattcggaatatac
ccagacctggattatatggacttgagcaccaataagttttttggagaactttccaaaaac
tggggacggtttgcaaaactcacgatgttgaacatctccaacaataaaatttcaggtagg
ctacctcctgaacttaggaaggcaactcaattacgggaacttgacctctcatccaacctt
ctcgtaggtaaaattcctaaggaattgggacaactgaaattgttgtacattctcaagctc
aacaataattccctttctagcaatgttcctggagaaattggaatgatatcggaccttgaa
acacttgatcttgcagccaaccaattgagtggaccaattcccatgcatttggagcactgt
tcaaaactactgcatttaaacttgaggaataacaaattcagtggaaatattcgcttccaa
cttgggaatctactctcccttgaaaatctggatctaagtaataattttctttcaggagag
ttgccttcggagcttggtcatttggataagctagaaacatttaacctctcacacaacaat
ctgtcaggctcaataccatccatgtttaacgaattgttaagcttgacaactgttgatata
tcctacaatcagttagaaggtcctcttccccacatcaaagctttcactgaagctccaatg
gaagccttggaaggtaataaaggattgtgcggcaacaacactagtttgaagccttgcctc
acacctaaagataaaaatagaaatcaagctgtaattgcaatcatagtatccatctccggc
attctatttttattgtttatcattgttgggatgctttttatttgccaaaaaagagtgacg
aatatggttgaaccaagagaaacacaaactgaagctttctttactgcatggaaccacgat
gggaaaaaagttcatgaagaaatagttgcagcaacagagaattttgattccaaatattgc
attggagttggagagaatggtagtgtgtataaaacactactatcaactggtcaaattgtt
gctgtgaaaaagttccatgagaatgatggaatagaccatcaacaagctttcaaaagcgag
acaagtattttgccaaaagtgcgccatcgaaacatcatcaagatttttggattttgtgtg
catacaagatactcatttttggtgtatgagttcatggaaatgggaagtttggtaaagata
ttgagcgacaatgaaaaggcaatggagttggaatggctcaagagagtgaatattgtcaaa
ggtttggcaaatgcgacatgctatctacaccatgaatgtttaccagctatagtccacaga
gacatatctagtaagaatgttctgttggatgatgattgtgaagctcacatttctgacttt
ggttctgctacaactttagatccagactcatcaaattggactccatttgcaggaaccttg
ggttactcagccccagagcttgcttatacaatggaagtaaatgagaagattgatgtctac
agcttcggagttgttgcattagaatctctcatgggagagcatcctggagacctcatatca
tctctgttatcatcaccattacatgctgctgatgttctgcttaaggatgtacttgaccaa
cgtctctcacctccaaagcggcaaatagcagaccaagtggtctccattgcagaaatagca
tttgtgtgcgtgcgacaaagtccacagtcacgaccaactatgaagcaagtatctcagaag
ctgtcaactccattacaatcattgtcagttccttttcatatggttacaataaagcagctg
tttgagtccccagcatggacatcctaa
DBGET
integrated database retrieval system