KEGG   ENZYME: 2.1.1.181
Entry
EC 2.1.1.181                Enzyme                                 
Name
23S rRNA (adenine1618-N6)-methyltransferase;
rRNA large subunit methyltransferase F;
YbiN protein;
rlmF (gene name);
m6A1618 methyltransferase
Class
Transferases;
Transferring one-carbon groups;
Methyltransferases
Sysname
S-adenosyl-L-methionine:23S rRNA (adenine1618-N6)-methyltransferase
Reaction(IUBMB)
S-adenosyl-L-methionine + adenine1618 in 23S rRNA = S-adenosyl-L-homocysteine + N6-methyladenine1618 in 23S rRNA [RN:R07232]
Reaction(KEGG)
R07232
Substrate
S-adenosyl-L-methionine [CPD:C00019];
adenine1618 in 23S rRNA
Product
S-adenosyl-L-homocysteine [CPD:C00021];
N6-methyladenine1618 in 23S rRNA
Comment
The recombinant YbiN protein is able to methylate partially deproteinized 50 S ribosomal subunit, but neither the completely assembled 50 S subunits nor completely deproteinized 23 S rRNA [1].
History
EC 2.1.1.181 created 1976 as EC 2.1.1.48, part transferred 2010 to EC 2.1.1.181
Orthology
K06970  23S rRNA (adenine1618-N6)-methyltransferase
Genes
ECO: b0807(rlmF)
ECJ: JW5107(ybiN)
ECD: ECDH10B_0875(ybiN)
EBW: BWG_0660(rlmF)
ECOK: ECMDS42_0657(ybiN)
ECOC: C3026_05085
ECE: Z1028(ybiN)
ECS: ECs_0885(rlmF)
ECF: ECH74115_0957
ETW: ECSP_0904(ybiN)
ELX: CDCO157_0863
EOI: ECO111_0868(ybiN)
EOJ: ECO26_0934(ybiN)
EOH: ECO103_0843(ybiN)
ECOO: ECRM13514_0884(ybiN)
ECOH: ECRM13516_0839(ybiN)
ESL: O3K_17315
ESO: O3O_07975
ESM: O3M_17285
ECK: EC55989_0851(ybiN)
ECG: E2348C_0759(ybiN)
EOK: G2583_1035(ybiN)
ELR: ECO55CA74_05025
ELH: ETEC_0874
ECW: EcE24377A_0877
EUN: UMNK88_848
ECP: ECP_0821
ENA: ECNA114_0740(ybiN)
ECOS: EC958_0920(ybiN)
ECV: APECO1_1284(ybiN)
ECOA: APECO78_07705
ECX: EcHS_A0862
ECM: EcSMS35_0832
ECY: ECSE_0863
ECR: ECIAI1_0845(ybiN)
ECQ: ECED1_0772(ybiN)
EUM: ECUMN_0951(ybiN)
ECT: ECIAI39_0785(ybiN)
EOC: CE10_0828(rlmF)
EBR: ECB_00774(ybiN)
ECOB: C3029_08300
EBL: ECD_00774(rlmF)
EBE: B21_00791(rlmF)
EBD: ECBD_2816
ECI: UTI89_C0810(ybiN)
EIH: ECOK1_0811
ECZ: ECS88_0825(ybiN)
ECC: c0892(ybiN)
ELO: EC042_0897
ELN: NRG857_03610
ESE: ECSF_0733
ECL: EcolC_2836
EKO: EKO11_3079
EKF: KO11_19745(rlmF)
EAB: ECABU_c08490(ybiN)
EDH: EcDH1_2835
EDJ: ECDH1ME8569_0760(ybiN)
ELU: UM146_13610
ELW: ECW_m0863(rlmF)
ELL: WFL_04195(rlmF)
ELC: i14_0856(ybiN)
ELD: i02_0856(ybiN)
ELP: P12B_c0794
ELF: LF82_2643(ybiN)
ECOL: LY180_04250
ECOI: ECOPMV1_00810(rlmF)
ECOJ: P423_04005
EFE: EFER_2301(ybiN)
EAL: EAKF1_ch0665c
EMA: C1192_08285
ESZ: FEM44_18540(rlmF)
ERUY: OSH18_05680(rlmF)
STM: STM0826(ybiN)
SEO: STM14_959(ybiN)
SEV: STMMW_08771
SEY: SL1344_0801(ybiN)
SEM: STMDT12_C08800
SEJ: STMUK_0830(ybiN)
SEB: STM474_0851(ybiN)
SEF: UMN798_0894
SETU: STU288_10285
SETC: CFSAN001921_12890
SENR: STMDT2_08021
SEND: DT104_08411
SENI: CY43_04420
SEEN: SE451236_10150
SPT: SPA1927(ybiN)
SEK: SSPA1796
SPQ: SPAB_02677
SEH: SeHA_C0953
SHB: SU5_01496
SENH: CFSAN002069_04720
SEEH: SEEH1578_13520
SEE: SNSL254_A0890
SENN: SN31241_18730
SEW: SeSA_A0974
SEA: SeAg_B0862
SENS: Q786_04010
SED: SeD_A0921
SEG: SG0804(ybiN)
SEL: SPUL_2149
SEGA: SPUCDC_2135
SET: SEN0771(ybiN)
SENA: AU38_03995
SENO: AU37_03980
SENV: AU39_03985
SENQ: AU40_04440
SENL: IY59_04055
SENJ: CFSAN001992_07310
SEEC: CFSAN002050_10705
SEEB: SEEB0189_015230
SEEP: I137_09770
SENB: BN855_7960
SENE: IA1_04190
SENC: SEET0819_11090
SES: SARI_02101
SBG: SBG_0710
SBZ: A464_789
SBV: N643_03600
SALZ: EOS98_15015(rlmF)
SFL: SF0758(ybiN)
SFX: S0800(ybiN)
SFV: SFV_0791(ybiN)
SFE: SFxv_0826(rlmF)
SFN: SFy_1030
SFS: SFyv_1074
SFT: NCTC1_00767(rlmF)
SSN: SSON_0787(ybiN)
SBO: SBO_0697(ybiN)
SBC: SbBS512_E2543
SDY: SDY_0790(ybiN)
SDZ: Asd1617_00991
SHQ: A0259_07985
ENC: ECL_02924
ENL: A3UG_06900
ECLG: EC036_13350
ECLE: ECNIH2_07715
ECLN: ECNIH4_15650
ECLI: ECNIH5_06790
ECLX: LI66_06670
ECLY: LI62_07570
ECLZ: LI64_07175
ECLO: ENC_19280
EHM: AB284_18190
EXF: BFV63_06815
ECLA: ECNIH3_06810
ECLC: ECR091_06790
EAU: DI57_11910
EKB: BFV64_06695
ENO: ECENHK_07000
EEC: EcWSU1_01353(rlmF)
ELG: BH714_02905
ECAN: CWI88_15415
ERN: BFV67_06460
ECLS: LI67_007715
ECHG: FY206_08085(rlmF)
ESH: C1N69_06820
EPT: HWQ17_05825(rlmF)
ENT: Ent638_1294
EAS: Entas_1282
ENR: H650_22755
ENX: NI40_006440
ENF: AKI40_2257
LNI: CWR52_05420(rlmF)
EBG: FAI37_22670(rlmF)
END: A4308_10775
ENZ: G0034_06810(rlmF)
ENS: HWQ15_15280(rlmF)
ENK: LOC22_17550(rlmF)
EHU: D5067_0015875(rlmF)
EMOR: L6Y89_06660(rlmF)
ENB: ELK40_07335(rlmF)
EQU: OM418_06570(rlmF)
EPU: QVH39_06750(rlmF)
ESA: ESA_02533
CSK: ES15_2627(rlmF)
CSZ: CSSP291_12000
CSJ: CSK29544_03835
CCON: AFK62_06525
CDM: AFK67_06725
CSI: P262_03825
CMJ: AFK66_013155
CUI: AFK65_06480
CMW: AFK63_12160
CTU: CTU_14080(rlmF)
KPN: KPN_00836(ybiN)
KPU: KP1_1793(ybiN)
KPM: KPHS_16670
KPP: A79E_3405
KPH: KPNIH24_20440
KPZ: KPNIH27_07865
KPV: KPNIH29_08560
KPW: KPNIH30_08580
KPY: KPNIH31_08460
KPG: KPNIH32_08685
KPC: KPNIH10_08355
KPQ: KPR0928_08255
KPT: VK055_1693(rlmF)
KPO: KPN2242_06995
KPR: KPR_3751(rlmF)
KPJ: N559_3497
KPI: D364_04385
KPA: KPNJ1_03745
KPS: KPNJ2_03733
KPX: PMK1_03169(rlmF)
KPB: FH42_25220
KPNE: KU54_018075
KPNU: LI86_17900
KPNK: BN49_1886(rlmF)
KVA: Kvar_3544
KPE: KPK_3733
KPK: A593_18675
KVD: KR75_16130
KVQ: SP68_22725
KOX: KOX_15110
KOE: A225_1850
KOY: J415_22420
KOM: HR38_13915
KMI: VW41_15895
KOK: KONIH1_09130
KOC: AB185_27035
KQU: AVR78_12900
EAE: EAE_14605
EAR: CCG31046
KQV: B8P98_19425
KLL: BJF97_09510
KLW: DA718_19115(rlmF)
KAR: LGL98_17095(rlmF)
KGR: JJJ10_19020(rlmF)
KPAS: LUW96_15900(rlmF)
KLC: K7H21_19050(rlmF)
KLM: BWI76_08955
REE: electrica_03508(rlmF)
ROR: RORB6_11020
RON: TE10_09895
RPLN: B1209_18585
RAO: DSD31_17440
RTG: NCTC13098_05191(rlmF)
CRO: ROD_08081
CKO: CKO_02316
CFD: CFNIH1_14145
CBRA: A6J81_08945
CWE: CO701_14750
CYO: CD187_16130
CPOT: FOB25_03625(rlmF)
CFQ: C2U38_08205
CSED: JY391_14300(rlmF)
CAMA: F384_03725
CAF: AL524_18565
CIF: AL515_08640
CFAR: CI104_08440
CIR: C2U53_17690
CIE: AN232_22300
CPAR: CUC49_03845
CTEL: GBC03_21550(rlmF)
CITZ: E4Z61_01020(rlmF)
CARS: E1B03_09240(rlmF)
CIX: M4I31_15580(rlmF)
CIB: HF677_015730(rlmF)
CENS: P2W74_15535(rlmF)
EBT: EBL_c25980(ybiN)
CNT: JT31_05565
CEM: LH23_12380
CEN: LH86_11780
CLAP: NCTC11466_03112(rlmF)
PGE: LG71_20750
ESC: Entcl_3015
KLE: AO703_07245
KSA: C813_07705
KOR: AWR26_17155(rlmF)
KRD: A3780_07100
KCO: BWI95_12815
KOT: EH164_15265(rlmF)
KPSE: IP581_07130(rlmF)
KOB: HF650_07735(rlmF)
KOO: O9K67_16800(rlmF)
KIE: NCTC12125_02178(rlmF)
KAS: KATP_31050(rlmF)
KLU: K7B04_12850(rlmF)
KCY: RIN60_15910(rlmF)
LAX: APT61_15680
LEI: C2U54_11815
LEH: C3F35_04665
LEE: DVA44_16785
LER: GNG29_07025(rlmF)
LEA: GNG26_06665(rlmF)
LPNU: KQ929_14200(rlmF)
LEY: DVA43_10890
LAZ: A8A57_06945
LEF: LJPFL01_1356
LEW: DAI21_19810
BUF: D8682_07995(rlmF)
BAGE: BADSM9389_28100(rlmF)
BFT: MNO13_17075(rlmF)
AHN: NCTC12129_03398(ybiN_2)
ASUB: NLZ15_07585(rlmF)
YRE: HEC60_01130(rlmF)
SGOE: A8O29_015600(rlmF)
KIN: AB182_17195
PDZ: HHA33_19730(rlmF)
METY: MRY16398_39580(rlmF)
IZH: FEM41_13935(rlmF)
PSHI: SAMEA2665130_1488(rlmF)
PSGC: G163CM_20170(rlmF)
SCOL: KFZ77_06095(rlmF)
PVJ: LMA04_05620(rlmF)
SUPE: P0H77_08145(rlmF)
TOE: QMG90_14395(rlmF)
EBF: D782_3017
EBC: C2U52_28195
EBU: CUC76_07155
EBB: F652_1802
PSTS: E05_09540
YPE: YPO2519
YPK: y1668
YPH: YPC_1603
YPA: YPA_2011
YPN: YPN_2114
YPM: YP_2331
YPP: YPDSF_1929
YPG: YpAngola_A1777
YPZ: YPZ3_2227
YPT: A1122_13535
YPD: YPD4_2488
YPX: YPD8_2183
YPW: CH59_56
YPJ: CH55_90
YPV: BZ15_1015
YPL: CH46_2593
YPS: YPTB2553
YPO: BZ17_4085
YPI: YpsIP31758_1491
YPY: YPK_1596
YPB: YPTS_2647
YPQ: DJ40_3990(rlmF)
YPU: BZ21_1849
YPR: BZ20_3656
YPC: BZ23_2133
YPF: BZ19_1915
YEN: YE2849
YEP: YE105_C1430
YEY: Y11_17551
YEL: LC20_01883
YEW: CH47_2201
YET: CH48_3024
YEF: FORC2_2829
YEE: YE5303_32771
YSI: BF17_22235
YAL: AT01_3898
YFR: AW19_606
YIN: CH53_3240
YKR: CH54_1056
YRO: CH64_3876
YRU: BD65_3120
YRB: UGYR_15930
YAK: ACZ76_02270
YMA: DA391_07530
YHI: D5F51_12180(rlmF)
YCA: F0T03_14845(rlmF)
YMO: HRD69_12605(rlmF)
YAS: N0H69_17755(rlmF)
YKI: HRD70_19195(rlmF)
SMAR: SM39_0915
SMAC: SMDB11_0746
SMW: SMWW4_v1c14560
SPE: Spro_1470
SRR: SerAS9_1459
SRL: SOD_c13670(rlmF)
SRY: M621_07595
SPLY: Q5A_007415(rlmF)
SRS: SerAS12_1459
SRA: SerAS13_1460
SMAF: D781_1403
SLQ: M495_06880
SERF: L085_21180
SERS: SERRSCBI_06915
SFW: WN53_16675
SFG: AV650_12125
SRZ: AXX16_3689
SERM: CLM71_06845
SQU: E4343_08800(rlmF)
SFJ: SAMEA4384070_1524(rlmF)
SOF: NCTC11214_05451(rlmF)
SSUR: ATE40_004120
SURI: J0X03_16435(rlmF)
SRHZ: FO014_03000(rlmF)
SENP: KHA73_07625(rlmF)
SNEM: NLX84_07335(rlmF)
SNEV: OI978_26450(rlmF)
SFO: Z042_20795
RAH: Rahaq_1351
RACE: JHW33_01260(rlmF)
RAQ: Rahaq2_1427
RAA: Q7S_06515
ROX: BV494_02130
RVC: J9880_14575(rlmF)
RBON: QNM34_06950(rlmF)
RIU: I2123_17130(rlmF)
GQU: AWC35_04665
EAME: GXP68_14310(rlmF)
RBAD: H2866_14185(rlmF)
CARU: P0E69_13620(rlmF)
NIG: C1N62_11380
PROD: PCO85_03700(rlmF)
SERA: Ser39006_021750
SERQ: CWC46_21760
ECA: ECA0761
PATR: EV46_03325
PATO: GZ59_06680
PCT: PC1_0640
PCC: PCC21_006700
PCV: BCS7_03235
PWA: Pecwa_0854
PPAR: A8F97_14670
PEC: W5S_0761
PWS: A7983_11775
PPOA: BJK05_20245
PBRA: B5S52_18360
PPUJ: E2566_03725(rlmF)
PARI: I2D83_18455(rlmF)
PAQU: DMB82_0003880(rlmF)
PVZ: OA04_07390(rlmF)
PPAV: LOZ86_03730(rlmF)
PQU: IG609_003315(rlmF)
PPOO: LW347_03590(rlmF)
PCAC: OI450_03580(rlmF)
PACB: M9782_05800(rlmF)
PCOA: PJ912_17575(rlmF)
BGJ: AWC36_15070
BRB: EH207_02650(rlmF)
BNG: EH206_18470(rlmF)
BIZ: HC231_19920(rlmF)
LBQ: CKQ53_08175
LPOP: I6N93_13750(rlmF)
SGL: SG0919
SOD: Sant_2685(rlmF)
SLIG: GTU79_06445(rlmF)
EAM: EAMY_1267(ybiN)
EAY: EAM_1265
ETA: ETA_22110
EPY: EpC_23440(rlmF)
EPR: EPYR_02534(ybiN)
EBI: EbC_14270
ERJ: EJP617_23800(rlmF)
EPE: CI789_11540
ERWI: GN242_13995(rlmF)
ETP: LU633_16035(rlmF)
ERP: LJN55_07070(rlmF)
ETO: RIN69_07880(rlmF)
EGE: EM595_1204(rlmF)
PAM: PANA_1279(ybiN)
PLF: PANA5342_3007(ybiN)
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PTV: AA957_08735
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PPUU: PputUW4_04439(rlmF)
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PSK: U771_06410
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PCH: EY04_04660
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PKE: DLD99_05295
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SPL: Spea_4146
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SHN: Shewana3_0127
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SJA: SJ2017_4079
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SCAA: TUM17387_37880(rlmF)
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SCHK: GII14_21460(rlmF)
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SPSR: EGC80_05210(rlmF)
CPS: CPS_2268
COM: CMT41_09920
COZ: A3Q34_15185
COV: EKO29_05610(rlmF)
LSD: EMK97_00760(rlmF)
THT: E2K93_03575(rlmF)
PHA: PSHAb0296
PTN: PTRA_b0439(rlmF)
PSM: PSM_B0367
PSEO: OM33_18235
PIA: PI2015_3393
PPHE: PP2015_4090
PBW: D172_018725
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Reference
1  [PMID:18021804]
  Authors
Sergiev PV, Serebryakova MV, Bogdanov AA, Dontsova OA
  Title
The ybiN gene of Escherichia coli encodes adenine-N6 methyltransferase specific for modification of A1618 of 23 S ribosomal RNA, a methylated residue located close to the ribosomal exit tunnel.
  Journal
J Mol Biol 375:291-300 (2008)
DOI:10.1016/j.jmb.2007.10.051
  Sequence
[eco:b0807]
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